Map Locations of contig_6773 (10667 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_6773

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75361 1 995 bp MLOC_75361.1 Available Available None
MLOC_75362 3 2149 bp MLOC_75362.1 Available Available LOC_Os12g39090.2, FRAME:-1, EVALUE:2e-73, 13112.m04042 protein expressed protein





CDS Structure of MLOC_75361






CDS Structure of MLOC_75362






Contig Sequence (10667 bp)

>contig_6773 10667 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAGGGGACAAGGGTCACGGGGAAGACACCTGGTCACTCCTCCCTATCGTCCCTCTCTTCG
AGGTCGCGCCGATGGGGAGAGGAGAGGAGCCGGCGACGGCAAGAGGGGACAAGGGTCGCG
GGAGAAATGCCTAGTCACTTGCGCTGCTGCCTGCTGCTGCTGTATCGCTGCGCTGCTGGC
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TGGTTGTGTCTAGCAACCCCTTCATCCTTTATAAGTAAAATGTTGAATATATATGTTGCC
ATGTGTGTACATGCTAAACCAATAGTATGAGTAGCAACAATATTGCCGCTCGATAGCACT
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AGTTGAAGGCCGCGCAGGAGGATCCTGCACTCTCCGCTGAGTGGGGGATTGGGTTCCCAG
AACACAAGCATTGGTTTGGGATATCCAACACAGCGATGAATATTATGGAGACTATGGCGA
CTCTTCTAGAGTTACTCTTAGTTAAACTATAACAAAATGTGATACGTTAAATATGTTTGT
CATCACTATATACACTCATACTGCTCTAATGCATACCGCAGAGCAATACTGATCAAATGT
GGTGGATAGATACACCATTGAAACCCAATAAAAAAATTATAGCTTCAATTGTATCTTATG
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GACGCACTTCCGTAAGTATCGACGGGAGTAAAAAGTACGTGTTGATTACTGGAATGGAAG
GTTTGAGAATGTGTTTGTCATTATTATTATTTCCTTTGTAGACAGATTAGACCAAGATTA
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GCGGCATGTATAGCAGTAAGCTATAAATATGTACTACTTTATTAATAACTGACATACCTT
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TCCTTTTTCCTCTCATCTTCTCTCTCCTTCAACTAAACAAAGATATAATATTAATTTTCT
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GGATAAAAACACCTATGACTAGGTTCCATTTCCCTTCGGGCCTAGGACTTCAAAAAGGAG
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ATGTCGGGTCCAACACATTAAGACCAGATAATCAGCATAAAGACTTGATAGAAAATAATT
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AACCCTTTAAGGATGTATCTCCATGTCTAAAACACGTGTATTTTGCAACAAGGGAGTTAA
CTGAAAGAATAAAAATAAATACTAAGCACTTCCGCCACATTGAAGATGATGCCCTCACAA
TGTGAGGACCACCATTTTATTAAGAGAGGTACAACACAATGAGGCCAACACATCTACTTA
CAAGCAGAGTAAATGATGTAGAAAATAATGACATAACCATGGCAAAGATGAGAAAAGAAA
CATACATCTAAGTCGCTGTTTTCTTTTATGGCAAGGCCTTCAAGAATGAGCTTCGCCCTC
TGACGTTGTTGGGTCCAACCTGTGAAGGCATGACAATATTTTTGTTATGGATGTCAGGGC
CAACTGATTAAGGTTATAGCATAAACAGAAAGACTTGATAATATTAATTAAAAATTGGTA
ATTTATAGAACTCACTTGTGTAGGTATTTTGTGTTCTGATGCAGAGGACAAACAACTGGC
GGACAAGGTAACCTAGAACAATTGCACAATCAATAGTAGTTCTACAGATTTATCAACAAA
ATAGCTCATGTACCCTTAAAAAGGTAAAAGTAGTTTGAGCATAAATGAAAAGGCAAAAAA
ATAATGGAAAGCATCTAACCTGGAGCAGAATAAATGAGTAACATGTTCACAAATGACAAC
TTCATCATCCCAGAATAAGTATAAGGGAAGGATTCCCTTTGTTTCAACATAACTCATTTA
ATAAATTGCGTCAGTGGTCACTAAACTTGCCACATATGTGTACTTTAGTCACACACATGT
TGAAAATAGACAGAACCGTCAAAATGAGCAAGCCAGGAATTTTGCTCATTATAGTTAGCG
AGTCTGTCGTGTTCAAGATTTAATATGTTCGAGCTACACAAATTCAAACCGAGCTATCTT
GTTGTCATACAACCTGTTGCTGAAGATACAATCATACAACAAACTGACAAGGTCACCTTA
GCACGCAAGTTAAGGCTCAGAACAGTCAAACTGAAATCTATATCCTGTAGCATGGAATTA
TATGGAGGGCAACCGTAGTGTAATAGCACTTTCACATAGCATTTGGTTACCACGCTAAAC
CACTCATTTGATATTTGAAATTCAAATGGAGGCAACACAGAAGTTCAAGCTTCAGGAACA
TAAGACAATATTGCAAACAGTAAGATGACAGCACACATAAGACGAGTTACTCAGCTGTGG
GAGCAATCAAAACAAAGGTCCAGCAGTACAAACTAACATTAGCATTTAAATGAAGCAAAG
ACAGAATGGCAGATCTTTTCCATGTGTGCAAAGGCACTTGTTATCAAAGTTCACTTACAT
TACAAAGTCCAAGAATCATGGATGTATAACTCGATCCTACTATTCCAAGTTCATTCATCT
CAGCTTAATCTAACTTTAGTTTCGCGGCATGGCCAACAGAAACATAACAGACATGCTATA
TGGTCAAGATAGTATTGCTAACACACAACAAAATTGCATTTGTAACCTTCACTGTTCCAT
AAGACGAAAGGAGATCTTCTCACGCTGCTTGGAATAATCACAGCCCAATAACTGTCTGTT
GGACTCCACTGCTACCTTAACATCTTGTAACGAAGCTTGGTAGGACTGGCCTGATTCTGA
AGGAAACCCATGGTTCTGTCCACCATTCCACGAAGGACCTGCTCTTCCATTTGCTTGAGG
TATCCTCGTTCCCTTTCCCCTTGCTTTAGCAACGTCCAAAGAAGACTTGAGCAAGCGAGT
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ATTAGCAAAACATGTTCCATAAGTGTAAGAGGTAGAAGGCTGAGGAGTGTGAGCCTTTGT
AATCCCCAACGGAGCTCTGATCGGGCTCCGGCTTTGAACACATGCTGGGCTACTGCGCAC
TTGCTCAACTTCCTCCCCATCTTCTACAGAGACAACTTCCAACATAACCTTGCTCCCTGA
TGAAACAAACTCCAGGGTACTCAGTTGCTCCCTAGATCTCGGTACGTCACAGGAGTTGCT
CACCTCGCCTCCATGACCATGAGGCGCCTTACCATGGGGACCAAGGGGGCTTGGCCTATC
AGCGAACTTCCTATCCCTGCTAGTGATAGACCACCCCTTATTTGCCGGCAGAGCGCCATT
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AGGTGGTCCAAGGGACAAGGAAGCATTGCCGAGGATCGACCGAATGAGAAAATTATGAAG
CTTGATATTTTCCTTGCCCAATACACCGAAGCAAATCTTGTCAAAGTCATCCTTGTTGAG
CTTAAAGCTCAGGAATTTCCTGAGGCTGTTGAAGTAATGCTGGGCTCGCTGATGGCCGAG
CTTCTTGGTGATCCGGGACTTCAGCTCCTGGGTGTCGACGCGAGCGAATTTCTGACGAGT
CTGCATCTTGGCTCACCGCTTCCAACCCAACCAACAGAAATGCAGGCAACCCCTGAAGAA
ACCCAATCAAACAGCTTCACGGAGAGCAAACCCTAGACAACGGACGAACACCGAGCGTCT
TCGCTAACCGCCGCCTAACTCTTCCCAAATGGTAATAATTACACAAGGTCGGAAGAGCCC
CCACCTGCGAAATCAGACAAAGTTAAAAAAAAATCAGGCCACCCCGCTCGAAGATTGCTC
CCCGATCCGGGAATCAGACGGACGCGGCGGATTGCCAGGCGAATCTGCTCGAAACCCCAA
ATGGGGAACCCCCAATCGCGATCGAACGAGCTCGAATTCCACGGAATTCCAGAACGGAAC
ATGCGAGGCCGAACAATTCCGGGGGAGGGAAACGGGATGGATTGGGGGTGGGGGGACGCT
GACCTCGAATCGGCGGGATCGAGCAGCTGCCGCGAGGAAGGAATCGGGGGATTGAGACGG
CGGGATGGAACGGGAGCTGCTTTGCGGCGGCCGCTGCCGGTGCTGCCCCCAAATTTATTG
ATTTGGCTGCGGAGAAGAACTTAGTACAAGTGGTTCTTCGGAGGCGCAAATGCTAACCCT
ACCCCCCGCCGCTGCCCTCGCGGGGCTAATCTCTATGCTGACGGGTGGGGGCGACGATGC
TTCGCTGCCGGCGTGGGCCCCGACGTAAGCGAGGATGGGTAGGTTAGGTGTGGCGTGGGA
CGGAGGAGGGGGCGCGTCTTGCCGTGGTCAACCGCACGTGCCGCGGGGAGGGAGGGTCAT
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AATGTTATTCTTCAGTGACATACCAAGTTGAGAATTAAGGAAAGGTAGTACTACGTTATA
TGCGTGACAGAGTATCTAGGCAGGAACTTAGCCTCCGTTTTCTGGAACTGGCCGTAGAAC
AATTGTTTTGTTACATTTTTGTATTAAAAATGAAATTTCTAGTAGTCCACTCTATGAAAT
TTTGGCCTAAAGATGTTTTTCATTCCTTTGATTCCAGCCAGGTGCTCCAACATCCTTCAA
TTATTATCTTCACGGCAATCCCCTTTTGACAGTAGTCGATGAGCAAGCAGAATTTAACCC
TTTAAAAAATAAACATATGGGATGACTGATGGATCCTTAATAGCTCTTTCAAGTTTGAGG
CTACATGCTTTGACATAATTAAATGAAGTTATAGACCCAACATGTGGTGGGTGAGATGAG
AACTTGATTCGGGAGATTTTTTGGCATATTGATGTGGAGCGCATGCTTCAAATTCCCATC
CATCAAAAGGACACTAAGGACTAGTATGTTGCATGCCACTTAACTACAAACGATGTATTC
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TTATTGGGGATGGCCGATGGTCGCCTCATCCGATATGAAAAAGATTGTGGAGCCTAAAAC
TGTCAAGTAAAGTTAAAAAAAAATTATGATGGCATTTGCATACCGCTATTACATGCATGT
GCATCCTTGCAAACTGCCACATATCTACTATTGGTCGGTGTCCAGTGTGCAAAGTGAAAG
CAAAATATATTGGGCACTCATTGTCTAGATGTGAGCAAGCAACAAAAGTTTGAAGATCTC
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CTGCTATGTGATGTTACGCATCATTACACTTATGTGGGGCTAGCCGGTTGAATTTCTAGA
GTTTGTTGCTAGTACATACGGTGACAGCGTAGGCTGCTTCCTAAAGAGAAGGACGGGTCT
ATGTTGCATGTTGCTTCTCCAATTCAAGGTGTAGCGTCAAACTTTGTTCATGCATCTAGG
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TTGAATTTTAATGCCTCGTTCTCAAAAGAGAATCACCCAGCCTCATGTGGTTTAGTTGTT
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GTTGTTATAGTGGAAGCGATGACATTGTTGGAAGGGTTCAAGCTTACACAATGTATTGGG
TGCAACTACATAATTATGGAGTAGATAATGTAATTGTTGTGCAAGTGTTGGACTTAAATC
TTCAAGAAAGGTTGGTCATATGTGTAACAAAGTATCTAAGAATGAATTCAAACCTTAACA
AAATGGTGTATTTAATGGCTGAGAAATGGATACATAATATTATGGAGCCTAAAATTGTCC
GGTAACGTTAAAATTTTCTTATGGAAATGTTTGCATAATGTTATCCCATGCATGTACAAC
CTTTCAAATTCCATATATCTATTACTAGCTAGTGCCCAATGTGAAAAGTAGAAGCAGAAG
ATATTGGCCATGTGTTGCTTAAATGTGATTGAGCAAGAGAAGTCTGGAGAGCTATTTCAT
TACATGAAATCATAGAAAATGTTACACATGTTGATGGATATGGAGCCAGCGTGCTTCAGT
TTTTGCTATGTGATGTTGTGCATTAGTATACTTATATGGACGTGATTGAATTATTAGAAT
TTGTTGTTGTTACATGTTGGTACATATGATGGTAGCATAGACTAGTCGCTAAAGAGGAGG
GTGTGCAGTTTCTATTGTGTATTGCTCGTGCAATTCAAGCCTAGGCATTAACCTTTATTT
GTGCACCTCGGAAACCAGCATCTACTACTAGGCTAAATCACTGGAATAAACTGTTGGTGG
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GTGTCGTAGTTGTTTTGAAAGTGTTGAACTTAAATCTTGTTCATTCGATGGTGGCGGCTC
TGATTCTTGATGATTGTCGAAGGGTTTTCAAGGATGGGAAGGTTCTTATTGAACATTGTA
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TTTTTGTCTCTACTTTATTATTCTTCACTCTGGAATGTCAAGGATGTTTCTAAAGGAGTG
TGGATTTAAGTTCATCTGATCAAACTATTTCAACATAATGTTATCCCACATGCCAGCTTG
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CCGCCGCCAGAGGGCGTCAACGGGCTAGGCCCTCGCGGCGACGTTTGCGATGGTGGCACC
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GTCCATGTCATATTGTTATGTTGGAGTCAAGCTTTATGCCGAGCTCAAGGTTTTTATGTC
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GATCCCTAATTTCTCTTCCAAGAAATTTGCCTTATATGATATGGAAAAGATCATTGTTTA
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GATAAGTTTATGCCATATCATCATCATTTATCATTTGGGTCGATTTATTGTTGTGACAAG
CGATTTATCAGGAATATATCGATAAATCGTGTCTATTTCTAGCAGTATCTATGCAAGAAC
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TTTGTCTTAAATATAGCATATTTTAGTGTTGGAAACCTGGGATTTGTAAATAATGGTTGA
TTAATAGTCAACCGATAAAATTAATTAATCGTCCAATTTCTGGTTAATCTCTAATCCCCA
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CTTGGATTATATAAAATAATAGAAGATTTACGTGTGCTGATGAATATGGGCCATGGGTGC
TTGTGTGTCTGCTATGTAATGTTGCACGTACACTTATATGGAGCTAATTGAATTTCCAAA
GTGTTGTTGTTGTTACGTGTTGGTACACATGATGGTAGCGTAGGATGGTCTGTAAAGAGG
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TTTGTGCGGCTAGAAAACTGACATCTACTTATAGGTTTAATCATTGTAATAAATCCTTGT
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TTGTGCACATAGATAATACAACTATTGTCAAAATGTTAAACTTAAATCTTGAGAATTCAA
TGACGGTTGCTTTGATCAATTTTTTTAAAGGAATTCAGGAATATTCTTATTGAACAACAG
ATAGTCTAATATGGTAGGGCATGTGCTAACTTTGGAAGGGTGTGATAATCCCCCTTCCTT
ATGGTTGGATGCACTCGCTGATTTTATCGCTAGATTTTTAGCGGACAATCTAAGTGTCAT
TTGACATTAATAAAGCTAGACATGAATGCCTTCCCATGAAAAAGGAATGAAAGGCAAGAT
GGTTCATCCATCTATGCAAAATCCAGGTCCTTTGTGTTTTGTTCTTTGTTATTCGGCACT
TCGGGATGTCAAGGACGTTCTAAATGTTGGGGATATGACTCAGTTATCCAGGGCGACTCA
TAAACCGTCTTGTTGTGTGGGTTGTAGTTAACCATGAAGTTCAAGGCCCAAGAGGCGACT
TAAAGAGAAGGCCGACTCGAGGCCTAGTATCTGGCAGGCCGGCTTAAAGAGAAAGTCATG
AGGAATTCCCTTACTTCAAAGACAAGATAAGTAGGAGGTAGATTGAGACACGAGTTGTAC
TATGACCCGAATTATATTGTGACCTCAGGGCCTCAACCTATATATAAAAGGAGCCCCTGA
GGCAGAGGATGGACTATAAACCCTCGAGAGCTAGGTTAGCGATNNNNNNNCCTTGTAATC
GAGATCATCCTCAATAAACACACAAAGTGGGATGTAGCCTTTTACCTCCACCGGAGGGGG
CAAACCTAGGTAAACCCTCGTCTCTCGTTCCTGATCAACCCCATCTGACCAACTGATGAC
CCACAAGTATANNNNNNNNNNNNTAGTCCTTTCAATAAGTAACAGTGTCGAACCCAACGA
GGAGCAAAAGGAAATGATAAGTAGATTTCAGCAAGGAATTCTCTGCAAGTGTTGTAAGTA
GAAGTGACAGATAGTTTTGTAGCAAGATAATTTGTAACAAGTGACAACTAACAATTGTAG
CAAAGGTGTGGCAAGGTAGACAAATCCTTTTTAGCAAAGGACATGCCTGAAAGTTCTCTT
ATATAAAACAAGCACTCCCGAGGACACATGGNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCATAT
TAAGTTGATTCGTGTTCGCTCCTTTCATGATTTGATATGTGGGTGGA