Map Locations of contig_78371 (10999 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_78371

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_78037 1 921 bp MLOC_78037.1 Available Available None
MLOC_78038 2 944 bp None Available Available None
MLOC_78036 7 2368 bp MLOC_78036.2 Available Available LOC_Os03g10850.1, FRAME:+2, EVALUE:4e-97, 13103.m01221 protein FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_78037






CDS Structure of MLOC_78038






CDS Structure of MLOC_78036






Contig Sequence (10999 bp)

>contig_78371 10999 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTATTGACCATAGAGGTGTGTCGGTCATGTCTCAATAGTTTTCGAACCCATAGGGTCTAC
ACACTTAACGTTCAATGACGATATAAACATAGTTGAGTTATTGTGTTGGTGACCGAAGGT
CATTCGGAGTCCCGGATGGGATCTCAAACATGATGAGGAGCTTCAGAATGGTCCGTAGAT
AAAGATTGATACATAGGAAGTTTCGTTTTGGTCATCGAAAAAGTTTCGCGCATCATCGGT
AATGTACCAGGAATGCCGAAAGTGTTCTGGAGTCCACCGGAAAGGGTCTACCACCCTCGG
AGGAGCCACATGGGCTGAGTCGGGTGCACTCCAGCCCCTGGTGGGCTGGGCGCCCCTCCC
CACCTAGGCCCATGCGACCAAGGGATGGTGGAGGGCTGGCCCAAGGGTGGCGCCACCTTT
CTTGGTGGCCAAGCCACCTTTCTTGAGAATTAAAATCACCTTGAAGAAACAAGAATAAGA
ATTATGTAGTGCATATCCTTCATCAAGTTAAATTTATTACAAGCAACATATTTAACATAC
CACTTATTCTTCTTAAAAATATTAAGGAGAGATATGATCACAAACTTGAAGAAATCTTGA
AAGACCACCGATGAGAATTTGGAATGAAAGAGGATAAAACAAATGAACTAGGCTACATGA
GGACAAGAGAGCATGATTCGACTAGAGAATGCTTGAGCAAGCCATCCGAATAATTGAGAG
ATGAACGAAGGGACAATAATTAAGAAGAAATTAAGAATGAAAGCTGAAAGACGACGATGA
TTTTGCTGCAACCATAGTTGGATTTTGCTACTACCGTTGAACTTTTTTGCTATATCCATT
CAACGACGCTGAATTACTGGTGGCCACCGCCGATGCAATCCCGTTTGGCGACTAGCGAGC
ATCAATGGCGAGGGGCGACGATGTAGCTACAACCGGAGGGGAGCTACAACCGTCCTGGTG
AGAGCTGCAACCACATGTGCAGTTGTTGCATGGGCTAAGGCGACGACGAGGACAACCGGC
AAGGGTGGGGACCATGACAGGAGGGCCGGAGAGGATGTGGACCGACGACGAGGACGTCCT
GCGGGGGTGGGGACTCGCGACGAGGACGACCATCGAAGGAGATCGAAGGCGCGGCGACGA
GGACCCCGAGCGGATCCAGCCCAAGAAAGAAGAAGACAAGAAGATTTTTTTTCCCACATC
TAATAATCACACGACTCGCATCCAACAAAATGAGATGCGGCCGGTGGAAACTTTTCGGCC
GGCGCACCGGCGCCCACGAGTTCCGTTTGAGGTGCCGAATTAGCCCCACCGTAAGCTCCG
CACCAAATCCGTCGATTTCGCCACGCGCCCACCGTTTTCGCGTCTTCCCCGCTCCGGCCC
TGTCTTTCTCTCTCTCCTCAGGCCGCGATGGCACCGTCGGGGTCGAACCCGCTGGAGCCC
GTGTTCCAGACCGTCGCTGCCTTCTCCCGCCGCCTCCTCATCGCCCCCGACACCGCACCG
GACGACCACCGCCTCCGCCCCCTCCTCTCCCTCTCCCTCTCCCCGCCTCCTCCCCCGCCC
CCGCTGCCGCCGCCGGAGGTCCTCAAGGCAAGCTCTCTCTCGCCGATTCCTCTCCGTTTC
TCCGTATGGAGGGGCTAGTCGTAAGGTGTTCGGCTGAATGCGCAGCAGAAGGATGCGAAG
GTGGCGCCCCTGACGAAGGAGGAGGTTGGCCGGGCGACCTGGATGCTGCTCCACACCATC
GCCGCGCAGGTGCTCCGTCTTTACTGGCTCTGTCAGTAGCACACCAATGTTCAGCAATTG
CCTGAAGCTACTAGTCTTGTTCATTTAGCAACATATCATGTGTCGTCAATTTGGATGGTC
CATGGATTATTATGCATTTGCGTTTATTGATCAATTTACTTGTGGATAAGGCAACGAGCT
GTTAAGCATTGATGCTTTAAATCCATTTGCTGCCAGCTTACTGTGTTTTGTTTAACCGAG
TTTCAGTTTCCCGATGAACCAACCAGGCAGCAGAAACGCGATGCGAAAGAGCTGGTAAGC
AGGACTGGGGACTCAACTAAATTTCTTTACATTTGGGGGTGATTCATAGGTGTGCTAGTA
TGGCATAATCTGCATACCTTACGGAATTGCGGTCTTGAAAGATGTATGAGCACTTTGCAG
GTACTAGCTATTTACTATCGAGGGTTAAGAAGAACGTTCCAATTCAGACATTGATGCTTT
TTTTATAGGCTTAGGTTGAGATCCGCACATGATTTGATAAAATAACCTGTAACGGATTCG
TTGGGAGTAATGCTTGTTTTATTCTTTTATTTACTCAAATGGATGCTATCTTTGTACATG
GACCCAAAAGGCAAGCAATGCTTGATAAAATTCGGACACAACGAGTTTCACAGTTTGAGT
ATTGCTACGGCAAAACTACAGGGCCATGCTATATTATGGACTTATCGATACACCTTCTGT
TCATTTCCAATAAGTTCTGAGCTTTACGGTTTTAACAAGCATGTATTCCACTTGGTTTAC
CATTACTCTGAAGTATTATTATGTTATACGAGCGACCATTGACTACCACTTAATCTATCT
GGAATATCAGTACAAGTCAGTTTGTTCAATTTTTTGTATTCTCTCTTCCTGAAGATCTCC
CTGTCCCGCTTCTCATTTTAACTTTTGCTTGTCTTTTGGGTCCATGTACAAAGATAACAT
TTCTGCCTATTTTCATATTCAGATGGCTTTAATTTCGAGAATGTATCCTTGCAAAGAGTG
CGCTGATCACTTCAAGGAAGTTTTGAAGTAAGCAATGCTCTCCGGACTCTTGGATAAATT
GTTATTTCCATTTAAGTGGTTTGATGCTTGAGATGCCTTTGTACGCTACAGTCTTATATC
GTGCTGAAATGTTGGTAGTTGATAGTTATCAAGGAATCAACCTTTGAACTTTTGCTGCTA
TATGATTAGTTACAGTTTGCAACATGAACCTATGTGTATAATGTCAGATTACCAAATTTA
TATACATGCACTTGTCTGTCACAATCTGCAACATTTTATCATTAAACTTTCCATGCCTGC
TCGGTTCTTCACAGAAAGCAGTTGATAACTGACCAGGGTCATATAGATATAACAATTGAG
CACGGTGATTCAATGGCTATTTATATGTACCAATTGCTAATATGTGGTGCAGGTGAATTG
CTGGACATTTGGGTTCTTGAAAGCTTGCTTAGATTAAAACACTTAATCATTGTAGTGTAA
TATGTTCGAACCATGTGATCAGGTTGTCCAATTGTTGTTACTCGATTACTTTTTTGTGTT
ATGTGAACATAATGGCAAATAGGCAGTTCTCTTGGAACAACATTAAACTGACTTCATTAT
GATCTTATTTCAGAGCAAATCCTGTGCAGGCAGGATCCCAGGCTGAATTCTCTCAGTGGT
TATGCTATGTGCACAATGTGGTTAATCGAAGGTAAGCCAATACAAGCAACTTTGTAATGT
TTACTCGGTGGTCCATTGGAAAACCATCAAGGTAATTGTAGTTATAGCGTGTTCCTGTTG
TCACTGGAAAGATATGGTCTGCAGGCCGAAAAGAGGAAAACCGAAGCAGTATATCGTTTT
GGTTTGCTTTTATTACGATAAAACAGATGTTCTCATTCATCACAACATGTCATGATTCTA
CAGAATATTAAGCCGTCCACCGGCGGGACCATTCTTGTGAGCTGCTCACCTGAGCGTATC
GTGGTTGTGTTTTGCAGCCTTGGAAAAACAATATTTCCCTGCCAGAGAGTAAATGCACGG
TGGGGCAAGCTGGATTGCCCGGATCGCGCGTGCGACCTAGAAGGCTCCAACGACATCATG
CCGAACCGATGACACTGCCCGGAAACCTTATAAAAATTTCCGTGCCAGTAACAAGTTTAA
ACCACCATTGGATGGGCAATACCAGGAGGATAAGGAAAGATAATTCAGGACAATACCGGT
GTATTATTATTATCGTTTACCTCCTCCATCCTCTATCCCTGGCAAATGTAATACTAGTAT
ATGTCATCTGAACCTGCCCCTTGATGCTGCGCTCCTGTACAGTACAGTTTCACCATCTTC
ACGGTGATGAAACACCCTATGATCTGTAAAGGTTTTGGGCGAGGTTCTATCAGTTACACC
GATTTTACTGCTCTCTGAAATCTGAACTCTGATCCTTTCAAGTTTCATTTCAACTCCCCT
ATCTGGCAAACATTAGAGGTTTCTGTGCAGCCTGTATCCTGTCACAGGAAACCCTGGGAA
ACAGGGCACGGCATGTTCACGAGATTGCGCAGGGAAATTTTGGGGAAAAAGAGGCGGCAA
ATGCATGGATGATGGATCGGTACCACCACTAGTATATTCAAGGGCTTGGCAATCAATGAG
AAGAGCAGGTCCGACAGACGGACTGACGGAGGAACGCATGGCATGGAGGCCACCTTCCTC
GCTTGGCCCGGCCATTTCCCTGCACTGCCTCCTCGGTGTTGCCGAGACATAAATTCTGCC
GTGTTATCGCCACCATTTCTTTAATCCCATACTGACTGACATCTAGAGTGATGCACATGC
GGAGGCTGCATCACGCTTTGAATTGCATGTACTAGTGCCTGTCTTTATCTTACAGCCAGG
AGGAGACGGTCTCAAGGAAGCAAACCACAAGAGCCAACGCCGGTGCTGAAGCTGAAGCGT
CTCGGCTTCTGAGCTTCTCGGGGGACCTTGCAAGCGGTGGGGGAGCGATGGCGATGAAGC
GCCGCTCCGTGCTGGCTTTGCTCGTCGTCGCGTTCGTCGGAGGGAACCTGCTCCTCGGGA
CCTCGTTCAGCGCCAGAAGCACGGTGGAGTCCTCAGCCTCAGGTACATACGCATGAAAAC
TGTCTCTGTTTGCTCTTCTCTCTCTTGCCCTCCTGTCACTTATACTTCAGGTGAATCCTG
TTCTGCTTCTTCTGTCCCGTTTGGTTTATTATAGAGAAAAGTGTAGATAGCTTTAGCAGC
TAGTGTCTGGTGTTGGTACTTGGTTCGATCTTTCAAAAGATTGTGGATGCAAGGTAGTGA
AAGAAACTGCCAGTTCGACATGATAAGGCAAATCTGTAGTTACTCGTCTTTTTTATTTTG
GATCTAACTCGGCTCCTCGCTATCTTTTTAACGATCGGGTCCTCGTCTCTGCAACTGCAT
ACAACTCGAAGGAAATGTTTGGTAGGAAATTAAGCGAGGTCACGTTTGCATGGGTTGGTG
CTGGTTTCTTCAGTTCTCACTATGTAGGTGCAGCAGCTACTTAGTCTCAGTAGGGAATAT
ATGGTCTATGGCTTGACATCTTAACTGCAATCAATGCAGACTCGGACTATGGAACCGCTC
AGCTAAACGGCAGGAGACTAAAGGTGTGCACTCTCAGACAGAACCTGTAAAAGTGCACTA
CATTTCACAGATCAGCATAATATACAAACACCACGTATACCCTCTGCTTCACACAATTTT
CCGAATGAAAATTTCCTTTTGTTCAGTATAGCTTAAACTCTCAAGGAAGGATACCTAAGT
TGTGTTCCCTGTATACCTTCTCCAGGAAAGTGGACATGATGTTACCAACAGGAAGACTAG
GAACTTACAAGATGTAAAGACTGATGACTACCAACCTATCGACCCAAGTCCAAGCTCCAA
GGCAAGTATCAGGCCAGGTCCAATCGAGCATGGCACTCCTATTCTTCCTTATATGCCACG
GTTCCCGCCGCCTCCTGGTCAACCTAAGGACGCACGTTCTGCTCAATCCGCTGCCTCTCC
TGTCGCTTAGCTGAAAACTTTTATGAACTGCTGCAGAGGCGGTACTTGAAAAATTAGAGA
ACCACCATATGTCCAAAGTCTTCTTTGATGTTATGTTATGTGTCGTATGTGTGTTTACAC
TAGGTACTTGAATGGTGCATGTTCTTTGATGTCTCCATGTTTGGAATCACTTGGTGAGGG
ACAGTATTAGCTGTATTTGTGGGTGGTCAATTAGTCAACTGATCAAATCTTGAGGGCATG
CTTCTAGATTAGATAAGGTACCAGCATTATTCTGGGGCGCCCAGGTAAGCAGCACTGCTA
TTGTCATATGTAAATGTTATTGTTATGTTATAGCATAACTATGGTATTAGTCAGAACTGT
TTACTGAATACTTATGTTACCTTGGTACTTGGTTGAAGCAGTTATCCAATTTTCAGAAAA
CTATCAGTATTGGAATACTTATTTCGAGTGTGAATCATTGGGCAGGTGTATTCACTAATC
TAAGCCTCTTAGAGGATCCGGTTTGGAACGCGGAAATTTTTCTGGGCTCCAGATTGAACT
ATTTCCTGTGAAATTCTTCTTGTCCTATACATGCCCTAAAAGTTTATTCATCCACTTCTT
CCGTCAGCCATCTGTAAAGATGGTGGATTTGACAACCTACTGAAAGTGGTATTGTCAAAC
CGGGTTTCATAATTAAAGAAAGTTGTCACTTAAGCTCTAAGTGTTTCTCGTATAGGTGTT
CTCACATTTGAGAATCTTGTGATGAGGTTTTCTAAGTATGGAATCCTTTAGTTTCGGTCG
GTATAATGAGAGAGATGGCTAGTTACAAGTTAGTCCAAGTCATTTCCAAAGACGCTTTCT
GAATATAATAGGCGAGTATACAAACATGTCCTGATTACATTTTGCACATTCACCTACCAA
TACCATACCCTTTTGTGTATCCTGTGACACCCTATTGCGCACATGCTGATTTCTTTATTC
TTGATTTGCCTTAGAAACTAAGGATCATGTGTTAATCAGCAAACGAAGGATGCTACCTAT
CTGTACTGTCTTCGCAACTTCCTGCAAGCGTGTGTTCAATTGTATAGCATATTTGACTTG
ATGATAGTAGAATTAAGCTGCAATTTAGTTGATGTGGGTATGCAGCTGCAAAAAAAGGCA
ACAAAACTTAGTTTGTCAAATCAAATTTACACCTGCCAAAACACTTTCAAAACCAGACAA
TATCATTTTGCCGACATCGGAGAAGAAGGAATATAGCATGGTTCTTCTTTAGTAAAATAT
ATGATATAATGCTGACATATAATATTAGCTTATCTATTGATGTAATGTATCAATTTTGTA
GAGCTGGTTGTTGGGATTTCCGGGATTGCTTTCAACTTAAGTTCAGACAAGCAGAACAAA
CTAATGGTGATTGACTGATGGTTCCCCTTATACCGGTCTCTTCCTTTCAAGCTTTGTTCA
TCTGTCCCACTGACACAAAGAGATGTCATAATATCATATGATCTATTATATGATACATGT
CACTGTTTTGTCTTCCGGAACAAATATTTGTCAAAAGTAAATTTGACCACAAACATCTTC
TTGGAATGAACTTGGTTACCAAAGGCATGTTCTGTTATATTAAGAATGCGTGCTCTAGAT
CAAAAGCAAGCAGAACCAAACATGCACATTACCTGCCAGGGCACAGCCTGTTCATAATCT
TATTTAAAAAATACTACCAATGTCGATTCACACGCGGAGAAAAGAATCGATATGTCATCA
GCAACTTGGATAAGCTAGGGTGACATGAGACCTAATCACCAAGCAACACTAGCAACAACC
TTGATTACTATCATGACTTCATGAGTCATGACATGCATCTTCCTTCTGCTTCAAGGTATA
ATCACATCTCAGAGTTCTAGTTAATAAAGTCCACATGCACATTGTATCCACCACTATGGA
CCTTTGTATGAGAAACTACTCATGCATGCATCCTCTTTTTTTATCCACTATAGGCAGTGA
GCTTCAATTACCTCTCCACTGGCAGCCTTCAACTATGTCACTTTGGGGCTTGAGTGACCA
AATTATGCCCATTAGGTGACACCTACTTTCAGTGATAGGCCTATTACTGCAAACAGCCTA
GCTGACAAGCTTTGTGATGGACAATAATTGTGGTTGAGCACCGGTGTTAAGACTCAGCAA
TCACAAAAAACGCCCTTTGCTGACACCTTAGCTGCTAATGGTGACGCATTGTGCGACTTG
GAGCGAGAACCGATGGTGTTGTTTCATTCAACAGTATTCGCGGCCCTATGGATACAGTGA
CAAGAGGTTGTTCAGAAGCTGTTGAGTTTGCGGTGACATTTTTCCAAACCATGGGTTCGC
AGCGGTACAATTATCGCAATCGGAAACGGACATTTCAGAGGGGCGTATATCTGAATTTAC
CTTTGGGAAACACTCATGCGCCTATCCCCTTTTGTCCTCTGATGACACAGCATTTCTTTG
AATCATTCTTCTAAATAAATGGCATTGTGCTGCGACTGAAGTCAAATCACGTTTATTTTC
GAAACCGTTATGTTTCCTTTCCTTTTTCTTATTTTTTGTATCATACTTATGTGCCCATCC
ATATCCTTGCTGACTGATGATTCCAATGTCAGTAACGTCGTCTTGCTGCATATGTGGATG
ATATCCATGGTGTATATCTTACGCTCGAAACTAATAGTAGGAAATATATTTCTAGTAAGC
TTATTACAGAGCGACAAGGATGTGCTTATTTTGTTTTCTTGGTCCAACAAGAAGCATCTG
TCTCATGGAAGGCAAGGGTTTGCATTGCTCCATCTGTTCATGAGAGCTTTAAAAGAGGAA
AGTGGGATCCCAGTTTGACAAATTCTCAAGCCTCAAGCGAGAATAGATTCTAAAACAAGC
CAAAATGCTGCTTTTTTCCCTGAGCCTTATTTGAAGCAACTGCATCTTAGCATCCTCCGA
GTGTTTCATTCCCCGATCCAAGCAAAGCTATGCCGAAGCCTAAAGAACGGAGACTCTCTT
TCCAGGAACTGAATCAACCGATCAGAACAGACTGCAGCACCGAATTCCAAGCTTGTGAAA
CTGAAACCTCACTCTGATGTTACATCCAAATGCACCATTCTATGCCCAGATCCTCTGTAC
GTACCAAGCATGGAACATGACAAGCGCAAGCAAGGACAGCCGGCCACTGAGAACAAGAAT
GATAAAGACAATTTTGGCTCAATTCAGACGATTTTTGGGACCATTCGAAATTGTAAACGG
AGGCGTAAGCGGAAGATTAGGCGGTCGAGACGAGCTCTTGGCGCACGCTTGCCGAGCTGT
CTGCATTGCACGCCGTGAGATGCTCGCTCGCTCCTTATCTGAAAGCTGGGGAGCAATCGT
CCCAGTGACGCTGCGTTGGTGCAAAGGCATAGGCATGATAGACAATAATGCCTGCCATGC
CCCGGGGTTTAGCCCAGTTGAGCTCCTATTCTTTTGGCAGTAGTCAGTGCTAAGTCATGT
GCTCTTGAGAGATACTCATGCCTTCCCTCTGCTTTCCCTCGATGCTTTGGTAATGCAAAC
CTGTGAGCTCTTTTTTCTTTTCTTTTCTGTAGCGGGTTAACAACGAACCTGTGAGCTCTT
AATTTGTGCCTTGGTTCTCTAACCGCTCGCTCATCAGTGCTGGTGCTCCTACATGAGACT
TACATGTTCCTTCCTGATTTTCTCTGTGAACTCAGGTACTTACACAGTGCAAATTGCACT
ACCATTTTGAGTGTGGTAAGCAGCAACTGGCTAGTACAGTACGTAAGAGTACATCAAACT
TTACTTTGAGGCTACTGCTATACTTAACCACTAGACTACTCGCTAGCTAGCAGTAGTACT
TCATGAGATGTGTAAACGCCAAGTGCTAATTAATGCGGTAGTGCATGGTCCTGGAGCTAC
ATTTGGCTTCTTTCTTTTGGTATCCACTGCTCCTCTATGCTCAACTAAAAGCCACTCAGC
AGTAACACTGCCGTGGTTAGTTAATAGCCACCGAACAGTGACGCCGCCGTGAATTGATAG
CACGCAGTGGAGCACGTTTCCAGTCTCTCTCCATGTAGTACAGCGATCTACTACCACTAC
GAGGACGAACCTTCTTCACCAGCTAGATAGCCAGCCGGCCAGTACAAAGGCGTCCAGCTC
TACTAAGATTCCGCCGCTTTATACCGTGTCTGTGCGGTCAGATACCAGTCGCCTTTGCAC
CCATATGCCATATAGTGCACATGCATCGGCACATGGCCAAAATGCCAACGTGATACATTC
ACTCACAGACGCAGGCTAACGACATAACCAATGATTAATCAGTGCTGATGAAGGAGAGGG
GAGAAGATATGTGATGTGTCTTTGGGGAAAGCCGATCCACTGTTCCAATCTGTAAACTAA
AGGAGGCACGGCAGTGTGCCCCATGAGGCCGAGGCCATGACCGACCGATTAAAAAGCGCA
TCATAAAAAAAGATTAGCAGATCCTCCTTAGAAGCAAAGGGGAGAGGAGGAGGGAAAGGT
ATGTATGTATTGTGTGCGGTCTTGCAGAGGGAAGGGAGCTAGCTGTGTGGGGGCCTGACG
AAGCTTAACTCGCAAATAACAGCCGCTTTTAAGGGCCCTCGACCTGCTTGCTCGCTGGGT
TTTGGAGCCTAGCATTTCGTCTTCTGGGAGGTCAGCCAAGATCTTCTCGTCTTCTGGGAG
GCAGGGCAGGCAGGCAGGCCGGATTTCATCTGAAGAAGATTAGGCTTCTCGGCCGCATTG
CATTTCCATATCAGGTACCACTGAAACCTATGCAGCCTTTGAAAACTCAGACTTGTTCTT
CCTCATCCTTACCGTGATGGCAGTCTTGTTTGGTCTCCTTCTCGTTTTGTTTGGAATCTT
GAAGCTTTCCGTCCCGTTCTTTTTCTCTTATGGTGCATGCCATTGCTGCATCTGTTGTTC
ATTTTTCCCTGATCGCAGTTTGCGACGTAGCTCGTGAACTGGAAACGGAACCATGCACTG
CATTTCGCAACTTCAGTTACACGTTGTCGGATTGCCCGACCCTCTTTCGGCTAGATAACG
AGCTAACAGGTTCCATAGGACAACCGAAGCTGAGGTTAATCTTCAGACTGCTGCTCAACT
TACCGGGCGTCATTAACAACAAGGTCATTTGTTAAGAGCTTTTTTACGGTACCCTATACT
GAGGCAACAGTATATTTCTAATCTCACCGTTGATTTCATATGGGTAATATAGACTTTTTT
AGTTTTCACGGTAAAAAAT