Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_67654 (5191 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_67654

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75325 4 919 bp MLOC_75325.4 Available Available None
MLOC_75327 1 1157 bp None Available Available None
MLOC_75326 3 1934 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_75325






CDS Structure of MLOC_75327






CDS Structure of MLOC_75326






Contig Sequence (5191 bp)

>contig_67654 5191 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTTCAAATACTTGACGGTATCCCTAAGCTTATTGATAAAATTTTGCAATAGAGCAATG
CCATCATTCACTATCAAATTAACAATGTGGGCACAACAGCGAACATGGAAGTACTTAGGA
ATAAATTTAGCAAATTTCCTAGCAATGATCTTGTCCATCAATCTCTTAGCAGCATTATCA
TTTGAGGAAGCATTATCCATAGTGATTGTCATAATCTTATCTTCTATTTTCCATTCTTGA
CAACACTCGAAAACTGCTTGAGCTATGACACTACCAGAGTGAGGTGGATCTAGCTCTAAG
AAGTTTAAAACACGACATTGCATGACCCAATCATCATCTATGTAGTGAGCAATAACGGCT
AGGTATGATAGGGTTTGGTTTGAAGTCCATAGATCACACGTCAAACTAATGCTTTCAACA
TTCTTTGGTTGCTTTTTAAGGATTTCTTTTTCGGAAAGATAGACCTTCATGCATTCAGCT
CTAATTTTCTTCCTACCAATGAACTTGTAGGAAGCATTCATATACCTCATCAGGATATTG
AACCATGCATGCTCTACCATCCTAAAGGGATATTCATGCACAATTATCATCTTTGCTATG
AACTTAACGACTTCGGCATGATCATATTCATGGTTAACTATAAGAGATGCACCTGGCTTT
TCAGGATCAAAATTGATTGTACCTTGATGTTGTTGTCTTCCCTTCTTGTTTAGATAGACT
GAACAAACATCTTTACGCCTATTGAGACTCGTAGTTTGACCCCTAGGAGTATAAGCAAAC
AATTTTGCACAATAGCACTTAGCCTTTGTAACAACCGCCCCTGGCCTCTTCTTACTTACA
GCCTTGACCTCCTTGAAATACTGCCAACATTCTGCACGCTTAAGTCTCGTTCTCTTCACC
TTCACCTTAGTACCATCCACTCCCGCCTTTTTCCTTTTCCCTCCTTTCTTTACCCTCTCT
TTGCCATTGACCTCTACTTCTGTGTCATTTTCATTGTCGCCTGATCCAAGAGAAGGCTCT
GACAGATCGTCATCCAGATCGTACGCCTCTGCTTCTTTAACCTCCTCGTGCCCTTCATCA
ATCTCTACCCATTCATCTGCATCACCATCATCTTCCTGTGCAAAATGAAATATATGATTC
AGATCTTACAAGCCAAAGCATGTACAAAATACAAGCCAAAGCTGAATCAGTGTAACAATT
GAGAAACATTCAGCTAAGTAATTTCAGAATCAATTAACTACACTCTACAGTCTACACTGA
AATTAATCAATTAACTAGGTAATTTCAGAATCAATTAACGTTGGCTAACTCTGTCTTTTG
CATGAGCATTTCAGAGGAAATCTGCCTAGACCCTCGACACCACCACCTCTACACTCTACA
TTCAGCTAAGTAATTTTAGAATCAATTAACTACAATCAATTAATCAGTACTAGCCTCCTG
TGCTCTTCGACGCCTTTGTCCGTGTGCTTGCTTCCGAGGAGGAGGTGGCTTTGCTGCCGT
GGAAGGAGACTCCCGTGATGCTGAATCGGAGGACGACCTCTTCTTCCTCACCATGTTTCT
GGCCTTGGACTCCATGCTTGGAGTTTCTGCTGCACGCGATGGTCGCTCGCGCGGTTCCAT
GGGGAGGCAACGTAGATGGCGGAGCCACGGAGGACCGGAGGCGGGCCAAAGTCGCCGTCG
AGTGGCACCGGCCGCCAGAATGGGGTCAGATCGATCTAGCCGCCGCCCTACTCGCGTATT
AGCAGGATCTAACCTAGCAGCCGCCCTACTCGCGTATTAGCAGGATCTAACCTAGCAGCC
GCTCTGCATCCTCTCCGCGTGGTCAAAGGTGTCTTCTCGCCTCCTCCTCTGGTCTGGACT
CTTCCTAAGTAGCGTGGGGTAGGGCTGTTAAGGTGATGTTTCTTTGTCCAGTGACTAGAC
TAAAAAATCCATTTTAGTCCCTAGGTAAAGAAATGGGAGGGACTTTTTCTTAAAAGACTA
TGAAAAGATTCTATTACAGAAAAAAAAATTAATTCGTGGGACTAAAAAAGTCTAGTTCCT
GAAAAAAAAAAATCACCACCTAAGGCTACTGATGAGATTCCCACGAGAGGGAGCCAGGGA
GGTGGGCTGTGGCTTGTGCATATGTGGGCTGAGATGTGGCATGTACGTTAGTACGTCCGT
GTGAAACTTAACTAGCCAAATGAGCTACTCGTGATACTCGTGATCTAGCTCATTAAGCTC
GTTTATATTAACGATCTAAAATTGATGTTCAGCTCGGCTCATTAACTAACGAGCACGAGC
CTTAACAAGTCGAGTTTTCGAGCGCTCACTAAACTCACGAGTAACGAGCTTTTCGTCCAG
CCCTAGCCACATGGTGACCACGTGTAGAGCACGTCAAAATCGTGCCCTATGCACCAGAGC
CGTCGGCAGCTCCTTCCAGAGAGCTCTGGCTTGTCTCGGAGCACCGGAGAGCTCCCTATC
GTGCGCGTGAACCCTCCAGATCCATCTCCCCCTTGTTTTCTTGCCGCGAACGGCCGTGCC
GACTACCAGATCGCCGCTACGACGGTGAGCTTCTCGGAGCTCCGTTCCCCGTCGAGGAGC
TTCTTCCCGCGGCTATATAAGGAGCGTGTCCGAGCCCCTCCCCTCACCAACAAGCCTCTC
TAGCCCCCATCGAGCCCTAGCCCTCTGTCTCGAACTCGTGGAGCTCTTCCCTCCTCTCGC
AGCCGAGCTCTGCCGCCGCCCGTTCCCCTCGGGCCAACCCAGCCCCGACCCTTCCCCTCC
TCTCAATCCTCGCCCTAGGCCTCCCCTAGAGCTCACGAAATCTCCACCGTCTTTAGTTAC
TCCGGGGGAGCGCTGCCGGAGTAGCTCCCCCAGTGGCCGTGGCCACCGCCCATGCCAGTT
GTAGTTGCCCCTTTCCCGTGGGACCCCGAGTCCATGGCGACCATCGCTGAGCGGGAGACG
GATCCGTGAAACCGCCCAGCTCGCCGACGGGTGCAGCCGAGTGGGGGAACATCGGCATCG
AGCGTGGCCGAACGGCCATGGTGCCTCTTCTGTTCTTATCGCGTCTGGAGGAAGGAGACC
AGGGGTGGAGGGAGAGAAGATAAGGCGGGCCCCACCTGGTGAAAAGTCAACCTTCGCCCA
CTGTCAGGTTAAGTGGAAGAGTATTTTGTAAAGTACTCTCTCGGTTAACCGAAAGCGTAT
TTCTGAAAGTATGCCTTCTGTTTTAGCCCAGCCGGCCGAACCCTTTATATTGCAAACATT
CATTAGTTAAGAGCATAAATGGATAAGTTTTTATTTGATTTCTACCTAACGAATGAACAT
CCATATCTTCGCGACCGTAACCCCGATTGAGGTAAAACCAACGCCCACTCCTTCGTATTT
TCGAGTCGGTCATGTTGGTATCATTTCCATAATGTTTTCACACAGTGAAAATTGACCATT
TTGCCCTTGACCTCCGATTGAGCCCTCCGAGAAGGAAAGTTCTCTCGCAAATCTTTCCAG
CATTTTATCGCGCTTCTTCCCGGCGTATCCATCGACCCCAAGGCAAGCCAACCTCTCATC
ATGAGCTGTGGACTTGTGTGATGATTTTGCTATGATTTTGCTTGCACCCTGTGTGGTCAT
CGTAGGACATTTAGATCATCTGTTTGTCCGCACTTGCATGCACCTCTTATGACATAGTAC
TAGATACTAGCATTACTTTTTATCTAATGTCGTGCCTTGTTTTCATATTACCATACTAAT
AATAATATTGTTAATAACATTGACATGTTATTGCTATGGTTTGATCCCATGCCATGATTG
TCAGCACTATGATTTTGCCATGCTCATGTTTAGCACTTATACTTGTGGAGGTAATGGATG
GATAGGTTGAGTTGAGTTAACAAATGCAACCCAGTTGGTTGATCTTGAGTCACCTGTCTG
GGCTTACGTGTGCAACCACATTTACCGGTATGGGACGACCTTGACTTGGTCTGGTTGTGT
GCTCTTGCACCAGTACCTCCAAAGAGGGAGGGTTATGCGTGTGCGCTACCCTGATCAGGT
AGGCGGCGATAACCCTACGAGCTAGTTGAGTTACGTGGGTACGCCCTACGAGCTAGTTGA
GTTATGTGGGTACCCGTTCCCATTTGGGACAGTTTAATTTGGCCAGGACGGTGGCAGGTG
TCCTAAGGACACAGGGGCCACCCAAGGCAGGACTCCGGGGGATGATGATTGTCGATGGTA
CGATGGGAGAGTCAGGGGTCAGACAGGTTTTGTTGGAGCAACGCTAGTCCACCCGAATGG
GATCACGAGGCTAGGTGCTCCATAGTGTGGGTAAAAAGTGCTCAACCTCTGTAGAGTGTA
AAATCTATTCGAATAGCCGCGTCCACGGTATTAGACAGCCCGTCCAGACCTCACTAGGTG
GTTAACCGTATCATTGTTAGTAATCATGGAAGAACTCATCTTGTATGTACATCATAGGAT
GTTGGGAATATGACATGTTAGCCAAGAAATGGCTATATCATGAGTTGTAGGATGACCATA
TGATTTGGATGCTATTTGGATCCATTTAAGTTGGATCACGAGTATATCGAGGGTTGTGGG
ACAACTCAGAAGAGAGTAAGTTGACATTCGGTAACAGTAAGTACTTCAAGTACCTACTAT
GACCATTTCCATGCTATGTATGTTAGATGCTTAATCCATGTTATGTTATGCCTTATCCCT
GTTTTTCTGTTAATTCCATGTCATGCTTAGAATACTTATTATATAAGTATAGGGCTAGTT
TTGTCATCTTCTTATTTGGATGCTATGTATTTGGTTGTCTNNNNAGTACATTCAAAGTAC
TCACCTAGCCTTGCACGTGGCGAGTTGTAGGAGAAGGTCCGTCGTGCTAGAACGTAATCT
AGCCAGTCCTATGAGTTATGAAGCCCAGCCAAAGCTGTCATTGTTGCCGAACCAAGACCT
CTGCTGCCATTTAGTGAGCCTTGGAGCTATGTAATATTGTTGTAATCAACAGTATTGTAA
TACTCCAATATAATCAATAAAGCCATTTTCTGCCTGGAATTGTTGTATCATGTCTTTCAC
GTGCGCCAGGTCTTATCTTGTGGCTGGCGTGCGTCGGCCCTCTATCGGGGTGCCACACTT
GCACTATTCATCCCCTCTACTCTATCGTTGTCGATTACTCTTTTGTGGTGAATGCTATTG
AGTTTCGTTGGAGGATTATTGTTATGACCAG