| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
 |
No map location |
Predicted Genes from contig_67424
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_75227 |
2 |
1499 bp |
MLOC_75227.1 |
Available |
Available |
LOC_Os07g07410.2, FRAME:+3, EVALUE:3e-110, 13107.m00723 protein oxidoreductase, 2OG-Fe oxygenase family protein, putative, expressed |
CDS Structure of MLOC_75227
Contig Sequence (6334 bp)
>contig_67424 6334 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
ATCAACGAGCTAGTCCATCAGAGGCTTAGTAGGGACAATGTGTTGTCTATATATTCACAC
ATGTATTTAAGTTTCCAGTCAATAAAATTCTAGGATGAATAATAAACGATTATCTTGAAC
AAGAATATATAATAATAATTATTACTTTTATTATTGCCTCTAGGGCATATTTCCAACAAG
CATTGCGAATGGATAGTGGGCGCTGACACGAAAGAGGGAGAGGAGTTATGAGACTTCTCA
TCCGTCTCCCGTGCTTTCCGAGGCGTGCAGCAAAGGGGCACACATGGCAGGAACGAGCGG
AGCTCGCCAAAAGTCACCAATTCGTCCATTCTTACGGGTAGCCCCGGGGTGCTTTAAGTT
TCGTATTCACCGAAAAGCAGATGTAGGCTAGGCAACCAAATATGTCAATTTCACCCACGT
GGGCCTGATTTTGCCTAATGCGGGCTACCAAACACACTCATATATTTTTGTCCATATTGA
TCCATAGCGATGTTCATCTGTTCTCCCGGTAACACAATGCTGCCGTTGCCGCTCTTCTAC
ATGTCTACTGTTTGGAATCCATCACCGAACGTTCTGAATTTGATTGGCCCGCGGTTTGGT
GGCTGAACAACGAGTTTCAGTTGTAGTAGAGAATAACAAGAAAAAGAATAATATGCTATA
CAAAATAGGGCTGTATTTAAAAATATGCTATTAGCAGCCTTTAATGCGTTATAGTATGCT
ATTGATGAGACATTATATGATCAATTTAGCTAGACGATTTTTTACACGCTATAGTGTGCT
ATTAGCAGCAATATAGCATGCTATTTTTTTTAATCGAAAATAGATAGGCTAGAAGATCTC
TTGTTGAAAATAACACTATAGCGTGGATGTTAAGAATAAGGCAAAGAAAAAAGAAGGTTC
AAAAGCGAAAGGGGAGTAGGGAAAAGAAGAATAAGATTTACTATACCGCACCGAACAAGC
AACGAACCTCCTTTTCTTTCTAGTTGCGATGTAGTTTTGTTAGTATCCCAGGCAATGGCG
ATTTTGCTAGCAGACAACCAAAAAAAAAACCCAGTTGTAGGTGCATAAACACTATGTCTG
CCGATAACTATTTTTTACGGTATTTGTTTTATGCTCTGTTTGTTCTTGGGCCGGAAAACA
CAGATGTGGCTGTGAGCGTCTGTTGCTCCCCGGCACTGAAGGCACGCAATAGCATGGCGA
CTATTTATTGCTTTAAGTGAGACATACGATTTCTCACGTTGAGGTCTACGTAACGGGCCG
GCCCATCCATACGCGACTGTGAGCACCGGTTGTTCCCAGGTGCTGAAAGCGGGCAACAAC
GCGGCGACTGTTTCTCGCTTTAAACAAGACGTACGGGATTTGTCGCAACAAGGTCTACGC
TAACGGGCCGGCTTGTTAGTGTAATTAAATGAAATAAAGGAGAGGAAGAAATGTCGTATG
TGGGTTTTGATCCCAACCTCTCTTGGTTGCTTGGTTGTACTACTAATACTAGATGAAGTA
GAAAAGCCGGATATCCACTATCTTTTCAGGTTTATGTGTCTGTTTTTAGGGTTTTTTTTA
CCGATTATCTTTGTTTGTTTTTCCATTTCACCATTTTCCCATGCTTTTCACGGTTTTTTA
TTTTTTGTTTTTGATTCTTGACAGGTTTTTTTTGTTTTTTTTGGTTTCTTATTTCTTCTC
CATTCTTTGTTTGATTTTCTTTTTATTCTTTTTTTTCTCATTTTCATTTGTTTTTCAATC
TGAATTTTCGTATACACCAAAAACATTTCTTTAATAAGAGATCAACATTTTTTGTATATA
CATTCAACAATGTCCAAACGCTTATTGAATTGCTCAATATTTTAGTAATTATTCAGCATT
TTTAAATACCATTTGTACATTTTGAAATACTCATTCAACATTTTTAATACTTAGCCAACA
GTTTTCGAATACTTAATAAACATTTTAAATACTTATTCAACATATTACTTACTTTTTAAA
TATTTTATAAATTCTTATTCAACATTTTTAATACTTATTCAACTTTATTAGATAGTTATT
CAACATTTTTCAATTTTTTTAATAGTGTTTTTAAAAACACTTGCTTGTTTAATATTCAAT
AGTAAAAAAGAAAGAAATAATGGAAACAAACAGGTGAAAAAAAATCTATAGCTACTAATA
GAGTAAATATGTATTCTTAGTCCGTCATGCTATTTTATATAAGCCACCCGTTATTTTTAA
CATTAAATCTGCAGTATATATCAAATGTTTTTCTCAAATATTCATATCTTCTAAACTGGA
ACTCAAAATTTAACATGTTATATATATAATTTGATTAGGAAAATATGTAGAATCTGAATA
TCATGTTATTTTACTTGTTAATCATTTAAATTATTAATAATAAATTGAAATAGGTATTCT
TAGTCTGTCATGTTAATTAATAAAAAACCTGATATTTTTACCATTAAACTCATAGTACAT
ATCATTTAAAAAAAATTACTCGTATCTTCTAAACCGCAACTTGAAATTTAACATGTTATA
TATGAAATTTGATTAGAGAAATATGTGCAATCTAAATATGGTTTTATTTACCTGTTAACC
ATTTAAAAGAAATACTATCTAGGATGCAATCTTAATCAATAATGCATTATCCTTCTTTCT
TTCTTACCAGTACTGATCCGGATTTGGGATAAACACCTCAGCAAAATCAGGATTGGTGAC
GAAATTGAAGATGACCTGTCTGTTTCTTTGTACTTAATAAATCTTCATGCAAACCGTGTT
GAAATAGAAGACCTGTGGAATCATGGACTGCGGTTTTGGAGGCTAAGACCATCTTAGTTT
TTCAGGTTTACGTTTTTGTTTTTTCTTGTTTTTTCATAGATTTTCTTTGTTTGTTTCTCC
ATTTCACCGTTTTTCGCATTGGTTTTCACGGTTTTTTTTCTGTTTTTTATCTTCTTTTGT
TTCTTGACAGGGTTTTCTTTTTTCTTCTCCTTTTTTTGGTTTTCATATTTCTTCTCCATT
CTTTGTTTGGTTTCCTTTTTTATTCTTATTTTTTGTTTTTTCTTACGTATGTTTTTCTTT
TCAATCTGAATTTTCATGTACGTTAAAAACATTTATTTAATAAAAGGTCAACATTTTTTG
TATATATATTCAACAATGTCCAAACGCTTATTTAATTGCCCAATATTTTAATACTAATTC
AAAAAAATTAAATAATTTTTCTATTTATTTCTAAATACTCATTCAACATTTGTAATACTT
AGCCGACATTTTTTAAATACTGGAACTACATTTTTCAAATATTTGATTAACATTTCATAA
AATCTTATTCAACATTTGTTAATACTTATTAAGCATTTGTAAATACATATTCAACATTTT
TAATGTGTTTTTGAATAGTGTCTTAAAAAATACTTGTTTTGTTTAATATTCAATAGTAAA
AAGGAACACAAATAATAAAAAGAAAAACATGAAAAAAGAAATACAATAAAACAGGCTTGT
GATTCCCTCCCGCGTGGGACGGCGGTTCCTACGAGGAGGTGTTGGGGCACCCCGGGCAAT
CGGAGGTATTCTCTCCGTCACGGTTTAAAAGGCATGCTTGGAAATTATCTAGAACCTAGA
TGGTTATTGATTAGTTATGAGATGGACTAAAAAATAGCAGTCACACTACGCATACATATA
GAAGTAGTATAACAGAGTACTATAATTAGCTGCTATGAGTAATGAAATGCACCCTAAATA
ATCTTGTCTATCATGGAAATGCACGTAAATTTAACCGTGTCTTCTAAATAGTGACGGAAG
GAGCACCAAATACATTGCAGTGGAGTCTCGGGCCAGTTAACTTTGACCCTCATTGATAAA
AATGAATAAATAACTTGGACTATGACTAGCAAAACTAGCCGGACAATTTGACCTAAACAG
GCTAGCTAGGACCCAATTACAAAAGCAACATGGACTAACTTGGACTCCACACCTACCCGA
AGTAGCACATGGAAAGGATTAACCGACTCATTCTGGACTTTTATAATCTAATAATCAACC
GAGAGGCCATGCATCCGTCTAGTATATTACAGTATATATAATAACAATCCATACTAGACG
ACGAGGACGATTTGAACGGCAAGTTTCACGCTGTCACTCCCACTCTCGCTCTCATTTTAT
TAATCACTAACAAACGCATGATTTGATCAGACACCCAAAATAGGAATAGGAGATGCTATC
ATCAAGCATGCTTCTTGCTGCCCAGAGCATCCCACGACTACAAAACACGGCTGGCCGGAG
GATTATAACACGATCGAGCGACCAATCCAAGCACCTACGCACTCTTCTTTGCTCTCATCC
TCTAGCTAGCTAACTAGCTCTCTTGGATCATCCATGGCGAAGGTGATGAACCTGACCCCG
GTGCACGCGTCGTCGATTCCAGACTCCTTCCTATTGCCGGCAGATCGACTCCACCCAGCC
ACCACCGATGTCTCCCTGCCCATCATCGACATGTCCCGCGGCCGCGACGAGGTCCGCCAA
GCCATCCTCGACTCTGGCAAGGAGTACGGCTTCATCCAGGCTAGTTGCTCGCTCTCGATG
GATCCATCTCATCAACAATAAAAAAATCCCACCTTTAAAAAAAAATTAAAATAAAATAAC
CAATCCACCTGCTTGAATTATCGGAATTGACCGACCAACTGGTAGTATTGCATTGCATGC
AGGTGGTCAACCATGGCATCTCCGAGCCGATGCTGCATGAAATGTACGCGGTGTGCCATG
AGTTCTTCGATATGCCTGCGGAGGACAAGGCGGAGTTCTTCTCTGAAGACAGAAGCGAAC
GCAACAAGCTCTTCTGCGGCTCCGCCTTCGAGACCCTAGGCGAGAAGTACTGGATTGACG
TCCTCGAACTCCTCTACCCCTTGCCTTCGGGCGACACCAAGGACTGGCCCCACAAGCCAC
AGATGCTCCGGTAATAATAATTAAGCTGCAACCATTTAGGCCGACGAATCGAATGGCTTG
CTTTCATGTCAACTGATCTTTGCGCCTTCGATTCTAATCTGCAGGGAGGTTGTTGGGAAC
TACACCTCGTTGGCAAGAGGCGTGGCCATGGAGATCCTGCGGCTGCTGTGCGAGGGACTG
GGACTCTGGCCAGACTTCTTTGTCGGGGACATCAGCGGAGGCCGCGTGGTCGTCGATATC
AACTACTACCCGCCTAGCCCGAACCCGAGCAGGACGTTGGGCCTGCCGCCACACTGTGAC
CGGGACCTTATGACCGTCCTCCTCCCCGGGGCCGTTCCTGGCCTCGAGATCGCCTACAAG
GGCGGCTGGATCAAGGTCCAGCCCGTGCCAAACTCCTTGGTTATCAACTTCGGCCTACAG
CTCGAGGTGACTTTTTTGCATCGTCGTTAAGTGTAATTACTAGTACTGAATATCCAGTAA
TAATATAATTCAGATTGCTCATTTCTTGGTTTTGCACTATATACACACTATATTCATGCA
TGCAGGTCGTGACCAACGGGTATCTGAAGGCTGTCGAGCACCGCGCGGCCACCAACTTTG
CCGAGCCCCGGCTGTCAGTGGCCTCGTTCATTGTGCCGGCGGACGACTGCGTCGTCGGCC
CTGCGGAGGAGTTCGTCAGCGAGGACAACCCGCCACGCTACCGCACCCTAACCGTCGGCG
AGTTCAAGCGCAAGCACAACGTTGTCAATCTGGATTCCTCAATCAATCAGATCATTAACA
TCAATAACAACCAGAAGGGAATATGAAGCAGAACCAGGAGAAAGAGGATTTGCATCACTT
CCTCGATCGTTCGAGAAAGGCCAAGTGATGCCAAGTTTTATTCTAATGTCTCTCAAGTCG
CGACGGGTGTCAGTTACATCTAGCTGATACGAGATATTTAGTCGTGACATGTGATGAGAT
CGGACGTACCTGTCGTACGTGTTGGTGATACCAAGCAATACAAATGTGACCAATAAGTTG
TATGTTTGAACTAAATAACGCAGAAAAGAGCACTATTCACCACATGGTCCAGCTCTAGTT
AATCATGCTTAGTCACCAATTTACAATTACTTAGTTGTCGGATTACAAAAAGTTAGTGCT
GGCTTTACAAGTACTTTGTTGTCGTATTAACCGTGCTAAATCACCAGATTATGAATACTT
AATAGCCAAATATTTAAACATACTTAGTTACCAGATTATAAAAACAATAATTTCTTCGTA
AACTAATGTAAGATCATTTGAAATACTATTTTAATAATCTAAACACTTTCATATTAGTTT
ACAGAGGAAGTGCTAGTTATCAGATTTGGATGTGCTTATTTGCCAGATATTTAGACTACT
TAGTTGCCAAAAACAAATAGCATGCTTGCTTGCC
