Map Locations of contig_74615 (3343 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_74615

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_77170 2 2819 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_77170






Contig Sequence (3343 bp)

>contig_74615 3343 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCCCGGCATGCAGATGCTTACCTATAATTAGGTAATTAAAGAAAAGA
ACATACTTTATTTAGTAAACAACACCAACTATGAAGTAAATTTAACTACAAATAATATCA
GCTAAGCATTATTGTATATTCAACTAAGCATATTAATTAACTAAAACAGTTCAACTATCA
TAATTATTTTTAACTAAGAATAATTATTTGTAGCTAGGGGTACAATAGCAACTTCCATCT
ATTATCAACTACACATAATTATTATCTGAAATAGTAGCAACAATAATAATGATTGTTAAC
TAATCATAACTACTAGTAATTATGTATGTACGAGCAATGCAGTTGATGTCAGAGAGAAAA
TTATTAATTGGATGCTAATATTAGGTACGATATTAGTTATGTGTTATTAATGTGGATAGT
GTAGACGTTGATATTTAGTATGATATTAATTGGATGCTAAACATGTTAAGTGAAGCAATA
TAGATCAGTCGTTTGATATGGTATGATGGTCGAGATTTGTTAGATCGCCCCATTGGGTCT
TTTTATATTGATATAGACTAGCAAAAATGCCCGTGCATTGCATCGGAAAAAAAGATCATC
ACACCCCGTAACCTATTACACGAGTAGTTGTTTGACTTATGACCCACATTAAACAGATAA
AATGTTTTTGTTCTCGTGAGCAAATGGCTAGAATAAACCTCACTAAAATAGCTGAGTGAT
TTATCCAAGGGCAAATAGTAGCTAAAAGAAATACTACTGACGGAAGAACAAGAAATAAGG
AAATGAAGAGATTTTACTTGTGAGTGCACAAAAGATTATTCCAAAGGAAGTACTTTCTTT
TAGCCAATCGCTCAAAGCAAAAGATTAGTGCAATGGGTAAGATGTACACAGCTTCACAGA
ATATGTTGTTTTTGTAAATCATGTGCTCTACACNNTTCTGAAATGTGCCACTATAATTGT
ACAAAAATCTTCCTCTGAAATCTTCCACTGTAATTGTACAAAAATCTTGCCACTGAAATC
TGCCAGACTGTCCACATAAGTTCTTCACTTCGGTCATAATCCAATTGATGAAAATAAGAA
ACTCTGCTAGTTGCATAAGATCTCGAAGCCAACTTATGGTTCTGGCACATGCATAACTAA
TTTGACTTAGGACAAATTTAAAACTTCAATTATTTTGAAACGGAGGGACTATTTGCTTCC
TCAAGTGCAGAAGTTTAAAGTATGATATAGTTACATACAATTTTGCATGTGTTTGAACAT
TTAGAGCATTTTTTTCATTCTCAAGGAGCTTAGTATTAGCACGGAAAGCTAGGCCTACTC
ATACTTCTGGTTTTTTTGACATTGTACTCATACTTCTGTTTGCCTTGCCGACTTGTGTGT
CTTTTTGTACTGTACTTCAGCGTAAGCAACATTACACCTTTTTCTTGTTCTAGCATTCAG
TTTATGGTTTAATAAAATAGAAAAAATGGAGCATCTATGTATCAAAGTCAGCATATATCA
ACGGGACAGCGACTGCGCATCGACACACATTAACCAAACTGATAACCACATGATATACGA
ATTCTCAACGAGGAAGCAGCAGAATTCAAGAACTACAAGTGCTCAATTGCTGATCATGTG
GGTCAATACTCCATAGAGATTATGGCTAGGTCCAAATGCCCTCTTTCAAGGTTCCAACCA
GGACAAACCTTAGCATAAAATGAACATACTGGGTTGGGCAAACCACACACCAGTCTGAGT
TTCTACTACTCAAGTGAAAGATGTCTGAAAGACATACTGTAGCAGTTGTCATATGATGAA
AGTAACAAGAGAACCTCTCCATATAATACAGTATGCACATATACTGCAAGCCATAGTATC
AAAGCAACTACTCCCTCCGTCTCAAAATAAGTGTCTCAACTTTGTACTAACTTTANNACA
AAGTTGTACTAAGGTTAAGACACTTATTTTGGGACGGAGGAAGTATTATGTTTACAGGTT
CAAAAAAGATGCAAATAATTAGCCATACAGTAATATTTTCCTAATCAAATAGGCTAAACC
ATCGGGGCACTAACAAGCTGACAAATACCAAGAGCTTAGGGTGACAGGCTACTTATTGAC
TCGCTACAGCAGCTAATATGAATTAAAAAATTATAAGAGGCACCAGATCCTAAGATAAGA
GGCCATGAGTTGTACATATGTTTAACAAGACCGGGAGCACGTATTATATTCAGGTCTTGA
CAGAGAACTGAAAAAACCTGCATTATTAGTTTATTACACAAGCTCATCTCTTCATGAAAA
AGCCTAGTAGGATGCCCAGAATAGTGGCCACGAGCACGAAAAGTAGCGAGAAACCGAAAT
TCTGCCTGCTGATTTCCCGTCTTAGGAGACGCTGTAAAATTCAATCAATGAAACAATAAA
CTTTGTCAATGTTGAACTAAACTGTACGCCGGCATTTAGATCTCACTGAAATACAGGAAA
CGATGTAACAGAGAAGTAATGAAAACATGGAGATCAGGAAATAAGTGCGGGGGCTCAGCC
TCCATTTCGAAAAAAAAGGAAATAAGTGCGGAATTTTGCACTTGTCAAAATCATGAAATG
CAATAGTGCTTGAAGATACGAGTGAATATTCGTACTACAAAGCTGGGTGGAATTATGAGG
TGTTCATTTAGCTCGAATGCACAAATTATCAGCAAAGCTTTCTCACAAGCCAGATCGGTA
GGGGCGGGGTTCTAGGTCGGGGGACGTGACCTAAACTCCATCGATCCCCTTTTACTTTGC
TCCCACAGGTGTGCGAGTTATAGACGAATTCGAAGAAAGCGGTCCTCCGCGCTCCTTCTC
CGCCTTGTCGTCGGCAAGCCCCGCCGCGGCGCGTGCTCGCGGCAGATGCCGGCGACGAGC
GTACCCACCCAAATCTGTCCCCCTTCCACCCTTCATCAACGCCCACGAGCACAACAAGGG
TGGCCTCCCTTACCTGAGCACGCGCCCACGAGGTCTGCCTTCTTGTTCTCCGTTTCAGGG
AGGCCGCCATGGATGGCCACCGCCCCTTGCATCGCCATGGACCTCCTCGCGCCCCCACCC
CTTCCACCTTGTTTGCCAGTGGATAAGGAGCACGGGCGGAATTATTACATAACGCAAGTG
TTAATTTGCTAAATCGAAACATTTTTTGCAGATCCACCTACATAGGGACTGCAGGTTGAA
TACATAAAACTGCATGAGTGTTTTTGTAAAACTGTTGCGACAGGTTTTCCCACAGAAGTC
ATAGCCGCTTTAGTATCACTAGCAAAAGAGCTCGTACGTTGCAACGGAAGCAAACCATAC
AACACGTCTTAACCTAATAATCATTACTTGAGATCTTTATTTA