Map Locations of contig_6705 (4199 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_6705

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_75057 2 1620 bp AK373732 Available Available None





CDS Structure of MLOC_75057






Contig Sequence (4199 bp)

>contig_6705 4199 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
GAAGGCGTCGTGATGTGGCGGCCCGGTGGGATGGAGAGGAGGATAAGTGGTAGCGACGGT
GCAGAGTGGCAGCCCGACTACGTAGGAGCAGGGTGGCCAGGCAGGGAGGCCCTATTGCTG
TCTGACCCGAGTGGAAATTTGAACGTAATATCGTCATTCAATAGGGATAGTAATTCAAAA
CGAAAGGTTTTCTTTTGAGGGGATGGCTAGAATTGCCATAATTGTGAGGTTCTCACACTT
CTAAAATGCACTAATAATTATGGTAATTTTCAGATAATTCTTGGGGAAGAAACAAGTTCT
TTTGTGATTGTAATTCTCCGACAGCCATTCTATGGAATTGAGTCAAAAAAACTGGCCCTT
GACAAGATCATAAAATATGGCATTTGTGATATGCTAGAATTTTCTTGAAATTTATGATAA
ATATTTACTTTCTAAGTATTTTAAAATATTGAAATATTCAGAAAGGATAATTGAATGTTT
TGACCAATATTTTAAGCTATGTAAAAAAGGATAATTGCATCAACTCTGACAATTGTGTGC
ATCTTGGTTGCGCTGCTCCTCCCTTAAGTGCGTAATGCACCTGAAGAGAGGGATTAATTT
ATAGGATGGCTTTTGAGTCTAAATTATTACCTTATACGTCGAGATTGGTCGGTATCCATC
ATATTTACTCCCTTTGTCCCGGTGCGTACCTAATAAATTCAAATAATTTCAAAACACTTA
GACGCGGTTCATTAATTTTCACCTTTTATTTTTTATATGAATAGAACAATTAACTAATAA
GAGACGTGGGACATGTATTGTTTTAATTACTTAAGACTATCCAACACAACATGCAATGGT
TAGTTCATTGCATGCAATGATATTAATTAGCAAATGAGTATTAAATTATTTCATTTTTTC
TCTCCGTCTAATTAGCAAATGAGTATTAAAATCTTTCATTTTTCTCGTCGCCTTTATCGT
GATGCACAACGTAAGATGACTTAAAAACCGAATTGAAAGGAGTAGCTCATATAAGGCGGG
TCGTAATGAAAGCACCATATCTAGTATCATGTATGCCAACTAAACAATTTTGATGAGGTG
GCATAGAATTAAATAAAAAAAAAGAGGGTTGAGTATCATATCATAATACCGTATCATATT
AAATGTTGTGCTAGTATGTGTCATGCATGGCAATAAATGACATATCCTATGATACTATGC
ATTACGGGTGTAGTATCATACACTAGTANNNNNNNNNTGATACTAGTATATGATACTCTC
CATTACAACCAGCCTAACCGGACACACCATAATTTCACCATCATATTTAGCTTATATATA
TTTAGCTTATATATGCGGGCTATAAAAAGGACAAGTAACGACCAAACAGACCGGACCCAC
CATATATTTCACCAAATCCCGCTCCCCTAAGCTTGCCGGACAAGCCCCACTTTTCTTCTC
CACTCACCTCCCTCGTCCACGCCGGCTCTCACCTAGCTTTGCTTGCCATCCTAGCTCACC
GACCCCTCCAATCTAGATTTTCCAATTCATAGGCCAGGCCAAGAGAATCTTTTAAATTAA
ACAGTAGAAACATAGGCCTGTCTTATTACAACACCGACAAGAACTTATTCATCATATATG
TCTTTAGTAGGACACGATATACGTGTCATTCATCAGCTCTCTATGGCAACACCATTCACC
ACGGTCTCCATCGGCCCAGGCTTATTGCTACCACCCACAGCGATCGTGTCCTGCTCGTAG
GCTGAGAGATGGACTCCAAGCGCTGCTCTCCCAGAGGGGTCCAGGTTCCCAGACCACTGC
GCGTCCCACTCTATTGCCTTGGCTGTGCTGCACGCCACGCTTGGCCCGCCTGGCACCGTG
AGGATCGCCGAGCTCTGAAACAAGGTCAAGCAACCAACATTGCTTCCATTAAACATTGCT
CCAATGGTATTGAAGTTAAGGTATCTATTTCATTCCTTTACGCAAAAGGATAATGTCCAT
GTTGCTCAACATTTCTTTTGTATTTACTCACTCACCTGGGGGAAGTACCTCTCGAAGATC
ATCCTGTAATAGTAGGCCTCTTTAGTTGTTGGGGTGTTGTGTGGGTAGATGAACTTTGCA
TTGGACATCATCTTATCACTCACCTGCAGTCAGTGATTTCATTTCATATCAGTTAGATAT
TGCAATCACATACTCGTATCGAGGAACGTACGTATTAGTTTTACCAAAACTAATTAACAT
GGAAAATATTTGTTTATTTACATTTGATGCTGCATGATCCTTAAGGCCATCAATCCAGCT
ATACCCAACACCATCACTAAACTGCTCCTTCTGCCTGTACAGAATGTGCTACATAGATCA
CACAGAAGAACGTGTTAATAACTCCACTACTCCAGCTGGATCTGACTGTTGAGTCGAAAA
ATGTTACCTTCGGCAAGAAGGGTTTCTCCTCATCGTCGAACGCTTTCCTCAGTATCCATT
TTTCAATTCTTCCAAGATCAGGCCGGATCTGTGTGATTAAATTTAGAAAACAATGCAGTG
CACTCCCATTCTTGTGAAATATTTTGTTCTTACCATCTTCCATTCAGGATCTATGCTCAT
AGCCTCATCGATGAACTCCTTGTCCAAGAATGGCACACGAACCTCAAGGCCCCATGCAGA
TGTTGCTTTATTGGCCCTCAAGCAATCGTACTGATGGAGAGCTTTGATCTGCAAAACAAA
TCATGTTAGAGCAGAGTGTTATGTGTCCTATATATTGTTTCTGCTCCTGTGAAATGTTTG
TATTTTAAAGACCTTCCGACATGTTTCTTGGTGGAACTCCTCCTTGTTGGGGGCCTTGTG
GAAATACAAGTACCCCCCGAAGATTTCATCAGCACCCTCACCAGAGATGACCATCTTGAC
ACCAAGCGCCTTGATCTTGCGTGACATCTGGAACATTAGTGTGCTTGCCCTGATCGTCGT
GACATCATATGTTTCAATGTGATATATCACGTCTTCAATTGCATCGATGCCGTCCTACAG
CAATTTGTGCAACTAAAATAAGTGATTGTGTACAAATAAGATAGGATCGTTATACTTCTT
AGTGGTACTACTACCGTACCTGAACTGTGAAGTTGAACTCATGGTGCACCGTACCCAGGT
GATCCGCGACCTCCTTTGCAGCCTTGAGATCCGGTGATCCCTACAATATAAATTGAGATA
ACAGCATGGATTCAAGTTCTATTACTCCGAAACTTCAATAAACGTGTACATGTTCCTTTC
AATTTCACACCTCAAGCCCAACACAGAAGGAGTGGAGCCTAGTTCCCCAGCGCTTTGCAG
CCTTCGTCCCTGCGAAATGACGGGCTGCGACGGCTGCCACCAGTGATGAGTCGAGGCCAC
CAGAGAGGAGGACACCGAATGGAACATCTGTCATGAGCCTCTTGATGACAGCCTGAATGA
AGAACATGAAGAATCATGGCCATGAGTCCGAAATTTTATTACATCTCTGTTTTTCAAAGA
TACTAGATGATGGTTAGTTGAGGCCGTTACAGTTTGCGACCTTTTCAAATGCCGATCTGA
GACGTAGTGGGTCATAGGGAACCGAGGGGATGACCTCAGAGAACCAAGGAGGGTTATACC
ATCTCTTGAAGCACTTTTCTTTGCTGGAGTAAAGATTACCAGGTGGGAAGATCTCGAAGT
GCTCACAATCATCGTTTAGTCCTTTCATCTCCGAAGATATCCACACTGAACCTGACAATT
TTTCAGAGACGTGCATGTTTAGAAACGCAGTGCAAATGATATAGGTTTGTTTCATGAAAA
GATTCCTCAAGCACTTTTGAGAGTGTTATACCATCGATTCCCCAGCCAATGTAGAGAGGC
GTGACACCAATGGCATCACGAGCAGCAATGAAGCTGTGATCTCGTGCGTCAAGCAACACG
AACGAGAAAACACCATCCAACATGTCAATGAAGCTTTCTCCATGTTCCTCATACTACATA
TCAAAAGGGAGAAAGTAGTCAGGTCATGACAAAAAATAAGAATTCACTTAAGGGTTGTGC
CTATTTCTTTTTAGTCGTGCAAGGATCTCAAAATGGGACTCTAGCTCGAGTATGCATGCA
CTCACATGAATAGTGAAATTCGGAAAAATAGCAAAATAAATAAAAGAAGCTAATTTTTTT
AAGCAAAATGGTCGAGTGCTCTACACCCGTGTCCACTGGCGGAGGACCCCTATGGGCAA