Map Locations of contig_66698 (6421 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_66698

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74875 1 892 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_74875






Contig Sequence (6421 bp)

>contig_66698 6421 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CATTCAAATCATGCAAATCAGAGTTCAAAACAAGGGCAAAAGAGNNNNNNNNNNTAGATA
CAACGGAGACGTATCAGACGTGAGTTCGATGATGGAACCCTCCTAGAAGGAGCCAACGTC
CACCACGACATGGTTGTGGCGCCCACCACACGAGGCGTCGAAGAATGCGACTACAACTCC
TCCACCGAGCCATGGATCCCGAACTGGTGTGGTGGCTGTTGCCGCCATCCATACCATGGT
CGCCCGTTCTACGGGAATCTCCTCCGTGCATTCCCCGCCTCCTCTAACACCGACTTTCAA
AAGTACACTGCCGGCACCGTCATACTCAAGGCATCTCCTGCATCCTCCTCTGTCTCGGGA
TGGGAGTTGTGTGGCCGGGGACTGATGTAATAGGCATCAAGGAAAGTTTATTTATATTGT
CCACCACGTGAGTCCGCCTTCGCTAACTATGCCATTGTTGTCCATAGTTCATTAGACCAG
CACGAGATATCTTGAACACAAATCTATTTCCCCCTCCCACGCCGAAGGGCAGGGGGCTCC
CAAGATGCCCGCTCGTCTAGGTACAAATTGCTCTGCTTTACCTATGTTGGGTGTTGCATG
CACTCTAGGTTCTGTGTTAGCTTGATGGGTTGCCGCTAAGTGCCTGATATGGGCCTAATA
TTAGTAGTAAAAATATAAATCCAGTTTTTGGAGGAGGGTTCGAGCCTGTTAAAGCCTCCT
TATAGTAGATTCAACCAAGGCGGGAAGCCAGGAAGTCGAAGACCTTCCAATGGCGATGCT
TGCTGTTTTGAGAAAATCAAGGAGTTACGTCATGTCGCCAATGACGTAACCCTATGATTG
TTGGAACTGAAATGTCCAGATCTAGCCCTCCCTATTAATTCCCGCATCAGTGTAGATTTT
TTTATTTCTCTAGTTTTTTTCCTAGTAACGCACGGACATGCAACTGTTACTATAATATAC
TTCCTTCGTTCCTAAATATAAGTTTTTTTAAGATTTCACTAAAAAACTACATAGAAATGT
ATATAGACATATTTTAGAGTATAGATTCACTGATTTTACTCCGTATGTAGTCCCTTAGTG
AAATCTCTAAAATGACTTATATTTAGGAGGAAGTATTTTGGGATGCATGAAAAAAAATAT
ACAAATAAAATAGGATGAAACAAAAAAATCCACCCAAATTTATTTCTGATTGGTACAAAC
TAAAAAGACTCGACTGACTGATCAACACTTTCATACCTAGAAAAATTGAACAGACTCACA
TGACACACACAGAAGCAAATAAAAGAAAACAAGGAGTAGGTGGACAACGACTGATTGAAA
CCAACATATCCAACGAACTAGAGGTCTCGCATGCACGAAAAAACCTGCAGCACGCGCTCA
CTAGCAGGCCTTCTCCCTGACGCATTGCACATTATCCTGGGCCTTTTTGCCTTGAGCCTT
CCACGCCTTCTTCATCTTGCAGAGGCACGAGTGGCCTCCAAAGACAACACAGCAGTCAAC
TGGAGCCTTACTGACGTTACCCGAAATAATCCTGTCGGCCATGGCATTTTGCATACCTAC
TCCGAAGCTCTTGTAGCACGCATTCACGACGTTCTGATCAACAATGTCGCACGCCGGCGC
ACCACCGGCGGCGGGTACCTGGGCCACAGCGACGGCGCACATCAGCGCGACCAGCGCTGC
CACGGCAACGAGCCTCGGGAGCATTGTTGCTGCCATGACCAAATGGATGTTTGATATAGC
TGATGGAAGGTGGATGCACTCACTCACTGTTTATGACTGATGTGGGATGTTTTCATGAAG
AGGTCTGTCACTAGTTTTTATAGAGCTGCGATAGGCGTGAGCATTTGGTGTCCTACCTGG
ACTCGACTAGACAGCAAGTGGCTACCATGCTTGATCACGTGGACTAGTAGTCGTCACTGA
ACCTGACATATTCCTCATGCGCTCCTTTCATTTGCTACTAAAGGCCATGTATCCTGGAAT
AAATAATGAGGAATGATATGATCAAGGATGAACTGAACGACACCACCGTCCTAGCAAAGC
TTGGATCCAGATCTAACTATATTTCTCATGTCTAATAATATTTATTCTTGGAAGTAGTGA
TGTTTTATATATGTGCATCATGACAAAATCTCGGCCCATTGCTTTGGATCGTCCATTTAT
TTGTTTTATCCTTTGAGAAAATAATTGTATGACCCACGCTTGTATGCCTGCCCGCACGCC
TATTTTATCCTGTGAGAATCTCTGCGCTTGAATCTCAAGTGGCCACATGCACATGCAGTG
TATGGCGTCGTTTGGAGTATATCTGGCCATGGGCCGGGTCGGGCCGGGCCGAGCTTAGGC
CAGGCCCTAAAAAGCCCAAGGCAAAAAACTAAGGCCCGGGCCATGCCATCAGGCCTACGT
TGAAGCCCAAGCCCGGCCCATCTATTGAAAAGCCCGTCGGGCTTGGGGCCATGGGACGAG
CCTCTTCCTTAAAATACCAATATGTCGAGCTCAAGCTTGTATTTTTGGGGCCGGGCCTGG
GCAGTGTATTTTGGGGCTGGGTCTGGGCAGACCGGTCGGGCCGGGCAAGAGATGCCCAGG
TATAGTTTGGAGGCAGCAAAAGGATGTGCCCTCATTAACTGGATTAATAATCCCTCTGTG
TGCCTGCCTGCACAACTCACACCTATGTACTAGTGTAGTGTAAGAGCATCTATAGTCGGA
CCCGTCAAATCCTTCTCAAACCTTCAGTCCATTCAATCACTGATCGGTAACGAAAAAGCG
ACCCCGAGGAATCCCGCACACATGCCTCGTTCGTCCGGGCTGACGGACACCCCTCATATC
CAGTCCTAATATGGGGTGGATCAGAGGGAGTTCGGGCGCACCCGGGCACGTCAGCCACGT
CAGACCCGGCATCACGACCCTACCGCAAATTGCATCAAATCCACACCGCAGAACTGCCGT
ATCCATTTCCTATTTCTCTCTCTTCTTCCTTTGTGCGTCTTCCATCTCGCACCTTCGCCG
CGCGCGCGCCGCTCCATCTCCTATTAGCTTCTACCGCCCCAGCCGCACAGTCAGAGGGAT
CATCTCTCCCGACCTTTCCCCTCAGGAAGTCGTCGTCGTCCCGGAAGACACCGCGGTCCG
TCCGACAACTCTCTAGCTGTGCCTTGCGCCGAATGTGTTCGATTGAATATCTGAACGGAT
TTGTTATTCAAATTTTTAGGGGAAATGATGGATTTTGATGCTTCGTTCGATGAGTAGTAT
GGACCGACCAATCTTGGTCAACTGGTTCAAGATGAGTTCTTCGATTAATTGAATTCGGAC
GAAGAAATGGACATGATGATACTCATGAGCTTGCAAGAGGAAATGGACCGGGAGTGGAGC
ACACTCTCAGTTTCAAGGGCTCAATCAAAGGGAGAAGAGTCATCAATCGGGATAGGGTAT
CTGAAGCAAAGCTTTTACAGAAGGATTACTTTGATGCAGACCCAACTTTCTCGGATAATA
CATTTTTTCGTCGTCGTTTTGGCATGCGAAAACCATTGTTTTTGCGCATTGTGGAGGGAG
TGAAGGCACACAATGACTACTTCAGGTTCACAAGGGATTGTTGCGATCAACTCCCTTTCT
CTGCCAAGCAGAAGTGCACGACTCCTATGAGGATGCTTGCACTCGGTACTACGGCATATG
TCGTTAGTGAGATGGTCAGGATGGGGAGAACACATGCCTGAAAACTACTGTCAAGTTTGC
CCATGATGTGGTGGATGTGTTTGGAGCAGAGTATCTGAGAGAGCCAAATGCATAAGACAG
AAGAAGTTGTTGGCTATTGGAAAGGCCACAGGGTTTTCATGAATGCTCGGATCAACCGAT
TGCATGCATTGGCAATGGAAGAACTGCCCCAAAGATTTGCGAGGAATGTACCAATGCAGC
TTATGAACTCTACATATGCATTGGAATCTCCGAAATGATCATGTACACACGCAACTACTC
AGTGATCTAGTAGACCATATGTGGACCCACAATGAAAATCAAAAAACAAATGATTAATTG
TGCACTTCAAATAAAATTGATGTAAACACTTCTTTTATTTGGTACCAACATTTGTTTCAT
ATGTGACATTTAGTATCACATGATCGATGTGCATGGCTTTAAGTGAATTTAAAAGTCAAG
AATATGAAATATATGGGTGCATGGAACAAAATATAAGGGACGTGTCTGTGAGAGTGCCCG
AACACATCTACGGGTGTATACGGACCGGATTTGTCCAGTTCGGGGTTAGCTAGACCTGCA
TCGGGCCTGACGTGCGGCGCCTGGTCCTATCCCTTTGGCTAAAAGTGTGTGCCAGGCATA
CTTTAGTTATACATAATAAGGAAAGATAAGTATGTATAGACATCACAATAAACTGCACGC
CTGGGGACACGGCGCCTAGTTGAAAGTCTTGTCCCAGCGCGTTCATGGTTACTAGAACTA
CTCATTTGAAAGGCCAAATGCTCAGATGGATGTTTGTTATAGGTGATCGAAGGTGGATGC
ACTCACTGACTTTTTATGATTGATGTGGGTTGTTTTCATGGAGAGGTTCGTTTTTATAGA
GCCAAACAAGCGTGGGCATTTGGATTGCTAGATGGACTTGACTAGACAGCACGTGGCTAC
CATGCTTGATAACGTGGGCTAGCAGTCCCCATGTAATCTGACATATTCCTCATGGCGCGC
TCCTTTCATTAGCTACTAATGGCCATCTATCCAAGAATAAATAATGTGGAATGGCGTGAT
TAAGGATGAACTGAACGACACCACCATCCTAGCAAAGCTTGGATCTGGATGTAACTATAT
TCCTCATGTCTAATACTTCCTCCGTTTTAGTTTATAAGTCCGGCACGTGTATCTAGATCG
TCAATTTGATTAACTTAATAAAGAACATATATTATAAAAAATATATGATTAGAAACTTTA
GATGTTTTATTTTTTAATGATATAATTTTTATGTTAAACAAGATATTTTACATAAGTTAA
ATTGACGATCTAAGTATACGTACATGCTTTATAAACTGTGACGGAGAGAGTAACATTTAT
TGTTGGAAGTAGTGATGTTTTATATATGTGCATGATGACAAAATCTCTGCCCATTGCTTT
GGATCGTCCATTTATTTGTTGTCTTGTGAGAAGATAATTATAAGACCCACATTTGCAGGG
TATGCCTGCCCGTGAGAATCTCTGCGCTTGATACTCAAGTAGCCACATGCAGATGCAGGT
GTATGCCGTCGTTTGGAGGCAGCAAAAGGCTGTGCGCCTGTGCCCTCATTAACTGAATTA
ACAATCCGTCTGTGTACCTGCCTGCACACCTATATACTTGAGTTAGCTTAGTTAGGGCAT
CTTGAATGATTGTAAGATAATTGTTGATAATTTTGACACATAATTTTTTTGATAATGTCT
TATGTAATAAATAAATAAAAAGGTTGTATGTGTAAATTAACCGTCACCTTTGCACAAGCT
TCAATGCAGAATAGGAGAACATCTTATTTATTACCTCACATCTTATTAAGCAAACTAGGT
ACAACCCATTAAAGTAGTTGTATGTTAAGGTGTTGACTGATGACATGTCAAATTTACCAA
CAAACTAACCAACAAATTGTTGGACATGCCTTTAGGTAACTAGACGTGCACCGCGCCTGA
GTGCGGGGCCGGTCCTATCCCTTTGGCTAAAAATGTGTGCCAGGTATACATTAATATTAG
TAACAAAAAAAGTTAACTATGTATAGCCAGCATCTACAATCAGATTTAACAGTGATCGGT
AAACTCTTAAATAAAGCGTTCTACAATTGAATACTTTAAATGAGAAATCTCAAATTCAAT
ATTGTTACATGCAACGTCAAACGATATTTAAACGGAGCTCGTCCAGCTCGTCATGCCCGT
GTTAGTCGATCGACTGCAATCCCAGAGTGTTCGGACGAAAGACGTCTCACTTCTTTCAAT
TCACCTCAAAAATGTCGCACAGGAGTTATTGACCCGGCATCTATCAGTGTCTATTATCTA
AGATCATGAGACATCAACGTTTAGCACCGATCAATGGAGAATCTAAGGAAAAAAGGAGGG
CGGGCTCAAAGTTAACGAATAAAGAATTCTTGATGAGATCTTCTGTTGTTTTCAGTGAAT
AAATTGTCAAAAACTACCATATTTCGCGCAACCGTGTATAGTAGCTACCACTTTACAATT
ATCAGCAAAAAACTACCAAAAGTTTCCTAATCTATGGCAAAAAACTACCAATTTTTTTAA
CTGCCCGATTTAGCTCGTTTAACCATTTTTCTGACAAGCTGGGCCCACATGTCAGGTTGA
CTGTTAGCTNNNNNNNTTATTACAGATAGGACCCACACGTCAGACCTTTCTTCCACCTCT
TTCCACCCTCATGTGCATTACATCGAACAGGTTATGTGCGTCTCGTCGCAGAGCACGGAG
A