| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_67633
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_75318 |
1 |
399 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_75318
Contig Sequence (8846 bp)
>contig_67633 8846 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AACAGCCCAAAAAGCAATAAATATGAANNNNNNNNNNNNNNGCAAAATGGACGTATCACA
CCACTACCGTCGGGGGTGTGCCATTGTGTGTTTCACCAACAATTTGCAACCTCAAAGTCA
CAAAGATGTTGGTAGATAGTGGGGTTGGTTTGAATTTGATCTTGACCGACATGATCAAGC
GGTTGCATATCCTTGACACAGATATCAAGCCGACACGGTCCTTTTAGGGGGTCAACCCAG
GTAGATCGCACCCCAAGGGGAAGATCACCCTGCCGGTAACATTTGGCACAAAGATCAACA
TCAGGATGGAAAGGCTTGTCTTTGATGTCGCCAAGATATGGCTACCATACAACAACACCT
TGGGCCGACCGACACTGGTGATGTTCATGGCGCATCCCACCATGCCTACAACACACTCAA
GATGCTAGGGCCGATGAGCGTCATCAACATCCCTGCTGACAACAAGGACATGGTCCTCTA
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GGACGGTGAGGCTGGTACTTTCAGCATAAGTGGCACCCAAGATAGAAAATAGGAAAGCGT
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TGCTTTAATTGATTGCTATTTCCTTGTTTACTTGATTGAGGTTAATTCAAAAAAATCCGT
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TTTCTAGGGTTTATAAAGTTTACATTCGCAACTTTTTTCAAACGAGCTCAAACTTTGTGA
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ATACTGCCCAACCGCGTTGTAGCATGCCCACCCCGAGGCCGCGTGATAGCTTTGGGCGAC
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ATATGTTTTTGGGGAGGGATCCGTGGCCTCGCATGTGATAGGCTAGCTGCCCCAATTGAA
AAGAAACGAGAAATTACACTCTTCAAGAGGAATCCCTGGACGCTCGCTGGTAATGCCCAT
GTCGACGCCCCATCCCTAGCCCCCCATTCTCCTATTCCCCTCTCTCAATCTCCCTCTCCC
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CTCTCACCCTGGTTCCAACGCCATGGAAAAGGTGCCCTCTCCAGCACTTCTCTCTACCTC
TCTCTCTGGTTTTTGATTTGAACTTTTGGAGTTGGTGCTTTGTTCCCGAAGCTCCCTCTC
TTCTCTGTTGCAGGGGAACATCTCTCTGTCCATGAAACATCGCCAACGCTAGACCTTGTT
GGCTTCTTGCCCATGGCGATCGAGCAGGCGTGAGAGGGTTTTATGTCCCGATGACGACTA
GAGCGCTTGTGACACTATAAGTCCCAATGCAAGGTATGTACACTTTTATCCATATAAACT
TTGGAATGGCCATCTATTGTAAGACTATTCCTTATACTGGTTTCAATGATCTTACATGAG
CGAATTGTTCTCTATAATCCCCAATTGATGATGCTACAAGTTCATAGGTTCTATTTGAAT
TTATTTTCTCATCTTGTAGCTATCGCTAAGATTTGCTTGCTTGCAATTTTTGAACCATCA
GCAGGTTGGCGTGACTGATGATGTATAGCCATTCCTGGGATCTGGAAGATTTGGTACTGA
TTCGACTTTTTGTTTAGAGATATTAGATCATTTTGGTTGTGCCTTTGGCCTAAATGCCCC
TGGTTTAAAATTGGACTAGAACTGTCTGAATAGGTCTCTTCATGCAAGTTTTGTAATTTT
CTATTCCCATTTTTTATGGAGCAAGTGAAACATATTTCTTCATATTACCCATAGTCGCTA
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TTCTTGTTGAGTGAAAAACCTTGCGAGCTTTCTGTATGTATGATCCACTTTTTATAATAA
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TCCCTTGTCTTTTAACATAGATGGCATTCGGTTGAGCAGTAGTACTGGTACTCCCGTTAG
ACTCACTATCAATCATTCTTTCTGGGTGAACCTGTAGACACAATGCTATGTGTTTTATGT
TTATTGGTTCAGTATAAACGATGGCGCATTATTCTTTGTAATTTTTGTTTTTGTGGTTGT
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GTTGTGACCCTAAAGTAATTCTACTTTCATGTAGGACGACTATATGCTTTGATGTATTTC
TTGAATGAACAACACCAGATTTTATTGTAAGAGTTAGCCTATTTATACTGTGATATATTT
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GCAATACCAATTGGTGCCTGTTTTTTATTGCTCTCGGTGTATTTTAGTTCTGATAATTTT
GCATCCAGTAATGAGTGTTTGACAATCTGCATAGATTATTTAGGTCTGATTGCAGGGGCT
TTGGTTTATGGATTAATGACTCTAAAAAAAACAAACTTGTTGAATGAATTTGGATCCATA
AATGTGATTGATGAACAAAGACAATGAAGGAAAGTAGTTTTACATTTTTCATATTATAAA
TCCATGCTAAACGTTGAAATTAGAAATAAAAACAGTACATGAAGACACGTGCAGGGTGGA
GAAGGAGCTCACTTGGAGCTTAGGTGCTTTGCCCCCCATCTAGGCTTTCAATAAAATGGA
TGGTGAAGGAGCAACGAGAGGGTCGAGAGGGTGAGGACAAGCAAAGTAGCACGCACAAGG
GATGAGACATGCTGCAATATTTTAGAAAATAGTGTTCGTCAAAAGGGCACTTCTATATAT
CGATTTATGCCATTTTTTCGTATTGCTGATTTCAGTGTGACAGTTTTGATCAAAAATTTT
GTAGCGGACTATTTCACTGTACTTTTTGACTTTGGTGGAAGGTCATTCAGTCAAGATGAA
TAATTAGATTGTTGTATTTCAAAATTAATATAATGGTTCACTGCACACCAGTTTACTTAA
TATTAATTGTTATCTTTTGTCATTATCTTCCACACCATCCTACCTATATATTTCGGGTCA
TGAACTAGCATGATGCGTGTTTTTATACACGTACACAGTACACTTGAAATGTAACTCTTT
CTGACAATGGCTCCCATTTGGTTTGGAGCACTAATTGCTTGTTGCTAATGGTGCACTATT
TCATCATGGTTTTCCTTTCTTTCAGTTCACATTCTTTATCTGTTTCTTCTATATTAGTTG
TCTTGTCATTTTAGACGAGGATCATTTTTCTACTAGAGTTGGGCAAATGCTGGAGGTGAG
CAAAGGTAAGCACCAGAATTTTGGTGCCAATTCTTAAGGTTCCCTTTGTTCTCAATGTAT
CTAGGTATACATACAAAATGTATAGGTAGATTTGTAGCCATGTTATATTTGTGTCTCGCC
ATTCTGGATGTAGAAGACCACAAACTATGATGACTATGATGTTCTCAATGTATCTAGGTA
TAAAAATTTGGATTTATGCTAATCAGGAGGTGTTGCATGAATTTGATATTGGACATTCGT
TAAATACCAATTTTTATCGTAAAGTTCTGAATAAGTTGGATCATCATAAGATTGGAGTCA
GTCTGGTGTTGCTCTACTCTTTTCTGCACTAAAGGTGTGATTCGGAATTTTGCGATTTAG
TTCCAGGGTTTTATTCTCGGATCCATATAGTTAGTTTCTCCTTGTTTTGTTATGTTGGAG
CTGCAGATGCATCTCGATCATTTAGGGAAACTGAAATCCGCGTCTTCAAATATAGTTTGC
TGATTTGGGTTATTTGTGAGAAGAATCCTACATAATAGTACCATTTTAGTTTCATTATAT
ATATGTTGCTAATACTTTCGAAAAGCAGGTCGACATAAATATGGAAATATGAATAATGCA
ATACATTGCACTTAAAAAGGATTCTAGTTTGAGAGATATGTTTCGATATTCTATTGCTTC
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ACAAGAATTTGGGAAGTCATCAAGGAGAACAAAAACCTTGAGTCCTTGACCTACCTGCTC
ATAAAGTGAGTATCGTCCTCCATTTTCTAACTAGGATATCGACATAATGATCATTAATTT
TTTTGCGATCCCCACTTTGTATACAAGAGAAAATGACAAATTTATGTTGCGTTGATCCTC
GAGTATAGCCAGCCATGCAAACGACAAATTGGTAGACGCAAAACATATTTACGTAGTGTT
GACACCTTAATCTTGCATCTATGTAACATAAGATGAGAGAAATTATATAACTTTTACCCC
AATTCATGAATTTATGTAACAGATAATGAGAGATATTGTACGGATTAATTAGTATCTTAA
TAGTAAGAGCATACATAAGGAGCTAGTCCAACACTTACATATTCCATCAGAAGTTACGAC
GTTCGCCAATTCGACCACATATTCTCTTGATAAATAGATCTGATGTGTAAGCTTGCACCA
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CTGTTGGAGGATGAAATAGTTCTAATTTATTTATTACTTGTACATTATAATATTTGATTA
TTTTGTATGCTTTCTTATGTTTGATTATTTGAATTACCAGGNNGATCTGAAGCACCCAGA
AGAAGTAGAGGAAAGGACAGGAGGAGGGAACAAAAATCTTTGTTTATCATTGATGTTATG
TGTGATCAACAAAAACTTGTGCTTCTCATCCAATCTTTGTCGAACTATGTTGATGTGTGA
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ACTTGTTGGGCCTTGAACCTTTATGTGTAGAGGAGTCGATGAATGATGTATTATAATTCA
TGTGATGTGCTACTGAAATGAAATAT
