Map Locations of contig_68115 (7430 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_68115

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75519 1 2068 bp MLOC_75519.1 Available Available LOC_Os07g08140.1, FRAME:+3, EVALUE:2e-170, 13107.m00803 protein heat stress transcription factor, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_75519






Contig Sequence (7430 bp)

>contig_68115 7430 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GATGATCATCACCATGATAGGTCCTGGTGTGCGTAGGATTTTTTTATTTCCCATGCAACG
TTCCCAACAGGAACCCTAGAGAATGCGCACTAACGCACCTCCCTGAAGTGGAGGAAACTC
TCGTCCAGATCTAGAATGGGGAACCGGTGGCGCCAGGATTTTATATCAGAGGAAACCCTA
GACACAGGAGGGCCATGGCGGTCGGATTGCTTCAACTCCACGTGTCGAGGATCCGCCATG
GGAGGAGGTGGGACAGCCCCAGTACCCCGTGGACGTTGGACCGAGGTGGAAATGTGCGCC
TGTGTACCACCTGCGCCCGAGTCGTGGCTGCATGGCTCGACTCCGGGCGCTTCGCATGAG
CAAGCCCGTCGGTCGCCGGAATTCGGCCCCTAACCCTAGCAAAATGGCAAGGAAAGGACA
GCAAACTTACAATGTCAATATCCTCACCCGCGTGTAAGTAGCGAGCGTCGAGCGTCGACT
GTCCGTCCGTGTATGTCGAAGAGGACGATGCGGAGAGCATCAGGACGGAGGAGAATCTCG
CCGTCATCGAGCGAAAGGCGTCGCGCGTGCTCGAGATCGGCAACGAAGATCACCCGCCAT
CTTGCTCTTCTAAACTAATTTTCTTGCCACAACATTTCCATGATCAGGCCACCTGACCAC
GAAGAGCGACGTGTACATCTTCGGTGTGGTCCTCTTGAAGATGTTGTCGGGGCGGCGTGC
GATGGACAAGAACCGGCCGACCGGCGAGCACCAACAGCATGCCACCTAAGCACATGCACA
CGAGTTTATGAATGGGACCATAAGATTCGACGCTTTTTTCATACTGTTGTGCCTGTCCAC
TTGGTATATTGTTGGATTTGTATTTGAAAGCGCCTTTTTATGGTATAGTTTCCATGGCAT
ATACTCCCTTCGTTTTAAAATTTTTGTCTTATATTTATGTGTATATATGAATGTATCTAG
TCACTTTTTGGTATTTAGATACATTCACTTTTAGACAAATCTAAAATAAAAAAATTGAAA
CGGAGGAAATAGTTTATTTTGCTAGTTAAATTCATGATCAAATTTTGACTCAAAATGAGA
GGGGCATTAGTAAACACGGAGGGAGGAAGCACGTGGCCCCACTGTGCGGCGTCGTTACTC
GCCGCTTATCGTGGACACAGCTGCAAAGCCAGGCACACCGACACTTGTCGCTCCGGCCCA
TGCGAGGCCCGCGTCGAGCCCAGGTCCCGACACGTGCCCGACCCGCACCGTTCATCCTCC
TCCAAACCCCCTCCTCCGTTCCCAAAATAGCAATCTCTCTCCCCCGCTCCCCACCGCTCC
TCCTCCCCTCGCCGCCGATCCCATCCCGGCGGGACCTCCGCCGCAAAATCCTGCCTCAGT
GCCCCGTCCGCATCCCGGCTTCCCTCGCCGGTTAAAGCTCGCGCCTCCGTCTCCGTCTCC
GTCTGGTCCCCAGCAATCGTTCAGCCGCTTTCGCGTGCACTTCCGGCAGGTGGTGGTGAT
ATGATTTCGACGTGTCCGTAGCGCGATTGCCCCCGCCTTATCCTGTCCCCTCCCCTCCCC
GTGCCCATCCCACCCACCTTCTCGCCGGGCCAGGGCTTCCGGCGCGTTCCCTGCGCAACA
GGGCAGCTTCTTGCTGGGTAGTGTGGTTAGGGTTCTTGGGGTTCGGGGGTATGGAGGACC
CAGTGCCGAGTCTGGTCAAGGAGGAGGAGGAGGAGGGTGCCCACGGGAGAGGCGGTTCCC
CGGGGGTCGGGGCGGCGCCAAGGCCGATGGAGGGGCTGCACGACGCCGGCCCACCGCCGT
TCCTTACGAAGACGTACGACATGGTCGATGACCCCAACACCGACAGCGTCGTGTCGTGGA
GCGCCGGCAACAACAGCTTCGTGGTGTGGGATCCGCACGCCTTCGCCACCGTGCTGCTGC
CCAGGCACTTCAAGCACAGCAACTTCTCCAGCTTTGTCAGGCAGCTCAACACCTATGTAA
GCTTCCAAGCCCGACTCCTCTTGCGAATTTGCAATGCAGCTGATTTGTGTGGATGTAGCT
CTTCTTCTCTGCGTCTTCTTGAAGCTCCCAAATGCAATGCTGTGAGACTGTTACCTGAAA
TCGGTCCAATGTAGCCATAGAGATTGTGTTGCCAAATTGGGTGAACTGAAGTACAGAAAA
GGAGTCAGTTACAACTCCAGAACATTATCAACTGGAGATATCATTTCTTGTTCTTCATTA
TTAGGACATGTTGTACTTCAGAAAAAATGTGCTATTACACTAAATAAGCAGAGCTAAATC
CCAGAAATGCGTAGGAATGGTATGTATCTAAAATTCCAAATACACAATATTTATGTACAA
AAGTGTGTGGGAATCCCTGGCTGATAATCTTCTGTTAAGAAGAAGCCAACACATTCACAA
AACTTTACCTTTTGGTCCGGATGTGCTGGATAAATCTTATGTCATCATTAAGAGAAAATA
AGTTGTCGATGAAAGTTTATTCTGTCTGTTTCACATGCATTTTATCCTTACCCTGTTAGT
GTCATTTTTTTTAGATATTTTTTCGTAAGTAATCAGCCGCAACATTTTCTTGGATGTGTT
GCACAATTGTGTACTTCATGCCTTCATACTAGAGCTCCCTCTTCCCGAATTAACAGCAGT
TGGAATATGTTCATGGTGTGCCACATTGTTTGGACTCCTTTGAGAGCATGTGCATTGTGC
CATTATAGGTCATATGTCACTTATCAAATGCTTATCTTCATAATTCATATGGCTGTTGCA
CTGGGCTGTTACCTGCTTTCACCATGCAGTGGTTACGTTAGCACCCTCCCTCCCTTTTTT
GCCAATTTGGTGAAGTGCTTAAAAATAAAATTAACTGGAGGTTGAAGATTGGTGTATGTT
ACTCCCTCCATGTCATAAATAAGTGTTTTAGACATACCGTAGGTCAAAGTAATAGAACTT
TGACTACAAATATCATTTTAATAAAGAAAGAAAATTCATATGTATATATTTGTCTCGAAA
AATATTTCTAGATTTAAAAAAAAGTTCTGTACATATATTGCATTATAAATTAGTGGTCAA
AGTTACATCTTGAAGACCGCGTCAATGTCTAAACCTCACTTATTTGTGACATGGAGGGAG
TATTAACTAGTCAGTGTAGATGGTTAGGTTCCTTGTGGTGGAACCAGCCCACCTGGATTA
AAGTCCTAGGCTTGGCACGGGTGCTTGCATTTTCCTGGATTTATTATTCCATGCTTCCTG
GCAATTTATTACAAGCTGCCTATGGACTATGGTGGCTTAGTCAATCTGAAGATTTGCCTG
ATCGGTCTCTCGAGGTGCTCATAGGGGTAGCCGGGTAGGGTGTGTGAGTGTGCTTTCATA
GGGTAAGTGTATGTGTGTATGCAAGTGTCTGCATTTGTATTGTGTTTCTTAAAAAAAAAC
TAGTTGCGTTAATAGTGTGGATATCAGGTCTCGTTCTTTATGATTAGGTGTTTTGTATGT
ACTACTCAAGAACAACTTGGTATTACACTAGAACAAGCAGAGCTAACTCCCAAAAGTGAA
TATGAATACATATTAGTATTGTGTAGAGAAGCATAGGGAATCCCAAGCAGAAAAACTTAA
GTTAATAAAGCAGCATATTGACAAACTCTAGTTAAATAAATCTTTGTTCAGATATAAGTA
AAAGCTGTATTTTAACAGTTTCTCGTGAATTACTTTCCTAAGGTACTTTTTTTGCTCGTG
TTATCATAAAAGGGAAATAAACATTCTGGTGAGCAAAATTTTAGTACTGTGTGTTCGCAT
TTCTTTTTCCTGTACCCTGCTAGTGTTATATTTATGAGTAAATTCACTTGCCATCAGGTA
AAGTGAAGCTAGTTGCACATCGCATGATTTTTTGCAACAATAAGCAGTTTGAACCAGGAT
AACGTAACCTGCATACGTGCCCCACTTCTTATTTCCCTGTGCACTACTGTTGTTACCTGC
TCTCCCTTCTACTGTAGTCATTAATGTGCATTCCTTATCTCATTTTTTGAACTTTTGCCA
CTGAACAAAGGTTGTATTCGAAAATGAGTTCAATATCTTCTCGGTACATCTTTTATTCTT
CTATAAGAGTCGACAGTTATTTTATTTTGACTATATTTTCAATTTTTCCCTTAAAAGGAA
TAGGATGAAGATTAAAGAGGAGTTTTTGAAACAATGTAGTAAAAATACAACTGAAATGAC
ACAAAATGAACCTAAACACATTATGAAGAGGTTACCGGAAGATACCCTGTTGCAGTTCTA
TCTGTTGGTGCTGATGCGGTTTATGATCTGAAAAGAAGTAAATGTAATTATAACGTCTTG
TTTGTTTCATGTTGAGAAAGAATTAACATCTTCATACAAACTTGCATTTGGAGTCTCCTG
GAATTAACTTTTCCCTGGTATGTTTGTTTGTTGGCTTCTCAGGGCTTCAGGAAGGTGGAT
CCTGACCGATGGGAGTTTGCCAATGAGGGTTTCCTACGGGGACAGAGGCACCTTCTGAAG
AACATCAGGCGTCGAAAACCTCCCGCTCATACTGCTTCAAATCAACAGTCCCTTGGATCT
TACCTTGAGGTGGGGCACTTTGGAAATGATGCAGAGATCGACCGGCTGAAAAGGGACAAG
CAACTGTTGATGGCAGAAGTGGTGAAGCTAAGGCAAGAACAGCAGAACACGAAGGCGCAT
CTGAAAGCCATGGAGGATAGGCTACGTGGAACCGAGCAGAAGCAGCAGCAGATGACGTCA
TTCATGGCGCGTGTCTTGCGGAACCCTGAGTTCTTAAAGCAACTGATTTCCCGAAATGGC
ATGAGGAAGGAGCTCCATGAGGCCATCTCAAAGAAAAGGAGGCGCCGCATCGACGGTGGA
CCTGAAGCTTATGACGTGGGTGCCAGTAGCAGCAGCCTGGAGCAAGAGTCGCCTGTTGTG
TTTGATTCTCATGGGTCAGTGGAACTTCTTGCCGATGTGTCGGTGCCGGTGGAACTCCTT
GCTGACGGGATCCCACCTGATCTGGAAGGCTCGGTGGAACTCCTTGCTGACGGGATCCCA
CCTGACCTGGAAGGTTCAGTGGCACTCCTTGCTGACGGGATCCCACCTGACCTGGAAGGC
TCAGTGGAACTCCTTGTTGATGGGATTCCATCTGATCTCGGTGGCTCAGGCATCGACGCT
AACGGCGTAACAGAGCCACACGATTTTGGTCTTGGCACCTGTGAACCGCAGCAGAACAGA
GTCCCGGGGTTGTTCCGTGATAGTTTCTGGGAGGAGCTGCTGAACAAAGGACTCAGCGAT
GAGAGTGATGAGCCGGTTAACGTCGACGGCATGGATGTGCTGTCTGAGAAGATGGGTTAT
CTCATCCCAAATAGCCCAACCCAAACAACTTAGTTCCATTTCATTCTATATCTGTCTAAC
CTGCAGTGTCTATCTATGCAAGTGTCGACAGTGATTCCCCATCAGGACTCGTCTGAACTC
TGTAGCGGGAAAGACTTCCATGGAACCGTTGGCGTCCTCTGAATCGCTGGAGAGAGATCT
GTTCGTTGTTTCAGGCTATGTAGCCCCTTGTCAGTCTGTAAAACGGGCACTTGTTAGCTG
TTGAATGACATAACATGTTCTGATCTATGCCGTATAAGAGTCTTTTGTGGTATGACTAAA
ATTGTGCTCCTTCTATCCGGATTTATATATAGGGCGTCTTTGTGGTTCTTGGTCGGCAAT
CATCTATATCTATACCTATATCATCTATTAATGAAGGAAATAGTTACGAGTCCGTCATGC
TATTTTATAGAAAACCTCATTAAACCCGTAGTACATATCAAATGTTTTTAAAAATACTCA
CATCTTCTAAACCGTAACTTCAAATTTAACATCTTATCTATGGATTTTGATTACAAAAAT
ATGTAAAATCTTTTAACATCTTATCTATGGATTTTGATTACAAAAATATGTAAAATCTGA
ATATAATGTTATTTCATCTGTTAACCATTTTAAATACTATCTAGAATACAATCTTAATCA
ATAATGCTTTACACTTTTTTTTTCATAGCGGTACTGATTTAGATTATGGATGAACATCTC
AGTAAAATCAGGATTAAAGACGAAATTGAAGATCACTTGGCCGTTTCTTTGTACGTATTA
AATTTACATGCAAGCTGTATTTAAATAAAAGACTTGTGGAATCTTGAACTGCGTTTTTAG
GCTAAAATCATCTTTGTTTGGATCGTAGCTACAAATACTCAAATTATAGACCACTTTTGG
TAAATTAAGAGTATGTGGTATTATTTTCTCACGTTACAACACACATACCCTTTTGCTAGT
TTGACTAACGAAATATGTGTTTTTCTTTAAACTGTCGCGGGGGAGTCCCCACCTGCATAA
ATTGTAAAAAAAAACAGTTTTAACATGGTCTCTCTTACATCTTCTTTTCAAAGGAAAGGT
AAGAGTATATATGATTTCAGTGAGTTAAGATGGTTTGTGCAAGAGTTAAGACAACGATAA
GACAGGAAATCACGCCACAAACAATATCAGAGATTACAACATTAGAGGAGACATCAACAA
CTTTAAACACTTTAAAGTTTCTAGAATCCCAAATTTTTCATAAGATTACGTGAAGCATGA
AAGGCCAAACAGACGCATGTAGTTCTTTGGACAGTGGACTGGCCAAGAGCACGCTGATCG
GTGAGAAGTTTGAATACAATCCAAGAACATACCATATACTTCTAGTGGTTGGGCAGGTGA
AGAACAAATGAGCCCTGTCCTCAATGACCTTTCCTTCTATGGTGCGTCGTAATAAGTTTT
AAAATAAATATCATGATGAATGAGAGGAATCTTCTCGGATAGTAGAGGTTTTTCGGACTT
GGCTAAAACACGGTCTCTTTCAGATACTTCTGGAGAGCATGATTTAGACTTTCATTGCTC
TCATGGAGATTGCTCTGTCCAATTTTGTCATGCCTTTTCAGGACTACTTGTGGGGTGGTC
TTGATTATCCCTGGTTTTGATATAAATAATTCTAAACTTGATGTTTTTAATATGGAGGTC
GGTGACTTTGTGGTCAAGTTTCATCTTCGCTCGAAATGTGATGGCCTTTTATGGGATCTT
GCGATTGTTTATGTGGCCGCACAACCTGAGTTTAAACCTAACTTTCTTACTAAGCTTGCT
TGATTTGTAGTTCATAATCTCTTCCCATGCTGCTGGGTGGTGATTTTAACATTATTCGGA
GGCTGGAAGAGGCGACCAACAATAATTTTGATGTGAGATGACCATTTATGTTCAACGCCA
TTATTAAGAGCCTTATCTTAAGTTACAGCACGACCAACTGACTCTCCTTTCTGGAAGGGG
TTGATGCGGACAAAAAATGCTTTCTTCAGCACAACTAGGTTTATCATAGGCAATGGTGAA
TCTACTAGTTTTTGGGAAGACACTTGGTTAGGGGAGATGCCTTTAGCTAT