Map Locations of contig_74510 (7542 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_74510

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_77141 1 690 bp MLOC_77141.1 Available Available None
MLOC_77140 1 901 bp MLOC_77140.1 Available Available LOC_Os04g02670.1, FRAME:+1, EVALUE:2e-16, 13104.m00186 protein hypothetical protein
MLOC_77139 1 364 bp AK371457 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_77141






CDS Structure of MLOC_77140






CDS Structure of MLOC_77139






Contig Sequence (7542 bp)

>contig_74510 7542 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCTTGTCCCCCCCTAGAATCGTCCCTGGCGACGCCGGTGTTTAGGTGGTGTGTGGAG
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TTTCCTTATAATTACACAGCATATAATGTAATATGATATTATGTGTTTTCTCTTATTTCG
CCTAGCCCAACTTGTTTGGGACTAAAGCTGCTGCTCTGTAAACAGGCAGTACAAAAAAAG
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CCGCTCTTCTGCGCACCTTCTTCTTCCTCTTCTCTGGCAACGGTCCACGGCAGCGTCGGT
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CCCGATGACTAAATGCCCGGACTACCCTCGCCTAGATCCATTGAAGCGCTTGACATGTGT
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TTAGCTCTGAATGTTTGCAGTCGAAATCGAAAGCGTATAAATTCAGGTGGAAATTAGCTC
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GGAATGTTGGCTAAATGTTTTACGACGTATTCGACCAAAAAATAGGTTGAATGAAATATT
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GGATGTGTTTTGGAGATGGAGATAGATTCATTCATGCATGGCTGCATGAACACATGTATG
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TATTGACCAGGGCGGGTCTAGATCCATGCATGCCTACATTTTAGATAGAGGTAGTAGCAT
AAGTAGTAGCATTACATAAGTAGTAGCATTGCATGAACTAGATAGTACCATTACTAGATA
GAACACTACACATCAACATAGTAGATAGTGCCATATTATACGGAAATTGCTTTTGGCTCC
CGAGCTCCATGAAGGCCTTTAAATTTGAAACTCAAATTTCATGAAAATTGGTATTTTTAT
ATTTCAAAAAAATTTGAAAAAAATACAGGGATAAGTGAAGNNNNNACACACATGTGTGTA
AATTTTCAGAAGAAAATACATTGAAATGAGGGCTGTGCAAAA