Map Locations of contig_66530 (10300 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_66530

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74787 1 447 bp None Available Available None
MLOC_74785 2 1383 bp MLOC_74785.1 Available Available LOC_Os07g49410.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13107.m05316 protein uncharacterized ACR, YagE family COG1723 containing protein, expressed
MLOC_74786 1 311 bp None Available Available None
MLOC_74788 1 437 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_74787






CDS Structure of MLOC_74785






CDS Structure of MLOC_74786






CDS Structure of MLOC_74788






Contig Sequence (10300 bp)

>contig_66530 10300 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAATAGCAATCTCCACATAACGAGATATAATCACTTGGTTGCCCTTGAAGTTCAACAGTG
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GCGGGGCGGGAGAGTAGGAAAATCTCTATGTCGCCATAGGCGGCGAGAGGAGATAAAACC
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CCCTCCTTCCCCGTCTCGTCGCCTCCACTCCACCAGTCCACCGCCGCCGCCACCGCCACC
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ACCCGCCTCGTCCCCGTCAAGGCCTACTTCCCCTGCACCAGGTCGCCTACCCTATCTCAC
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ACAGCCACCCTATTCTGACCTATATAGCGTACATGTTGGCTAAACAGAAAACATGTCACG
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GATTTGATACAGTATAGCTCCTGAATCTTCATCTGATAACTGCTACTGTTTTCTTCCTCA
TACGAATGCTATGTTCTCCAATGCCGAGATGTTTCAAATTTATTACTCCAACATAAATAT
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CTTCCAGCTCGCAATGCCCTTCTATATTTGTCCAGTGGACGTTTACTTACAGCTTTGTCT
GCTCCACCAGGTCAGACATTGCTTGGAAGAACGCAAACTATGCTCAGATCTGGGAGTTCC
TCCGGGACGAATACGAGCTAACCCAAAGATTCGGAAACCTCGATTTCAAGTTGAAATTCG
TTGAGGTAAGGGTCACGACCGGGTACGAAAACATGCGCATGGTTTACATCATCTGAAGAC
CTCTGACAGGGAGTCTGTGATTTTTTGGCTGCAGCACAACATCCGGTTCCTCCAGGAGAT
CCTCCAGAACAGGAAGTCGGATTTCCTCGAGTGGCTGATCATCATCCTGATCAGCGTGGA
GATCTTGATATCTGTGTATAACATTGTCCAGGAGCAGATGTAGAGCGATAGCGAGATACC
CAACACGGTTGTTGGTGAGAGCGAGCGAGAGAGATCGAGATCATCGGACGAACCACACTC
TTTTGCCCGAGAGTTTCCCCCCCCCCCCCCACCAAAATCT