Map Locations of contig_7601 (9309 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_7601

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_77520 2 1678 bp MLOC_77520.1 Available Available LOC_Os04g46020.1, FRAME:-1, EVALUE:8e-127, 13104.m04622 protein GATA zinc finger domain containing protein, expressed





CDS Structure of MLOC_77520






Contig Sequence (9309 bp)

>contig_7601 9309 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGGGGGGGGGGGGGGGTCTAGAAGGAGCTACAACGGATGAGAGCGATAACGTATAAAG
CAACAAATGTGGACGTGTGACCTCTAAAAAGCGCGGGAAAGTTTAAATTTGTACATTTTA
ATGCATCATCAATTAATACAAAACCAGTTGAAACATAGTAGAGAACTAAGAGCATCGAAA
ATTTAAATAAGTATGATAATGTTATTGCAATATGATTGCCTTATGTGGCGTCGCACGATT
TACCCTACTAAAAAAAGAGCTAACGGAGCGAAGGCACTCACATGAGCGATCCCATGACTC
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GGCATAATACCATGCACTCTTACCTGTTCCCTTCCTCGATAACCCCTACCCCGGGCGCAA
CAGGAGGGACAAGAAGCTCAAAGTTTGGCTAGTCCTCGATTCGATGGGTGACAACCATGA
AGCCTCTCGGAGGCCAATGATAGAGAGGAAGGTTTCCGACGAGCTACAACAGATGAGAGT
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TGTGACGTGGCACGATTTACCCTAAAATGGAAGCTAGGGGAGTGTAGTTACTCATATGAG
CACTCCCGTGACTCGCCTCCCCCCGCCTCCACCTATCACCCTCCACAACATGACCTCACT
GGAGAGCACACTGCTCATTTCACCAGCATTCTACCCCACACTCTTATCAGCTCTCCTACC
ATGTTATCGGCCCCTATCTCAGGCGTGATGGAAGGGGCGAGAAGCTCAAAGTTCAGCTAA
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ATCACCAACGAGCTACAACGGATTAGAGCGGCAAGGTTTCAAGCGGCGACTGCAGACATG
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ATACAAGGCGACTTGAAACATCATAAAGAACTAAGAGCACAGGGAAATTTTAAACATGGT
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ATGAGTGACATTACTCATATGTGCGCTCATGTGACTCGCCTCTCCCCCGCCTTCACCTAC
CACCCTAGACCACATGGCTCCGTTGCGTGACATTCTATCCCAATCTTAGAGGTTCTCCTT
CCTTTTATTGGCCCCTATCTCGGGGGAGGGGGGAGGGAAGCTCAGAGTTTGGCTAAGAGT
GAATTACACTTTTTTACTTCATAGTTGTGCATTTATGACCCTTATTACCCCATTTAGTGA
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TCCTAGTCAGTGTCCTGATATTTGTGAGTCTCATTCATCAGCCCCACACTTTTCCAAATG
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TTAAATGGGGTAACTAGCGTCAAAAATGCATAACTAGGGGGTAAAAAGTGGAATTCACTC
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TGAGGGAGGTCACCGACGAGCTAAAGTGGATGAGAGCGACAAGGTATAAAGCATCGACTG
AGGACGTGTGACCTCTAAGAAGCGTCAGAAAGTTTAAACATGTATATTTTAAAACACATC
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AATTATGTTGATATTACTACAATCGAGGTTATATGGTGTGGCACAATTTACCCTAAAAAG
GAGCTACCAGAGCGGAGTTATTACTAAGAGCATCTCTAACAGCAACCCTTTACAGGGCGT
TATAGGGCAGAAAACGACCAAAAACGGTCTCGAACGGCTGCCCTAAATAGGTGAGTGGCC
AAAAAAAATTTAGGTCACTACCCTGAAATATAGCAAACTGATGTGTATTTAGGGCAGCAA
AGGGTCTGCCCCAAATTCCAACCCCACGCGCGCGCAGCTAATCGCCAACCGGACATTTCA
CGGTCCCGCCCCAGCGCAACACTGCTCCACCGCCCCGCACAAATCCGCTACCGGTAGACC
GCACCACCATCCAACGACCGCCGACCGTCCACCGCATGACCCTGCAGCAGTCCTAGGTCG
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TCCGCCATCGATTCGCGGCCGCCGCTACCTCGCTGTCGCTCGAACACGGTCCCCACGGCG
CCAGCAACTCCCTATGACGGTTGCATGGGCTAGCTGCGGCCAGACCGACGACTTCACTGC
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GCTATTGTCACGGGACCCGCGAGGTTTTGGGATCAAGAGATGCTTTGGTATATCATGACT
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GGCACCTATGAGTTGATGGGACGTCCGGTGTGTCCTAGGAGAGGTGGAGACCGGATTGAG
CGCTTCTTGGATGCCTACCACGACATTCGTGACGTTGATGTGCACATAGATCTTCACAAA
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ATTTATCATATTTTTTGTTGATATATATGTGCAAACATATATAAAATATGGAGGTAGTTT
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TGCTGGAAAAGCAGCTGCCATTTTTATGCCCTAAAATAGAAATAGGACAACCCTATAACA
CCCAAAGTGGTTGCCCTATAAAGGGCTGCTGTTAGAGATGCTCTAAGAGAGCGCTCCCAT
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GAAGACCATACCGCTCCCTTCACTGGCATTCTACCCCCACTCTTAGCGACTATCCTTCCC
TGTTATTGACCCCTATCTCAGGCATGGTTTGAGGGACGTGAAGCTCGAAGTTCGTATAAT
CCTCAATTTCAATCTGGGGGACAACCATGGAACCTCAGAGTCTGCTGACGTAAAGGGAGG
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ATATGATTCTGAACGGGAGTGCAATGATAGAAAGATGATATTTCTATATTGTTGGGCAAT
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CTGGAGTATTTAATTAATTTCACCATTACACATATACATATGCAAGTTAATTTTATTAAC
TTTGAAGCTTCCCAATTATTAATCTATTGAAAGGATATTTTTCTTCCATTCCGCCCCCTT
GAGAGTGGGGTGGGTGGGTCAAGAAAGATCATGTTAGTGGTACATGTGTAAAACATATAA
TTTTCTGTTCACGGTGCAAGGCATGCACCATGTTGATTTCATTAACAGATAGAAAACAGT
GTACAATTGTTTAATGATGGGCATAATATATGTTTAGAATATAGTAATTTCACATAATTT
TTAGAGCAACTCGCCAATGAATTAGGTTGTCCCCCATGTTTCATTATAATTTTTTTGCAT
GTATGACAACTAGCTACCATTTTAAACTAGCCATTCGTTGAATTAAAGTTGTGATACTCG
TGGAAAATGGAAGAGAAATGTGTGGCGTCTAAGAAGCGTGGGAAAGTTTAAACATGTGCA
TTTTTTTAAACCGCATCATCAATTAATATGAAGCAACTTGAAACGCCAAATAGAATTAAG
AGAGCAAGGGAAATTTACATAGGTATGGTATAAACACAACATAAGTAAATGCAAGCGGAC
TTCAAACGCCACACAGAACAATAGCAGGAGGCATCTGAGAATACGATGACTCGGTGTGGG
AGAGTTTAAACATGTACAAAGAGACTTCAAGCATCACACCGAATGATAAAAGCAATCAAC
ATCCACAACATATGAATTAGTTACAAAGCGCTGCCCATACTAGTTATATGTCTACTTTAA
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AAAATTCTTATTCCGAGATAGAAGTTTTAGAAAAATAAAGATACTGGAAACAGGGACCCA
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TTACAAACAACAAACTAACAAACAAAAATAGCTACATGGACAAAATAGTAAAAGAAGAGT
TCATTGGCAATATTGTTCTGCCTTTAACAAAAAATGGTTGTTTCTTTCAACGGCTTAGCA
TATTATCATCAATTATTTCTTGGGCTCCAACGCTTTAAACCCCCATCCTACACATCTCAC
AACAAATTGAATTGTTTGTATATGCAAATGTAATTGTTTGTACAAGATGATAAATACTCC
ATATAGAGGCCGACATATGTTTGTTTGCCAAGATAGTTACCTGGCAAATCCAAGGGTGTT
GCTTTTGAATATTTTGCACGGTTTGGGAATGTCTTCAAACTCTTACAATTCACTGTCACT
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AAACTACAAGTCGTTTTTTCTAGGGTTTGAGAGTAGGAGGCGGTTGCACTTTGCATTGAC
CCGCCCGCGCTACCACTTCCCTGTCGGTACAGTTATGGAAGGGTGAGGGAACCCTGGATT
TGTGTGGCGGGTTCGTGTCGCATAGGTGTTTCGAGTTCTTTGTTAACGGTGAATTTGGGG
CAGCGAAGGGGATGAGAATAATGGTTCCTCGACTTTTCCCATGTGGATGGCTTTCCATGA
GTAGGGGGATTGCGAACACACCACCTACGGCACACGAGGGTGTTGCTCTGATAATCGCGG
GCTTCTCCGCACCCAGATCTTCTCAGGACTGAGTGCCATCACGAGAGGCCATGCCGCCGC
CCGCTTTGATGACTGCACCTACAGCAGGTAGCTTCAAGCAATGCACTGTGAACTTTTTTT
TTTCAATTTCCATCTTTCCCATGATAGTAGGATTCTATCCATTCCCCATACATACAACAG
ATATACAAGTTACAATTTCTCCAGCCATATATATATGCTATACCAAAAAAAAATCAAGCC
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GATCCAGGAACCAAAATGTAAACAGAACTACCACTGATGCCTGTTCCTAAGCTGATCGCC
AACGGAACCAGGACTATGGTTGCGCGGAGGAGAGGCTGTGGTTACGGTCACGGAGCTGAG
CTGAGATGGTGGGGGGCCGCAGAGAAGAAGCTCTGCTTCCGAGTGCCGTGTGTTGCAAGG
GACCTCCAGCAGCAGCGAATCTTTGTCAGAATCCTTGTCCAAGGGATTCAGCATAGATGA
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GCCAGATTTCGGCAAACATGCGCTTCTTCTCAACTGACAAGAAGAAGCCATAGCCCTGGA
TCTCGAAGAAGCTATTGTCATGGTTCCACCTCTCACATCTGCATCTTCACAAACAGAACA
AAACCACAAGACATCTACATGTTACTTGCAAATAAGCCAAACACAGAAATTGTAAAAACT
ATACGAAAATCAAGTGTACATTTTCAGATGCGCAGAATCTACAAAATGTATCTGCAGTGC
AGAAGCAGAGGAGCCAAGACTGCTGACCTGTGAAGCTTTGCGGCTGGCTTTCATAAGGTC
TTTTGAGAGACCTCATGCTTGACTTGGTAAGGCCTCTGAAACCGCCGCCTGCATCTCCTC
TTCCTTCAACTTCCTTGCTGTAATTGTCCTAAATAAAGAGATAGATACATAACCACTGAG
TCAGGTACTGCATATATGTAAGGGAAGACAAAACCACCCAACGGCAAGGTGAACTCAAAA
GGCCTTCGTAGGTCGGATAAGGCACCTCTAAAGTTACTGAAACTAAAGCTGAATCTGTGC
TCTCCAGGGTATGCTGGTTCGAATAATGAAGCTCGTCCCTGCAAAAAGATTAAAAAAAAG
TAATTACATTGATTCATACCATAATAGCTTCTCTGCATTAGTATCGAATGTGGGACCGTG
GACACAGGGCAGCAACGAATGCTCAGCACAAACATTTTAGGCTAAAAAGAGTGTAAAATA
CCTTTTAGCACTGTCATGTGTCTGCATCGGTGACCACTTTAGCTTCTCAGATGCAGCATT
TGAGTTGCTCGCTCCCTTGATTTCACTATGCGCAATGAATGAGGCAGAACCTGAATAGGA
TTCGCTCGTAATGTATGACTTGCTATCTGCAGGAACAGAGTTTGCTTCTGACTCTTCCTC
TACTGATTTCGAGTTCGGATATCTAAGAAGCACACTCCCATAACCGATCTCAAAGGAGCC
AACGGGAGTTTCACTATGATAAAGCAGGTCTTCCTCTGTGGATCCTGCTGAAAGGCAATA
TAACTTTTCTTCCTGCAATATGGAGTTGAGATCCTCTACAAGCTCTTCCACGGGTGACGG
CTTAGGACGAGTGACACAACTCCTTTTTCTTGATGGTACTAGTGAATCCCAAGCACGTGA
CTGAGCTGAACCTGAATTTGAATGATACCAGAAAACCCACCATTAGCAAACCTAACAATA
GTTGTGAAAGAAGTCGTCCAAAAAGAGAGCTTCTTATTCTGATTCTTTTACAGCGGATTT
CAAGCCTCAAGTTTGATTCTTATATTATATGTTTGAATTGAACCGAATTATAAGGTCCAC
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TTAGAGGAAACTGACCGGCTATTTCACACGCATCAACAGAACCATATGGGGCACAACTCT
CTGAATATGACACCGCTGATCCAGAACCAGATCGATTGCTTGTGTCCGCATTCCCCATCT
TCCAGAAGTTCTGATCAGAACATGGTTCATCCTGGACTATGCTGCGGTTTGGTCTTTTCT
TGGGCTGTTTCTGTCCCTTATGCTTCAGCTTGTCAGCATCAGTATCTTCCCAACGATGCG
CCGGTGTGTAATTCACCAACGTACCCTTTATCCTCCATCTTGACCCACACGCATTGCAGA
GAACTGGCTTGTCTGGTGGCCCGTTTCGCCAAAGAGGAGTACCTGTATCAGCAGCATTTG
CCATGAGCAATAAGAAATACAATACAAAACTGATGCCCCAAGTATCTGTGCAATGTACAT
AGTCCCTTGGAAGTTAACTGAAGTTTGCACCGGCATTAATTGGGGAAGGGAACATAAAAC
AACAGAGGGGAAGAGTACATATCGAAGAATGTATCTTTGAGGGAGGCAATAAATAAGTAA
TCCCACAAGCATACATAGTCAAATTGCATATTTCAGGTATTGTTTTCAACTGTAAGTAAT
ACATGCAAGCATGTGATTTTCCATGTGCTGTCCTACTGAATCATGCCTAGCAAATGCATA
TGGTCAGTTGAATTGAGCAGCTCTGCTTCATAGCTCACATGACAGAGAGCAGCAGAAACT
AAGCATTTTTCTGAGACTGCAGCAGCAGAAAATAAGTATGTAGGGAACTCTGAATAATAA
CTGCAGCTAGTATTAAGTTGTTTTCTTCTTGTAAGCCAAGAGTGTCAGCTGGATCTAATT
GCTCACTATCAGCAGCACAAACCTCTTACCTGACAAGCAAGCAAGCAAGCATGGTCAAAA
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CACACACACACACACAGGTTCTAGACCTCAACCGTATCCATATTGAATCCAAAGAAGAAG
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CAACGCCCACGCCCACGCCCACGCCCACGAACAAAGATGGGAAATTTTTGAGCAAAAAAA
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