Map Locations of contig_66471 (10138 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_66471

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74748 1 3932 bp MLOC_74748.1 Available Available LOC_Os12g38110.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13112.m03924 protein importin subunit beta, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_74748






Contig Sequence (10138 bp)

>contig_66471 10138 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAGTTCCAAAAAAGATATAAAAGACATACAAAACATCCGAAGTTTGACANNNNNNNNNNN
NNNNACCATAAAAAATTATAGATATGTTGGGGACGTATCAAGGCTATGTTGAAATTTTCA
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AGCAGTTACCTCCTTGTAGAAAGATCAGTGTTTCTCCTCAATCCTGATCGTGTCTCATTA
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CAGTTACTCATGCCGTATGCTCCACATATTCTTCAGTTCCTTGATGCCCTTCATAATGGA
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GTTGTATTTGTTTATTACAGGAACTGTATTATTTTGTGGAACTCTGCCTCCTACCAGACA
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TAGGTACTCTAGTCGGCAGCTTATCAAAAGCGAACCATAACTTTCCCTTCCCCATGTCGC
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GTGGCAGCGGCCCCCTGCTGCTGAAGGTTTGATGGCGTTGGGGAGGTCGTCGGGTACTTC
TGGGGTGGTGGCTCGCCGGCACGGGATGTCGGGGTGGCGACCCCGGGAGATGGTGGCCGC
GATCTTGTTGTGGGCTGTGTTGGTGGGAGAGGGCCTTGGCCGGCACGATGGTGGTTGCAT
CGTCGTCGCGGCGGCTGCTGGATCTCGATCCAGTTTTCGCGGACGGGCTCGGGGTCCTTC
TGTGGCGACGCAGCGGCGTTGATTTGTCGGATTTGGCTGGTTTCGGTCGGGTCTGGCCCG
TTGGCATTCTGTTCAGCGGCGAGGTTTGATGGCGGCTCCTGCGTGATGGCTTGGTGGG