Map Locations of contig_7017 (4415 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_7017

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76113 2 1346 bp MLOC_76113.1 Available Available LOC_Os01g55360.3, FRAME:-3, EVALUE:9e-61, 13101.m05831 protein phosphatidate cytidylyltransferase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_76113






Contig Sequence (4415 bp)

>contig_7017 4415 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCCCCCCCGCGCGCGCACCTTGCCTTGCCTTACCGCCTTAAAAACAATGTATT
TTATCACTCCTTACTTCGAACTTTGAATCTCACCTACAAAGGATTGAGTATGGAGTGGTT
ATCCGACTCAGCTTGTCGAACAACGACCATCTGTGTCATGTCATCGTGGGTGCGGAGGAT
TCCGACCGCGTCCTCCTCCAGGGTTGCAGAGGAGCGAGCGAGCTAATAAGAAATCCACTT
TATTTGCTATGGGCACCCCATGGGTGGGGTTTCATAAAATAGATTTATTATAATACTTGT
TATTTTTGTTACATTAGGTGAAACCTTAGTTCTCAGGTTTCTTGAAAATTTTGGTCATGT
ATGCAAAAGTTGATGAGTTCGAACCCTGCCTATACATTGCCATTGCTAATCCATGTGTTT
CGTCCATGGTTTTAGATTTGTCTCGTGTTATCTTATCCATTTGATCTGCTCGGGAAAACC
CTCTCTCCTTTTGATTTACTAGAGCGAGGATGTCACTCAGGGTAATCATCCTTCGACTTA
TTCTATCGAAGTCTTGTGCAAAGCCGTCGTGGAATTATCAAGGCGTCTTTCTTGTGAATC
TTATAAATTCTAAAGTAGCAGTTGTGTAAGTTAGTGTTGAAGTTGTTTTTTCAACAGCGT
CCTTTTTGACTTGTCAGAGTTGGGGCACTCGTCGCCTCCAACAAATATGGACACGCTCTC
GTTCCAAACTCCCTCTTCGTGAAAGCAAAAAAAAATAACTCAACAAGAAAAAAGAGTTTA
TAATCGGAGATCATTCCATCTTCCTTATTCAGTACAATATTGCATACATGAGATATTCTA
CAGAAACACCCACAGTGCTTAGCGCCCCCAACCCGCCCGCTGCCTTGCCTTGCCTTACCG
CCTTAAAAACAATGTATTTTACCACTCCTTACTTTCAACTTTGAGTCTCACCTACAAAGG
ATTACTTTGAGTCTCACCTACAAAGGATTGAGTATGGAGTGGTTATCCGACTCAGCTTGA
CGAACAACGATCATATGTGTCGTGTCATCGTGGGTGCGTGAACGCTATCACCGCCGGAGA
AGGGCTTCCCCTTGGAGCTAGCATTCCTTGAGAGCCTGGAACATCTGCTTTATAGCTTCG
GTCTTCTCCTCCTCCGTGTTGGTCGTGAACGCCACTTGGATGTCCACAAATAGCATCATT
GAATAGCTCAACATGCATGGATACAATTGAAAAAAAAATTGATAACAAAAAAAATTGTTG
CTCGACGTTCTCATCATAGCTCAAGCCCTTGAGGTGGAGCGCGATTTTCACCCTGGCAGA
CCAGGGGCTCGCCCATGCACTCAATCTCCATCCATTTTCTCCTCCCTTGCACGCTATGGG
TGTGTGTTGCAGATTTCAACTTTGATTGTTTTGCTCGGTTCCTTGCTAGAGTGAGAGGGG
TGAGTTTTAGAGCTTGGGTGATGGGTATGGAAAGGCAAGAATGCATCATCCATGAGGCCG
GTGCTAACGTCGAGGCTAATGACCCTCCACAATCACTTAGTTTAAGATATGCAAACGTTG
GATGGAGATTTTGTGCAATGCTTAGTGGGTCGTCGCTTGCGGATTAGTTGACTTTCATGT
CAAGCTTCTCAAGGCACATTAGTCATGTCTTGGAGAAGAAGGCTATCAAGTGAAAAGATT
GGCATAGTCCTTGACATCCCCAGCCAGTCATCATCAACTAACTTCAGACTAGTCTTGTAC
AAGGACATGAACCATCCCATATAATAATACTCCAAGCATGCACAACACACTCTGTAATCA
TATAATGTGTACTAGTCTGAACAAGTCAAATGCCTAATAGTCATCCTCCAAACAGTGTAT
CCGTCCCTTCTGCAATATGAATTTGCAATTTGGATGTCGATGCAAACGGTTGTATTACGG
ACATATGGTGACATGCAAAAAAGATGTAGGGCTTGTTTGGTTGGAGACTAATTTTACCAA
GCCAAAGTGTGACAAGCCATTAAAGTGTGGCAAGCCACAAAATGTGGCTGAAAAAACGAA
CGCGGCAAAAGTTGACAAAAAAATTGACTCTATGACAAATGGACCATAACGACAATAAAG
TGTGACAAAAAACAGACATATGTCAACTAAACTGCGGCTGCCAAATTTTGGCTTAGCAAA
GTGTGGCTGGGAATCAAACAGGCCCGTAACATCAAACAATTTGGCATGCCACATAGTACT
AGTCAAACTTAAAGATGTTTTGACTTAGGACAAACCTTGAACTTCAAATACTTTGAATGA
ACCGGAGAGTAGTACATACTGTTAATGTAGATGAGAGGGGCAACGGAAACATGCAGACTT
CAAATATTTTGCGTGCAGCTCTCCAAATATTGAGGTCCAACAAAGCGAGGGTTTACAGGA
ATATAAGTTTTCCATCTCCGATTACGACAAACAAGCGCTTCGGGCAAATTAATAAATCAA
TAGCAGGGGAAGAAAAGAAGTAGCAACAAGTTCACAGCGAATCAAGCACCTAATTAAATT
AGTTAGCCCTATCAACCATAGTCCATACATTCGTTCTGTACAATGTTTTCCATCACAACT
CACAAGGGTACAGAGGAGCTCCGACGACGATGCTGTACACGGTGAATCTAGAGCTACATT
CATGGCGGCGAACTCAGGTCTCAAATAAATAACATACACAGCCAGCCTACTGTATCGTAT
TGTGTGCTTTTCATAAGCAAGCAGACAGTTTATCAGCTTTGCATAAGTTGCCTAACATCT
CCCCGAGTTGCTCATACAAGTTTCTCTGCTCCTCGTACGTCAGGTTTCTTAAGATCTGTG
TGTTTGCAAAAGAAATATAGTAGGCCATGAATGGATGAGAACCACGATGAACAGGATAAT
AGTAAGATCAAACGAAAACCAACAAGGAGCTACAGATACGGACCTGATCCAAGATTGCGT
CAACAGAGAAATTGTGCGGTGAGATGAATGACTGGTGGTATATGTATGCAAAAACTGCCA
TGACCATCTGGGGAAAATATACGAGAACAAATGTCATTTTCAGCTAAACTGCACAGACTA
GGAATATATGATACATAACGAATCTTAAACAAGCTCATTCAACTTTGCATAATCAAGTCT
TCTCAGTAATTTCTTCTTTACTCTAAACAACAAGCTTGGGCATTTACGTCAATAAGTTGG
TTCACAATTGAATTGCTAACCACATGCTTCCTCATAAAAATTAATGTAGAATGTTGAGGT
ATATGCATATATATGTTTCATAGCCAGCATGTAAATGTTCTTTGCGATGACTTACTTGAC
AGTCCATTCGGTCAGTGATTCCACCATGCCCAGGTATACTGTCGCCAAAATCCTATAAAA
TTTGAAGATATTAATGGAAGTAAAAAACAGCATAATTTCCATACTTTAGTATTCCCAGAG
AAAGCAATGATAATGTAGCAGTACACACCTTTATTTTAAAAGCCCTCTTGAAGCCACTTG
CGAAAAATCCACCAAATGGTGCAATTATCGATGCAAACAAACCAAGGGCTAAAGCATGCC
ACTGCACAGGCATTAGGAACACATCTTTCCATGGAAACTGTCAAGAGACAAGTAAGCAGA
AAATGTTCATGACTAAAAGATCCATAAACTTTGTAAAGATGGTACAAAACCAGTAAGGAA
ACAACCAAGTACGTAAATATATCAATTATCATGATAAAGTAGCACTAATTCATCAAGCAG
GAGGGATTTGATGGATACGGGAAAAGAATAGTCTGTTGGTTCAGCTGAGCACTTGGTCAC
ATGCAAATGACGTGAGTATGCTTGTTTTAACCTTTCACGGACCAAAAGGGATAAACATCC
TCATTGGTTATTCAACCACTAGATTTGACCTTACCCAAAAGCCCTGTGATTTTAATAAAC
ATGGTACCTACATGTTAAACTTCCCTAATGTAAATGCTGCTTTTAAGTCGCATTAGCAGC
CACAACAAGTGCTCTGTTATTAACCTTGGTTCACATCACCACATCGGGATAATTACTGTC
GGGAGGAGGACAGACAAATATGTGACATACTTTTTCTTGATTGTCAAACACAGCGTTGAC
CCTTTCCAATTATCAAGAGGGGTACCCGTAATATTACTTCTAATCTTCAACTGACACAAG
ACTGGGACTAACATGTCATGGACAGCAGCTACTACCCGCAGAGAACTCCACAACTCCTTT
GAGACTAAACTCCATCTGGATACAGGACCTTCTCCAGCTCAAGATTCTTGCCGCCGCTTC
TGCCGTGCTCTGCATATGACTGGCTGCTGCTGATCCTTCTACCTCTGCTTCCATAGCTAA
GGAATAGAGTCAGCGCCGCTGCTGATGTGCTCCACTTCCCTGTCGGCTGCTGCGAATGTG
CAGTAGGAAGGAAGTGTTACAGTATATGTGGATTG