Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_6953 (7002 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_6953

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75942 3 1365 bp MLOC_75942.1 Available Available LOC_Os05g38520.4, FRAME:+3, EVALUE:7e-61, 13105.m10387 protein 60S ribosomal protein L36-2, putative, expressed
MLOC_75943 1 183 bp MLOC_75943.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_75942






CDS Structure of MLOC_75943






Contig Sequence (7002 bp)

>contig_6953 7002 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAATCAATAAATAAATAATGCTCCGAGTTTAGATCACTTGTAATGAGTGTATGGTGAGGA
CTGAGTAGACCGAGTTTTAGGCGCACCCATATGAAGAAGGCAACAATTTTATTACCATTT
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TATAACAGGGACAACCCCCCTAGCTAGGTGTGAAAATGGTTTTAAAAGTAAGCGAGTTTG
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AAGCATAGTTGTGTAACCAAAATTATAAGGTAAACTTAAGTTAACGTTTACCTGGTCACT
TATTAGTTTGGCACGACTTCTTGCGATTGGACCTATAATTGTTGGAGACTTGTCGATGGT
TGTGGTATCTTCTTGTTATGTGTAAACCCAAGGAACTTGGGAGTACTTCTATTATGAACA
AATGTTTGATCCTTAAACGGTGGTGGTCGATTCTTCGTTGTGATCTCGAGTCTCTTTGGA
TGCGTATTCTTAAAGCTAAATACTTCCCGTCCTCACATCCTCTTTTGGCACATCATGGCT
CCGATTACTCCGTTTCTCAATTTTGGCACCAACTACTGCTGGTTCGTGATGAGTTCAAGT
CGCTAGTGAAGTTCTTGGTTGGTAATGGGCTTGTTGTTTGGTTCTGGTTGGATTGGTGGG
TGCGGAATGCCCCCTAGTGTTTTCCTTCTCTATGCTTTTTTTTCTTTCATTTCGTCTCCT
TCTGCCTTCATTGTGGAGCTCACGACCAGTGGTTGGGATCTGGTTTTTTGCCGTGTCCTG
TCCCCTAAGGAGTTGGAAGATTGACATCGCCTTGATGCTCTCTTCCCCGTGCTCTCGGAG
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TATTGTGTTCTATCGTCTAGTCCTAAGATGTCCAAGTTCAAGTCCATTTAGTCGGCTATA
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TTCCTGATGTCTTTATTAATTTAAAATCGGGCCTCGGTCTTTTCTCTAAGATGCTCTAAT
CGAAATAGAAACAAAGGATGTGCTCAAAGGATGTGTCATGGTTGGACTACCCTCGAAGGA
CTATTGCGATGGGTCGGACAACTATGACGTTGAGCAGATCCCGTCTTTTCGATCGCTACT
TCCACGACAAGGACAACAAGGGCACTGGAAAAGGCAAGGGTAGCTATGGATAATCTTCTA
CATATACAGGTTGAACATGGCAAATTTTGATAGTCCGATGACATGACGTAGTAGTCGGAC
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TTTGAGAGGTCGGATTTGTTAAATTTGGTTCTAACAAAACAGTTTAATAATTAATTCTAG
TAATAGAATTACAATGAGAGTTGCAAGAGACAATAAATGCTTTAACTCAAATTAAACACA
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CAAAACCACGAGAAAGAGTAAAAACTCCCACTATCTCTCCAAGAAACCGCCAGCTCAGCA
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CCCGCTACCACCCCGGACCCGGTAACCCACCCGCTCCTCGCCGGCGCGCCGCCGCCGCCG
CCGCCATGAAGCGCGCGCGCAGCTCCGAGATCTTCCTCGTCG