Map Locations of contig_71761 (11470 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_71761

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76536 1 2065 bp AK376906 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76536






Contig Sequence (11470 bp)

>contig_71761 11470 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GATGTCAGCAGCTCTTATCGTAGTCCCTCCAACTCCCAGCGAAATACTTCCGTATGACAT
ACATTATACTAAGCTAGCCGGCCCGCCGCGCCGCCATCCCCGCCCGCCCCGCGGACGGCG
GGGATGCTCGTCCCGGCCGGCCGGCACCGCGACTGGATCTTCTCCACCCGCGCCGGGCAG
CTCCACCTCCTCCTTTCCTCCAGATCCCAGTGGACATTCTCTCGTCTTATACTCGTCGGC
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GGAGCTCTTCCAATGTCCATCAGGATGGGACTTGGCTTCGATGTATTGGGCGTCGAGGCT
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GTTTGTTTATCTGCTGTGATGTAGAAGAATCTGTCACGGAAGAAATGCCAAAATGCGAGC
AAATGATTTCATCAGTTGGAGAGGATGTTTCGTTGGAGCACTCTACCGTAGAACATGACT
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ATTTTGTCAGAACCCAATATGTCGCCACTGCTTTTCCTTAGTTCGTACTCGGGTGTAGCA
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TCTGTGACAGAAAAATGAGTGCTCTAAATGTGTGTTTTAGAGACCTGATTTTTTTTTTGG
GTACAGGCCACCACGGATGTCTTTTCTAGGTGAATTTTCAAAGGATTTTAGAACATATGT
TGATGTTCATCCATAAAAGAATCATATTTTAAAAAAATAATGACTATTTTTTGGGGATTT
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TTTTTTGTTTGCCAAGAACCACTCTAGAACCATGAAAAACAACTGCTATTATGGATGACA
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CATGTTCATCTCATATTCCCCTGCAAAAGTAATTGAATGGGTTGAATTAAATAGGATCGG
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GATATAACATCCGTAAAACTAGTAGTTCTAGCAAGAATAGATTCTCCTATCATTGATAAA
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GAATAAAAATACATGCCTCGCTACTCCTCCTATCACAGAGTGAGGACACCGCAAGATTGA
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GGCTTGCGGCGGCGGAAATAAGGTTTCGGGAGCTCCCTCTGAAGCTTCCATGGTCCATTT
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GCAATTCTGTGGTGCAACATTTACGATGCATATTGCATCACAAACAATTTATAATTGTGA
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TTAATGCCACATTTTGGCCCATTGTCATAACAATGTTTATTACTTACCTCGCACGATGTT
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ATGACCCCAACTAGGTCTCGCCTCTTGATACGTCTCCAACGTANNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGGTTTTGACCTCTAATTTGCATGATAACCCGAAGTGACGCTATTTTTAGCA
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TGCCACGGGGCCACAAGCCAACAAGGCCCGACCCCTCCAGGTCGCTCCTTGATGGCTTGT
AGGGCCCACGTGGCTCCTCCAACCCTAATCCTGTCCTATAAAATCACATCTTCAAAGAAA
AAATAGAGAGCAGTTTTCATCGCGTTGCACGAGACGAAGCCGCCACCACCTCCTGTTGTT
CCTCCAGAGGGCTGATCTGGAGTCAGTTTGGGGCTCCAGAGAGGGGGATTCAACGCTGTC
GTCATCACCAACCCTTCTCCATCAACACCACTATGACGCTCACCACCGGGAGTGAGTAAT
TCCTTTGTAGGCTTGCTAGATGGTGGTGGGATTGGATGAGANNNNNCATGTAATCGAGTT
AAGTTTGGTAGGACTTGATCCCTAGTATCCACTATGTTCTCAGATTGATGTTACTATGAT
TTTCTATGCTTAATGCTTGTGACTAGGGACCGAGTGCCATGATTTTATATCTAAACCTAT
TATGTTTTCATGAATATAAGAATGATCTGGATCCTATCTTGAAAGTTGTAGTTACCTATG
TCTTGATTCGCATACCGCAAGGTGATAATAATTGGGATTCTTTCCGATGATTGCCTAGTT
TGAGGAGTTCATGTATTCANNNNNNNNNNNNNNNNNGTTCTAGTTCTCTATTAAAAGGAG
GACTTAATATCTCTAAGTTTACAATAGGACCCGTTGCCATGGGAAGGTAGGATAAAAGAT
GTCATGCAAGTTCTTATCGCAAGAACGTATGGCTATATACGGAATACATGCCTACATCAT
ACTCATGAATTGGAGCTACTTCTGTGTCGCCCTAGTGTGTAACTNNNACATGATGAATGT
CATCTAAATCATTATCCATCACCGTTCCATGTGCCTATGATTTACATATACTAAGTCTTG
CTAAGTTACTACTGTTGCTGCTGCTGTCACACCTGCTACTCAATTGCTACTGTTACAAAA
TTGCTGTTATCACCATTACTGTTACTATTATCATTTGCTATGCTACTAAATGTTTATTGT
AGAGAGATATCTAAGGTGTGATTGAATTGAAAACTCAACTGTTACGACCAATAAATATTC
TTTGGCTCCCCTTGTGTCAAATAATTAAATTAGGGTGAAATACTACCCGTGAAGACTCTC
GCGATCCCCT