Map Locations of contig_68975 (7723 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_68975

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75797 1 1049 bp MLOC_75797.1 Available Available None
MLOC_75798 5 2530 bp MLOC_75798.2 Available Available LOC_Os03g42280.1, FRAME:-1, EVALUE:5e-40, 13103.m04552 protein B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MLOC_75796 2 886 bp MLOC_75796.2 Available Available None





CDS Structure of MLOC_75797






CDS Structure of MLOC_75798






CDS Structure of MLOC_75796






Contig Sequence (7723 bp)

>contig_68975 7723 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TCGTCGGCGATCCTGGACCGCAGCCTTGCCCTGCGCCGTCGGCGAGGTCCAGCTGCTCCC
TCTTCCGGCCACCGCGGCTGCCTCGTCGTGACCGAGGCGCAGAACGGCCGTGACCAGGAG
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GTAGGTCATGGCTATCTAATGTTTACTTTTTGTATTTGCAGATTTTGAATTTTCTAAGCA
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TGTATTCCAACTGGTTCACTTCATCCTTTATACCTTCCTTATGTACTTGGGGAAACAAAG
AATGAAACTTGGCTTCTAACAGGAAATTGCAATAACTAGCATTCACAGCTAGTAGACAAC
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GAGCACCTTTGCGCCGCCATTCCTCGGGTGCACCTCGACTTCCCATGACTTGCTCCTCTC
TGCCGTCACGAGTGTCACAGTCTGCTCTCCAGCGGGGAGATACTCGTCAGCATACTCCCT
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ATCGACACGTAAATGGGAACTTTAGACTGAAGGGCGCGAGCTCTCTTGTCGACATTCATC
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GCTTCATGATCATGGCTGTGAACCGAATAAGGCGCATCTCCTCCTGGAAACATTGCTAAA
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CAACCTGGTTCCTTCCTAACACAGGTCGTCGAAGTTGCCTTTGCCCTGGTAGACCTTTGC
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GCCACGAGTTAAGCTTACTCTTTATGAACCAGTTCCGCTTCCACCGGAATGCAGCATTGA
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AAAGACGCAGATATCTCCCACCTGTACTCGACTCTTGCGAATAAAGTCTAACCAACCAGG
CCCACAAAGGATGGACCCGTGTTTATCTTTCCTGATGTGAAATCTGGGAAGCCACTTCTC
GCTCTTGCCTTGGCACTCCAGCACCACAGTTTGACTTTTACGTGGGAAGTGTTCGTCTGC
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TGACTAGGCTGGGATCAGTTCATACAGAGAGTAACTCCACCCTGGTGATGTGAAGTGTTT
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TCCAAGAGCATATATGCTAGTTCTTAAAAATTGCCAACTTTACAACACAATCTGAGCACA
GTGCTTACTTGTACTCTCTCGGTCCATATTAATTGTCACCGACTTAGTACAACTTTGTAC
TAAATCAGGGACAATTAATATGGACTGGAGGGACTACATGATAACTTAAACAGCTATCTT
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ATTTCAGCTCCAACATCCTGGATAAGTGTAGTTACTTTCTCATCCTGTACACTGGATAGA
GTACTTCCCCGAGCTAAGACATAATCATGCCCTGAAGGTGTGTGGCCATCATCTAGCTCA
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GTGAAAACAGCAACAATAAAATCTAATAGAGAATGTTTTTTAAAGGCATAATGCAGAAAG
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CAGAAAAGGATCAGAATGTAACCTGAATCCTCAGATGATGAGTATATTGTGTCTGTATTT
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AAGGCAACCTGAATTCTCAGGTGAGGAGTAATTTATGACTGTCTTCGCCACTTTTCTAGG
ATGGCTTGAGTTACCCCTTCCGCACGTAGCAAACCTTTTGCTTCCTGGTGATCTTGTGGC
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AACCTCAAAACGGGGTTTCTCAATGTGACGAAACAGCAAGAATCATTCTCTTCTATGTGA
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CCTCCGAAATTATCTATGAACTTCTTTGGTATGATCTGGAAAAAATTTTAGAAACATGTT
GGTATGAAGTATAAACACAACAATTTCGTAGTTTCCGACAATGATGACTGCAACAAAAAA
TACGATATGGATGCAGTGTGAGAACTATGTTCTAATAGACTAGTCAGGAAATAGATTAAT
GAATGGAGCTTGATTGCATTGCTAATATTAATCAAAAGTTCACGATGACACAATGCATGA
TTAACTTTGAAATTAGAAAACACACAATGATGATCGTCATCTTGAGCTTTGAAGTTTTTT
AGCCACAACGTTTCAGCCTTACAGAAATAATAACTGCTCAACTGGAACCCATTAGTTTAA
CTACAGAATTTGCTCACTAGCAATATGTTCAGAATCTATTCACTTCTTTCTATTTGTTTA
ATACCAGAACTGCCATTAGTTCAACCAACTAGCAGGCGACTAT