Map Locations of contig_6721 (5205 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_6721

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75138 9 2117 bp AK363018 Available Available None





CDS Structure of MLOC_75138






Contig Sequence (5205 bp)

>contig_6721 5205 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTGAGTCTAGGTCTAGGATCTGTCATCCAATCCAATCAAATCGGAGAGCTTTGCTTCGCC
TCGCCGGTCCATAAATACCCCTAACTGGCCGCGGCCGGCTCAAAGAAGGAATCCATGGTT
CCGATTGCCCCTCCGCCGGCGGCGCCCATCGGGGGGCAGTGGGAGGAGGGCACGGGCGAG
AGCTCCTCGCCGCCCAGGTCCTCCGCCGCCCACGAGGAGCTGCGGCGCAAGATATACGAG
CGCCTGGTGCAGGCCGGCAAGCAGGGGGACTCTGATGACGCCTCGTTCCGGGAAATGCTC
TACGCCCACTTCGACAAGCTGCCACACAGGTACCTGACGGACCTGGGTGAAAGCAAGGCC
GAGGATGTGCTGCTCCACCGGGAGGTCCTCCAAGAGTGCGCTCGCAACGGCAACCAGCCC
GTCTTCCGAGCTCGCTTCCTCAAGGTACCCAACACACCTGATTTTCGCTTTGCAGTTCAT
CCCCAAAGATAGCTTGTGCAGTATACAACAACCAAGTCTTTAAACCTGGTACTGTGTATT
ATGCTGTTTACTCTTAGAATTGAGGTTTGGCTGAGTAAATAAAGGGACACTTTGTTAGTA
TTTTTCACGTTCTATTGATCTACCTTGATCGACAGTACATGGCAGTTCAACCGGAACGGG
TGGAGACCAGTCCCGACTCTGATACATATCAAAGGTTATTGGAAGACCTCACTTTGGAGA
GGATACATGGCGCCGACACCATGGGCTCTCTTTCTTCGCCATCAAGGTCATTCACTCTAA
ATCGTACCGTGACTTATCTTTGATATACCATTGTTAGCTTCTTTTTGTATTTCACACTTC
TAAATGCTGCTGTTTTTACCTTTGTCAAATTCGAGACCAGTGGCTGCAATTTGTCCTTCC
TCCAATAAGTCATCCTCTCCATGTGCTTCCAGCTTACTGTGTTTACTTGTTATGTTTATG
ACTTTTAGTTAAAACGCCCTCCCAATTCTCCACAGGGATTCAGAACCTGCCCTTCTTCAT
GAGATCATCTTCTCTTCCCAGGACAAGCCCAAGCTCCTTGGCCGGGTAATGGCAATAAAA
GAGGTAGCCTGGTGCGCGTAGCTCCCGCTTGCGCGGGATCCAGGGATACGTGACCAGGGG
GGCCAAATTTTACCAGAATTGTCTTGATACCCAATTTTATATAGCTTGTTTTTCACATTT
GACATGCCAAGTTTCTTATGAGAAATAATTGTTCAACAGCTAACTTCGTTGCTATCTGAA
GTTGGACTAAATATTCAAGAAGCTCATGTTTACTCCACAACTGATAGCTTTTGTTTGGAT
GTTTTCGTTGTTGATGGGTGGAAGACAGAGGTAAACTTTCAGCATATGTATACGAAGGCT
GGACTGTTTATGATTTTCTGCAGATATTATATTTACGTTGTGCATAACATTTGACTATAA
TATCTCCAGAATTAATTAAATAAACTTGCCAGTTTGCAGTGCTGCTGGCTACAACTACTA
CCTGCTTACGTTTCTAAGACGCTATGAACTACTCCCTCTGTACACTAATGTAAGTCGTTT
TAGGTCACTACTTTAGTGACCTAAAACCTCTTATATTTGTTTACAGAGGGAGTATTTATT
CTCTATAATTACATCCTCTTGCATATGCCATCTTGATATTGTACATGCAGGAGACAGAGG
CGTTGATTGTGACAATTGAGGACACATTAATGCAAAAAAATGTATGATGCCCTTTTCCAT
TTAACTTCAGTAAATACAGTATTATGTGATATCTGTACCTTTGGTTAAGATGCCATCTCT
AGCATCTCCTTCCAGATCGAGTTAAATTGTCCCCATGTAAATATGTAGGGAGCACCACCT
AACTCAGCAAATTCTTCATCCTCGGAGAAAATACTTGAGCTGCGGCAACAGCTTCTGGAT
TGTGAAATCGACTGGAACACGCTAGCAGTGGGGGAAAAGATCACATCTGGGTCTTCTGCA
GACTTGTAAGAACTGTTCGACACTTCATATTATATGTCCATCTTAGGGTTCATCTATTTG
AAGTGCCCACAATGCCAAGTTCAGTTCTACCTATGATGCTGGCTTCTGCTGACAGAAAAC
GTTAGCATTTATCGTGAACGTATCTGACAAATTTTTTACTCATCCTATATACATAAGAGA
GTCATCCTACTAACTTATTTATCTCAGCATGCAAGCATGCCACCTCACCATATAATTATG
AATGGTATAAGGCCCACGTCAACATGCAATCATGCATGGGAAAAGACCCACCACAATATT
TCAACCATGCATGGGAAAATGTTTTTCATTTGTTATTCTACTTATATTCAATAAATATTG
TTACAACTATTACATAATCAAATATAATAAGTCATATGCATTCTTAATTTTGGTTCTCAT
GTTATCAACCCAAATTTCCATCAAACATTTCCCGCAGCAGCGCGCGGGGTATCCTCTAGT
ATATATATGAATGGCAGACGCCTGCCTTTTCCTGTAAAAACAACACAAAAGTATCGTGAT
AGGCAAGGCCACACTAGAGTCCAACGGATCTCATTCATTTCTATTCCACAGATATAGAGG
AACATATAATGGTTTGGATGTTTGCATAAAGATACTCAGGAGCGTACATCTCAACAGTCC
TTCAGAAGTTGAGTTCTTGCAGCAAGCGCTCATGCTAAGGCAAGCTTTCTGCGACCATTA
CTTAATGATCAGTTATGCTTTATTCTGACTGATTCATGATATTTGGCGTCCAGGAGAGTT
AAGCACGAAAACATCCTTACATTTTATGGGACATGCACAAGGCATAAGAAGTATTTAGGC
ACTATAACAGGTACCATCAATACTGCCAAAGAATATTATGGATTGGAATAAACTTTGCCA
TGATTGCTACTCTTTAGTTAGTTGCTAGACCATATTTGGAATGCCCGTACCATGATTTTT
TTTACATGATGCAGTACAAAACCATTGTCATGCACCAATTCACCTAAGATATCAGCTAAT
GCATTGTTGTGATTGTTTTTGTTTGTTATTTCGGTTGTAACTTATGGTTGAATCTGAAGT
CAGGTAATGTAGATATTGGTAGAGTTTTCAATGCAACTTCTGATTGAAAAAAATGTGAAA
TTTCAATGCTCGATTTTTTAGTCCGCACGAAACTATAATCACATGTGGAATTATTTTTAT
GCCTACTGTATGCTTAACAGTTTCTGACTTGCTGCTATTCCTGTCAAGTGTGCCCATAGC
TCACAACTTGCGAGTTTGATGGGCAGGAAAAACAAACGCTTTGCTATTGTGTCAAACTGT
GTAACTAGATGCGTCTCTTGAATCCATTTCTGATAGTTTATCTCTCATGTATTCTCTATT
TATATATAATGTGATATGCGATTATAAGGCCTTCTTTTCATTCAAGCAACCGGATTCCCG
TTAGAGCACATCACCAGGCATTTGAATTTCAGTGTGATTCATTCGAAATTTGCAAAATCG
ACAATTCTTGTTCAGTTTCGGCCAAAAATATCGATTGTTTTGAATTTTTCCCTTGGTTAA
GACAGTTTCGAGCAGTCATGCATCATGTTATGACTTTGGATGCAATGGTTAATTTAAACA
ACTTTATGCTTCTGTGAGTTCGAACGCCCATAAAGCATAAATTTTCCTGAATTTTTATTT
TATTTTTCCTAGCTCAGTAGAAAAGGTAGACAAAAATTGTGTAGGTTGTAAAGCACAAAC
TGGAGACAAGATGGCTGAGTTCTATGGACGGAAATCACTACAATGGAGTAAACTCTTTGG
TACCATTACATGGTTTACATATAAACATATTATCAGGTAGTGAATTTGAATTTGGCCAAA
AAAATTGTTTATTTTTTGGAATTTTTGTACCTTTCCTGAAAATTTTCCAGGAGTGGAATT
TAACCCTTTGACCGTCACTACCTAGCTAGGTTCCCCCATCCCGCCTAACAGACCCTTCAG
GGCTAAATCGCGGTGACTGTGCCTAAGCAGTCGCCTAGCCTGCTTTTAAGAATACTGTAC
ATGCTTGTGTCTTAAACTCTTGTTTATTTATTTTTGTTTCTTGAATGAGCATGTTGCACA
ATTTCAACATAGCCCACTCTGTCTAGTAAACTCACCTTTTTTTTCTCGAACACAATGTGG
TCATCTTTCACCTAGTATGCTCACGTTTTTTTTTCTTTCGTTAATTCTGTTCCTTTCAGA
ATACATGCCTGGAGGGGATTTATATGGATTTATACATGAGCAAAATGATGTTTTAGACCT
CTTTCTGATTCTAAGGATTGCTATCAGCATCTCAAAAGGAATGGAATATCTGCACCAGCA
TAACATAATCCATAGAGATCTGAAGACTGCAAACATTCTCATGGGCGACAATCATGTATG
CATACTTATTCAAACTATCGAAGCTATTGGTTCTGAGAATCCGAGAGTCCATTTTGTTCT
GCTTTTCTAGTGTGGTATAAAACCTGGAAAATATATAAAAGCATTGCAGCGGTAGATCTT
TTAGTCCAATCGGGGCTGCTTTGTTACAAGCACATTCCTTAAACACATAAAGGTTTATAG
TTCACATACGGCAAACTAGCAATGGCAGATGACGTTTTAAAGCTCAAATAAATTATAATA
AGTTGCAAAATAAATGGAAATCTAATTCCATTCAGGAAAACTGTAGTTATTCAGGAACTC
AATATCAATTTATATTTGTATATTTTAAGAAAATTACTGTTCATAAAAATATTTTGTCTT
GTAAATTGTGATTTTAATTATCTTATGTCACACACTTAACTTTTTTGTCCCTAAGCATAT
AAGTTGTGGATCTACTTCTAGAAAATGGTGAGAAAAATAATGATAAATATTTCTTGAACT
GTTGTAAGCTTACTTGCCTACGTGACCCCCATTTAGCCTCCTTGAAAGCTCGGGGAGAGG
AAACCTAGCAATCACAACTACCTCCCCCTGCTCCTTCTTGTCTCGCCACCACTTGAGGGC
GGCCTCGGCGAAGCCCGGTCTGACCCCGACAAAGGCGGCGGTGGGGCACTTCCCTGCCAG
CGCAGCGTATGTGCAAGACGAGGTTGGGCCGGTGCGGCGGCAAGGCGGCAGATCATGGCC
ACACGACAGCTCCCAGGCAGGAAGGCAGAGCGGCAAGCATGCGGTAGCTTTCCCGGTGGG
TTTTTTTCTTTGAGAAAAGGCAAAAGACTTTTGCGTTTCATTGTA