Map Locations of contig_70314 (13321 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_70314

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76161 1 410 bp MLOC_76161.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76161






Contig Sequence (13321 bp)

>contig_70314 13321 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAAGTTACCTGCATTGGGGCCAGCCTCAATCAATCGATTCCGCATGCCCCCACGGTCCTC
CTCTAGTCCCTGGAGAAGAAAGATGCAGCGTGCTTTCATTGGTGCTTTGTGTGAAAGAAT
AAAAGCAAATGAGCGAACGGATAAGGTTCCTTATCGTCATCCTTGATGGATGCAAAAACG
AATTAATCCATTCGATTCATTCGGATTTGCACAGAGGACACCCATGTTGCAGTTCATGGC
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GCGAGTGTCCCGCGTCGGCAGTTTCTCCTGCAGATGCGGGGAAAAATCCTTCTGCCCTTG
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CTTAAATCGAAACTGAAACGAGCAGCTTGCAACGATCCATCGATGTCATGGATCCCCATT
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GACGAGGTGGTGCGCGCGCGCCCACACCAGCTGGTGGCTCTGGTGCACGGACAGCTCCTG
CATGTCCTTCTCCTTCCACCAGTACCGGCCCTCCTTGCCCCACGAGCTGCCGCTGCAGCG
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GGTCTGCACCAGGTACGGGCTTCGCCGGTGACGTTGCCCAGGAACTCGAAGTCGAACTCG
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TACTCATTTTAATCCTATACAAACGGAACAAGCTTTGCCTGATGCATATGGAGATATTAT
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TGTCTGCAGACGAGGAGCGTACGTACCGGAGGAGCTGTCGAGGCGGAGCTTGAGGAGGTC
GTCCTCGTACAGGACGTGGTCGTTGGCCCAGCTGGGCTGCACCACGTCGTCGAACTTGCT
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GGCGACGTTCTTCCACCACGCCATCGCCGGCAACCCGCAACGCTACTCTCACTTGTGTTG
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GCCCCGCAGATGCCACTGCCGTGTCGTGTTTAGAGTACACTACTTTACGCTTAATAATCT
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AAAAGATTGAATAAAGAAAAAATGAAGGTGGTCCGAGGTGGGGTCGCATCTTATGTGCCG
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GTTCTCTGACGTCTTTGTTTGATCGTGGAACACAAACGAAGAACGCGAAGTTGCAGCTAT
GGCTCACTTCTAATCTAAACAAAATCCCAGTCTAAACGGCGTCCTAAGGGCTGTATATAT
GGGGGAATAGAGGAGGGTTTTCGTGACCCATTGGAGGAGGGGTCTGAAACCGACCCAAAC
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TTTTCTTCTGTCTCTTGTCCGGTCACCGACCGGGCGCGTCCACAGACGTAGGATGGGTCA
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TGTGTATCTAGGTCGTCAATTTGACCAACTTAATAAGAGGCATATATTATAAAATATATA
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TTTTATATAAGTTAAATTAACAATATAGGTACACGTGCACGTCTTATAAACTATGATGGA
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GGCTATATTATTAACCATACCCTTAAAGTTCCCGACATAAATTATAATTAAGCATTCGTG
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TGTTTGTGACTAAGTTATCACGTTTGACTGTTTGTCATGCAGAAATTAGCAAGATGTTCA
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TGCATGGAGCTTCGATGGAGATGTCAAGTCCTGCATGTCCGACAGGTGCTACGCTTTGTC
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TCGTGGTACCGGCGGCGACCGCGACGTGCTCGGCAGTTCGCGCGCAGGGTGGTGGTGTCG
TTGGGCGCCGTGGTGGCGTTGACGGTAGATAGACCAAGCAAGGATGATGCGTCAATACAA
CTCTGAAGATGGAGTAGTGAGAGTTGGCGACGGCGGCCTGTGAGAGCATGCCGGACCGGT
GGGTGCCCCATACCCGGTAAGTGGCTTGGTTGGGGCCTCAAGTCTTAGATGTTAGACTTG
TGTGCGAGGTCTGTGGTATTAGGCCCGGACTATCAGCATCCCTTCATCAGATGGATAGGA
GTAGTGACGGTTGTCGCCTAGACGATGGCTTCAGACTTATTGTTATATTTCTTTGTAAGG
TCTTGTGTGAATAATTTATAAAATGGCTGCATGCATCGTCCAGATGTAAAGGCCGGGGGC
GATCCTCTTTTTTCTAAAAAAATATATGCATGCGTAGTCGAATACTATTTTTCAGTCAAT
CTCACAGTCAATCAATAACCACCTAGGTTCGAGGTAATTTTTAAATACGCCTTATAAACC
GTGATGGAGCAGTACCATTATGTGTCATGCATATGTCAATAAATTAATTAATTTGTAATT
CTACACAATCTCGATGTACCGTGACGAGGACGGAAAGGAAAATGAAAGTAATTAATGTCA
ATTTACTAATTAATAAAATCAATTACATGCAGTGAATTGATCAATGCATGTCGTGTTAGT
TGGTCTCAATTTATAAAAAACATACACGTCCCATGTCTTTGAGTGATTTATTTATTCATT
CATGTCAAAAAACAAAAAATAAGATGAAAATTAATGCATCGTGCTTGAGTATTTTAAGAT
TGTTTGATTTTTTTAAGATGACTTGTACATAATATATAAACGCCTCACTAAATAGTCCTC
CCATTTTTTGGGTGCAAAGCACGATGATAACATCACACGCACACATGCTGTGTCTTTTGG
TGGAACGGACGAAAACTCACGAGGCATGATTCCACGAGCTCTCTTCTTTTGGCTCTTGGG
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CTAAACCGTTTTATCAGTGGAGAGATGCTCTCTTCCTTTTCGTTTCCTTTTTGGCGGACG
AGAGATGCTCGTGCCTCCTTTTGTTTTCGGAGCGAAGTGAAGGACGTGATGGGGCAAGGA
CCATCTAGTGCGACTGGCGTGTGGGCCACTGCCATTTGCGGCTGACGTCATCTACATTAA
CGTGTTCATACCAGCTCCTTTTACGCCCCGGTCCTGGAAAAGGTGAAAAGGGAAAGGGTC
TCGGAGTTTGGACTCATCTTTTGCGTCCAAAAAAGTTTTTAAGACGGAGACAACAACAGC
TCCTGCTGGCCCCGATCAACCTTTGGGCAGGTCATGTTTTCAAATTTAAAAATTGTGCCG
TTGCTCGGCTAAGACGCCTTGTTTTGCAGTTGCACTGATCGGCAGCGACCGATCAGACTA
CGTACGTACCTGTGAACGAACAGCAACACTGCTGAATCGTATTCCTACTCTGTAACATAC
TAGCGCTCCAGCCCTACTTGCGGCCAGCACACCAGTGGGCTAGCTACAAGTGCGACAAAT
GAGTGTACCTACGCTTACACGTACTCCCTACTAATGCGAACACCGAGACACACTGTAACG
ATCTCCGGTGCAACAGTACTGCATATACACACACGACAGCCATCCCGTGGCGTGGGTAAT
TGCCCAGCCGCACGCTGTACAAAGATTATTACTACCGTCTGAAAACAGTCCTTGAAAACG
CAGTAAAAGTAAAAGACGGGACATCTGCCTACGAGGGCCTGTGACCGTGTCGGGGGCATG
GCCGCGTATGAGAAACCATCAACGGCCATGCGACGGACGTGAGTGACCCTTTGCCAGATT
CCGGGTCTGGACGCCCGCGCCATGCCTCGAATCGTGTCCTCCTCTGGGGTAAAAGTTTCC
CGTTTCTACCTCTAGCGCCGGGCCCTAGCTAGGCAGGAGGCAGCAGCTTGCGCCCGTCGT
CACGGACTCGTCGTCTCCACCGCGCGCGCGCGCTCGGTCGATCGACAGCGACTTGTGGGC
GCCTGCAGCGTTGGTTTGTGGCCACTTCCGTCGTCGTTCTCTCAGTTTCCGTGACCAGAT
AAATTCCCATCGTCGTGTGTGGATCGACCGATCTCGTCTCGTGTGTGCACCTGCAGTAAA
ATGCCCCGGTAACTTGGATCGCTCATCCGGTAAGTAGTATGACGAGTGGCCCGCGTGGCA
GGTTCCGGGTATCTTTCGGGCAATGGCAGTTTCGGACATGACATGGTGCATGATGCATGA
TGATGCGTGATGAAATGATGGCCCATGGGATCCGGGGACGGATGTGCAGTGAAGTGACAG
AAGCCATGAATGAATGATCCCGGCCGGGCGCGCGTGCCAAATTATTGCTCTGGCCATGTC
ACGTCGCATTGCTTCGGCCAGCAGCACCATAAACTCCGGTAGTCCTCGCACGCCAATGGC
ATGAGAGAGGCTCCGAGGAGGAGGAGGATACGGACGACCTATGGCTCTGAAACGTGGCTC
GCCTCTCGCGATAGTCGTGCCTCGGCCAATTCCACCGCACCACCAAGACCTTTATGACCG
GATTTTGTTCGTTTGAGATCGTAATGGATTCTTTCATGTTCGCTTATGTCCGTTGGGTCA
TGCGTGCACGTACTGCGTGGCCGTGGCCGCATCCCAAATCATGTTCGTGTTGGACATGAT
TAAAAAAAATAGAAAAACTTAACTCAAAAGTGAATAAACACAGTTAAAAAACGTAAAACA
TAATAACATTAACATAACACAAACGGTCCAGTTTTCACGTCCACAAAACGGTTCAGTTTG
ACATAATTAACATAAAAAAAGAAGCTTGTCGATGCCGTGACCGTCACCGTCTTCACTGGT
CGCCAGTGTCGTCGCCGTCGCCGTCGTTGACGAGGTCGACGTAGGCCGGCGGCGTCCAGA
GGTGGGCCGGCGGGCCCTGGTGCGGTGGGGCGGGGTGGAAGCTGGGGGGGGCAGGGGGGT
GGGGAGGGTGGGGGGGGGGGAGGGAGGGAGAGGGAGAGGTAGAGGGAGAGAGAGGGAGAG
G