Map Locations of contig_67407 (11583 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_67407

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75223 3 3232 bp MLOC_75223.1 Available Available LOC_Os08g41470.2, FRAME:+1, EVALUE:2e-69, 13108.m04458 protein proteophosphoglycan ppg4, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_75223






Contig Sequence (11583 bp)

>contig_67407 11583 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAAATGTTCATGCATTTTAAGAAATGTCCTAAAATTTTAAAGACATAATATGATCAGCA
CCATTGGATATTATTATTGTTTTTCTCCCGTTGCAACGCAAGGGTCTTTTGCTATGAAGG
CTTAAGTTCAATTCCCAGCAGGTTCTCCTTTTTGAAATTTTTAACTCGCGTTTTAGGAAA
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GGGATGGGAATGGGATGGTTGTGGACTTGGGCGACCGGTGGTAACGGTGATGGCAAGGCG
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TAGGAGGAGCCCGTCAACGGTCCCCGTTTTCCAAGGCTTTTCTCCGTTTACACCCCACGG
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GCATATCCCGTCCATCAATTACCTTGAACATTACATATATAAGTAGTACTCCGTACTATA
TACACACTGTCCTTCGCCCTCTCCGCGCCGTGTTGATCCAGTCAGTGTCATGCTTAGCAA
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GCTCAATACGAGTAGTATATTTACTCTATCTATAATAATCTATGGTATTCCCTCTATAAA
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CGAGAGGAAGGACCAGCGAACGAAGCAACCAAACCATCCATCCCTGTCTCCTAGTTATAA
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TTTGCGTCCACCAGGTGTAGTTTCTCGTGGTTTGATGGTTCCAACGTGGATACCCCGAAT
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GCTTGTACCAGTAGAGAAATTTAGCTGCTATCATTCATGTGCTTAATCAGGCTAAAAGTT
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ATTGCACTAGGTACTAGTAGTAGTCTAGTATAATTCAAGTTCTTTTCTCTTGTGTGGATG
GATCGCAGAGCTAATTCATCGGCAGCAAAGGTCTTTCTTGGCAGTTGAGGCGTATCTTTC
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CTTGATCACATATCTACTAAACTTTCCATTGATTAGTCAATGACAGTGTTTAAAATGTGC
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AATCTTCTGACCATGGCTTAACCACCATCACCGAAGCTTCCTTGGGTCCAAGTTGAAGCG
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GCTAGTTTGGACTCAACTAATCCAAAAACATTCAAAGAGGAGGGTTAATTTTGATTAGAT
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TGAGGCCCAGAAAAAAGTTACTTTTTCCTCTTCCTTCACCACACTAAATCTTGGTTAAAG
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GCTAGAATATCCAAATAAAATCTATATTATGAATGTGAATAATCCGTAGAAAGAATTAAT
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GTAGAAAGAATTAATTAACGCAATCTCTATACAGTGTAAAATGGGACATTGTATAGAGGT
TGCGTCATTTAATTCTGACGAGAGGGAGTACCAAAATCAAGGTTATCGCTGTGATTTTCT
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GCCTTCTCCTCCTCCGTCGTCGCGCCGTCGCCGAACCGCTCCTTCGACCAGGCCAGGCCG
GCGCCGGCACTCCCTCCCGCTTCCCCGCCTCCCGCTCACCACCACGAGCGCCGGCCCAGC
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GGCCTCGTGGCCAACGCCAACTCCGTCGACCGGTCCCGTGCCAGGGCCGCCTCCCGCGGC
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GGGTCGGCGGTGCCCAAGTTCGGGGACTGGGACTCCAACCCGGCGTCGGCGGACGGCTAC
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GGCAAGGACAACGTCGCCTATGGCAAAGGCGCCAGGCAGCACGACGACGGCTACGTCTCC
TCGGTGAGTTTCACATCATGCTCACGTCGCCATTGGCTTGTCCATGTCGGTCCTCGCTTT
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TGGTTTCGCCTGCAGAGTCGCTGGTGCTTTGGGTGGTGCAAGTAGGAAAGGTTCGACGGA
TGATGGAGCAAAGTAAGCAGGGATCTTTGGGAATGTAAATTGTGTGGAATTAAGAAGGTT
TTTGCCATTGATTCAACTTCGAACTTGTGTAATCCCATTTCTTGGGACATTATTTGGCAT
TGGGCACTGAGCAGAGTTCATATTCTTTTGATTGTCAGTATACTATTTCTTTCTGATGTG
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TGAGGAGCAGTGCCCACATTTGCTCATGATGGGCACTTCTCGTTAATATGTGGGGCTGAA
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GTGGCGCGTCCCCTCAGCCCCGCCTTACTCCCTCACCATCTCCGGCGAGATTCCAACACA
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TGTCGACTGTCAGAATCGCATCAAACCTCCCTCTTTTGTGCAATATGGGATGGGGCTCCC
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TGGAAGGCATGCGGGTCTGGGCCGTGCATGGCTGGGATTGCAGGTGAATCGATTGCCAGA
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CAAATCTGTAGGTTAGCTCTCTAAAGTTTGGGTGTTGGTGGACGATGTTTGTGCGGAGCT
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TGGTGAGTCTTTGACCAGGTTGGGCCCAGTCCGTCTCAGGATTTGGTGTGTGGATCTGGT
GTGTTTGCATGGTCCGGTGGATGTGTCGCCCTCCGTTGATGGAATCCATCTGCGGGTGCG
GCTCGAGGGAGCTGAGGCCTCCCAGGCGCCTGCGCCTCCCCCTCATCCTGCTCCCTCTTC
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TGGGGGCACTCATGCCTGTTTCACCCAGTCCGAATGGGATAGACTGGGTTCTGAGGTTCA
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TGATGACAACGTGGGGGTTGCGTCGGGATCTCCTCCCAGGGCAGTGCCGCTTTCCCCTTC
TGCTCCTTCCCCGTCCATCCCCACGCCTACCTCCACGGCCCGCTAGGCCAGACGGGTGCG
TGACTCGAGGGAGACCGTGGCGGCGCGTGCGGAGCGGCGGGCTGCGGCTAGAGACCTTCC
TCCTTCAGGAATTATTCTCTCTCCCCCTCCCCCTTCCTTCCTCCCCTATTAGGTTAGTGC
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CCATCTTATGTTCTTTCCATTATCCGTGCTAATGAGATGACCGAGGCGGCCATTGCTAAG
GCTAAAGATTTGGTTGCGGTGAATGGGATCGTTGCAACCTCGGCGGGTGTGGATGATGGT
GTTACTGATAGTGGCCAGTCACCCCCTTCACCTTCTAAGTGGGCTATCTCTAAGCGTGCC
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GAGACCTCTTCTGTAATATTAGATATTTCGGCGCTAGGGGGCGCCGCGACCAAATTCGGG
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TCTCCCCCAGTGAGCTCTCCGCAGTTGCGGGGATGGACAAACTTGATTGGAACTTCCTTC
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TGACCTTTGACCATGGAGTTTTTGGGCTAGCACGGTGGTGCACCATCGGAGTTTGAATCT
CTTATGGGAAATCATGGTTGTCTATGGGCATGCAGACCTCTTTGTCTTCCCTATTTCTGG
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TGGTTTTGGATGGGCACACGGTGTTTTCGGTCAATGGTCAAGTTAGTAATTATTTGCCAA
TGGTAGGGTACTAAGGCAAGGGGATCCGGCGTCCCTGATCCTTTTTAATTTTGTTGTCGA
TGCCTTATCGCGTATTCTGTCTAGGGCTGGTGCTTCTGGCCACATTTCTCCAGTAATATC
TCATCACATCCCCCATGGGGTCAGCCACCTTCAGTATGCGGAAGATATCATTATCATGGT
GGAGCTTAATGATTCCTGCCTTGCTCATCTTAAGTTCATCATGTTATGCTTTGAAGCCTT
GTCGGGGCTCAAAATTAACTTTGCGAAGAGTGAGGTCATTATCATTGGTGTTGATGATGT
GGAGGCTTTACGAGTGGCGCACCTCCTAAATTGTAGGTAGGGTTCCTTTCCTTTTAAATA
CTTGGGCCTCCTGATTGCCCGGGATAAGGTTTGTGCCAAGGAGTTTGCGCCTATTGTTAC
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GGCCTTGACTAATTCTTGTCTCTCCTCCCTACCCATGTTCACAATGGGCTTCTACCTTCT
TTCTGCGGGTACACACGATGGTTTCGACAAGCATAGAGGTGCTTTCTATTAGAATTCAGC
GGATAATAAGAATAAGTATCAGTTGGTCAAATGGAACATCATTTGTAGGACCAAAAACCT
GGGAGGTTGGGCATCATTAATACCGCGGTGATGAACAAATGCCTTATGATCAAGTGGTGG
TGGAAAATCATGTCCCCGGGCAGGGACTCCCTTTTGTTCTCTATTCTCAAGGCGAAATAC
TTTCCCTCCTCTAATCCTATGTTTGCCTCACCTAGGGGGGATCGCAGTTCTGGAAGGATT
TGTTTAAGATCCGACCTCTTTTCAAGGACCATGTCAAATGTTTGGTGGGTAATGGCGCCT
CGACCCGTTTTTGGCTTGACTGGTGGTGTGGGGATTCTACTCTCTCGGTGGCTTTCCCCA
CATTGTTTTCCTTTTGTCCTAAGCCTGAGATCTCCATCGCGGAGCTTGCAGGTGATAATT
GGAACCTGGCCTTCTGACCCTCACTATCTCCAGAAGAGTTGGTTCAATGGCATCGTCTTG
CTGCCCTTTTTCCCACGCTCTACGAGGTGGAGGACTTGGTGATCTGGCCACACTCTGCTT
TGGGCCGCTTCTCTGTTAAGTCCCTTTATTCCAAGATTATTGCTGGCACACCAATGAATA
AGTTTTGTTGGATTTGGCATTCGCGTATTCCTCCTAAGATTAAAATCTTCATGTGGCAAG
CTTTCACGAGCCGTCTCCCGGCGGCCGATCAGATTCGGAAACGCAATGGCCCGGGTTCGG
ACCGTTGTGTCTTGTGTGATGCTTTGGAGGATATCGATCATATCTTTTTCAATTGTGTCT
TAGCTAAACTGATATCGTGCTGCTTTCGATCTTGGTTGCAAGTGTCTTGGGCTCCAACTT
ATTTTTGTGAGCTCCGGACCCTCGCCATTCCTCTGGTCGGTGTTACAAAATGGTTCTTCT
GGATTGGACTGGCGGCGGTCTGTTGGGCCTGGCGGGCTACCAGGAACAAGTTTACCATTG
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AGTGGAGATTATTGACTAAGCCTGAAGACCGTGATTGCTTTTACTTGCTGCTATCTAAGG
TTCGGGCCTCGGCATCCTCCCGTTCATGGCAGGAGCCTGACGTCTAATCTCTTGGTGGTC
TGCGGGCATGGCTGCCGATCTTCCTTTTCTTTCGAAGTTTTTGCTTGTCCAGCCTGCGTG
CCATGTGTATGGCCTGCGTACCGTGTATCACATACTTTGGTTATCGTTTGGCCTTGGGTG
GCTGTTGAACTCGTGGTGTCGTGATGGTTGTTACTCTGCCTGGTGGCTTTATTTATAAAG
TCGGGATCATGCCTTTCCTCTAAAAAGTAGGATTGCCTCTTCGCTCTGTGTTTGGTTGCC
TACATTGGTTGCGGTCATAGGAGAGCACATTGTTTGATTGCATACTGATACGTCTCAAAC
GTA