Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_7117 (2044 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_7117

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76376 1 592 bp MLOC_76376.1 Available Available LOC_Os06g49150.1, FRAME:+3, EVALUE:1e-66, 13106.m05247 protein exostosin, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_76376






Contig Sequence (2044 bp)

>contig_7117 2044 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GACAGGGACATACAGCATGGTACTTTCCAAAGCGAGTTTTCTCCATAAGCGGTATTTGGA
TCTATATACCAACCACATGCTACCGTCGATTCGCGATTATGTGACAGAGAATAGGTATAT
ATAACTCTATGTTGCTGTGGCACCATTTGTAGAAAGTTTCCTTCAGTTATGTATACATTA
TGCTGAAATGATGCCCTGTGTAGGATGTAGTATTAAGATTTCCACCAATGCTTGGCAGGA
ATTGTGAGGACATTGCTATGTCTTTTCTTGTTGCAAATGTGACCGGAGCTCCACCAATAT
GGGTCCAAGGTCTGTACGCATCCCTTGAGCACAAGTGAAGAACTTATATAGCCTTATTTA
GTTGAGTTAGTTCACAATTAATGTGCTGCAATGATCTTTACATTTACAGTCACCTCTCAG
TATATTGATAAATTCCATCTTTGGGGGATTATTAGTGATGCCCAGTTTTAATTATGGCAA
CAAATGACTTTAGACTGTCAATCTTGATGCGTTTTTTCTGTGCATTTTGTCATCAAATGG
ATTGTCAGCACAACCTACCTACAATTCAGGGGTGCTCGTGAATTGAACATATTTAGTATC
TTTAGTTCGAGCATGCTAATTATGTACTGTACTTAATAGTATCTCATCCGTGGTTAATCC
TCCAAATGTTTCACAATACATAGTGTCAAAAACGCTATTATTATTGTGGGACGGAGGGAG
TAGTTTTTTTCTTCTTCTTTTTGAATAAAAAAGGAGGTTTATTGAGCCATAGCAGAGTTA
CAACCAACACGCACTGTGCCAGCGATTTCCTCAGGGCAATTCCTAAACCAATAAGCTGTG
TGGCCGTCGGTGGTGAAACTTCACAACATTCTGATAACGAACAGTAAATATTTATTTACA
AGATTTTTGATAGAAATTATTAATGACTTCAATTGAACCCAGTTGTTGTACAAAAGATTT
CCCCCTGGTGGCCATGAGCATGGTCTAAGTTTGTTGGTATATGGTTTACAACGTCATGAT
CACCTGAGGCTTTCAGAACTTGAACTTGATCTAGTTAAAAATATCTTAATGCTACTGTAG
CTTCATATGTAGCATTAAGTTCCGCAAAGTTCAAATTGAACGGTTACAGTAAGTCAGTAA
CTTACCCACCATTCCAGTCATCCCGTGTCTATTAGAATGTAGGAAAGCATTAAGTTGCTG
TAGCTTGTGTGAAATCTTGTTGCTTTTCCTGCAATTAATTGTAGGATTACTTGAAGTGCC
TTGCTTGAATTAGCAACAACAGTCTGGAAGCAATCAGTAACTCACCTCAACAGACCAATA
GAGCCTATAGCAGTAATACCATTTTGACATGAATACAGAAAACCAAAGAGAACTAGCCAC
GAAAACATAGGACATGTGTATTTAGATGACTATTTCGTTATCCTGTATGTTATTGTTATG
AGGAGGTCAGACTCATGCCCACATTGTTAATATTACTGCAGGAAGAATTTTTGAGATCGG
ATCGGCCGGCATCAGCAGTCTAAAAGGCCACGATTTGCGGAGATCTAGATGTTTGAATGC
ATTTGTTTCCATGTATGGCCATATGCCCCTGGTAGCGACTACAGTCAAGGCTGTTGATAG
CCGAACTAGCTGGTTTTGGTGATATGGTTTTAAGTTCAGTTTGGTTTAGCGTTATTATGC
CTTCTCTTAGGTGCGGCCTAGCACATATTACCAGGTTAGCATACTTCTGCATAGTTATTC
AGGTCCCAAGAATACAGGTTGCAAGATTATACACATAACGTGCTGAATTCAAGATAGAGT
GGCCGTTTGCAAAGCTATAGCTTTTTGTAAATTATGTGCAGGGGAGGTGAAACTATTTAT
GAATTGTGACACTCCTCGAGTCAAGCGCAGTACAGAGTTCTGTTTTTTACTCTAGATACT
AACATTGCACATGAAACAAGGGCATGATGTATTGCCTACAAAATACCTGCAGGAGTACGT
ACTTTCATGGGGATCGCAAGGCACCTTCTCGAATGATACTTGACATCTGGCCCTAACCCC
CCCC