Map Locations of contig_68826 (4493 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_68826

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75744 1 990 bp AK363792 Not available Available None





CDS Structure of MLOC_75744






Contig Sequence (4493 bp)

>contig_68826 4493 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GGAGGAAGTATTTAGCATGCTTCATCATGATTCAGAATGGTCTCATGAACAATGACAGCC
TCAATTATGTATATCTTGTGTTAGAAAAAAAATCGTCTCCTTTCTTGATCTATAACATTA
AATTGGCTAGAATAGTATTGGTGATTCATAATTGTAGGGTCATACCTATTGTGATATAGT
GATGTTTATAATTTCACATGCCCTAATCTATCACAATCAGCAGTTGAGCTTTAACTTAGG
AATATTGCATCACTCCAGGTTCTCAAGGCTATGAAAGAATCCGACTCCCCCTGCCCTGCA
ATTTTTGCAATGTCCAACCCAACAACTAAAGGTTTCTCCCTATATTTACTTGCAAATACT
TAAAAATAAGCACTAACATTGGCCTTTTCTTGTTACAGCTGAATGTACGCCTGAAGATGT
ATTCAAGCATGTTGGTGAAAATGCAGTATTTGCTAGTGGAAGCCCTTTCAGTAATGTTAC
TTTAAGTAAGTCATGTTTAATCTCATTTGATTTGTTTGCATACTATAAATCCTTGTCAGC
GACTGCTAATGCTAATGCTACGACCGGGTTGTCCCAGGCAATGGTAGAAAAGGCTATGCT
AATCAAGCAAACAACATGTATCTGTTTCCTGGGTATGATAATCTTTGTGTCTTCCCTTGG
AGTCTCTGGTTTTTGTTTTCACTGTCTCTGGTTTTTGTTTTCACCTGATCTAAGTTTCTG
TGAAATACAGGATTGGTTTAGGAGCCCTTCTTTCAGGTGCTCGGCATATATCGGATGGCA
TGCTACATGCTGCAGCTGAGTGGTAAGTCTCGCTTGATAGGATTTAAGATTGACCAAGTC
CATAAAAAATATATCAACATCGACTACAGCAAAATAGTTTCATTAGATTCTTTATAAAAT
ATATTTACGTAGTATTATATATATTTCACATTTTTACATAAACTTTGTAAAACTTAAAGA
AGTTTGACTTGGGACAAACCTAGAATAATTAATTTGGAATGGAGTGAGTAGGTACTAATG
TAACTTGGAGACAACGTGCAAAACTTTTTAGCTTGCAGTTTTTCAGCCAAAAGACTTTTC
ACAAAATGGACCCATGATTATTAATTTTTCAACTTACATTGCACAGTTTTTGTAATTAAT
GTATCTCGCATGGCTCTTGTTTGTTCTCCTTCTTCCCTGGACAAAATTCAGCTAAGCTTT
TGTGTAACAATTGCTGGTGCAGCCTTGCTTCATACATCACAGATGATGCAATTCGAAAAG
GAATCCTCTTTCCTTCAATTTCAAGGTTTGCTCAATGACCCAACTCGTGCCATCGCACTC
TGTAACCACTAACCATGACACCTTGCTCCAAGCATTATGTTGTTGCTGACTACCACCCAT
CACACATCACAGTATCAGGCACATCACCGCACGTGTCGGCGCTGCAGTCGCCCGTGCTGC
TGTTGATGAAGATTTGGCCGAGGGATGCTCTGACATGGATCCTCGGGACCTCAGGAGCAT
GTCAGAGGTACGCCATACAAAATCTCACATCCCTAAAGTTGCCCGCCAGAACATTGCCTG
ATTCTTTTTCATGTGTTCACAGTCGGATACGGTGGATTACGTGGCTCGGAAGATGTGGTA
CCCTGTTTACAGCCCACTTGTGAATGACAAGTAGTGTTCGACGAAGCACACCTGAAGAGA
CATATCAGGCACATACATTTGTTCTGATTAGTGAATACTTTGCTATTTCGGTTTAGCTGC
TCTACCTGGGAGCATTTCAGCAGATACTGCTGCCACGTCTACTGGCTATGTTGTTGCCTC
ATTTGTTTACGTTGACAGGTTCATCAAACATTGCTCAGTTTTGAGACCCGTTGAGCTACA
GTTATGTCCCGTGTCGTAGGACTTGAATAAATGTCTGATGTTGGCAGTCTGCCTCCTGGG
GGGGAATTTTTGGTCTATGCATGTATATACAGCCTATATGCGGAAAAAAATAGTATTTAA
ATAAAAAGTCAAAAAATCTGAAAATATTTTTAAAATAACTTAACCTTCCATTCTACCTGT
GAAAAACATTCCACAAAAACAAAAATCTCTTTTGACCTTTTTTGGTCAGAATGGTGTGAA
TAGTGACCTATAATAACAAATATTTTTTGTTATTTTTGCCCTGAAATCAACTCTTGCTTG
TTTTTTATTGGTGGAAATCCATATACTAGTGCAAAAAAGTCAAGTTTATTAAAAAAAAAC
TTATGAACTATTTTGACTTTTTATTTTGTAATACTAAAAATAAAATTTTATATAGAGGGT
AGATACAACCAGGAACCAAAGGGTATTTCCCTCTGCCTCATGCATCTTCATTGTTTGGCG
TATCAAATACTAGGAACCAGGAACCATCACCTTTTCGGCTTTTATAATATAAAACAAGAT
GAAAATGTGTGGTCAGGTGATTTATAAGTCAGATGACAACCAAATAGGCGTGACTTATAA
GTCATTGGTTTTAAGTTACCTGACTTATAAGTCACCTGACTTATTGAAACCAAACAGGTC
CTTAACATCCTTTAGATTCCCTCAGATTTGGGTTAGATAATATGATTACTTAGTTTGTTA
TGTGCCATAAAAGAAAACAATGGCGAATCAATATGTGATTGGATGTTGTTCGTATTTTTT
TGAATTTATTTCAGACCTTTTTAGGGGTGAATATGTAGGGGTGAACATCGCTCTCTTGGG
AGTTGAATCTCACCTGTATCTAGGAAACACATGCCATAATCATATCTATCAATCGATTAT
GGAACCCCAGTTTCTGTACTGTGTAATTACCTCAGGTGAGTCGACCTTGGGGATCAGAAC
TATTGATGTATCATTCCATTCCTCCAGAGTTTGCCTAGAATTTATCATAAAAAGGACCTT
CTGTGAAATATCATCTCCTAGTATATGCCAGAATGTCTTAAAGAAGACCGCATGGAGGCC
ATCAGGCCCGGGTGCCTTCAGGTCCCCAATGTTGAACATTGCTTTATGTACACCATCATG
TGTATACGGGCCATTAACATGGTATTCATTTGAACATTTGGTCCGTCACCTTTGGCTGGA
CTTTTTGGATGATTGAGGGATCAACATGATGAACTTCGGATGAAAATAAATGAGCGAAGT
ACCTTTGGATATGTGAACCGAGGGTTGTCGTACCTTCCAGTACGTTACCAGCTCTATCAT
TAAGCTTCTTAATGAGATTTCTTTTCCTGTGCACGGATGAGTAGCGTTAGAATAATACGA
GAGGCAATAATCGAGAGAGGTGTAAAGTGAATCGTTGATCTTTTATTAGATGATTGTAGA
TATTTATACAGGTAGAAGGGATGCCTTGAAGTGGCATCCGTTCAGGAGAGATGGCATGAA
CCGACACGACGGTTGTCAAAAGGCAATTGCCCGTGGTTGGTACAATGAAAGATTCCCCAT
AACTAACACATGTTAATTAAGTTTTAGCACTTTTCTTAATCTACACTTGTCCATAAAAAT
ATCATCATCTTGAAAGGTCTTCTCTAAAAACCTCTGGAAAAAATGTGAGGACTATAGTAT
TTGATAAAACTTCTTTAAACCGAGTGGAGAAAATAAGGAGAAAATGCTGTAACATATAAT
TGTTGTTGTCTTCCTTAACTCAATATGTGAGAACTATAGAGTTTAGAGGACAATAAATTT
GTCGTATATACTTTTCTAAAAACCCCGATAGGGAAAACAGAAAGTAGGCCATATGATCTT
GTGTTGATATTACCTCATTAAAAACCTTTACGAGAACCTGTATAGTAACTCATGAAGGAA
AAAGAGTATAATATGATGCATTGAACATGAATAATTCACGAAGATACTCCCCCTGATTCT
TGCAAATTTCGAAGCCATCATATACCAATTCCATGAACATATTTCTGGAATGTAAAAGTT
GATAGAGACTTCGTAAGAAAATCAGTCACATGATTTGATTTGCAAGATATGCATATAGTG
ATGTTGCTTATTGCATAACCTATTTGCATCCGGGCAACACAAGAAACATTATCGTTAAGA
TAGTGGTTGGTGGATGTAACCATGAGATATGTTTCGAAGACTCTTCATGAGAGGGCTATT
GTACCTAGTAGGAACACTAAGCTTGTCTATGATCTGACATAGCGGGGATCTGGTCAATGT
ATCCAATGGTATTGGTGTTCAGATTTCTCTAAAACTTAAAAAACTAGGACAAGCTGTTTG
ATGCCTTTGGAGATATCGTTAGAAATTCTTGAGTCCCAATCAACTGTGTTTGGTGGATCC
AATGGCATTATGAAATTTTGAGTCCCAATATCTCATTCCCATCATCTCTTGGTCTAAATA
GATCTTTCTCTACGTCTAGAGAATGAACTACCATGAGAGTTATGGATGGATAAGATTTGT
CCACAATGAATTTTTCCAATATGTTTTGAATATAGACAACATAGTATACCATAATGTATG
AATGAATGAAGGTGCTGAAGTTGTAGTAACGAGCGGTATTTTGGTTTACCCAA