Map Locations of contig_7114 (3014 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_7114

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76373 1 379 bp MLOC_76373.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76373






Contig Sequence (3014 bp)

>contig_7114 3014 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATGAGATGGGAATTCTTCTTTTACCGCCTATGTCAAACCAAACTAATGGTTATTATGTG
TCTCTACAAAAGGAATTGAAGACCTGTTTTTCATAGGTGATTGTTGACTACACTAGAGGT
GCTTTGGTGTTTCGATGGTTTGCACAACGACATGGTTAGGACGATAGAAATATTAGACCA
CTAATCTTCAGTTTTAGCAGGATCAACTTAGCAGGAGCAAGGACCTAGCACATTTATGAC
CAATCCTCGGTAACACTCTGCTCCTTAGTTGTAAAGAGGCCATATTCAATTGGGATCCCC
AATTAAAATTGCATCACCCGATTTTGATCACGTTAACAATTTCATAAATATTTCTCATTC
AATTCTTTTATACTATCCAATATGCTTTCTATTTTTTAAGCCTTCGCAATTAATTAAAGA
CTTCAATTTAAAATTGGGTCACTTGACTTTGATCGGGTCAACAATTTCTCAATTAGCACT
CGGATTTATTTCTTTTAATTCGTTATATTTTCTAATTTTGAAGTTCTTTCATTAACTTGA
GATATTCAATTTTAAATTTGTTTTACGATTTTGACTAGGCCAACGAATTTACAAATCAAT
CAGCAACAACCTGCCTGTAAAATTATAACAATCTCGCTCATCCTCCCACCATCTAGAAAA
AAAAGAAGTGTTACGGTGTGATAATGTAGCATCAGTATAGTATATGCAACCATTGATCCA
AAATTTTCCCACATAAATATAGGTTGACAGTGGATAACACAAAATCACACCACGGAAGAC
CCACCAAATAAGCGCATTATAAATAAAAATAAAACATATTGTCATCTCTTCCACTCGTCA
CGGAAGAGATGATAGTATGTTTTATTTTTATTTATAATGGGAGAAACCTTCCACCAAACA
ACTTTCTCTCTTTTCAATGCAATGAAACGCAAAATCTATTGCGTCTTCTAAAAAAAATTA
ACATGTCATCAGTTCTAAAATATAAGGGGTATTTTTTTGGAAAGTCAAATTTCTATAACT
TTGTCCAAATTCAGAGAAAAAATATCGACATCCACAATATTAAATAAAAAAGGATGGAAA
ATCAATTTATGACAAATCTAAGCATAATATTTAATATTATGAATTTTGATATATTTCTCT
ATAAATTTGATCAAACTTAAAAGGTTTGGCCTTTCATACACCTTATATTTTGAAACAAAG
AAAGTATTTTTTTTAAGGAACACAACAACACTAACGACGCATCAAAATACAATCCTACTA
GTAAAATACAATCCTACTAGAGATATCGAGATATATGTAAGGAGCTAAACAGTATAGTGA
TGGTGAAGATGTGAACTGGATCGGCTCTGTCCAACATGTTAGCAGTTTTGGTCTTTTGCC
AATAGTACACTGCCTGCAAACAAGGAATATCCTATTTGACGCAAACTGCGACAAGTATTG
TTGGAACACACAAGGAACAGCTGCGAGCGAGCGACATGGGCCGGCCCACTACTGGATGAT
TACATTCCAAAGCCGGTTTTCACTAGTTTTCCGGCTTTTCAGATTTTCCTCTTTTATTGC
TGTTTCTGTTTCTGTTCTTTTTTCTTCCTTCCTTTGCAAGTTTTATTTTCCTTTTTTACA
GTTTCCTTTTTATTAATTTATGTTATATTTTTGAATTTTTTAAATTATTTAAAAAGTTTG
AATTTACAATTTTCCAAATATTCCCAGTTTGTTTGCTTTAAAAAATGTTTGATAATTAAC
AAAATTGTTCGCATTTTCGAAAATATTTCATGGTTTCGATAAATGTTAGGGATTTCAAAA
AAGTGGTTGATGTATTAAAAAAAGTTCACGTCTCCAAAGTTGTTTAAGTTTTCAAATTTT
TTCTTCATTTGAAAAGAAATTCTTAAATTTTAAAAATTCGTGCTCTCAAAAGTATCTCTT
TCAAAAATTTCTTCTAATTATGAAATTTTGTTCATAAAGTCAAAAAAATATGTAAAATGT
TCAAAAATGTTCTGTAAATTTAAAAATGTTCGACTTTGAAATAAATTATTTATAACTTCA
AATGACGTTCCATTTTCTGAAGTTGCAAATAAAATAGGAAAACATAATAATTTTCTGAAT
ATGTGAACAAATTAGGAAAAACTTGAACAATTTTGAAATTCTCAATCATTTTTTCAATTT
GTCAACAAAATTTGAAAACACAAACGTTTTTCGAAACTATGAACATTTTTTTCAAAACGC
AAACATTTTCTCTAAATTTCCTGAATAATTTATGAATTCCTTACCAAAATTTGAAATGCC
AAACATTTTTGTATATTTGATTTTTTTGGAAAAGATGGAACAGTTGTTGAAATTCCAGAA
CATTTTTTGAATATGTGAACTAAAATTTGAAAAAAGAACATTTTTTGAAAAGTGTGAACA
ATTTTTGTAAACAAGAGCATTTTGAAATCCCAGTCATTATTTGGAAAGTTCAGCAAATTT
TGTACAAAAACAATTTGAACACTTTTGGACAAACGGGAACATTTTTTTAATGCGAACAAT
TTTTGAATTTATGAAGAAATTTTGGAAACACAAATGTATTTCAAGAGAACGAACTTTTTC
CAAGTTCGGAACAATTTTGTAAATATGTTTTTTTTAAAGAAAAACAAACTTGAAAAAAAG
GAAAATGATAAGAAAAGAAAAATAAACAGAAAAACAAAAAATAAAACGGAAAAAACAATA
ACCTTGAAAGACCATTAGAAAACAGGAAAACTGGTCCAGGAAAACTTCTAGAAAGTTCCC
AAAACCAAAGAAAACCAGTTGAGAAACTCTAGAAGGATCCTAAAACCGAAAACAATGCAA
CATATTTTAATGGGTTGGCCGAGGTCATCGAGATTATGACTAATTTCCAACTTCCCCCGC
GCTACATCCTTACCCTACTGCCGCCTAAATACGGCCATCCCCATCCCTCATCATCGCCCG
ATCCATCACCTTCATCATCGCACGTCGACACCACCCCCACCTTGCCAACCGCCAATATTC
ACCCCATCGCGGAG