Map Locations of contig_69811 (10615 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_69811

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76008 1 986 bp AK358994 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76008






Contig Sequence (10615 bp)

>contig_69811 10615 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ACTCGTTGTCATAGCAATTATTAGGCTTACACTCATATTCCGCACTTCTGCCTAAAATTG
CTAAGTAATTATTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAGGTCCATCTCGA
TCCTTTTCATCTAGTCGAACAATCACGAACGTAGAGGATAAACACAGGAGCTAGTCAACC
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AGTCGCATCATGAAATGGATGCACAAATGTACTATAATCGTCTTGTATTAGAAAGCCCCC
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CTTCTCAGGGAGACGTAGCACAAGCTTGCTCACATTGTAAGTCTTCGCCCGAACTTCCCT
GCTCTAGTAGCACCGGGCCTGTTGTTGATAAAAGGTGGAACGTGCAAGAGCTATATCAAT
GCGTGCAAGAGCTATATCACACTCTTCTTCAAGTGCGTCCAAGTCATCCTGCCGATCCAC
CTCGACTTGTTTTTCCTCGTACATGCGCATTCTAGGTGCATCATGAATGATATCACAGGG
GAGGACTACTTCCGCCCTGTACACTATGAAGAATGGCCTATAACCCATAGGTCTATTTGG
AGTGGTGCGTAAACCCCATAATACGGAGTCGAGATCCTCTACCCAGTGGCAATTGGACTC
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ACCTGTCCATTTATTTGCAGGTGATACACGGAAGCGTAGTCGAGTTTAATGCCCAAGTTC
GCGCACCAGTCCTTAACTTCATGGGCTGTGAAATTGGATCCATTGTCCGTTATTATACTA
TGAGGAACACCATAATGGTGCACCACATCTGATATAAAAATCAATGACCGATCCGGACTT
GGCAGAAGTTACTGGTTTAGCTTCGATCCACTTAGTGAACCTATTGACCATAACGAGTAA
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GAACACCCAAGTAATCAATATTGTCTGAAGAGGTGTTGCACGCATGTGTCTTTGATTTGC
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GGACTCTGGTAGTGCTTTTTCTATAGATTTCCCCTTCATGAACCTTGTAAAACTTGGATC
ATCGAACTATCCATCTTGCTTCTGGTTGGTCATTGGGGAGTTCCTGGCGAAGAATATAAG
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CCTCCAGTGCGGAGCCGTCGATGATTTGATCATCTAGCTCAACTATAAGGGGAGTAACTT
GTTCCTTCCCGTGGCTTCAATGTCTCCATTTTCGTTCTTCCATACCACGGAAGGCTTGAA
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CATCGGCAACCTGATTGTTGTCTCTGGAGACATGCTGGAATTCGAGGCCTTCGAACCGAG
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CTCCATTGATTTGGGAGGATGACGAGCTTCGAACCCCCCTGCACCTCCAACCTTTGTACG
CCCATCGAAGTTGCCATCCGTAAACCATGCAACAAAGCCTCGTATTCGGACACATTATTG
GAATCAGTGTACATGATTTGTAATACGTACCGGATATTGTCGCCGGTGGGGGAGGTAAGT
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AATATGTATTGTACTCTTTAGGGAGTTCGGCTTCCGTCCATTCGGCTAGAAAGTCAACCA
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TGGCCCATTTGGCTATGTGACCAGTAGCGTCCTTGTTATTGATTATATCAATCAAGGGTA
CTTCAGATGCTACCGTGATCGAACACTCTTGAAAGTAGTGTGGGAGCTTGCGAGATGCCA
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CGACCACGAGTACCGCGCTGACAACATGGTTGGTGGCCGAGATGTATAATAACATTGGTT
CTCCTATGGTAGGTGCTACCAGTATTGGGTTACTGGCTAGCAGTGTTTTAGTTTCCTCCA
GGGATGTTGTTGCTTCTTTGGTCCACTCAAAGTTTTTGGTTCGCTTAAGCAGTCGATAGA
GTGGTAGTGCCTTTTTGCCGAGGCGAGAAATGAAACGGCTTAAAGCCGCCACATAGCTCG
CTAGTTTTTGTATGTGTTTTAACTTTGTTTGGATCGCCAGCTGGGATAGAGCCCGAACCT
TTGTCGGATCGGCCTCTATTCCTCTATGGGGGATGATGAAACCGAGCAGTAAGCCTGCGG
GAATGCCGAAGACACATTTCTCCGGATTGAGCCATAAGTCATATTTCCGGAGATTGTCAA
AGGTTTGTTGGAGGTCGTCCACCAGCTCACTGACGTGTTTAGTCTTGATGACCACGTCAT
CCACGTATGCCTAGATTGTCTTGCCGATTTATTTTTCTAGGCATGTCTGAATCATGTGTT
CATATGTGGCACCTGCATTTTTTTAACCCAAAGGGCATTATGTTGAAGCATAATGGCCCG
TAGGGAGCGATGAAAGCAGTTGCGCCGTGATGGGATTCCTTCATCTTTATTTGATGGTAT
GTGGAGTAAGTGTCAAGGAAACATAGTGAGTCGTGTATGGCTGTGGCATCAATGATTTTT
CCTATGCGAGGTAGAGTAAATGGATCCTTAGGATTGAGATCTTTGAAATCGACGAATAGC
CGCCAGGATTTGTCCTTCTTTGGAACCATGACCAAATTTGCCAACCACTCGGGGTGTTTG
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GCGAGCGTTGCAGTTTTATTCTCGCGTGCAGACCCTATCCGGGTCACTTTTGAGGGTAAT
GACAGTGTTGGGTCCGGGCATTTTGAGTTTCATGTACCCATAATGCAGTATGGCTTGAAA
TCTGGTGAAGGCCTCCGTCCCAAAAGAGCGTGATAGCCCCTTTTAAATGGTATAATATGA
AAGATGAGTTCTTTGGACCTGTAATTCTCATAGGTGTCGAATACTACTTCAAGGGAGACT
TGGCATGTGCATCGCGCTTCTCTTTCGGGGACGATTCCTCGAAAGGTTGTGCTACTTCGT
TCGACGCGGGATCTATCGAACTGCATTTTATCCAAAGTATCCTCATAAATGAGGTTTAAG
CCGTTGTTGCCATCCATTAGTACCTTGGATAGTTNNNAACCATCTATAATGGGATTGAGG
ACTAGTGTGGGAGGTGTACGGTAGAATGTATTCCAGGCTGGTCCTCCTCAGTAAAGGTTA
TAAGCATGTTTGTCCAAGAGTTTGTTGCTACCACCAGGAATACCAGGTCGGTTTCTCAAA
GAGCTCTTTTTCTTTGATTATTTGAGGAGAAAGTCTCGTAAATTGTGAGTACGTCGACAC
TGTTGTGTTGCAGTTCGGATGAACGCTTTTGTAGTGGTTGGGTCCCGAGGATAACCTCTC
CGCTTTTGGCCACCTTCCTGATGACCCAACAAGCTCGAAGGATGTGAGTCGGGCTAGTGT
TGGGTAATGCGGCATGTATAGGGCATGGGTTGTCCAATAGTTTATCAACTACGGTTTGGG
ATTCATCAAGGGGCTTGTTCTTCTTCCCCGAGGGCCCACGATCGATCGATCGTTGTTGGG
GCGCGTTCTTCCTTTGAGCTTCTCTCGGCTGCTCTATATGGATTGATTCCACTTGCAATT
GTTGAGACTGCCAAGTACTTTCCATTGCACAATATTTGTGTATCAATGTAGAAAGCTCGG
TAAGGCCTTGTACGCGGCGGCGGGCGAGGGCATTTAGGATTGCCTTCTCGTGACAGTTAT
GATTTGTTTTTCTTATCTTATACTATAGAAATAAACCTTTGATGATAGAACTAGAATAGA
TATCTTTTGTTCTCTACTCACGCGGGCCCATATCCTTTCTTTTTTATCAATTGCTCCGGA
ATATGTCTATAGTTTCCTCGCCGCTGCAGTCCCGTATCTGGTTTATTGTCATGAGAAATC
TAGCCCAAAAGTGTTGGATTCTTTCCTCTAGCTTTTGCCGGACGCAGTGGAGGTCCCGCA
TGCTAGGCTTTTCTAAGGTGCTCACATGGCGCCTAGATTGGGAGGTGGGTGGGAAAAATT
TTGGTGTTTCAACAGAACACGCGTCTTTCGTGTTGTCAATTGTGTCTGAAATTATTGAAG
AGTATGAAGCACTGGGTTCAGGGCCTGGACGGCTGGCTGGACACGACTGCCCATGCCTCG
AATTGAGTTCAGGGCGTAATTCGATTACCAGACTACCTAGAGAGTCTAGGTTACTGGATA
CCGAGATATAGACGATTTTGAGTTCCGATGACCGAGAGGGCAAACCTTCCGCTGGTCTCT
CAATGGTGGCAATCAAGTGCGTGATAGGTGGGATATGGATTTCCCTGTCATCGGGTCTGA
TCCCGATCTGGTCGTATATCGATGGTTGGTCGTGGGATACTCCCATGTTCTGAATTCGAC
CTAGCAACTCGTCTAATTCCGTAACATTCACGGCGTCCACATTTTCGGAGTCCATGGGGC
TAACCCGAGGTGCCGTTGTTGTCAGAATATTTGGAGTCGTGACAGAGCTGCGTTCACCCA
AAGATGATCTGCATAAGGCATCTGGATCGGGCCTCAAGGCCGGAGCCTAGTCGAGAGTCA
TCTCGAGGGCGAGATCCGCCTCCTCCGATGTCGAGGCGTCGAGGGTAAAAGGCGTTGTCA
GAATAAGGTCTCCCCAGGAATCGATGACGAACTCTAAATTGCCTAACCCGATCTCCTGAA
CGGGGTCCAGGCTTTCGATCCGATCTAAGCAACCAGTGGAATTTGGCATGCACCACGATG
AGTCGAACGCGAAGATCTGCCCAGGGACGAAAACGTTCCCAACACGGATGTCATCGTCGA
TGATGAGACGGGCCATTGATCCTTCCGTAGTTCCACATCGGGCTCTCAATGAAAGCACCA
ATGTCGGTGTCAAAATCAGCTAATTTCGAGTAGGGGGTCCGAACTATGGACCTTGGATCG
ATGGATAACAAGGGACGAAAGAGACAATGTTTACCCAGGTTCGGGCCCTTTTGATGGAGG
TAAAACCCTACGTCCTGCTTTTATTGTATTGATGTAGTAGCACAAAGTACAAAGTTGATC
TACTTCAAGATTGAATGTTGTGGTTTGAGACCCTAATCGTAATGAGCTTAATCCTCCCAT
GAACTACGACCCCCTGGTTTATATAGATACCAGGGGTGCTACAACAACAGTTACATTAAG
GAAAGGAATATGCACATCACCACGTTGCCTTGGATTGCACGCCAAGTNNNNNNAAGAGTC
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CGGATAAGTGGCCCGAGGACTCCCTTAATCCCGGACTCCCTCACGAGGCATAGAGCGTGG
TGGCCGCAGCTGAAACCTCCGCATCGTGTTGAGCATCTCGTCGCGGTCGGTGGCGCTCGC
TCGAGCCGGCTGGCATGGGCCCGGATCGCGGTGGCTTGCCCGTCGGTGTCGGCGAACCAC
GCGCGATGGACTCAGACATCATGGGAAGGAGGGCGCGGCCGAGAGAAGTCAGACCACAGT
GCGGGGAGGAGGGTGTAGCGGAGAGGAGACATGCCATAGTGCGGGGAGGACGACACGACG
GAGGATGTGGGCCGACGGCGGATCCAGGTGAGGTGGGAGGCGCGATTGCTCGACTCGGGA
GTGTTTTTTTTGTCAAACGTGTCCACAGGTGGGACAGGGCAATACATAACATTTTTTTCA
CTTATTTAGTGGATTGCAAGTTAATTTACTTAATACCATAAGGGCATTTTGCAAAATCAC
TCCAACCGTAAGTGAACAAAAACGATGACAGCTTTATTATTAGGTAAATATTTACATTAA
TGATGGAGTACCGACAAAACAACATACTACCTCCGTCCAAGTGTATAAGGCATGCGCGTA
GTTCTAGGTTGTCAATTTAACTAGCTAAATATATATTATATGTGATAAAAATTACATATT
CAGAAACTACACCCTCACATGAATCTAATGGTATATTATTTATTACATATAATATATATT
TAAATAGTTAAATTAACGATCTAGAACAACGCGCATGCCCTATACACCTGGACGGAGGGA
GTATAAGCTATCATTTTCGTATAGCAAAAGCATATTATAGAAGCTCCCGAATTAAATACT
CCGAATTCATAGTTCCAAAATTGAAACGATTTCGATGTTATCACGTTGAACAATCCATTA
GAAAAATCTCAAAAACTAGGATAATCTTTCGAACTCTGTATCGATCGATCCGCGCACCTA
TCAACCGATGATGTTTTTTTTTTAGAGAAGGAGGCCACGCCTCGACCTCTGCATCGAGAG
ATGCATACAGCCCTATGAACCGATGATGTTGAACAATCCATGATGATACACACCGTCGTT
GATGAGACATCTCAATTTTGAACTTCGCTTTTAGCACAAGGCAGATGTGATTGAGCATTA
CATGTTACTATTTCTAATTTCTACATCTGGTCACCCTGCTAGGTATATTGACCAACTATC
TCGGAGTCTTAGCGTCGAATACAAACACCACGGAGTGGATGTCCAATGCCAGGTATGTAT
GCAGTAATCTCTTCATATCTTCATAGAAAACCTGAAATAGTTTGCGTCTACTAATGAAAT
GCAGACAAACTTCATTACTAAAAAGAAGTATTATAGTAATGGGTTACTCGGGTGCACTGC
AGATTCCTTTGTACGTGGCCACCAAGATGTCACCTGTTAAGGGTAACTCTCCGTTCATAC
CATCACCCGAGGAGTACGTCAAAGCTGCCATTCGTTGCATTGGTTACGAGCCGAGATGTG
TACCCTACTGGCGCCACTCTGTCCAGTGGTTCTTGGCGTCTCTAGCGCCAGACTCTGCTC
TCAATCTGTGGCGTCTCCGGGTTGGTATCCGGAAGAGAAACGAGATGAGAGCCCTGATCG
GAGAGAAGGAGCTCAACTGAACAGCCCATGGTCTTTGTAAGAGGAAACCGTAAAGCATGA
TGTGATCTGTTTATTTTTTGTGGGAAGTGATTTGGACAGTCATCAGCGCCCGTATTTGGT
CTACATTTAGGCTTGTTTCGGAAGTTGAGTATTTGGGTTTTTCTCTCGTATGTAATTAAC
GTTTGTTCTCTTGTCGATGTTCTTGATTGATGCAACAGCGAGCTACGGTGGCTCAGTTAC
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ATGACAAATTTCCCCGATCAAATTATAGTTTTATGTTTAAACCGAGCCATAAGATTTGAC
TCATCTGTTAAATAAAAAGATAATAAAGTTTTATAAGTAACCCATCTATTAATTTAGAGA
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AGATTTGACTCATAAAAAGATAATAAAGTTTAAACCGAGCCATAAGATTTGACTCATCTA
TTAATTTAGAGATGCAATATTCAATAAACACTTCGATAATACTGTGTTGGTCCTAGGCTA
GATCGTACTAGAGAACCAAGTCTAAAACACTAACGGAATCATGGGTTACGACCACTTGCA
GCAACGGATGATATGAAGTGAAGATCACAATGGCAATAAATATAATGAAGATAAATGACC
GTCAAACAGGATAGACCAAAACTCCCTCTCCAACTTTCCTCTCAAAAATATGACGCTATA
TTTTTTATGATTTTTTCTCAAGAATGCTACCGACTCAAACTGTCCAATGCAAAAAGAATC
ACTCAATTACGAGTTCGTAGAAGGGGTCAAACAAATTGAAAACTAACCTGAAACAGTGAC
AAACTGTGTTCGCCAACTTTGGAGGGCAAAAAATACTATTGAGAACATGATTTGGAAGTG
ACAATAATGAACAACTTCATGAACTATTCAGATGCGGCTTGTCTATAGCTTGAATTTGAG
TGCTCGTAGAGCTAAAATGGACTTCATATGAGGAAGATATGCATGTTTTACTAAACACTT
TGCAAAAGAGATTCCAATTCGAATTCAGATACACTATTGAGTCTAGATAGATCTAAAATA
TGTCCTTTTTCTCTTCTTACTGTTTTTCAACATTTTCCCTCTTCTTTTTCCTCTCACTTT
CTTTTTACCTTTTTGTCTCTCTCTTTTTTTTCAAAACAAAACAATTAAGATACAGAATGG
ATCAAGCGTAGATGCGAACGACCTCAAGTATGACCAAGACAATGAACGATGGAGACCATG
TGGTGGAAATTGATGGATAATGGTGGTTGACAGCGGAAGGGATGATGATGCAACGGTGGT
GTGACTAATGAGAACGGAACTCGGAACTCTAAAGGAACTAGACACTAAGACGAGCAACTC
AACACGAGATGCAACCGATAATTCAACTATGCATGCACTAAAAATAAAATTACAAATGTT
GAGCCTTACTTAGATAATTGATTTCTAACTTTTTTGTGGATCTTTATTGGACAATCGATA
ATAAAATAAAATCTATTCTAGGGATAACTGAAAATTCTCACCGAGTGATGACCCACAAGT
ATATGGGATCGATCGTAGTCCCTTCGATAAGTAAGAGTGTCGAAACCAATGAGGAGCAGA
AGAAAATGATAAGTGATTTTCAACAAGGTATTCTTTGTAAGTGTTGTAAGTAATAGTGAT
AGATAATTTTGTAGCAAGATAATTCTTAACAAGTAACAAGTAACAATAGCAGCAAGTGTG
CAGCAAGATGGCCAATCTTTTTATAGCAAGGGACAAGCCTGAAAGTTATCTCATATAAAG
TAAAGCAATCTCGAGGACACATGGGAATTGTCGTCTAGTCATGTTCATCATGTTGAGTTG
ATTTTTGTTCATTATTTTGATAATTTGATATGTAGGTGGACCGGTGGTCGGGTGTTTTTC
TTACTTGAACAAGCAACCNNNNNNNNNNNNNCCCCTCTCGCAAGTATCCGCAACTTCGAA
AGAAGAATTAAGATAAATTAACCATAGCATGAAACATATGGATCCAAATCAGCCCCTTAG
AGAAATAACACGTAAACTAGGGTTTAAGTTTCTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTACTT
ATTACTCCACAATGTCTTCCCTTAGGCCCAAGTGTGATGAAGTGTCAAGTAGTCGACGTT
CACATGACACCTCCAAAGGAAGCAACAACGCACATATCATTAAAATATCGAACGAATACC
AACTTNNNNNNNNNNNNNNNNACAAGACTTTTCCCATGTCCTCAAGAGAAAACCCAACTA
CTCACTAATCATCATCATGCTCAAGATCAGAGGTGTACTAAAGGATCTGGACATATTATC
TTCCACCAAGTAAACCAACAAGCATCAAGTACAAGATGTAATCAACACTTCTAGCAACCC
ATAGGTATCAATCCGAGGTTTTGAGACAAAGATTGCATACAAGAGATGAAGTAGG