Map Locations of contig_7499 (7917 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_7499

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_77271 1 2460 bp AK373165 Available Available None





CDS Structure of MLOC_77271






Contig Sequence (7917 bp)

>contig_7499 7917 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATAGGATCGCATCTTGGACGTTACACACATGTCTTGAAATTGTATCATGGGTGAGGCCAT
GTTCATGACTAAGATTTTGTCCCACTAGCACGTCATGAGCCCACCCATTACAAAATATTA
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TTGATTAAGCATGTTCAGTATTGATGCTATCGTTAAACTGGGTTGTGCGTACAGGTAATT
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AGCTTGACAGTTGGGCATAGCATTCTTGACACCGGTACTATTTACTTGTAAAAAGCTCAT
AAGCTATTGTATTTCTTCTAAACTTCTGCGGGTCTGAAAATTTTCATTGCCATGTGAGAG
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CGATAAAGATGGCAGTGGTTACATTACTCAAGATGAACTGCAAAAAGCATGTGAAGAGTT
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TAGATTCATTCTCAATATGAAATGTATTAGATACTAGAGATAAAGAAGTTTATCCCCTTT
TCTGTCTCCAGGATGGCCGGATCGACTACAATGAATTTGTAACAATGATGCAGAAGGGAA
ATAATCCACTAGGGAAAAAGGGACAAGGGCAGACGAGCTTTGGTCTTAGGGAAGCATTGA
AGATACGCTAGTGGTAACTGATCTATGCTCTTTCACTTTTCTCACTTTATGTTGGATGGT
TCGATTTATATAGTGCCTTACTCATCAGATATTGTTTTAACTGCCCACAGTACATTGTTT
GGTCTATGTGCCCCAGTCATTTGCTATGCTAATGATAGTGTGGCCTGAAGGATCCGCCCC
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TGCCATTTTTCAATCAGAAGGGATCACCCTGCTTGTAGATTGCGTGTATCTAGTTTTGGC
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GTAGTATTGAATTTGAATGGAAGATAGAAGCTGGTGTTTTTTTTTTCCTGTGCTTGCTCT
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GTTTCCCCGCATCGCCTTCCTGTTGGAGCCCTGTCCAATATAAAATGAACGAACACATTG
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GCAAAAAAATTACACCAGGAAAAATATTGACTATGAATTGGGGCAGCATTCAGTCCGCAG
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TAATTTTGCTTTCCAGATCCACTTATAATGACATCCATGAAGTGGTTTCTCCAACCACTT
ATACATGGATTTGGTAGTAAACTTGCCATCACCAGTGAAGCACCAGGACACTCTATCACT
ATCACGAGTTAGCGCAATACTAGAAATAGTATCATGCATCTCTCTCCATTGAACTCTAAG
CTCCGGGTTTAACCTTCTTCTAAAGAAGGAATAATCATCCATCGAGCACATATTCTCCAC
AGTGCAATCATGTTCATTACAAATATCAAACAACAAAGGAAATTGATCCTTTAATGAGGG
AAGCCCATTAATTGAATCCTGCCATATCCTGGCAACATTTCTGGACTCAATTTTAATTTT
CCTCCCCACAAAATAGTAATCCTTGACTTTAAGAATCGCTTTCCAGCATGGTGAGTTAGA
GAATCTGGGCTTAATAGTAGCCACAGATTTGTTTCGGAGATATCTAGCTTTAATAATATC
TTGACAGACCCCCTTCTCGGTCTCCAACTTCCACCACCACTTAACCATCAAATTAATATT
TTGCTTACGGAGGTACTTAACCCCGAGGCCCCCTTTTTGCTTAGATCTGCACACCCTGTT
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ATGCTCATCTAGTTTTTCAAATGATTTATTCATGAGCCACATAGACATGTGATAAATGGA
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AATCCAAGCCTCAAACCATTTCATATATCTCTCCACTATGAATTCCTAGTCAAAATTCTT
TAGCGTGGTATAGCTAACAGACATACCAAGATATTTAATTGGGAACTTGCCAATATCACA
GTTAAACAGATCAGTATAAGATTTCACCACACTATCACCCCCCCCCCCCCCCCCCCC