Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_6964 (4213 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_6964

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75966 2 1318 bp MLOC_75966.2 Available Available LOC_Os02g04110.1, FRAME:+2, EVALUE:1e-127, 13102.m00412 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_75966






Contig Sequence (4213 bp)

>contig_6964 4213 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGGGCAGGGGGGAGGGAGGAGGAGGGCCCCGCGCTGGTGGTGCTGCTGGGCTGGCTCGGC
GCGCGGCAGAAGCACCTGCGGAGGTACGCCGACCTCTACCGCGACCGCGGGGTCGGGTCC
GTGCGGTTCGTGGTGCCCGTCCGCGAGCTCCTGGGGCTCGACCTCGGCCGCCGGGTCGAG
CGCAGGGTCGCCGACCTCTCGGCTGAGATCGCCGCCTGGTGCGACGCCGACCGCAGCCGC
ACGCTCCTCTTCCACACCTTCAGCAACACCGGCTGGCTCGCGTACGGGAATACCAAAAAT
CCTCCTCCCTCTTTTTTTAAGCTCTTCGATTCTCTGTGTGCCGCATGTTTTAGTTGTGTC
ATTGTGGTTTCCTAGACGAGGTTGGTGGCTAAAACGTGCTTGATCGGTCCAGTAGGCGTG
CCATTATCGAAGATATCTCGAGTTAGAGTAGGAGCATGCTTTGCTCGTGCAATAATGCGG
GATCCGTTGCTAGTTTGGAGGAACCAACAAGTTGTTGTGCCAGCAACCTGATGTACTTTG
GACAAACTCTCCATTTCCTGTTTGCTCTGTATAACAGTTTAAGTATAATTAAATCTCCTA
ACAAATTTACCACCGGGTATGATCTAGGAGAAACATCAAGGTAAATAGTAATAACTGAAT
TCAGGCAAGATTGTATTGCGTGCTATGAAATACTGGCAATTTAGCTTAACTTGACGCCTT
TTATCTTTTGGTGTACTTACTGTAGGATCCTTTTTGTTCTGATAGGAATGGAGGGTTTAG
TTCCTGGCAAAACAAGTTGATAACACATTGTAGTTAGGCACACTGACTTGGGGGACACTT
GTTCCTGGTGCATCATGTTTTTGGTATGACAATTTGGCTTGCTAACCATGAGTTTGGTAG
ATAAATGTGCTCGATGGATTGAATATGTGTGCTGTGGTTAAAGAGATCCTGGTTTAGGGG
AGACCCACGTGTGTGCGGTGGTACGGGAGCTGTTGCTAGTTGGGGGAAACCAGACGGTGT
CAGCGTACTTTTGGTTAACTTTTTTTTTTGCTGCTTGTGTTTCTTGTCTAGTTGAATATC
TCTGGTTCTCAACTGTACGGATTATGTTTTCCCACCACCTAGTGGTCGGCATCTAAGAGA
AATAGAGAACGTGAACATAAATAATTGAGTTTAGGTAGTTTTGTTGATGAACATGTCAGG
TATGCCTGCAATTAAAGTCTTGCCAGATTGCTTAATTTTGTTCTTTCCTTGTACTTGTAC
TCACAGTAGGGTTCATCCTATCCTGCTGTTACTGGCCAAAAGCGAACACATCACATATAC
TTTTGGTAGATCATTCGATGAGTAGGTTGAATAAAACAGAGCAGGAACCTGATAAAAGCA
TGGTTATAGACTTATTGTGTTGTTTGTTGAGTCACATTGGTTTACTTACAGTGATTAGGT
CTGGAGCAGTAGTGCTGTGGTTACTGATATATGGTGCTGAACTATACTCAAATTTCTATG
GTTGATTTGGCGAGTCTTATCCTGTTTTGTCAGTGGAGTTAAATTGTGGGCACCGAGCTT
CAGTGTCCAATAGTTTCAAGTGATTGTTGCATGTAGTTAAGGACACTTTTTAATATTAAT
CTTACTTAAAACCCTACTGGATTAGAGCTTTGCTTCGTCGGTGTCTTTCACCTGATGTTT
GTGGCTTTAAATTTACAGTGGATATAACACTCTATTGTTTTAATTTTATTTTCAGCTATG
GTGCGGTACTTGAGAATCTACAATCAAGGGCGGATATAATTGAGAGGATAAAGGGGTGTA
TTGTAGACTCTGCGCCAGTTCTAGAGATTAGACCAGAGGTTTGTATATCTTGCTTGAAAT
AAGCTTTCAACTGGTAGTGGTAAATGCTGCAATCCCCTTCTTCCATTTTAGCCTGTGTGA
AAACATTTCATTGTAAGTGATATATTATTGCACGTGCGACCGTTTGTACTTGTCTCCCAT
GCAGAGAAACTTGTATACTTGGAGTTTCTCATGTGTACCCTAAACTCAGGTCTGGGCAGC
TGGTTTCTCTGCTGCCATGCTGAAGAAAAGCAGTTCTTTAACAGGACCTTTAGCTGACTC
CCCTGATGGATCTACTTTGAATGGTGCATTGAACAAAGTTACTTCTGTCTCAGAGTTGAC
AAAACCATCATGGAGTGAAACTTTTCTTCTGTCAACTCTTCAGAAGTTTTTTGAGGTTGT
CCTTCGCCTACCTGATGTAAACCAGTAAGTCCATTCACCATTAGTAATTATTGCTTTACA
TGGTATTGAATGCTCACATCTCTGTTTGTACTCCCTCCGTAAACTAATANNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNTAGTAATCTAAACACTCTTATATTAATTTACAGAGGGAGTAGTAAAGT
CGGCCAAGGCATATGCATTGAAATAATGTTACAATGGGTGTTCTTTTAGCGGTGACATTA
TGTACTCTTAACTAATCCACATAGTCATATCTAAACATTATAACAAAAAATAATAGCTTA
TTCACTGTCAAGAAACTAAGGATATATGCCTTCCCATTACCAATTTTCGTACGTGCATCA
TGAAAATTAGGCTATTAGGAAGTGAGCCTAGCTCACTTGGCTAGTGGAGTGGATGTATAA
CCCAGCCACCCAGGTTCAAGTCCCCACGGGGGCGAATTTGGGTTCTTATTATTTCAAAAA
AAACTCGCTGTGGGGGGTTTCTCTTACAGTTTTCCTTCAAAAAAAATAAAAATAGGCTAT
CTGGATGACATGATACATATGCATTATTTTGTACTCCCTCCGTTCCATAATCTTGTCATG
GTTTGAGTTCAAATTTGTACTAAAACAACGACAATAATTATGGAACGGAGGGAGTATTTT
TCATTGTCGGGTGGCCTGCTGACCCTTCTAGTCTGGAATCTACATGCAACCAAAAATCAT
CATTAGGTGCCCATAGCCATACCATGACTCAATTCCTATATAAAAGAAGAGCCTACATCA
TTTCATTTTTTTAGTATTTGCTTCTTACATCCACCTTCCCTTGGGGAGTTGGAGGATTGG
ATTGAATAGAATATGATATTTCTAATTTGTAATAAAAACTTGTGTGCTCTGTCCAGTTAC
TTACCTTGTGAGACTGATATGTTGCCGGTTTCCTGTTTCTTCGTAAGCTGTTCTCTGGCT
GAATATACTAAGCTCCCAACGTGTAAAAACCTACTAGATGACTAATATCTTGTGCGCAAC
TTGCATCTGCGTGTTTGTTCTCCATTTTCGTCCTTACTATATGGTAAACTAGTGCATGAC
TATAGTTCATTTTCGTCCACACATCTTTAACTCATCTCATACCCTTTGAACATGCATTTC
AAAACGACCAGTTTTCATCTCCAAATATATTTACCACATAAACACCAGATGTTTGTTCAT
ATTCTGATATTTTTCTGCCCCTTCTGATCATGTTCAGGAGAATGCACAAGGTCCTCTCGG
TTCTTTCGGATAAGCAGCCGCCCTGCCCCCAGTTCTACCTGTACAGCTCCGCCGACAGAG
TGATCCCTGCCGAATGCGTGGAGAGCTTCATCAACATGCAGAGATCACTGGGGCTGAGCG
TCTCATCACACAATTTTGTCTCGTCGCCGCATGTGGACCACTACAGGAGCTTTCCTCACC
TGTACTCTGCCAAGATCGACGAGTTCCTGAAGGTCTGTTCCCCAGTTAGTGTATGATGAT
GAAACGACGATTAATCTTGCTGAAGATCTGTTCCCTACTTAGAGATGAGTTGATGGTTAG
CCTTTTGACCAACACGGTGGTTGAAGATTCTAGTGACAATTTGATCGGTTTTGTATTTTT
TTAGCGTAAGTAGCGCGCGTGCGATGTAGGATGCTTCTACATGGGTGTTTGAGGAGGGGT
AATATCGCCGCATCGTCAAGCATCCATGTGAGCTTCATCTACTCAAACTCAAGCAACTCT
TTGTAGGTACGTGATGATCGAACTGTCTATTCCTTTTGGGGGAAATTGTATTGTCCATTC
TTGGGATAATCTTATATGTTAAGCACAGCTGCCTAGTTAAGCATCTTATCTACTCCGCGA
GGCAAGAAAAAGCTGTTTTTTTTGCCAATGGTATGTAATAACGAGATGATCCATTTGTTG
ATGTAATTTTTGCTGAGTTGAAAGACATAGATAAGCACAGTTGTCACATGCAAAGAGAGC
CTTGGCTCAGTGG