Map Locations of contig_72052 (4264 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_72052

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76619 3 1735 bp AK251407.1 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_76619






Contig Sequence (4264 bp)

>contig_72052 4264 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCTAAGATGTGGGGGGGGGGCAGAGTCCCAGCGGCTGGTCCCGAAGGTGCTTGTTCCTAA
TGATGTCGAGCCAAAGGCCACCGTCACCGTTGGCGATTCTCCAAAGCCACTTAGTCAGCA
AGGCGATGTTCATGCGCTTGGACGACATGATCCCCAGACCGCCTTGGTCGCGAGGCTTGC
AGATGTCGGGCTAGCTCACCATGTGATATTTCTGCTTATCGCCCTCTCCGGTCCAGTAAA
AACGAGACTGGTCAATGGCTTCTTTGTGCAACATGATTTTCTTCCCGTGAGTTGAACTCT
ATGTTATTACGACATTGAGACTAGAACGACCGAGAAGCTTCTTGATGTGGTGATAAAGCT
ACTAAATAACCTGTTCGCTGTATGAAGTTTGGATGAGTAAACATTGATAGTATTTTAAAT
TTTTTGGCTCTCTATACTTTGTCACATGCAGCCATGTGCGTGTATGATAATATCAATGGA
TTGTTGTTTATTTTTGATTCATTGAGTACTTGGTTTTCAAGTTTGGTTGAAGAACCATGT
TAGCTTAAAGTTGAGGACGTAAGATGCGTGTTAGTGAAGGCATGCATTATTCTTAATTTA
TTTATGCTTTGTGAGTTTCATCGTATTTTTTTAAAGCCGGCGGCAACACGAGCGTTCTAC
TAGTAGATAGGTACTAGATGTGACCTTGAGAGTGAGTATTTTATTTTATTTTCCGCCTCC
CTCGTTTCCCTCCGGTTTCATTGCCGTTCTTTGGCTTTTATTTTTATTTTTATTGGAGCT
CTTGGTCATATTGTTGGTAGGGAGTGAATGTGAGTGGAGTGGAGTGGGAGCGGTGTTGGG
TCTCCCAGAACACGCGGACGTGGCCCTCCTATTTTCCCATCCCGGTACGGTAACCCCTCC
CCTCCGGGCAGAGGCAGAGGAGGGTGGCTCCACCATCTTTTTTCACCGTGGCATGTGCCT
TTCGCCTTTTCTGGTCCGCTAGCTGCCGAGCTCTATCCCCTTCCTCCAGTCCCGTTCAGT
CTTCAGCTCAATCCTTGCACTCTTCCGCTCTTCTACGTTGTTTTGTTTCGAGGTACTTGT
CTATATTTTCTTCCGCTCGCTCTTGTATTTTTGGGCAAGCAGATTTGTCTGGGTTTTGGT
AACGGCAGCGTATTTCTGTACTATGTAAGATTAGCTTTCGCCTGTTTCTTGCGGCAGGAA
ATCAGTAAAAGCCAAGTGTTATGTGCGAAGGAGGCTGATTGATTGATTGATTGATTTCTC
ACGGTCACGGAGCAATGGATCTTGAGTTCGGGAGGGGAATGAGATCCCCGCAGGTTCGTC
TATTTCCCAAACTGCTGAGTGAGTAATCATGGGAAGGGAGCAACCCGTTGTTTATGTTGG
TGTTGGGATTGTTGCATTTGCAATTGCAGAGGGACTCATGGAGGACCACCATGCTCCTGG
CGTACCAGAGCCTCGGGGTGGTGTACGGGGACCTGAGCATATCCCCCCTCTACGTCTTCA
AGAGCACCTTCGCCGAGGATATCCAGCACTCAGACACCAACGAGGAGATCTTCGGCGTCC
TCTCCTTCGTCTTCTGGACGCTCACCCTCATCCCTCTCATCAAGTATGTCTCCATTGTCC
TCAGAGCCGACGACAATGGCGAGGGTATGCGCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTT
CTTCTTCTCCAGGTCTCAGACATGTTCGGTTCCAAGAAGAAGAAGGGCTCTTGTGACAAT
CTCTTTGTTCCGCAGGAGGGACGTTTGCCCTCTACTCGCTGATTTGCCGGCATGCCAATG
TGAGCCTCTTGCCCAACAGGCAGATTGCGGACGAGGAGCTCTCCACCTACAAGCTGGAGC
GCAACCCTGAAACCGTCGACAAGACCCGCGTCAAGGTGTGGCTCGAGAAGCACAAGAACC
TGCACACCGCCCTCCTCGTCATGGTTCTCATTGGAACCTGCATGGTCATTGGGGACGGTG
TCCTCACGCCGGCTATATCTGGTTGCCTTGCCACCCCCAACCTTTCTTTGCTCAGCCTGG
TTGGCTGTTTTCAATCAATATACTAATGACTGGTTGCTAACTTTGGATTCTGTCTTTCAA
CCATGACAGTGTTTTCGGCTGTGTCAGGTCTTGAGTTCTCCTTGTCCAAAGATCACCATG
AATGTGCGCCTTCTCTCTTAAATTCTTTTTGCTTTCAGTAATCTTTGCAAGCGATTTAAA
TAAAGTTTAGACTAAGATGATAGACACTGGTCAAAACTTCAGTCCACCAGTTCAGACTAC
TTGCATGCAAAAATCATTCAATACCATGCTCGTTGACTTTGACTTGTGATCTTTTGGGTT
GGACATATTCCAAGAGTATTCCCGTTCCCGGCATATCCCCTTTTACTGTATGTAGGATTG
TTTAAAGACGAATAAAAATGGGATAATGGGTGCCCTCGATATCCGATATGGATGTTTGAC
AAGTATCTGCGAGACATTCAGGATCTTACTTCTGTCAGTATAGCTGAATATTCATATCCT
GGTAATTTTTACAAGTCACCATATATTAGGTAAGGTCAGGAACATTGATAATGATGACTA
GCAACTAGACTTTAGGAAAATCAATCATCCAAATCACATGCTTTATTGTCCCTTTGCATT
GCATTTCTACGCTACTAGTACAAATGAAAAGTCTGTATATTTTCACTCCCATATGGCATA
TGCTTTGGATCTTTACTCAAGAATGCACACAGTCATGTACACCATTTCTTTCAAAAGGCG
AGAGTGATCATAAAAACCACCTTTCGGTGCTACAAATATATTTGTAAATTGTTTTGGCAT
GATATTTCCCTTTCAAACCTCTTTATTTGTGTTTAGATAATGGTCTGTCAGCCTCAGCAC
TCGAGGGCGCACATAGCCATTTCAAACATCTTTGTTGGCTCTGATGACTGCTCTCTTTTA
CATGCAGATGCCGTCATTCCAATAACATGCGTTATATTAGCATTTCTATTTGCCCTCCAG
CATTTTGGCACACATCGAGTCGGATTTATATTTGCCCCGATAGTTCTAGCCTGGCTATTC
TGCATGAGTGCTCTTGGTCTCTATAATATCATACATTGGAATCCTCATGTCTATCAAGCT
CTGAATCCCTATTACATGTTCAAATTCTTAAAGAAGACTAGGAAATATGGCTGGATGTCA
CTCGGTGGAATTTTGCTCTGCATGACAGGTATGTCCTATGGATATTAACATGATTCAGTT
GTTCCTTTCTGTCGTTCGTATCGAATACAATAAGCAGAAGTTAACTATCTAGCTTGCGTG
ACGGTGCAGGATCTGAAGCAATGTTCGCGGATCTTGGACACTTCTCATACAGTGCAATCC
AGGTAATTTGTTGATGCTGCATATGAATTCGAACATTATGTTTCGTACATTATTTTTAAT
GTACTGATCATTTAGTTTTATCACAGCTTGCTTTCACTTCCTTAGTTTACCCCGCGTTGA
TTCTGGCATACATGGGTCAGGCAGCTTACTTGTCAAAGCATCATGACTTTTACTCAAACT
CTCAAGTTGGATTTTACATCGCAGTTCCAGGTATGTACTGGCATTGCAGCTCATCTATTT
TTACGATGTTTCATCTCATTTATTCTTGTGAACAAAATTAAATCATGTTGTCTCACTGTA
CTGTCACACATAATATATAAAAAGTTATCTCATAGTCTGCTTTAGTTAAATTATAATTTA
GTCTTGTTATATATGCAATGTTGATTTCACTCCCATATATTTCTATAATGATCTGTAATC
TTCTTTGCCAAATACCATTTGTTCAATACGTGGATTTCAAGTCGCTCGACTAGTCGTCAG
CTAGTCTACGAGTCACAACAGCAAGGTCGACTCAACTTAGTGTCGACTCGAAAAGCGAGT
CGCGACTAGTCGCAACTACAGGCTCGACTCTTTCCGAGTCGCTACCCCTGAGCGAACCAT
GGTTCAATAAAAAAACTTTGAATACTATTTCGTATTTGGTCTTGCATCAGTTCAAAAAGT
CAGTTATATATTGCTTGATTTTTTATTTATAATTAAAAGAGGGAATTCGTCCCTGGCCTC
TGTACGATTGATACACACAGCCTTTAACTAACTGTTTCAACGTTTACAAGGTCCAGACAA
TGTGAAATAAAACGGCCACTCCTGGGCAGCCATAGAGAAAGACAAATCCGTACTACTCGT
TGTTGAGGCAAATTGAAATCTACATGGATAGAAGGCCTTGTACACACCGCCCGTCACCCT
ATAG