Map Locations of contig_6978 (9526 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_6978

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_76000 8 3444 bp MLOC_76000.8 Available Available LOC_Os12g42876.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m22136 protein 5-methyltetrahydropteroyltriglutamate--homocysteine methyltransferase, putative, expressed
MLOC_76001 1 744 bp MLOC_76001.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_76000






CDS Structure of MLOC_76001






Contig Sequence (9526 bp)

>contig_6978 9526 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GATCGTCGGGCCTCGCCGTCGATCCGCTCCACCCACCTCCCCGTTCCGCGCCGCGCGTAG
GCGGCGCGGCGAGCGAGCGAGCGAGCGAGCTGTGCCCCGTCCTGCCCCGCTCCGCGGCGG
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ATAGTTTGTTCACTATGTTGCTAGCAGAAAATTGTTATTGAAATTTTTTTTGTATTTTGC
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TTCTACTCATGCAGCTTGGCGTTGATACCGTCCCAGTGCTTGTTGGACCAGTCTCATACT
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GAGTACTTTGGTGAGCAGCTCTCTGGTTTCACATTCACTGCCAATGGATGGGTGCAATCT
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TTGACAGGCCCCGTCACAATCCTTAACTGGTCTTTTGTCAGAAATGACCAACCGAGGTTA
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TCTTCTAAATGGTTTCTTGCAGGTCATCCAAATTGACGAGGCTGCTTTGAGAGAGGGTCT
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GCCATGGCCGGCGTTTTACTTTGAATAATCTGGACCTCGTGTCCACTTGTTGGTTATTAG
GGTAGTTGTTTCTCGGCAGGATGTGCTCATCCCTTGATTCGGTGGCTTTTTGAGGCGGTT
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GTTACGGTTTCAAATTACAAAATTTCTTCAGATGTTTCCGTGTAGGCTGGTGGTTTGCTG
GTGGATTTCCTGCTCTCTGACATGGTTCATTCTTGGTGTGTTGCCTTGCCTAGCCATTCT
TGACATTGCTTGTCTTGTCAACTTGTACATGGCAGCACGGCTGAAACCAAAACCAGTGCA
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GTTGTCTGAGCTTTAGACTGGGTCTTTAGTTCGGGAGGAAGGAAGTCTCTATAGACATTT
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ATATTATGCCCGAGCTGCAGGAGCGTTGTGTCGAGCCCACTTCACCTCTTTCGAGGGTGC
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GTTGAGGATTTCTTTGCACCATAGAAGTGCAATGATATTCAATATCTTGCCATGAAACCG
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TTTTCTCCATAATCAGCACTGGTCGAGCAGCAACCTCCGGCTTTAGATCTATAATAATAA
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CCCATGATTTGCACATGCCCTATTGCTTTTTTAGGCTTGGCCTTTT