Map Locations of contig_68250 (18749 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_68250

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75577 19 2215 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_75577






Contig Sequence (18749 bp)

>contig_68250 18749 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATGCTATACGAAGTTATTACGGAGTTAGTAGGTTAGTCCAAATATGTGTAAAGTGATAT
AAAAGTGTAGCANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GAGTGGGCGCGTGGGGCACACAGCCAACCCATTTAGAAAAGGGGTGGAGGAGCTGACCGA
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ACGACCAATTCAAATGGTCTCAATATCATACCGTGTTATGATTGGTCAATGGGTAAGTCA
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TCCACCCCGCCTCCTTTCTTCCTCTTGCCGCAAGCAACACGAAACCACACACTTCTCCTC
CCTCATGCTCATCTCTCTCCCACACGACCCAATGTCACCCGTGAACGTCTCCGGTGCCGA
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GATCCCAACCCCCTTATTTCCTTGCTGTGTCGAGGCCCCCTAGGGACGCTGCTCGACGGA
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GTTTTCTTGCATCGTTCCTCTGAAATTACCTATAGAATCATTCCTAGCTGATGGTCAACA
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TGATGAAATCTTTCTCTTTTAACCACAGTAGCCTAGCAGTAACATGTTATAACTTTGGAT
GATGAAAATCATTTTTAAATGTTGGGTTCTTTTCCCTAATGCTCCTTATCCTATTCCTCT
AATATTTTTGTATTAATTGTGCACAAGGTTTGTTACTGTTATGGTGTTTACACTGTTATA
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ACCAATTACATGGTTTCTTTAGCTATGTAAACTTATATTTTAGACTTGTGTTTGATGTAA
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TTATAATTATGCTTCTATGTGGTTGTTGCAGCATGACTTTCATGCCTTCATCAAGCTCTA
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AAAGCCCACAAAGGAGAGAGTAGCTAGTTATAATGTAGTGCTAGTTATGTTGTACAGTAG
TGAGCGTATCTCATTGTATGAATGTTCTAAAGACTACAATTTCGTATGTTTTTAGTGGTA
ATTTTGGGTATCATTTCAAGAATGTTGTATGTTCTCTTGCGATTTTAAATATTTGTCATT
TCTATAATGTGAAAGTGTGAGAAATATAAGCTCACGAGTGGGCCAACTTATTGAAAAGGC
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AAAAAGGTCGAGGCCGAATAAAATGGAATATAAATCCCACGACTCAGGAAATAAAAACAT
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CTTTAGGTCCGAATGCTTCATGATGCCTCCTCCTCTTCAACAAGATGCCCCTATACGTGT
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ATGCCCAGCAAGTGAGCAACAAAACTAAGTATATCCGTCTAGTGAGCAAGAAAACAAATG
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TGATCTGTGCACTGCTAGGCCATGGTGCCATGAGCTGCTTCAAGTGCCTGTAATACTTGA
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TGACTGCATCGAAGTACGGCCTGAAATGCCTTTGTTCATGGAACCATATTTGAATGTTGT
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GTGTAGGACTGTTGCGTGGCTGTCTGGGTGTGGACCTGCTGCTGGTAGTAGTTGTCGGAC
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CTAGGCATTGTAGCAAATAGTGTGTGGGAACCCATCTACTCACGTGTCGCCGTTTGCGCA
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TAAGGCACCTTACTCGTGGGGGTTCTGAGCTGCGTGGCAGTGTAATAGTACGCACGCTTG
TAATGCTCTGGCCATGGTGACGTATGTATTATGGGCGCGCCCATCTGGCAATGTTTGTCA
TGTCATGCATGACCATTGCGACCACCATGCCCAACGTCACCACCAGGCGCATCGGCTGCC
AACCGCTTCTTGAGCTTCTCCTTCTTTGCAGCTTTTGCTTTGACACGACGAGTTTGCCGC
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GGTGGGAGAAAAGAGCGAGAATTAGGCTGAGAGTGGTGGGGTGGAAGAAGAGAGTAGGGA
TCTTGGCACGAAAACAGTGTGGATAGCTACAGAAGTGTTGGCTTCGCTTTCCTTTCGGGT
GGGCCAGCGGGCAGAGAGTAAGTGTCGTCTGTCCAGACTCCCGCAAACTCCCTTCCCCCA
TCCCCACTTTTGGTTCCAACTTACAGGAGAAAATACGTCTGAATCATTCGGCGCACCGAT
ATAGGCCCGCGTTGTATGTCTTTCGTGGTCTGGGCAGCTCCGTCCCGATGGATGAAGGTG
GTTTGTGTGTCGCTTTTGGAGATGCCCTTACATTCTCATAGTTTGTGAGCAGGGATGGAG
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GTTTTTTATTTCCAAAATTTATTGAGATAATTTTGTTCACTAGCTTCCGCATTAATGTAT
TTGCATTAGCATCCTGCCATCATGTCCACAAGGACATTTATATATTGAATCAAGGAGACC
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TGTACGTTCAATGTGCTAGTTTAGGCCCGCTACAGATTAGTTGTAGGCGATAATTGGGTG
CTCCACAACTGCTCCCACAATTCACGCTCAGGTTACCTGCTCTCTCTCTCTCTCCATCCG
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TGTGATAGAAGCATTACCTTTTTTATGGAAGCATTACTAGTGAGAACAAATACATTGGTC
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TCTCAACCACTAGACACATAGTTATGTTTTGTAAAGGAACAATTTTTAAGTACCAATAAA
ACAGTTCTTCACATTGGTGGAAATGCATTCCATGTGAATCAATTCATACAAAATTAATAA
AGGTTCACTCTTTAGCATTCCATGTAACATTTTATTGTTTCCAATGCACTAAAAATTTGC
GTCTTGTGACAACATTATTTGCCATTGCAATCAAATTTTGGTTAGTCGGTAACAAAATTT
TAGGTCCAAGGACTTTGCTTCCAGTAACAGATTTTTGCATCCAAGAATTCCACATTGAAA
TTTTCAAGTCCCATGTATCTTTTGTTATTATGATTGCACCACATAAAACTTCACTTATAT
CCACTAAAAAGTGTTTCCGTCACAAAACTTGCTTCTAACCAAACATAAGTTTGTTTATGT
GCTTTGTTCATCCATACACCACCTTCATGTGCCACAAATTAGTTTCCTTCCAAGACAGCA
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GCAGGAGGACGCCTTCATGGTGGGGTCTGATCCAAGTGCTTCATGCTTCTTAGTATATTG
CTCTTCTCTTCAACATAAGTCTGCTTGGGCCTGCTTCATTATTTCTAATGAACTAAAAAT
GTATGAAATGTAGTACATTCGCAATTATTAAAATATGTAAGTAATCCATGGAAACAAAAT
ACGTACACCAAAAGAACAAATGACATTTCATATGGGAGTATGTCATAGTACATCAGTGAT
AATAATGAAAACAAATTTTGTAAAAGAAGCAGGACGTATGGACTGTGGATACTCAAGAAG
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AGGTGGATATACGTTTCCCCTTCTACGTTTTGTTGGGGGTGTACCCAAGCACACCTCAGA
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TTTGAAAAAATAATAACACTGCCTATCTGAATTAACTATGGGAACTATAAGAAGCGTAAA
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CCCTAATTTCAACAATCATGATTATATATGAAGAGGTATGGAAATGTACAGTTATGATAT
GAAGGCATGGAAGGAAATTTCGACAATAGCAAAATGGGTAAAATGTAGAAACACATAGGT
ACGAAACTAGGAAATAATGCAACAGATGCATTATTAATGTAAGGTGGAAGCATCAAATTT
TGAAACATAGAGCAGAAAATATTTCCGACAACTAGGGATGCATATTTTTGGAATCTTTAT
ATATGAAAGCATTGAAAGAAAACTTTCCAACATTAGCCATATTAATTGGAAGCACTGACT
ATTGAAACCGCAGAATAAGCATGTTTGATGCGTATGTAGTTATGGGCGATCGAGTCATGT
AAAAACTTCATCAACACATGAAGGACCTAACACATGATCTTCATTCATACTAGGCAGAGG
ATGAGCATAAATTACAATGAGTAACCGGCTGTTAGATGAATTACAAAGGAAATTGCATGG
GAAAAATAGAAATCATCAAATCAAGGGCGATTGAAGCAGCGCAATACCTTCGATTTGAAG
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CTACTCCAGCAGCTGATTTCTAACCAGCCGATCCAGGAATCAATGTTGAGGATTAGGCAA
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GAGAAGAGGGTCGACGAGGAGCAGATAAGGAGGAGCGGGTGGGATGGGAAGAGCTGGCCA
GCTGGTCGACTACGAGGAGCAATGGAGGATCACGGGGGCCGAAAGGAGATTGGGTGAGAC
GAGCGAACGTTTAGTGAAGATCAGGTGAGCACGGGATGGAGGAGGAGCTTCAGTTGTCGT
GTCCCGATTAGAAAGCTGGGATTAGTGGAGAAGATTATGCACATACGTTGCTAGGGCCTT
TTTTAAGTATTTCCTTATTTATTACGAAAAAAGGAGGTATAATACCCAGCGTTAGATTTG
GAATAGATCGACGACCTTCCACGGGTCTGATGTTGGAGTCTTCTCAGACTATAGATGCAA
AGTGTTTCCCTTGAATCAATTATCCTGGGAAATTTTAGAATAGATTCGGTTTTCTTCCTC
TTGATGTCTACAAGGACCAATCTGATTTTTTTTTCTATTTAATTTCTATGACTGTAGTTT
GTAGTTTGCAATATTTTGTTTCTATGACTATAGTTTGTGGTTTCCAAGAACTGACTAACA
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GCAGCACCCCATCCTATTCTCATTCTCCGGTCACAGATGGATTTTAAATTTGGATCAGGA
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TTTGTTTCTCTCATTTAGAACATGTCTTGAAGTTCAAACACTTACAACGCGGCAAAGCTT
TCTAACTAGAATCTAGCATAACTGTTTTAGAATTTTTGGTCCCACATATATACTTAAAAA
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TTTTATCCTAGATTCTAGTTAGAAAGCTTTGTTCTTCTCCAAAGGTTTGGACTTCAAAAC
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ACTTCCCTTTGCGGCTGTTGTGCATGAAGTACACCAAACCGAAACCTAAACTATCTCCGT
GCGTCCAGCTACTGGTTCGTCTCTCATGATGCACACGAACACGTCACGTGTACCCTCGAC
GTCTGGGATGATGCACCGCAGCTCACATCGAAGGAGTCTCACCAGAAGCGCGATTCGCAC
GACGACCAGTGAGAGCTTTTGAAGACCCGAAACCCCGCATGCCCGGCAAGGACCCCGTCA
GGGAGTGCCACGGCAATGGGCTTCCGTAGGTCGATTCGCTCGCCCCTACAGCCTCAGGAT
ATGCAGCTCCCCACTACGAAGAACGAGGAAGCAAAAAACGAGGGAGAGACAAAAACGTAG
ATGAAAAAACAGTAGATGTGTTTTTGCGATTGTGTCTTGTTCAATCGACCGCCACCTCTA
ACATATATATGAGGCGCTAGACTTCCCGTACAAGAAAAGGACTAAACATTCCACCCAAAA
CGTCAAAAACCCTAACCTAACTCGGACAGAAAACTTTAACAATTTTCCGGACCAACTCGA
AGCCACCAAGTGATTTTTCTCGGTCCGACCGAGTTAATGTGGCCAACTTTCCATAATATT
CTGCATCTCATTCAGAATTATATGAGTGATTTTTCTCGGAACTACTGAGGAAACTCGGTG
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GTTTGGCTCTACAGGTTGCATACGACCTCCGATTGAGATGATATTTATATCAAAATCAAT
TGCCTTGACGATACCGAACTTTTCATGTTGAAATTTTTTCCATATCAGGACATCTTGAAG
GCTTAATCGGACGGACAGTATTGTGCATATGAAATCTTTGTACTTTGAGCACAATTTCTG
CCTTCGAGATGAGATCGAATGACGATGGTCCAAACTTAAAAAATGTTCATGTCAACACCA
TCTAACTTTTTCATGTGGAGCACTTCTTTATTTGAAGCCATATTAATCATGATTTATTCC
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AGGGCGATAATAATGTATCCGCCATGTTTGTACTAAGGGCGATAATCGTATATCGTCCAT
TACTCACTTAGGCTTCTTGCTACACACTAGGGTGGTATGTTTTCAGATATTTGTCACTGA
GAGCTCGAGATAACACTGTCACTTGAATGGACTCTACCAAATATGAGTTTTCGGGAACTT
CTCTTCTAATTATATAAGGACCTTCCCAGTTTGGAGACCGCTTCCCAAATTTTCTATCTC
TCGAACGGATCGGTTGGATTACCTTCCACACGAGATCACCAACTTGAAAATTCTTCAACT
TTTCTTATTATAAGCTATTGCCACTCTCAACTTGCCTGTCTCTATGGCCTTTAAAGCAAC
CAAACGTTTATCGCAACCTCATCAATATTGTCCATCATCAAATTATAAAAAACCATTGCC
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CTAGCTCATAAGGGGTTACCTTTGTAGCACCGTGTTTTGAGATTCTATGTTCCCACAAAG
CTTCAGACAACAGCAGATAACATTTTCTTGGATTATCCTAACTCTTCTTCTTGATGAGCT
TGATTAATATTTTATTGCTAGACTCAGCTTGTCCATTAGCTTGGATATAATACGGAGATG
AATTGAGCAACTTTATCTTATAAGATTCAGCAAATTCTCTAACTTGATGTGACATGAAAG
ATGAACCTTGATCTGTTGTTAAGGTTTGAGGAATGTGGAATCTATGAATAATATGCACAG
TTATGAATTGAATTACCTCCACATGTCTCATGTTCTTGAGAGGTACTTCTTCAGACCATT
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TTTCTCCAACGAAGTCTAAACCCACCCTTTAAAAGGCCACGGTTTGGTAATAGGATGTAA
CATGGCAGCAGGAGCCAATTGAATATCACCAAAATTTTGACAAGCTTAACATCCTTTATA
ATTTTTGGAACAAACATTAATCATCGTCGGCCAATAAAACCCGGCATGTCGCAATAACCA
CTTCATCTTGGGAGCCGACTAATGGGTTCCACAAATACTTTCATGCACCTCTCCCACAGC
AACTCTAGCTTGGTCTTCATCCACACACTTTAGAAGAAGATCATCAACTGTTCGGCTATA
AAGGTCATCATCTCTCATCGTATATTTGAAAGGCATGCGTCGAACAACCCTTTCCACCTT
TTATTCAGATCACGCAAGTAACCAATAATGGGTTTCCTCCAGTCTAGATTTTCACCTGCA
CTAGATTCTTTGTTAGTAGCCAAAGTGGAGTGTTCCAGTTCGGCCTCTCCCATACTCACA
AAGCTAGACACTGGCTTGTGGAAAATATGAAACATACCATGATCAACATGATAGCCCGAT
GCTTGTTGTGCCAAATCATTTTCTCTCCAATTGTCATGTCTAGATATATGAGCAATGCTA
AAATAATCCAAAGTAGAAACTATATCTATACATTTATCAAGATAAACATTAAGTGATTCG
TCAAAACATTGAAAAACTCTGGATATTTGTTGTACCACTAATAACGAATCACCAAAAGCC
TCAATATGTGTAGCACCTATAGCCATCAATATCTCAAGGCCGAATTACAATGCTTCTAAG
CGGCATGATTATTTGTGCAAAAATATTCTAAGCGACATGAGGCTGCAAAAATAGCACCAT
GAGAAGATATATAAACAACACCAACACCTTGGCCATTGCTACAAATTGAACCATGAAAAT
ATAATCTCCATGGTACCAATGACACAATATTTATATCAACATTGTGCTTGTCATTAATCC
GATGCTCAACGATAAAATTAGCAACTATTTGGCCCTTCATAGATTTGAGAGTTTCATAGG
CCAAATCATATTCTATTAAAGCATAAGCCCATTAACTAATTCTACCACTAAGAATTGGTC
TATGCAACATGTACTTAATGACATCGGTTTGACAAGCTTCTATGCAAGCACTCGACAATA
GGTAATGTCTTAGTGTTTTGCAAGCATAATATAAACACGGGCATATTTTTTCAATAAATT
TATACCTTGTCTCGGCATCCAATAATTGTCGGCTCAAATACGTAATGGCATGCTCTTTTC
CTTCGGTCTCTTGAGTCAAAAAAGCATGAATAACGCCTTCCTCTACTGCAATGTAAACCT
TAAATGGCTCCCTATGCTTGGGTGCTTTTATCACCAGAGGAATGGATAAATAACTCTTGA
TCATATCAAATGCCTCTTGTTGTTTTCCCTCTAAGTGAAATTGGCATCATTGTTTAACCG
AAAGATGTGAGTGAATGCATCAACTTTCCCTCACAAGTTAGCTCTGAATCTCCTCAAATA
ATTGACTTCGCCAAGGAATTTGTGTGTATCTCTCTTGCATGTTGGAGTTTCCACTTTTTT
ATAGCTTCTATCTTTTAAGGATCAACCTCTACGCCATTTTCATGAATAATGAAACCCTAA
AACTTGCTAGCCGACACACCGAATCCACATTTTAAAGGATTCATCTTAAGACCATACTTT
TTCATTCTTTCAAAGGCTGAATGCAAATCGACTAGATGAGATTCAAAGCATCCAATTTGA
GAACAATATCATCAATATAAACCTCAAGTATAATGCCGAGTAAATCATGAAAATTCAAAT
TCGTAGCCCTTTGATATGTGGCACCAAAATTTTTTAATCTAAAGCTCATCACCGTGCATT
TAAACAAACTAATGAAACCGGGGCACCAAAAAGCCGTTTTGGACATGTCCTGTGCATCCA
TAGAAATCTGCTTATACCCTGTATTACATCAAGAAAGCTAATGACCTTATATCCAGAATC
ATCATTAATAAGCATATGAGCTATGGGCATGGGATGCTCATATTTGGATGTAGCTCTATT
CAAATCTCTAAAATCAATGCACACCCTCAACTTGCTGGACCCTTTCTTCTCTATGGGTAC
AATGTTAGAAATCCACTTGGCATACGTGCAAGGTCTAATAAAATTAGCTTTGAGAAAACG
ACTGATATCTTCTTTGATCTGGTCATATGTTTTTGGATTAAAATTTCTGGTCGATTTCTT
ATAAGGTCTAAAACCAACCTTTATAGGTAACGATGCTCCACTAGCGCTCGGCTTAAACCG
GTCATCTCATGATATTCCCATGCAAAGCAGCAAACATATTCTTTCAACAAGCTGATCAAC
TTAGCTTTATGATCAGATCTTAAGTTTTCATTTACTAATCTTGGTCAAGGAATTGAACCA
TCTCCTATATCTATCTCTTCTAATGGATCCGCCGATGTAAAACCTTTTCCAAGTTTATCC
ATACATCTAACTCTTCTATAGAATCATACATATCGTTCGTGTTGGAGCGATATTCTCTAA
GTCGCATGTGTAACCACTCGGAATTAGGATCCATTTAAATACATTGTGCTTTGGAGCCGA
TTTCCACCAACTGACTTTAAAGAAACTGGCACAAAACCATTCTTTTGTAGCTCTGATAAA
ATCAAACTCTCATAGGTCACGCACCGTCAAGCAAGTAGCATTGGGATGGTGCCAATCCAC
CAATGCATCATCCAAAGCAACACAACCCAAATTACCCGCATGAATGACTTCCACTTTGTC
ATCACCCCACTGAATTAAAAACTGGTGCATGGTAGATGGCACACACTGGCTTGCATGAAC
CCAATCACGACCTAAAATCACATTGTAGTTACCTTGCACTTCGGCAACAAAGAATGCAGT
AGCCAAAGTTTTGCTTCCAATTTTAAGCTCCACATACATCACACCTTTAGATTCAGTTTT
ATCTTTGCCTTCAAATCCATTAAGCACCATATTGGTGTTTATCAACTCTTCGTCCGGCAA
GCCCAAATTCTTGAAGACCAAATAGGGCATAAGATTCACGACAGTACCACCATCAACCAA
CATCCGAGAAAGTGGTGACCCATTAATATGACCTATGAGGTATAATGGTTTCAAGTGCGT
CACCGGCTCTTTTCGTTTTCGAAGATAGCATTTTTAGGGCCAAAGTCCTGCTGAGCTATT
TCCCCTTCTTGGTCTATAGCAAGAAATTCAGCGGGTAACTAATACACCATATTAATATCC
ATAACTACATGAACCGGTGTAGATCCATAATCCATAATATCATGTCCATCCTCAAGCATG
TCCACCGAGTGAAGAAGAAGTAAAAGGTGAAGTCGACGATGTGATAGCGACCGCATCATC
CCTCGTTTGTGGTGTAGGTATTGCTATGATAGGTGTAGAAGCCGCTGCATCTTGTATTTG
TTTAGGCTTCCACACTTGTTTTATAGGTACCATGGGCCGAGTGTCATTGAACANNNNATC
TCTTTGTTTCTCGGCCTCCTGCTCTTCCATCTCTTGATTCCTCAACCTATGTAGTTTCCT
CTTTTGTGTCTTTGTTAGCCCTGGAGGACACCACTTTGGCTGAGTGTATTTAGGGTCTCG
TGGCTTTGCTTAGCTAGTACTTCCTTCATGGTCATTGGTCGAGTACTCTCGTGCGATAGC
AAGTATCGACTCTGTCGGTTGTTATGCACACTCGGCTATTGTATGGTGAATGTTTTGGTA
CCCAAGATGAGTGAGTTGGCATTTATTTTTTCCTTGCCCTTTCTTGACTCGACTGCTACG
GCACTAGGTGACTTAGCACGCCATATTTGATTATTGACCTTCTTTTGATTATGTTGCATT
CTCCGATTGAGACCATTGTTCAAATGGCCTCATATGGGGTAAGAAAGCCTCTCATGAACG
GGTCTTCCTAGTTCTTCCCAACCCGGCTGAAAAGCATAAGGGGCAATTGGGGGCTGCCCA
CATCCTCCATTGAAGTCTCCCATGTATTATGGCGCATTGGGGGGGTGGCGCCATCCATGG
TCCTGGTGCCCACGACCCATATGGCCTTCCATGATGCTGAAATTCTTGCCGAGGAGGTGA
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