| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_74211
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_77078 |
2 |
620 bp |
AK364104 |
Not available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_77078
Contig Sequence (6521 bp)
>contig_74211 6521 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGCGGAGCGGGGGAGGGAGGGGGGGCGGCCCCCCCGCCCGCGCCCGCCCCCGCCAGTGGA
GGTACCCGGTGTCCGGGCGGCCGTGCGCCATGCAGTTCTGGCCGTCCTTTATGGTGCCGC
AGCTCGTCCCGTTGTAGAGCGGCGGGCGCGCGTCCGGCACCCACTCGCCGTCCGAGTAGT
CGCACGGCGGCGACGCGGGCGCCGACACTTCTCCGCCTGCTCGGGCCAACACGACAAGGA
AACATTTAGTGCTACTGCTATCCCAAACTGCCATTTCTTTACCAAGCAATCTCGCAGGAA
CCAAAATGCTGCACAAGTGGGTGAAATCACATGCCAGATATGGCACATTTCAACCTTAAA
ACCACCATGGCCACTATTTATTGAGCTTATTAAGAGCGCCTTTTATAAATACTTCAGAAA
ACGGCAAAAAAAAAAGAGGTAATTTTATCATTGAGCAAACTCGAATCCGCTCGAGGGAAA
ACTCAATTGACCAGCTAAATCGGCCAGAGACAAATCCACAAAGTACATTGCGAGGAGAAA
TCGATTGGAAAACCTAACACCGTACCTTGAGTTTTCCCCAACAGTTGGCCCCCTCGGTCG
GGAGGGGGCGGGGGCAGCTGCTCCTCAAGCGCATTCACGGGCGCGCGGCCGCGCTGGGGC
GGGACGATGGACGGCGCCGCCTCTCGCACCTGCGGCTGGGCCAGGACCGGCGGTGTGGGC
GCGGCCAGCGGGTTGAAGAGCAGGTAATGGAGGAGCGCGAGGGGGACAAGGGCGTAGAGG
GCGTAGGCCAGGAATTGCTTCCTGGGGAGCGAGAAGTGGGTGTTCTGGAGGTGGTGGTTC
TGCGAGAAATTGGTGCCCATGGCTGCGTGGGGGGGAGCTATGTTCGTGCGCGGGGAGAGG
GAACCATGGCGGACGGGGGACGAGGCACGAGTCAAGAAGGGGATCGAGGAGAGGGGAATC
CTGGGGAACACAAAATGTTTTTTCTATTGTCTCCGACAGAGAGAGAGAAAAGAATGTTTT
TTCCACGGGCCGCTGTCCCGACATCCGGGTTTGTTAAATGGCTGCTTGCTGGGCCCAACT
GATAAAGCCCAAACAGCCCATAAGCATGGCTGTGTTTTTTTATTAGTATCATTTTTGACC
AAAGCATACCAGTGTTGTGTTGATATACGTACTCTGCTGAATAAATGTCTACTTCAATTT
GCTCTCAACAATTGGCAAGGCTTCAGCGGGAGTTCGGTGAGACCGAATGTTTCTTTAGTT
GGAGCACGTTGAGGCGTTCAAGCTGGTGAAGGTCGGCTGGCATCTGCGTACAGAGCGTTG
TTTCCATAAGAGGATGATCTGCCATCAGAGATCAGAACTGCGAGCGTCATGGGATCCTGC
CGAGCCGGTGGTTGGACGTCTGTTGAGCCGTCCACAACGTCGGCAGGAGACAGATGTTCA
AGACGTCGGACCGGTGGTGTCTTGGGAGTTCATGGGTTCTGCACCTATTCGGCAGGCATC
AATGCAGGAATCACGTGAATATATTTAGACCAGATACTCATAGTGGAGTGCCAATTATAA
TATTGTGGAGTGGAGTATTTTTTGGGTTTCAATACAAACAGAATCAGATTTTCAAATATG
GTAAATCAAACTACCGAGATGTCAAATTATGTTGTCGCGACTGATGGCAATTTTCATTAT
CCTTATCCTTGTCATGTTCAGCTTTTGGTCAAGAATTGTCATGCCCGCTAAAGAAAAGGG
AAATGTTTTTAGTCGGTGCGCCGGCCGAATCACCGCACACGACCCGTGATTAGCTATGCA
ACTTTTTTTTATCTATATTTGTTGCAACTAGTGTTCATGTTACAAATGTTTTTTATTTGC
TATATTTGTTCAATAAAAGACTGCATATACGTTTGGTTGCAACTTCAGTTCGTTGGATTT
TTCGTTAAAATTGATTTTATTTTTATTTTTGCTACAACTGTGTTAATTTTTGCTATAACC
GACATCATTTTTTGCTGCAATCGTTTACTAAAAAAGTTGCATACACGTTCGTCAGAGTTG
CAACCCGGATTTACCGGATTGTTTTGCTACAACCATTTTTTTGTTTTGCTACCGCGCATC
ATCAGCTTTGTTTTTTTTGTTATGACCACGTTGATTTTTTTTTGCTACAACTATATTTTT
GTTGAAACCNNNNNNNNNAATTGCTGCATCGTAAACGAAATTTGTTGCATCGAAAGAATA
ATGCTGCATGAAGATCTAACGGTGCGGCACACGTACAACTGACGGATCGGATGGCCCGCA
CGCGGCCGGCCGAACGATTCGGCCGGCGCGCCGGCGCAGAGCACTGCCTTAAAGAAAATT
ACCATCATCCGGACGATATAATTTGCCATAAAACGTTTAGATTTTTAGTATTGTCGTACT
TTCTAGGGCTTATTCGGTGTGCAAGAATTTTGTAGGATTATTTTTCATGGGATTTTTCCT
ATGTTGAGCATCAGTTTCATAGGACTAGATGTGCTAGATTTCGAAGGATTATGTCCATAT
TCTTTTTCATACGTTGTTGTCCATCACATCGTACGACCTTGCACTAGGAGAGTGCTTGAC
CTTCGTCCCCCTCACCTTCCTCGCGGATGGGGCAAGCTGTTTTGACATCAATCCATCCTC
CTCCCACGATCGCACCATTTTCATAGGATCGCTCGCATTCGTCATCGACCGTTGTGTCAG
CCTTCGACTCTGCATTCCACCATCCCATTTTGGTCACAAGTGTGGTCTCATTGAAGCTCG
TTTAACCTACACCACCGACCTCGATTGAGAGGACGACAACCTCACATGGTCCAAGCTCAT
GATCCAAGCCCGTATTTCGGCCTCAAGATCAGAACGCTGCCCCGTGATACGGCTTCGTCG
TATATAATTTTCAAATGTTTCATGCCATTATTTATAACTTTTATATACTTTTGAAAATAA
TTTATATGATATTTTTGGGCTAACATATTGATCGAGTGACCAGTGTGAGTTCATGTCTGT
TGCATGTTTTTGGTTTCACAAAAATATCATATCAAATGAAGTCCAAATGCGATAAAAATT
TAAGAAAAATTATTTTAGAATATATGTCATTTTTGGGATGAAGAATCAACGCAAGACGGT
GCCTGAGGTGGCCACACAGCAACATAGCGCCGTGAGGGAGTGGCCACGTCGTGTTGCCTT
GTGACTCCCTCGTAAGGCAGTTGCAACCCTTCATTTGCCGCAAGAAAGATAATTTTCAGA
TAAAAATACCTCAAAATTTCACCTCAATCGGAGTTACAAATATATGGGAATATAAAAACG
GTGAAAGGGTCTGAAAACAGACGGTGAAACAGAAGAGAAACTAAGAGAGATCCAATCTCG
GAGGGGCTCCTACCCTCTGGGATCCATGGCGGCCATGGACCAGAGGGGAAACTCTCCTCC
CATCTAGAGAAGAGGCCAAGCAAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGAGGGGTCTCTCTCCCCC
TCTCTTCCTATGGTGACGGATCATCGCTTAGGGAACCATCGTGATGGCGATCTACGTTAA
CAATTGTGTCGTCTTCCTGAACACCACCATCACCTTCCCTCATCTATTTATAATTATCCA
CTCTCTAGCAAATCGTTGCACCCCCTACTTGAACATGGTGCTTTNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNTGTGTTGCCATCCTATGATGTTTGAATACATTTCTTTTGTCCTATGGGTTTA
TTGATAATCTTGATTGGTTTGAGTTGTGTGTTTTATTTTGGTGATATACTATGGTGTCTT
CTGTGTCGCGCACACGTGAGAGATTCCTGTTGTAGGGTGTTGCAATACGTTCATGATTCG
CTTATACTGGGTTGCGAGAGTGGCAGAAGGTTATACCTTAACGATCTTCAGTAGTTTTGG
ATGCTTACTAGAGTTCCAATCATAAGTTCATATGATCCAAGTATGGACAGTATGTTAGTT
GATGCCTCTTCCTCATATAAAATTGCAGTAATGATTACCAACCTTGTTATCAATTACCTA
CGACAATATCGCGAATCCTTCCACCACTTTTCCACAGTCGCTATATTTACTTATTTATTC
TTTTATAGAAACAACACCTAATTTTTTTCCAGGTGGTCGATAGAACTTGAGAGAATATTA
ATCCAACCTTTAGCTCCTCATTGGGTTCGACACTCTTACTTATTGAAACATTCTACAAGT
GATCCCCTATACTTGTGGGTTGTCAAGAGCTTTTTTTAGCCGCGTTGTTGGGGATCAATA
ACATGTGGTGAATATTTCTGTGTGTGCTTGTTTCCTTTATCTCTAAGTAATTTTATTTTC
ACTTTTTGTTTTCTATCTTTAGTTATGGGTAGTAAACATAAAATACCAAAAAAATAGTTG
TACTTGCTACCCCAAAAATTGAGGAACCACCGGTGTTCCGTACTACCGAAGCTTTTTAGT
TGGATCATTTTTTATCCCTTTGTGCTCGTCCTAAAAATCCAACTAGCTTAGTTGAGGGAA
ANNCATTAGATGAGCATGCTTATTTTGTGTGACACCGCTTGTCTCAGAAAGGGAAACTCT
TATGTCGTCAAATTAATTGTTTGAATTATTAGGTTTGGAATTTATTAGAAATACGCGATT
TTACTTACTATTCTGAAGACCCTAAAAAACACCTTCCCTATGAGTGTGAGTTTAATGATA
ATGAAATGCTATCTTCTTTTGCCAAGGTTTTCTATAGTTATTATTATGTTGAACAAATTG
AAGAATTTGTTTCTTTTACTGGTGCATATGAAATTGCTTCTTTGATTGAAAAGTATGATG
TTATTCTTTACAAATACGAAAAATGTACCATAATTAAATATTGCTATAAAATCTATACTT
CTAATGCTTATGTTAAAGAATTTACTGAGAGAATGTTTGTTGCCTTGGAAGAGACTAATA
TTTTGCAGGAACCAATGGAAGAAGAAATTGCTGAAACTATAAACTTGTTACATGAAAAGA
TGAGAACAACGAAGAACAAAAGGAGGAAGAGCAGATTGACCACCCATGCCCACATTCTAA
TGAGAGTAACTCTTTAGCTCATACATTTTTTAATTTCCCTTCATGCTTACCGGAGGATTA
TATTGCTATTGCTATGATCCCTTCGAATCGTTTGAAATGTCCCTTTTTGATGANNNNNNN
NNTTGCTATGCTTGTGGCCATGACGCCAATATAAATTATGCTTATGGAGATGAACTTGAT
ATAGTTCCTTATGTTAAACATGAAAATGTTGTTATTGCACCCACACATGATAGTCCTATT
AGCTTCTTGAATTCTCCCAACAACACTATATCGGAGAAGTTTGCNNNNNNNNNNNNTTAT
ATTGATGGGTTGCCTTTTACCATTACACATGATAATTTTAATGGATATAATATGAATGTG
TTTGCTTCTACTACTTGCAATTATTATAAGATAGGAACCAAATCTTAACCTCTCTGTGTT
TCCGATATGATAAATTTACAAGAAATTGTTTATACTATGCATTGGCCTTTACTTTCCTTG
AATGAATTGTTCTTTTATGACATNNNNNNNNNNNNNAAGAGAGTTAGACTTCGTTGTTAC
ATTATATATCTTAATTTATGCTCACTACTTAATTAAAAATCATTGTTAATTTAAATTGGC
TTTGATATACCTTGGGATCCAGGTGGATCAATTACTTGAGCACCATATACTTAGCTTAAT
GGCTTTAGAGAAAGCGCTACCAGGAGACAACCTGGAAGATTTAGAGAGTCATTTTTATTC
TGTTGTGTGATTTTAAAATAATTACAAGCAAAAAATAAAGTGGGGAACTTAAAACATTTT
GAAAAAAGTGAAAGTGAGAAAGACGAGCAACGTTGAAGTGGGGGGCGTCCTTGAACTTTT
GTTCATGTCCATCAAAACTTTGTGAATCTTGATTACAAGTACTTCTCAACAAAAATAAAT
ATACCTTGTACAAATCCATTGTATTATAAAAATAATGTGTCAAAATTTACCTTTAGGGTG
TTTAAATTGCTTGTTTGATATGTGTTGCGCAAAAACGGAAACTTTGGTTGTAGTGTTTGA
TTTTTCCTATTTTACTGGAACATCAAATATTTCTCAAAATTTTACACAGTAATGTTATGC
AAATTGTTTATTATGTCCTAATTTAAAAAATAGTTACATAAGTATATGTTTCATTTGCAT
ATTTACAGACTATCCTGTTTTTCACAGATTGTTGTTATAGTTCCTTTGTGTGCTTATGCT
TGAAATCTTGTTGAGACCCGTTGACTTGGGATCCATAGAATTGTGATAGCATGCATTAAG
TAATGTTGGATTATAATTATACATTAATGTTATGGCAATACATGATCACATTTGATTTTA
TATGTACTAACATTTCTAATAAAAGTTTTGTTATATTTTGTGTGGATGAAGTGTTCGAAG
ATCGGGGAGGTGTCGATATGAGAAGAATAAGGAGAGATAAGAGTTCAAGCTATGGGATGC
CCAAGGCACCACAAGTAAATATTCAATGAGACTCAAGCGTC