Map Locations of contig_6947 (6533 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map locationNo map location




Predicted Genes from contig_6947

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75925 4 1911 bp AK356821 Available Available None
MLOC_75926 1 884 bp MLOC_75926.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_75925






CDS Structure of MLOC_75926






Contig Sequence (6533 bp)

>contig_6947 6533 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCGCCATGCTGCTCTACATGGGCTCCGTCTCCCTCGACGGCGTGCCCCGCATCATCTCCC
GCCCCGCGCCCGGCTCGCTCTACCGCAGCCCGCAGCTGTACGCCCGCCTGCGCCCCGAAA
TGGACGCCGACAACGCCACGGACGCCGTGAGTGCCGCGCTCGCGCTTCCCCTCCCCCTCC
CCCCCACCTCCACCCTGCTCGTCCGTGGCCCCGGCCTGCTGTTTGCGATCAAAGTGTTTG
CTCGATTCGGGTGCGCAGCCAGTTCTGTCGATGCTCGGATTGCCGTAGCTGCGGCGTTGG
GTGGTTGAATCATTGGGCGTCAGCTGACTTTCAGCATGTCTTCAGAGACTGAACTATGTC
GTTTTCTGCTTCTGGCCAGTGGCGTGTACCTGTTTGTTGGGTTAGGACTTAGGACTGATG
TGGGTTAGTTTTACCCCCAATTGCAGCAGAATTACTGCAATGCAATTGTGGAAATATATG
TGAGGGTGGATATGAGGGCAAACTGATGGTGTTTCACCCGTTGAAACATACTTCAGATTT
GTTGGGTTCCTGGTATTTTTAGCCGTCAGGGAGAAGATAAGTATCCTGGCCAGAATCAGA
TAATTGCTGTTTGAGAACTTGTCAGATTAGCTGCTTTGAACAATAGCATGTGCGAAAATG
TTGTAAATACCACGGTACCACATATTGGTTAATTGAACGGAATTTTGGAAAACGCAATGT
AAACTATCCATCCAACAGCCTGCAATTCTACTGGTCTAAAACAAGCTTTTAAAATTTGAA
TCTTATGAATGTGTGTACACAATTCACATGGTTAGGAGCATCTGGTTGAACATGGCTTTT
CATATTTAGTAGCGATTATGACAGGTTAATTTATGATTCAAGTGCATGAAACTTGTGTAT
ACCTGATGGCCTCTCAACTCCTAAGGACTTGTTTTTCAGTAGTAGCTCATATTCATTTTG
CATGCTACTAGTATAAGAGAATTAGTATTTCGTTCTATTGTGTCTTTGAGATATGTTTGT
TTGCCGCATTTTGTTGCCTATTTGTGTCTCTTATTTAGTTCACATACATGTGTTACTAGT
ATTCTCATATTGCTACATTTTTGTAGCTAGCAACTGTATGGCGGCATGCTTACAAAGGTG
GTGTTTGGCAACCTTGCATAAGCAATAATACCTATGGTATGTTAGTTCAAAACTTCTGAA
TACTTCTCTGCCTTTCTAATTTCATGTACTGGTATCATTCTAATGATATATGGCTTGATG
AAGTTCAAAGAAACTTATTTTTTTTCTGCACATTTGCAATTGAGCGTCCTCTGATTTGTC
GTAGGCACTTTTTCTATGTTTGATTGCCCTGGTATGAGTCGTTCAAAAGTTATAGTTGCA
AAAACGATATACTTAATGTATTTGACATATTTGACCACAGTTTATGCATTGCTCTATTTT
TCTATTTTAGTTTATGGCAGATGCCATTTCGCGCAAAGCATTTCATATTGAAAGAAGTTC
AGATCAATAATTGGTTACTTTTGTATTTTGGTAGGTTTGCCCGAACCAAACGGCTACATA
TATGTGGAGGCAAATGGTGGTTTGAATCAGCAAAGGACATCGGTAGGCACCTTCCATCAG
TTGCTCTTTGTGACAATTACCAAAATAAATTTGTATTGTAAAGTTTCCAATGTACAAAAT
GTTCTCACTGATATTTCCTATTATTCTGCAGATATGCAATGCAGTTGCAGTTGCTGGTTT
TCTGAACGCAACTCTTGTAATTCCAAATTTTCACTACCACAGCATTTGGAGGGATCCTAG
GTCTCTCTCTTTTTGATATGCATGATGTTGATTGTATTCCTTAATGGTGATGCTACTGGG
TTTTCATACTCCGTACCACTATCTGTATATAGTCCTTTCACATCATATCTTTTGGTTAGG
GTTGACAACAATTGAATTCATGGTTATTGATATCTTTTCCTGAACAACGACAGTTGCACT
GTACTTAACTTCTACCATTCTCTACAATATGAAAGACTTCACACTGTACTTAACTTCTAC
CATTCTCTACAATATGAAAGACTTCACAAACGATGACTTGTATATTATGTTAGCATCGAA
ATTTATACTCCCTCCGTCCAGAAATACTTGTCGGAGGAATGGATGTATCTAGACGTATTT
TAGTTCTAGATGCATCCATTTTTATCCATTTCTCCGACGAGTATTTTCGGACGGAGGGAG
TATTTAGGAACGGAGGAAGTATTTGTGTAGTTATATTGATGTTTGAATCCATTCACCATA
GCATGGCACTACAGCAAGCCAAAAAAAGGATAACAGTTCATAGCTAACAAACTGAGCTCT
ATAGTCTGAATCTAGCGCAATAATATACAAATTGAGCTGACAAATTCTTTATCATGAGGG
AGTACACACTTAGTCAGTTAGGTTTAGGGAACTACTTTAATATACTGTTGTACACGATAG
CATGTTTCCCATTTTATATTGTGATGGCATGTGTTTCATGCATGTGCCTTTTGTTAGCCA
TGCGGAATTTCAAGGTTCTGGCGATTCTGAAAAATAATGTGCTGTCCATAAAATGTAAAT
CTCAGGGGTGTGTTTGGATGAGGGGATTTCTTGGAACTTGTGGTTCTTAGGTCAACTTTA
ATATGAATGAATCCTATTAATTTTGCCTAGAATTGCCAAGGTTTGATACTAATATTTATT
TTTGATACAGCAAATTCAATGATATCTATGACGAAGACCACTTTGTCCAACGTTTGAAAA
ATGATGTTCGAGTGGTTGACAAGGTGCCTGGATTCATAATGGAGCGGTTTAGTAACAACT
TGAGTAATGTTTATAATTTCAAGATAAAGGCTTGGTCTCCTATTCAGTACTACAAAGATG
TTGTTCTTCCGAAGTTGATTGAAGAAAGGTGAGTTAAAGCCAATTTGGTTATTGCAGCTC
CGAAGAAAATGTTCTTCTGATATTATTGTGTTTAACTGTTATATGACTATTTAACGCTAT
TGTCTGTGAATAAATTATAGGGTCATAAGGATATCACCTTTTGCAAATCGGCTTTCAGTT
GATGCTCCGCCTGCTGTTCAGCGACTGAGATGTCTGGCTAACTTTGAAGCCTTAAAGTTT
TCTAAACCAATCACTGCTTTATCTGACACTTTAATTTCTCGAATGAGAGAAAAAAGTGTG
GAAAACAACGGGAAATATGTAGCTGTGCATCTCCGTTTTGAAGAGGTTGGTTTTCTACTT
TGAAAGACTGTTCTTCATTCTTCTGTCTGAATTTCATTTGTGAAATATGGGCATGCACAT
GGTTACCAGACGAGGACTGTCATCCATTGTTTTTGTTTTTGCAGGATATGGTTGCGTTCT
CTTGCTGTGTCTTTGACGGTGGTGATGAGGAAAAAAAGGAATTGGATGAGGCCAGGGAAA
GAGGCTGGCGTGGAAAATTTACTAGGCCTGGACGTGTAATAAGGCCTGGAGCAATAAGGA
TGAATGGTAAATGTCCACTTACACCTTTGGAGGTATGGTAGCATGTAATGTTGGTGTTAC
TGCTTCAGAAGATGCTTCGGAAATTCATTATGAAGTGAATACAAGCTATATTTCCAGAAA
ATCTAGTCTGATTTCAGCAGCAGTTGGTGCCGATTCTTTTTTATAGTCATTTACATGTCC
ATGCTGTATGTTGTTTAGGTTGGATTAATGCTTCGTGGAATGGGTTTCAGCAATAAGACT
TCAATCTATTTGGCTTCTGGGAGAATATATAAAGCAGAGAAGAACATGGCTCCTCTCCTT
GAAATGTTCCCTCTCTTACAGACAAAAGAAACATTGGCATCAGATGAAGAACTTGCTCCG
TTCAAGGTTTGTAGGAATTGGAGCGTTAAAGTCTTATTTACTGAACTTTGAAGTATGCTG
CTCTACTGCTCTAACATAGCACAATGTTTTCCAGAATTTCTCCTCGAGGATGGCAGCTAT
TGACTACAGTGTTTGTGTTCATAGTGAGGTTTTCGTGACTACTCAAGGTGGAAATTTTCC
TCATTTCCTTCTTGGTCATAGAAGATACTTGTATGGTGGCCACTCAAAGACAATTAAGCC
TGATAAAAGAAGATTGGCCATACTCTTTGACAGTCCACGTATCGGGTATGTTATTGTGGT
TTACCTTTTCACTCTGCATGACTTGGATACTCCTATATTTTTTCACTTTTGGAATCATAA
ATATTATTTTGTTAAAACTGCACTCCCCTTCTATGCAGATGGAAGTCACTAAAACGTCAG
CTGCTTAGTATGAGATCACACAGTGATGCCAAGGGTATTCAAATAAAAAGAGCAAATGAA
TCTGTATACACATTTCCAAGCCCTGACTGCATGTGCCATCCAAATAAATCAGAACACTCT
AAACACATCCAGGCTAGATAGCATCTGCCATGACTGGTTTGACTGATCCTTATACATTTT
GGCACCATTGTACAGTATATATACTCATTCTTTGCGTGCAGTCTGGTGGTGTGATTTTCC
GGCATCAAGCACCCCTGTTGCAGTGTTGTTCATTCCATGGCCCTCATGTCGACCTTTGCA
GAGACATGTTCAGGCCATTTTGATGTAGGCTAATTCTGGGGCTAACAACACACTGATCCT
CGTCTACAATAGATGATGTATCTCTTAGATCTTAACCATCTCTAGGCCTTCTTGGTGTGG
TTGTAGACTTGTAGTCTTCCCTTGTACAAAGTTGAGACACTTATTTTGGGACGGACAAAG
TATATAACTCTCGAAGCGAAGACAGAATGTCCACTTTATTCTATTGCGTCGATGATTTTA
TTCTAATGCGCCCAATTTAACTGTAATATCTTTTCATTGGAGTAATCCAGTGTGGGTAGA
TTTGCATTGGCCTGAGCCCTGAGGGTTGTCTTCATTGCTGTAGTAATTTGTTTGCACTGC
ACTCGTACGAATTATTAGTTCGTCAGTTGAAAGAAGGAGAGCACCAAAAGGTGAAATTCT
GTTGTTGGCCTTTGTCTCATGTTGGAAACAGCATCTGGAGATTGTCTGGACAATCATCAA
TCGAGCACAAAGGTAAACGAGTGAGGTAGGAGTACTTCATCTTTCTGAATTTCTTTGCGC
TCTCGTTGAGTGGGTGCTTTATTACGCAGAGGACGCAAGCGGCAGCAATGTAAAGCAGCT
TTCATAGCCGAGGCTGGTCACATGCCCGGTTTGGCTGCTTGCAGTAGATGGAGCCTGTAG
TCTGCTCGCATCATTACCTTTGTGAAAGGAAGCTGGCGCTCTTCCCCTGAAATATCTGGC
GGATTTCAGCTTCAGTTAACCAGATTAGGCTGCCAATTGCTAGTTAATCTCTGGCTAACC
AGATTCTGCGGACGCGAACTCGAATTAGGTGACTGTTTTATTGTGTGGATCCCACCATAG
GGCATGCGCAACGTGCATCGTGACTGGAACCGGAGATGAAGCAGATTGCCTGGTCGCGGC
ACCGCACACTGTAACTGCGGCAGCCACTAGGAAACTAGGCGAAATGAAAAGCGAGAAGGG
GGAATGTGGTAGGAGAAAAATAAGTGATTTTGTTTCTTATCTTGAAAAGAAAGTTTTAGA
CACTAGATACATAGAAAGAGAAACTTCAGTGCAAAGCGTGATGTGGGAAATTTTAGCGCT
AGCAAAGGCACTCACAATGTGCGTGCTAGGCCAAGGACGCCAAGGTAGAATAGTCTTGAT
GATACCTCTTTCCACACCTTTGGAACCAACGAATGATTGCAAGTTCATGCTCGCTACAGT
CAGTTTGTAAGAATTAAGCTAGGGACGTGTTTAGTTGACTACATTAGGTTCAACCAGGCC
ATGCCGAAAGAAAACGGGCTGATCGATTGCTATCATCGGTCCACATGGCACAAACTTTAA
AGTATCTTTGTGCCTGTCTCGTGAGGCACGTTCAAATCGACAGTTTCTCGTGAGCCAGGC
CCGCACGATGCATGTGGGCGGCAAGGGCTACACGCGAGGAGCTACCCTCAAGAAGCCGTG
TTGCTTTCCGAAGCGCCGACAGTTATTACCATCACCTTTCCTCATCACTCTCTCTCCCCT
CTCCCCGCTCTCATTGACGGCGACGGCGGCGGCGTGCAGCAGATTAGAGAACAATAAGTC
GACCTCCGACCCTTCATTGGTATCCGCATCAACACTTCGTCAATGGAGGTAAACACTTTT
TCGCTTCCTCACGTACTACTTCGCACTCGATCCGAGTTTAGATTCGATCCGTGTTAGGGG
AATCAGGGTAAACGTCATAAGAGTGATCATAACATCGTCATGACTACCAGTGGATATGAG
GTTCCTGATCCAGATCGAGTAAAATAGGAATGGGGATTAGATTCATCTTACACAATAGGC
ACAAATCTTAGCCTCGGGGACCTTGGAGGCAGTTGGAGCAGGGGGTGGCCTTGGCCTTGG
TCTTCTCCTCGAGCTGCACCGTCGTCTCTTCTTCCTCACCGGAGTCCAGCTCGATTTGCA
TGCTTCGGTGCCTTCGCTCCGGCACCATCACAATCATCACCACCACATCTTCT