Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_68835 (6062 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_68835

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75748 17 3604 bp None Available Available None
MLOC_75747 3 2150 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_75748






CDS Structure of MLOC_75747






Contig Sequence (6062 bp)

>contig_68835 6062 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAGCCATATGTGTAGACCTCAATTTATATAGGATAACACTTTGAAGATAAGCACCAATAT
GGTGTAGATCTCGCAGTAATAGAAAACATAGTCTGGCCATTGTCAGTAGATGTTCATAAT
TCTATTACCTTATGTTATGCTATTTTTAAGAAAATCACTTTGAAGGTAGTCATCTGTCAG
AATGACATGATGTAGACCTTGCAGTAATAATGCATAGTCTGCAAAATTTTGCAGTAGATG
CGAGTATTACCTTATGATATCTTGAGGTAGTCACATATTAAATTTGAAAGAGCACTTTAA
AGGTAGTCATCTTGTTAGTGATAAGATGTAGACCTCACAGTAGTGGTGGATAATCTGCAA
ATGATCGAGTAAATGCCACCAATACCTTGTGGTTCACAAATAAATTTTGAGATAATCACT
TAATATAGTGGGGTTTTTATAACTCAACTGAATTAATATAAATTTGCAAAAGAAAATTAA
TTCCAATTGCAAATATAGTTGTTATAAACATAGTTGCATGTTATGGGATTGCATAAGGCA
AACATATTGAATGTAGAAAAATATGGTCCAGCAAGTGAGCAAAATATTATTTTGCCCTAA
TGATATTTCAATAGGTCTGAAACAGAGTTAATGCTGCTGGAACTATTGTTAGATGAATAA
TTTGCTACAGTAAAAAGGCTGAACTGTAATAGCATTAAGCAAATATAGCTTGAGTTGCTT
GTGGCCCAAACCGCTTCCACAAGCTAACACGCTAGAAAAAGGAATAAGTAGTGTGTTGGT
GGCAGGGATGTGTGCACATGGGCCTAATTAGTACTGTACTCCATGATCCCAGCCACTTTA
CCACACGAGCGCTCATGCGGGCGGCAGCATTACTAGTGGCCGAACGGATAAGGAGATAAA
ATGACCCATCGTCTAAATCCCCAATGCGAGACCGCACGAGAAACTCCCATGGCCGCTCGC
CGCACCACCATCGATTGAAGGAGCTCCCGCGGTTCTATTCCTTGTCGGAGAAGACGCTGG
GAAGGTGAGTGCCGGGTGCGACGCCGTGGAGGGGCCGTCCGCGAGTCCGAGCACTCCTGG
CCAGAGGAGGAGGGCACACCACGTACGCGTGCATCGGGCAGAAGACCGGCGTCGCCGGGC
TAGGGCCTGCGCCTCAGGCTGCTAGCGTTCCGACGGCCTGGTCGGGAGGATCGAGGTCGC
GCCGCACAGGAGTGCTGGGCTGCTGGCTGTCGGTCGACGTCGTCCGTGTCGAGACGGCTG
CGTCGTCAGGCCGAGTTGGAGGCTGCGCCGCGCGTGCCCGGCACCAACGTTCGTGGAATG
GCCGCGCCTGGTGCTTGACGCGCGTGCGCCGGAGGGCACAGTCGCTGGCGGTGCTCTGGC
CATCGGATACCGATGGGAGCCACGGGCTCGACCGACGCCGTGCTTCACAACGAGGCCCGA
AGTCAACGGCTGCGCCGAGGACGTCGTCTCCGGCGCGCTGCAGAGGGCCACACCACGGGG
AGCCGTGCAAGAGGGACGTCAATGGGGAGAGACATCACGGCCGAAGCCGCAACGGTAGGT
GAGGTCGCTCGAAGTCGGCGTCGAAGGCAATCCTTTGGTTCTCCGTTCTTAGAATTTTGT
GGCCTCGATGCTCTCGGTTGAGAAAAGTGCTGGTAACGTGTTAGAGTAAAACGAGATTGA
ATGAAAGTAATGGACGATCAGTCTTTATTTCTATTGATTCTCAAGTTTATATACATCTGG
AAGATGTGCGAAGAAGAGGTGTCTGTTAGCAATGGAGAGAGAGAGGAGACACGACTATTC
GGGTTGGACACATCCCTTGAATTAATATACTAATTAATTTCTAACACTGTTTTCAGCTTT
TATGGTATGCTTTTGGATCTTGCCACGTCTCCATGCGGTTTCTAGATCCCACCGCTTTGA
CCAGCCAGAAGATATTTTCTTCCTTCACCAATCCTTTGCGTTGCGGTCACCTCAACCTCT
CCTTCTTCTCCTTGTGCCCCCTCTGTTTCCCACCTCGGCCTGCCGTCAATCCACCGCGGC
CGTCACCTTCGCTTCCATCAAAACATCAGATAAGCGTCCGCTACCCGCTCCTCAATCCCT
GCCCGCAGCGCCCTCGACGGTCTGCCTCCCTCGCTGGCGCTGGACGGGGGATTGGGAGGG
GAAATAGGAATCCCCACGACAGGAAGCACATGAGGAGGTGAATGCAAGCCATGACAGCGG
CCACGCACGGGAGGGTGGAGGGGCACATGCGGATGCTGGTAGCGCACACCTCGGGTGCCG
TAGGTCTTTCTCTGTACTTGCGACAGGCTGCTGCAGGATGAGGGTCGACGGTCCGAGAGG
TCGAACTGCGCTCCATTTAGCGCCGCCATCAAGCATAGCATCGCAAGGTCCATAGCCATA
TACTCATAACATGTTCTGCTCCATGTGCACACTTATCTGTGTTTTGCATCCTCATCCTCT
GTTTAATTCTGTCTGCATCATGTTGCCTGCAAAGTGTGTGCTGAAATGTTTCTTTCTCCT
TGATTTTCTATTCTTGATGGAAACAGTAGCAGGAAATTACGGTGAGTTTGCCCCAGCAGT
AAGACCACATCAGCTCAGGGCGTCATGAAAAGCCTAAGAATCGGTTGTTCTCTACCATAC
ATAGTAGGCCTAGAGGTTGCAGCCAGTCTGCCCTGTAGCTGTATTGCCGGATGGATGGAC
CGGTTGCTTACAACACGGTCCAATGGCCTAATGCTTACGTCGAGGTATGTGGTTCAATAC
CATGTTTAGTTTTGTAGTGCTTAAGTCTGATTCTCCTTTTCCGTGGATACAAAATAGTAT
TATATCCCTACTGATATGTACGCATAATGATGAATCACATATTTATATGTTTAGTTTTTC
CAGATTTGTTGCACACGGTGGAATCTGGGAGCATCACTCTCCTTGAGTGGAATCACAGTG
GCCAGATTATAGATCGCACAAGCTGTTGGTGATCTTTTCCTTTTGATTTCTAAATCTCTG
GGTTATAGGTCAACTCCCACTTTGTAGACTTTATCTTTTGTGGCTCCAGAAATTCTTTAT
TCACCTGTATGCTTTCTTTTGCAAGTTGCATTCGCAACCTCTAATAGCAAATTAATGAGT
ACATGATCTGGTTCTGCTTTAGTACCCTCAAATTGTACATTCACTTAGATGCCTATTGAA
TAATGATTGCTTCATCTTCTTATATCATTTGCCTTTCAAATTGTGCTTCACAAATAGTAG
TAAAAAAAGACTACCATTTACTCAGACCATGCTTTCAATTCCACGCCTACTGACTAATGA
TTGCTTCTTCAGGCATGGAAATCCCTGTGCTGGCGGTGCTTGCAAATATTTAAAGCCATT
CAATATGTGATGTAAGGTGCAGGGGAGTATGCACGTCCCCATTGGCAGAGATCCCCGCTT
TTGAACTTTTTGGTTTAAAATTCAGATCTCTCGAGTTCAGTAAAATTCAGTGGTAAAGAA
AGTCATACGATGTACAATTTTTTAGTATAAATCTTTGTTGGAAAAAAATCAGTTAGTACA
GAAGGAATATATCGTGCTTTTTGTTATAACAATGTTTATGGTATTTTGTTGCAGAGAATA
AAGGGGTTGTAAGATATGTGGCATAACGCAATACATATAACAAACAATGAAATCTTGGCT
AAAGAGTTGAGACACATGTATGTAGACTTATTTTCTTCCCTGTAGAATAATAGCTTTTAT
AAGCTAATAAGGATGTTAGATTCATATGAGATTACCTTTTGGCCAGATTTTAATGATTTA
TATTTTCCTGTGTTTTTCTCTCGGTTATGATTGCTCCTCCCAATTGCATTGATGATTATA
GGTGAAATGAAATTAAACGCTAGGTTGTGTGAAACGACAATGATGGATTCATTGCTGTAG
TTGATGTGAAGTTCATCAAGTGGTAGTCTAATGTGATTTATCCTCCATATACATGTCAAC
TAACTCTCCTATTTCATAGCATAGACATTCTGCTGTACACTGCAGTATATTGCTTCTGTC
AAACTGAAAAACATACATACTTCAATAAAAAATAATTTCCAGTGACTCCAGTATCAGGTG
AAATCTTGATTCCATAGTTGGGTGTGGCTTGAAAACTCATTCATGAATAGCAGTATATTT
ACTATTGGAAAGATTACAATGGATTGTACATTTCCTCAAGCTATAGTGCGACGGCTACTT
CTCATCGGAATTCCTGCTGGAAGCATAAAGTTCAGTACTGGTGAAAAGGTTTCTTGGTAC
TGATCTGAGTATTATTTTTGCAGTTTTTTAGCCGTGGTGTATGAGGCTTGAAGGCTTCTT
CACAAGATTGTAGAAGGGCCTGAATTTATTAATGATAGAAATTAAATGCTCCCATAATTG
TTCAAGGATTCCTCCGTAGTATCATTGCTCTCAGAGCTAAGAACCTTACTTTGTTATTGA
AGTGAGAATGTTTTATCTCTTGAATTAATGCCGATGAAGAATTGTAATTCTGATATTATT
TATAAATGCATTCGAAGATTATCTATTAATGAAATTGGTGGACTTCTGCTTCTTGAATTG
TTGTCATGCAGTGATGAACTGTATCAGTTGGCGACTTCTTGGCTGTCATAACTTTTTAGT
TATCACTTATTGAAAATGTTCAAACGATACATTTGCCACAATGAATAAAAAGCATGTACA
AAGGCTTGCATCCAACCAAAAAATACTACACAAGGAGATAAAAGAAACAATTGGTCGAAC
AAAACTATCACTCCCACTCCAACGAATCAAACGGGCTCTCTTACGGGTGCGGCGGCACGA
CACTAGTATAAAACTATGTAACTCATGTGACGCCTCACACCGGTCCAACAATCATCACTT
GAACATGTCGTTGAGCTGCATGCATCTGACGCCATGTCTCAGTTCAAGCTTATCCTTATC
CTCCTAAAATGTATGAAAAATCATTTTTTTGCGGAAATATGAAAAATCATGAAACTTGAT
GAAGATAGTTTTGAACTTTTGGGTTTTCTGGTCAAATATTTCTTTATCATCTTGTCCGTA
GTGTTGTAGAAGCCATACTTATATTTCAAATAACAATAGGTAAATTTACAAGCTTGCTTT
AATTATTTTAAACCGACCTAAAAATTTGTAGAAGCTCGCTCTTCTCTATTCTAAAAGTTC
GCCCAAATTATTGGATGCCCACCTATATGATCTTGTAAATTTGTCTTACTTTTGGAAATA
GATCCTGCTAGCAACCCAACATAGTCATAGAGGAAAGTAATAACTATGCTTTTCTTGGGT
TACTACTAAATTACATTTTTACTTAATTAAGCGCTCTCCATTGGGGGGCATTTATAATTA
ACTATCTTATATATGACATTTGATCTACACATCCGCACTTCTGAAATCAATGGATTTTGG
ATGCACTTGCACAGTTCAGCAATTTTTATTTCTAAAACATATTCTAGGATTTTTATTAAA
TGTATTTTCCACATAGACTTAATATTTTTTGACACTGATTGTCTTAATATTTTTTGTAAA
CATTTTGTGCATGTCACATACAGATTCAACAGTATATGTGTAGGAGTGATTTAAGTACAT
GCATGATAGGTATAGTACACGCATATGTGCATATATGCATTGTGCTTATCTTTATGGTGA
TTTTAGGATTAAAAAAGTAGTTCACATACTGAATGCATGTACGCAAAACATACTTACCTA
CTTAGTTGTGTCACGCATGCATGGGTACGTTCATTAGTTCGATCCCCGGAAAAAATAGGT
AGGTGATCTTACCTTGGACGTTTCCTAGCGTGACATATATGGACTCTTGGCTGACGCAAA
CTTTTTGGAATCATACGGACTGCCACAAAAAAAAAAATTGAATAAGGGAAAGTCCAAAGG
GAGGAAGACTCGTGCGTGGCATTGGGGAGCATGTTTCCTCTTTCATCTGATGGCTATGAA
CGCATTATATATTAACTAGCAAAAGGTCCGTGCGTTGCAACGGGAGAAAAAATACTACAT
GCTTTTAATCTTTTTATAATCATTTTGATTTATTAAAATAATGATGGAGCGCGGGTTGAA
TA