Map Locations of contig_7596 (8676 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_7596

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_77509 11 1221 bp AK361266 Available Available None





CDS Structure of MLOC_77509






Contig Sequence (8676 bp)

>contig_7596 8676 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTCTTAAGCGCAAGTCCGATGTGTTTTATGTTTTCTTACAATTCCAAGCGCATATTGAGC
GTCTCCTTAGCCACAAAATTATTCATGTGCAACCTGATTGGTGTCGTGAGTATCCCAACC
TCAACGCGTTCTTTACTAAGCTTGGAATTACTCATAGTGTGTCTTGTCCTCATACACATC
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TCCATATAACCAATGCAAGTTGGAGTTTCGGTCTAATCAGTGCATGTTTCTTGGCTATAG
TTCTCTTCATAAAGGGTGCAAGTGTCTTCATGTTGTCTCTCACCGCACCTGCGCCACTCG
CTCGTGATGTGGTGTTTGATGAGAATGTTTTTCCTTTTGCCGCACCTCCAGTCGTCTCCA
CCACTCCCACCGCACCCGCGCCACTCGCTTTACCATTGCCTGGTCAATTTGTTGATGCTG
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AGCTTCTAGACGAGCAGCCGCCTGCTGCGTCTTCTCTTCCACCTGCGGCTCAGCCGGTTG
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CCTCTGCCGCTGGGGCTACGCTCTGGCTTCGGAGCCGGCGTCTTCGCCACCCCAGTCTTC
GCCGTCGCCTCCACCACCTGCTGCTCCTCTGTGTCCTCGTACGCGGAGTCAGAGTGGTAT
TGTTCGGCCGAAGGAACGTACTGATGGCACATTTGCATGGATTGCAGCGTGCATGGCACA
GATGACTGCTGATCCCACGTCCGAGTCTCGTCATTTTCAGGCAACTCTTCGGATTCCTCA
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TGATCCAGCTCGTCCACATCATTTGTGTCGTCTTCTTAAGGCGCTTTATGGACTCAAGCA
GGCTCCTCGTGCATGGCATGCCCGACTCGGCTTGGTTCTTCGACAGCTTGGGTTTACTCC
GTCCATTGCTGACACATCCCTGTTCCTGTTTCGTCGTCCTGAGGTGACTGTGTACCTGTT
GGTCTACGTTGATGACATTATTCTTATTAGCTCGTCCGTGGCTGCTGCGGATCGCCTGCT
TTCTGTTTTCAGTGGTCACTTTGCCGTCAAGGATCTGGGGGCTCCCCATTACTTTCTTGG
CCTGAAGGTTTCACGGTCTTCTGCTGGCCTGACTCTCACTCAACATAAGTACTCTCTGGA
TCTGCTACGCCGTGCAGGTATGTTGCGCTGCAAACATGCTCCTCGGACTTCGCACTGGTC
AGCTGTGAAGCGTATCTTGCGTTACCTCTCTCATACTGTCTCATATGGCTTGCATCTTCG
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TGCACGTAAGCAGGCCACAATATCTCGGAGTAGCACTGAAGCAGAGTACAAGGCAGTTGC
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ACAGCAGCCACCCGTTCTTTGGTGTGATAATATTGGTGCAACATATCTGTCATCTAATCC
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TGCACAGAAGCTTCTTCATATCAAGTTCATCTCTTCCAAGGATCAACTTCCTGACATCTT
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TTTTGCATACTTGGTTATTCAGTACTCCCTCTGTAAAGAAATATANNNNNNNNNNNATCA
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TGGTAGCGACGGATAATTTTTTATGAAAACGCGCCAACATGTGATCTTATTTTGAAACCC
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TGCTCTCTCCTTGCATAGATTTCTCGGTAGACATCGTCAACGCTGTAAGACTAAGTGGGG
GATGTGCCCCATTTAGAGGCACGCACTGCCACTTGATTATCCTCCTACGCGGATCGGAAT
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GATCTGAGATATCTACTTTATAGATGCCGTTTTAGCAGAATGTTACTTCACTGCTATCTT
TTTATATAGTACACGTACTCCCTTCGATCGGAAATAAGTGTCATGGTTTTAGTTCAAATT
TGAACTAAAAGCACGACACTTATTTCCAATCGGAGGGAGTATATATTTTTCCTTAGTGTA
AAAATTGTGGAATTGTGTTCCTAGCTAAAGTCATACTTCTGAGTTTCTCCATGGCATCCC
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TACTATTGGCTGCACGAGATAGAACTTTAAAGAAGCATGGAAAAAAATCCCTTGAAAAAT
TAGTAGTTTATGCATCTGATCAGACACATTCTGCTCTGCAAAAGGCATGCCAGGTATCCA
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TGTTCTTCAAGTTTGAAGTTATTTCAAAGAATTACAGTTAGGTAGTTAGATTAATATGCA
TTATGTTCATGTTCTTTTTGTTTATTTCCTGTTGACCTGAGGTAACATTCTTCTGTTAAA
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TGCTGTTGCACCTGAAGCAGTGACAGAGGCCATTTCCGTTGACTTGTCATCTGGTTTGAT
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TTTGAATTAGATAATGGAAAACTTGTATTTGAATTTCAACATTGATATTGCTAGAGATAT
ATGCATTGTTGTTTTCCGTTTGTATTAGGATTCCTACTTATCTCCTCTCTAGTACATGTA
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ATACTATTTTAGTGAACTACTTGAGTTAATATATACTCCCTCCGTTCACAAATATAAAAT
GTTTTGTATATTTTTAATATACTGGTATCCATGGCATGGTCACTAAGCAGTTGTCCTTTT
TGTGTCTCATAAATGAGATTGAATTTGATCCTTACATTTTGCATTGGATATAGGACATCC
CTTTTCTATACCTACTGATTATATATGAAGTTTTGGGAACTTCTATACCATATTGTCCCA
GGATTGCAACCAGGCCATCCTGATCATATAAGCCATTGTAATAGATATGAAAATTATGGT
GTTTGCAATGTACGAACTGCCCCCACACAGAATCAGGTTTGCAGTTATTTCCACCCGAAA
GATATTGCTTTAAAGGCTTAACATCATACTCTTAAGGCCTTATTCGGTTAACAGGGAATT
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TCCTTTCCAGTCCCTTTGAGAAGGGGTGTAACTGACCAAGCCTAAAGGCAGTGGGGCCAG
TTTGTTTACATTAGATAATTCCACTACCACTTATGTGTCCAGTGCATTTGTTAGCTGTGT
AGTTTCCCCTTTACATAGGCTTCTATTTGCATATGTACTGGTTACTTAAACGATGCCCTA
TGATCAAGAAAACAAGATTATCATGTAACACATGAGCTAGTCTTAGAGGTGAGACTAGGA
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CCGGGCAGCCATGGCGTAGGAGGGGAGGGCGGAGCGCGTTTAGAAGCACCCCCTTGCCGC
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CACTGGTGGAGATTGCCAGGCTCCGATACTAAACTAGTACGAACCTTAAACATGATTGCA
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ATAGAATGGGTAACTGCATAACGCCGTAACAGAACAGTAGGAAGACATATATTTGGGCTT
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TAAGGAACTACCAACTTGCGTACCAGGAAACTAATTATAGTAAAATCCCTACTTGCTAAA
GGTAACTAAGATACTTATCTCTAGCCACTCTTTATAACATGATTACATGATGATGTTACA
AAAGATAAACTGGAATGGTGTTCTCTGGTGTGTAATAAGCTTAGCTTTTTATCTGGTAAC
ACATATTTTTGCTCCTTGCTTACTTTCTAAGGACAGCTCTTATTTGTTTCAGGTAGGCAC
AACATCTTCATCTGCCGTGGACCCCTTGCCTGAACTAGGAAACATAGCACAGGTGTTTAG
GCCCATTGGTTGTGATAATTAGGAAATTAGAATTGTATAATGAAGTAATCTAATCTGTCT
GTATTTGATACTTTCTCTTGCTATATCTTCTGCAAGTATTTTCCAAAAAATTGACGATCT
TCTGCCAGGTAGGAATAGAACACAGTTGTGTTGGTGCTAGTTTGGAACCTAGTTATGTGC
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GTTTCCCAGAAATTTTAGATGGGACCAGAAACTTGAAAAATAATCCTTGTAAATTGATTT
TTCCCCATATGTTAATCCTAATCAATCTAAATTTGCAGTGGAGCTAAAACTAAGTATTTA
TCAGCTCTCTAGTGGGAACCTATACTGTCCTATGTCTGGGATTTTTCTGGAGCATGGTTT
TGGGATGCTGGTTGCATCCCCATTGTCATTAGCAACCTTGTTTGCGTAGGACTTTTGCAA
ATTGTACATATTGTTATTCATGAATGTACTTTCACTAATTGTTTCTGTTTATAATTTTTG
TTAGGGCCATGACATGTGGTTCCATATTGATGCTGCATATGCTGGAAGTGCTTGTATATG
CCCAGAGTATCGACATCACCTTGATGGAGTGGAAAAAGCTGATTCATTCAATATGAATGC
ACACAAATGGTTCCTCACAAACTTTGACTGTTCTTTGCTATGGGTTAAGGTAAGCCATGT
GATAATGTTCCAATTGGGATAACATGATTTGCGCATCTAAATAATGTTGATTTCTTGTTT
TTTCTAAGTATATCAATATTGGTAATGCACAAACTGACATCACACATAACAAACAGGACA
GGAGTTATCTTGTAGAAGCATTGTCTACATATCCAGAGTTTCTTAAGAATAAGGTTAAGA
TCTCCTTCCCTTCCTATGTTTTTCTCTTGGAGATTTTCATCATTTCATGGAAGTGGACTT
TAATCTACTTTCTGAACTGAATTATGAATGCTTGTTCATTTATCTTTTTTTCTCGTACAT
GCATCAAAGCACATGTCTTTTTGTATTAGGAGCAAGCGTTGAAACGATGCGCATCTTATA
TAACTCAAAGCAACAAAAAGAAAACGAAATTTAACAAAGAACTAAACCCAGGCAAAGAAA
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CGCTCCCCCCCCCCCTGCGGGCGACGGGCGGACTCT