Map Locations of contig_7108 (7474 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_7108

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76355 2 2339 bp MLOC_76355.1 Available Available LOC_Os02g04660.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m00489 protein arginine N-methyltransferase 5, putative, expressed
MLOC_76356 1 425 bp MLOC_76356.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76355






CDS Structure of MLOC_76356






Contig Sequence (7474 bp)

>contig_7108 7474 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GCGCCGCCCCCCGCGTGGGAGGGCTCCGCCGCTGGGGCGCGCGGGGCGCGCCAAGGGGCG
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GTCGGGTTTTGAGAGAGAAGAAAATGCCAATCATATATGCTAGGTTTTTGAGTGCGTCCA
GCTACCTTGATCAAAGAAACAGATCTTAGAACCTGGATGCAGGGCACATGCTGTAACTCC
AAAGCTTTTGTTTTGTAACATTTTTTACTTGTTATTGTTGTTGACGTGTCAGTCCTTGCG
TGCTAGAGTTAGGAATTGAGCTCATCATCAGTTTTGGCATTGCCTTTTGGGATGCAAAGC
AAGTGGTTTACTGGAGAATCACAAACATGCATAGGGTTTACTACTCATATAATTCTCGAT
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TGTAAGTGAACAGTTGGTTAACCTAATGGTAAAATATAAGTCAGAAACATATCTCCCCTT
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TGTTGTCCCACCTCATTTTTGGGGATCAGGTTTGTGTATTTTTGGAGCATAAGAGAATTC
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ATATATGTTTTGGACGTACGAGTCCACGGCCCATCTTCGTATATGTTGCACCCGTCCTAA
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GAGTCAAACTGATTTAAAGTGTTTAAGTCTCACATTACATTTAATTCATAGAGATAAAAG
AAAAAAAAAGGTCATGCATGCATCTATTTCTACATCTGCCGTGCAAGCCCATAAAAAAAC
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ACGGAAGAGCCTCTCCTTATTTTCTCATCTCACCCACCCCACTTGTATGGTCCATCCCTC
TTCCTCAAAGTAAGAAAAAAAAAACCAAACCTCTCTCCCACAACGACGCTGACACGCGGG
CCCACACCAGGACCGACTAGCTGCTACTAGTAGTAGCGTAGAAAACCGGAAAAGAATCGA
GAAGCTTCCCGAGGCACGTGCTCGCTGGCCGCGGGGCCAGAATAAAAGAGTCAAAATTGG
AGCGCCCCCATACCCCACCCCCCCTACGATCCCCGACGCGCACAGAAAATTCTGGTGGCA
ATCCTCTCCTCCTCCCACCCCGGGGAAGAAGAAGCCTCTCGATCCCCCGAGAAGGGGCGC
TCTTCCCCGCGGATCTCCTCCCTCCGAGAGATCTGTACCGAGCGAGCGGGCGAGGGCTCG
ATCCGCCGATGGAGGAGGCGGCGGCGACGGAGACCGTGACGGAGACGGGTACGCCGGAGA
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