Map Locations of contig_7189 (9263 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_7189

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76568 1 577 bp MLOC_76568.1 Available Available None
MLOC_76567 5 8146 bp AK373337 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76568






CDS Structure of MLOC_76567






Contig Sequence (9263 bp)

>contig_7189 9263 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGTCGTCGCGGCTCTCATTGTCCGTCGTGTTCCTCCAGGGGAACTCCGATCCTTGGGTCA
GGCGATGGCGGTGCGTCGGTGTCGTAGTCTTCTTGAAGGCCCTGCCTTGGAGCCCACAAT
TTATCATATGCGGCTTCATCTCTTCGTGGTGGCGTGTCCACGGTTGAAGCCCCAATTGCT
CTTGTAGTGCTAGAAATAGTGTTGTTGCGCTCAACACCTATGTACCATGCCTTGGGTGTG
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AAAGCAGTGCGAAAGCCTTTTTTGGCAATAAGGTTTATTCTATGCCCTCAAGTACGTAAT
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CTGTTTGTGATGACGATGGCTTCGAGTTCCCTCTACCGGAAGGATGAATCTTCGGCAATA
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AAAATCCTAGAGAAGTCCATGATCTTCTTAAGTTAGATGGGATTTTATGGCAAAAGGCAT
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CTGTGATACCCATCTTCTCACATATGTCGCCTTGTCTTCGATAAAAAATGGTCAAATTTT
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TCTCCAAGTACAATTATTTTGATAGGGGGAAGCAACATTCAAATTAACTAATAATATGCA
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TCAAAGCGAACACGCATGTGGTGACATGCATCAAGATTGATGCTTTCGATCTAATGGTCG
TCGGGTCGTTCGCTGGGAATACCAAAATCTATGACCTCAATCAAATAACATTTCTGTATT
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TATGTAGAAAAGATTATGTAAGTATGTGACAAAGCAATTAAGAAGGCTAAACAAACAATA
CTAAACACGTGAACCTATATAAAATACATATCATCAATGTATGTAAAAGTTGTTGAGATT
TTTAATACTCTCATCATCTCATCTAAATATATCATCTACTTCTTCTAGTTCTTTTTAACT
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AAAGTATGAGAGAGTTAGCAACAGCAAGTCAATAAAGACAAACTAGGGTGTGGGTGTCGG
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GGAGAGACCAGAGACCAAGGGAAGCTTCGCCGAGGATGGCCGCCGTCCCTCCGCCGGAGA
CTGCGCTCTCCTCCGTGGCGGACGGCTCGGATGACGAGGATGGGGACCAGTGCCGCATCT
GCCGCTTCCCCGCCGAGGCGGATCGCCCTCTGCGCCGCCCCTGCGCCTGCAGCGGCAGCA
TCAGGTTCGTCCACGACGACTGCCTCCTCCGATGGCTCGCCACCAGCCGCCAGTCCCGGT
GCGAGGTACCCCTCCAGTCCTCTCCTCCGCCTACCCCTCTCTCGGCATCGATCATATCCG
CCATGAATGGTCCACGCGCTTGTTTGCTTTAGTAATTTCGATTCGTGCTGCTGCTGTGTG
GTGTGGTGTGGTCTGCGCGTAGCTAATCTCCGAATTCCAATTCCACGTGATGCTCATGTT
TCTGTGCTCGTTTCGATCAGGTGTGCAAACGCGAGATCACCATCAGCCCTCTCTACGCTC
CAAATGCTCCCGCGAGGCTGCCCCTTTCCGAATTCATGCTCGGCCTGGCCAACAAGGTCA
TGGGCTGGGTTATCGTGCTGCTCTCCCTCGTTGTCGCGGTCCTCGTCTGGGAATTCATCA
TGCCCATCACCACTCTCTGGACATGGCGCCTCGCTCTCTCCAGGAGCTTTGCTCAAGTGC
GGCACCTGCTCTCCCTCCGCCTCTCCGCCACCTCCTTCGCAGATGGGTTCTACAGGTTCA
GGTTCATGCCTTCCGTGGATACCATATTCGCCTGTGTTTCTATCAGAAGAGCCTTCGTCA
GGGACCTTGTCCATTTTAGACAGCTCAACGGGCTTGCCAGAATTGGTGCTGACGCTGTTG
CTCCATTTGCTCTCTGGGTTGCTCGCCTGGAAACTAACCTTCAGAACAGATTTGGGGGAT
TGGATAGCCTGCAAGTCCTTGCGCTGCATACCGTGGAAGCTTCCTTGATGGTACGCTTCT
TGCTTTGATCTCCCCAGTGTCCTCTGACTGTACATTATTGTTCCCTTTTTTGAGGGAACG
TCCACAAGCTGTGCACATCTTATGACTATATAGAGAAGCAAATTGTAATTCATAATAGCC
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TACCTTTTTCCTACCCTGCAATTGGGCAAGACATCATCAACATGGTTTGCTGTCCATCAG
TCTGGACCCTGGAGACGTAGAAATTCCAATGTTGGATGACTATTCCGAATATGTAGGTTT
AGGATTTCTTAGGCCATTATTTTGAGTGCGCCACCATGAGTGGCTAACCTTGTCCTCCTT
GGTGCTTAAATCATTGTGCTGTTCCACCATGGTTTTATCTACAACATTTTTGGACAATGC
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GCTTATCTTTTCTAATATATTTAATTGCAGAAAATCTAACTAAATAATTTTCTATTCAGG
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TTTTCTTCAAGATCTTGGCTGATGGGACATGCTGGTTGTTGAGCCCCTTTAGATGGCTGC
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TTGGAAAATTGATCACTTTTGCCAACTTTTCTCTTAATGTCATAAATATGGTTGTAGTAT
TCCCCTTGCTCTTTGGCTGGTCTCTTGATATCTGTACTTCGAAAATGTTTGGTGCAACAA
TACATCAAAGGTTCAAACTTATGTGGGCTTCATCCTTTTCTTCTATTGCTCTACATTGGC
TTACTGGATGCATCTTTTTGATGCTACGCTCCAAGTTGTCCAGTCTTCTTCGCCCGGTAT
TTATCGTACTGTATTTGTGGTCTCACCATTTCATAGTGCATGCATTATATGTTTCAGGGG
TCTAACAGTGATTTTTTTTTTTTGCTTGTGAATAGATACTGAGGCGAGGAGTTAGTATTC
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TTATTTCTTTCAAGAAGCTTCCTCGTCTTTTTGCTGGCATTATCAATGTTGGTATGGTCT
TTCTTGTTCCTGTTCAAATCGCTAGTGGATTGGCACCTAAGTTGTTCCCGTTAGATATCA
CGTAAGTATTCTTTTTTTTTCTTCATCTTATGCATCTGCCGGTCTTTGACGATTCAACAC
ATTTATTTTAATATTATGAACTGTAGCTACTTCGATCCTCCTACTAAGGGCACATCATTT
TGGCAAGCGCCACGGACCTATGCAGAGTTACTTTCTGGCATTGTTCTTCTGAGGTTTCTC
ATTTGCAATACACTCAAATACCTTCAACCTAGCAAACTGATGGAGAAGATACTGCAAAAT
TGGTTTGCCACTACTGGACAAGCTCTTGATCTATTAGATTTGTTGACTGTCCAGCCTGCT
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TTTTCTGCACTATTTGTAGTTTGATGCTGCCGCACCCATTCTCCAATATGATCTAATTCT
ATTTCTTTATGATTTCGTTGTTGACTATTCATTTAAGATGCATGCATTCTGGTGGATAGG
CATTAGTGTTGGTATTTGTTCTTTTTGCACACTTTTACCTCTCGAATGAAGAGGGTAGTC
TATCTCGGTATATATCTTCCCAAATGTGTCTCGTCACAGCAATTTCCATCTTCTTTTCGG
GGTTAAACATTGCAACGGTGGTCTAAGTATGTCACAGAACTGGAAAATTGAATTTTTGGA
TCCTCAAACTTGTACAGCTGGATTGAAGTGGGATCCATATATGGTTGTAGTGTCTGGCAT
TACTTCCATATGGGCACTATGGGTCATTTAAAAACGATACTTCAAGAAACAAATATGTGT
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TTGTTTTTTTTTCTGCTTTTTTTTTTACCATTCAACTAACTAATGTTTGGCAAACTCAAG
ATGTTGGCTGCACTTTTTTAGAAGATATTTACCCTTCTTACACATTGTAACAGGAGATCT
GTTGCAGTTCGAATGACACTGCTTGTAGTGCTAGCATGGTTGACTGTTGTGATATTCAAC
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CTGCCAGTAGTAGGTGGATTGAAGTTCAATGGTAATAATTGCTTATGATCGTTGAAATTC
CTCTGTAAATGAAGTAAATATTTGTTTATGTTATTCATCTTATTTTGGGCTTAATTGGGC
AATCTTTCTTTTAGATCTGTTTGCATTTGCTGTTGGATTTTGCACCATATCAACTATTAT
TGCCACATCTAGAGATTCATTTGTCTACATGACTTCTGGGAGAACATGCCTTCTAGCTTC
TGCTATCTGCAAGTGGGGTATAACTGCTGTGAAGAGCTCTCCACTTTTGTTCATATGGGT
GAGCATTCTAATTGAGGTGGTTTCATTTTTATCTATTTTATTTTGAGATACAGTTTAGTA
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TCTCCTGATATCACCCTTCAAGTTCCTGGTTGATTTTCTAGTCATGTCACCCTTTATAGT
GCCCGCTGATGACATTCCAGTTCTAGACTTTTTCAGCATTTGGTTCCTGGGGCTGATATT
GCTGAAATTCTGGACTATTTTGGTGAGATGCAACTTGTTTTGTCACTTTTCTGACCTCTT
AACTTGTATTTATCGTGTATGTACCAAACCTGGCAATAATCAGGTGATCGCAATTATTTG
GGAAAAATTGTTACTCCCTCCTTTCCAAAAAATTGTCATAATTTTGGTTCGAACTAAAAC
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TGCACAGTTTCCTTGCTAAAGCGAATTATCAAAATAAACAGTGCATATTTTTATATTAGT
CCACAATGCTTTTGTAATTCACTCTTCCCATTGAGAAAGCCTGCAAATATTTGACTTGTC
TCCATGCCGCCTCAAGCATGCTATCAAGTATCAACTGCCAATATCTGCCTAATGATGGCT
GAGTTTCTATTCTGACAGATCTTGCAATGGGCATACTTAGTGTAGTTTGCTGGTAATTTG
CCAAGTTATTCTTATTAGATTTTTTTGTTATCATTGTTGAAGGCTCATTGGACAAGGGGC
GTGCCTTTCCTGGCTCATTTCATTGATGGAAGATGGGACTGGAAGCTTACTCGGGCAAAG
GATGATGGCTTTGCAGGGTTGAGGGCAAAGTGGGTCTTGCAAGATATATTGATGCCTATC
ACCATGAAGCTAGTGATTGTTCTGTGTGTTCCTTATGTGCTTGCGAAGGGCCTTTTCCCA
AGGTTTGGCTACTCTGCTGCGGTGAATTCGGCAGTGTACCATTTCGCATGGCTGGGCAGC
CTCGCCTCGTGTGGGCTCTGCTACCTTGCCAAGGTATTCTGGGGTGCCCTGGTGAAACTC
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AATAGCTGAAGGCCCCTTTCCTTGCAACTCAGTTTTCTATAGTAGTTAGGTTTAAACATT
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GGTTGTAATAGCCTACGGTTCTTAGGAATCTCATACACTTTTTGCGATCATCATCACCCC
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TTCCTAGGGCTTTAGCCATATGGGTGTGGCGTTTCTTGGTATTTTGGCTTCCTTCAGGAC
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AAAGAGCTCCCGTCCCTGGAGGGGAGCCAGTATGTTACTAGTTTTTGGACCCTACAAATA
TACATATGTTGCAGTTTTTCCTTTTTCTTTCTGAGACGGTGTAGCCTGTAGTTTCTGACA
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TCACAAATTTTGATTTAATTTACAATCGGTGAGGAACAAGGGAGGGCCTTGGGAAGATAT
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TGCTTGCAATTTTTCATCATGATATCACATCCGTGTAAGGCGTGGCAAAAAAAAAATCAG
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AAAAAAAAATCAGAATTTTTTTACATATTTTTGATTTTTTTTTTTTCTGATTTTACTGTT
CACGCGGATGCATTTGAGCTCGAGCTCATATACTCCATGTCCGGGAAATGACTCCTACTA
GACTGTCTCTTCAACGCTTCCTCAGATTCCTAATAGCTTTTGCCCTGCCCAGCACCTTGA
ATAATTTAGTTTGCGGCTGGCGTGTCTTTCTGCTCCTATTTAAAGAAATAAAAGTTCAGG
CGAGTACTTGAGTGAATAACGGGCATCACTGGACAAAAAAAAGATGATTAACTGTTAATT
ACACTTCTGTTTGTGGAAAGAGTACGCATTTTGCTTGATGTTGTCACACCTAGCTTGCCA
CAAAATTTTGCAAACAAAAGGGCACTAGAAAATAGCCCGAAGTAAACTAATAATGGACAG
CGGTTGCATAACACAAGTCCGTCTTTTGAATAAAAAAATTACAAGTAAATTGATTTATTT
GTTTTGTATGGTGATAGCAAGAACCTACTATTTTCCATCTCTATTATACCACCGTTTTAC
AAAAACATACCAGGTCTTAGAATAATGTTACATATGGATAACGATTTGTGTTTCTAAGGT
CCAGCCCCTCAAGCATCTAATATCACATGTGCCCCCTGTATTAACATGGACCATATTGTG
GTTGAGAACAAAGTTAGGCAGGTAATCATGACTCTTTTCTTAAAAAGAAATTGCAAGATG
CTGAAGAAATATATTTCATGATAGCCAGATTTCAAACTAGTGCTGCACTCAAAATTTCAG
TTAAATATTCATGAGTAGATTGAGAGCTTCCACCTTTGCACTGGATATATTATTAGACCT
TCTGGAAACTGCTCTTCTGCCCAGATTTACATGCACGGTGACGCTGGCTTGTGATAAATC
GATGCCCAAATTTTCCATTGCATTAGTCAAAGACGTAAATAGGCTGTTCAAGAAGAATTA
CAATAATAGTCGAGTGAGTCAAAGCTGTTCAAGATGAATGTCAAAAACATGTAGGGATAC
CAAATCTAAAACTGATCAGAAAAGAAAATGAATCTAAATGGACGACTAAGATAATTCCAT
CCTCGAGGATAACAAAAAGATGTACACATATGGAATCACTTCTTATGAAGTGCAGCAAAT
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ATAATATGTACTCCCTCCATCCC