Map Locations of contig_78292 (7629 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_78292

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_78016 1 775 bp None Available Available None
MLOC_78015 1 1717 bp MLOC_78015.1 Available Available LOC_Os03g18810.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13103.m02251 protein aminotransferase, classes I and II, domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_78016






CDS Structure of MLOC_78015






Contig Sequence (7629 bp)

>contig_78292 7629 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCTACCTAGTGTATTGGGGATAAATAGGGATTTGAAGGGATTGAGTGAAGGTTGGAGTT
TCACCCAACCCCTTGAGAATTATTCCCACCAATCTCCTCAAAAACACTAGTACCAAACAA
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CGTCCATGCGACCTTTTGACGCACATGGCGTAGCTCCCAAGTCGTTTCCTCTCTAGATGT
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TGCATATTTGTGATTCCCAAACCTTAAGTGATGTTTGTGGTGACATACTTGCTACATGTC
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TATGTTTCTTGATTTAACTGCTTACCATTTTCTGGAGATCTTAAGAATTTACCAACATGT
CTGGTCCAGTTTTCTTAGGACCGCTAACAAATTATTTCCATCAAATATGTCAGGCTAGAC
CTGTATCATTATGGTTTGTTGATGTGTAGGTTGCCCTCGAGACAGCATCTTTCTCTAAAT
ATGCTGGGTTCACCGGTGTCCGACTGGGATGGACTGTGGTCCCCAAGGAGCTCCTTTTCG
CTGATGGGCATCCAGTTGCTAAAGATTTCAACCGCATAGTCTGCACTTCCTTCAATGGCG
CATCGACAATCTCTCAGGCCGGTGGTTTAGGCTGCCTCTCTGCAGAGGGTCTAAAGGTAG
CGGTTCAGTGCTTTGAAATCTTTATTAGTATATGGCTTCTTTTCGCTGTGCTGCTTCTCA
TCCAAAGTCCACCATGCAGGCTATGCAAGAGGTTGTTGGATTCTACAAGGAGAATACTAA
AATCATCGTTGACACGTTTACGTCGCTTGGATTCAACGTCTATGGTGCCAAGAATGCCCC
CTATGTGTGGGTGCACTTCCCTGGCCGCAATTCTTGGGATGTCTTTGCTGAGATCCTTGA
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CCAGCCAATAAGAACCCAGCAGCATTTGGAACACCAGATTTGCTCCTGGGCTTCTGGGAA
CTGGGAAGTGTTAGAACAGAGACAGGGTATTGTTTTTGCTCCTCTAGATGTTACTCTTTT
CATAACCATTTAATACTGGAAATTTGCTTGTTCAATTGTGCTGTGGAGCCTGTATCATGA
TGTATTTGTCTCGCATCTGCTCGTCTTCAGCATTATGCTTTTCCTACGATGGTGTGCATC
TCCCATTTCTCTCCTATATATCTATATATCTATTAAAAAGAACCATCATAAGCCAGCCTT
GCCAATGCTCATCAATTTCCAGTGTACTCTTTTATAATTCTTCACCTAGTATTTCGTCTT
CCATGTCTGCTTCCTCTGTTGCATCACCTGTTTCTTCATCACCATCAGCTCCACCCTCAT
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AAAGCCTCCTTCTGGAGCAACTCTGCTCCTTGCTTCAGCATCATTTTGCTGGCCCGCCCA
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GAAAAAGCCATGACTACTTTCAGCCCAAACCTATTCTTGCAGCAGATCACTGGAAGAATA
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AGCACAGGGAAGAGAATTCATTGGGGCATGAGCACTAATAACTCGCAGCGTCGAGGGAAG
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TGACCATGTGACGGCATAGGATACTGAAACTGAACACCGACAAGATCCATGGCAGCACCA
CACAACGCATGGGGCCAAAAGTTACAGGCTCCTCTACTAGGAGATGGAGAACTCTACTAG
TACTAGGAGAAGCTAACCGAATTATCCTATGAAAATGAACCAGACAAGCCTTGAGTGATT
TGCTTCACTCAAGACAAACTTGCTACACTACGTCCAAAGCATAGTTAAAACTAACAAATC
CGCTCGGGCGAATTTGCAGATAGACTAGAAAATGAAAAACATAGCAGCTCATCCACAAGA
AGATACTCCATAATCTCATGACGAGGAAATCATCACTAATATATAGACCAATTTTCACAT
CAACTCTCAATTTGGTCAGAACATCAAAGTAGACAAAAACTGATGAATTGCATACCAGCC
ATATTATGTGCTTCAAAACTAAACTGATGAAGATGAAGCCAGGACACATCAGGCAGGTAC
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TACCACCAATGGCAATGCAAATAGGAAAGCAAAATAATTGGCTCAGAGGGGCGACCATAT
CCTACTGAAGAAGAACCAATAAGCACATGACGAATAACCTTTAGGGAAGTGAAATGTACA
CTTACAACAAATGAAAACCCTAACTGTTTTACCGATAACAAATACAACCTCTGTACACTA
ATATAAAACGTTTTTACAGTTTAATTTGAAACGTCTTAATTAGTTTACAGAGGGAGTAAA
TAGGAAATCCATAGAGCTATTCAGCTGAGTACCCTCGTCTAACTCGATTTCTAGAAGCGG
AAGGCATAGATTGTGCCATCAATAACATAACTTCATCCTCTAACATTTCACAGTACAACA
TAGATATCCATCCCGCGATACCAAAACCAAATTTCCTTGTTACCCTGATTCTACAAAAAA
GAACAATTATAGGATTTTGATCCAAGAGAATCTAGAACGAACGAACAAAATAAACGTGGA
CGTAGTGTACTATAGTTATCACGTTGTAGCAGTCTTGACGGCCTTGAATGCTGGGTGGAG
CAACCCGTAATCATCCTTCATATCAAGAGGGTTACTGGTCTCATTCCTGATCCTCTTGAT
CCTCCTGCT