| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
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No map location |
Predicted Genes from contig_66297
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_74665 |
6 |
1660 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_74665
Contig Sequence (10588 bp)
>contig_66297 10588 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATCCACACATGTATCTATTTTTCATTCAATACAATTGTAGCATGGATAATAAATGATTC
TCTTGTAACAGGAAATATAATAATAANNNNNNNNNNNNNNNNCTAGGGCATATTTCCAAC
AGCTCGTCCAACTGGCCAGTTGGAGGGTATAATTCGTTTATCTCGCTCGTGTATATGTTA
GTCTTAGTAGTACTAGCTATATGCGTAGATGTTTTTACTATATGTGTAGTACATTCTAGT
TTGCTTCATAGTCAGTATGCCAGTAATCTAGTCAATGCCATGATAGTGATTATTTCATGG
ATTAATATAATCAAGAAATTGTCTATTTACTCAACAGATGGGGCAGACGCCTCCTCGGCT
GCACTTGGGGCCATGACCATAAAAGCAGATGGGAGAGAGGGAGAGGTTACCTAGAAGGGC
CACAACACACACCGATCCTATAGCCATCGCGACCAGCAGGATGCCGCACCTCCCTCGTTA
GGGCTCCCCAGCCTCTTCCACCCCTGCCGCACCCTCTCGCCTTTGGTGCATGCTCCAGCG
CGGCGGACTTGCTCCTTGGTCGCAACTCTCCACGCCTCGAGGCCCCTTCGTCTTTCACGA
GCCCTACTACTCCTCTGCCTCCCCTCCGTCGTGGTCTTTCCGCTCACGGTGAGGGCATGG
ATCGCGGCGGCAACAGGTGTGGAAAACGCATAGAAGAGGCAAAGGATGTATGCAAGCCAC
CTTAGGCGGGACCTAAACACGTGCGAGTTGACCCAAGTGCCTCTCCAACTTATAGGCGGG
CCCCAAACACGTTTCACGAGCCGTGTTGTATCGGGATGCGGTATTTCCTCGGAGCTTAGG
GTGTGTTTGGTTGGGGGACGAACTCTCACATGATGGAATGGTTCCATTCCAGAGGAACGA
GTCCATCCCATTTATGTGTTAGAAGTAAAATAGTAAAATGGGTTGGTTCCGTTTCAGTGT
TTGGTTGGAAGAACGGAATGAAAAATAAAATGACATAAAAATTATAATTTCGACAACATT
TCGTTTGCATCTTCAAGAAAGACAACAAAATAATATATATTAACAAGCTTATAACACATA
CAAGTGATGCATACTATCAAAATATGGCTACCAATGATGCTAACATATATATTGGAAAGA
TACAAGCCAGGAAGCCGCACCTCCGCTACAAGCCCTCTGCCAGCCTCCGCCCCGCCGCAA
GCGGACGCCTCGCTGCAAGACACCACCAGTCATCGCCACGTTGCAAGACGCTGCCCCTCC
GCAAGCCATCGCGGATCCAGATCGAGGCATTTTCCCTCGTTCTGCTGCAAATTGAGAGAG
CAAAGGGAGCATTCAGTATGCATCGACGGAAGGAACGAATCGCCCGACGAGGAACAGAGG
AATCGACCGGCGCGGCTCAGATCTGATGGAGGGGGAGAGAAGAGGATCGGCGCACCAGGG
AGAGCGAGTCCCTGGGGCCGCGAGTGTGTGAGGGGGTGAGCGAGGCGTTGGTTCCACATG
GTCCGACCGTTTTCGAGCTATCACCTCGTTCCGCATCTCGACGGAATATTCGATCTGTGG
GAACCAATGGGTTCCGGTGCATATGGCAACCAACGCGAGAATGAGGCATGTGAACGGGTC
GGACCCGTGCCATTCCGGTGCATTACTGCAACTAAACACACCATATAGCATCTACAAACG
GAACTTGCAAATTCGGCCCCTCAAACGCCCGCGGACACGACCTATCAGTGACCGGGCGTT
TTCGTTTTACACCCCTACTTTTTCGTTCGTGGAGCCGCATCTTTTATATTTTCCCTCATA
TTTTCTGTCATTTGCACGTGATTGGCGAAGAAAAAGAAAGAGAAAAAAGAATGAATAAAG
AAAACAAAGATGGTCCGGAGTGGGGTCGCGTCCTACGTGGCGGACCGACCGGACGTATCC
GTGCACATCCACGAGCCCTCATATTTAAGATGGATATGAGGGTTGCTGGTCAATTCGAAC
GTTTGAGATGAGTATAAAAGGTCTGGTTCAATCATTATTTTATGACGCCGATCATTGTTC
GGTTGGGCTGTCCGCGCGTTTGACATGAATTTGAGGAGTCTAGCTGTCTAGCCGTAGATG
CTCTTATTAACTTGATAGATAAAAAGCTAATAACACCACAAGTCCTACAACTTACTAGGA
ATGTGATGTTTTGATCCAAAATTTGTAAAATCTTACTCCACCATTCTATAACTTGGAGCC
TATGTGACAATTTGGTCCAAAGCCAGTCATAACATGACAAGTGGCACCACACTGGTTGAA
CCAGTCTTCACTGCAGTTTTGCAAATACCCCCTGACATTTTAGCGAATTAACCCGCAATA
CACCAAATCCCTAGCCCTCTCTCTGTTCCTCGTTCCCCTGAGCCCCTTCTACTCGATCTG
GCCACCGTGCCGCCGCCGCGTCGCAACGAGCAGCGGGTCCCTGTCCAGCAGCTCCTGCAC
GATGCCCGCGCCCCGCGCGGACGACGCTGTGTAGAGCAGCCAGCCGCCGTAGCCGGCCCG
GAGCAGCGTGTTGTCGGCGCCGTGCTTGCACTTGCACTTCAGCAGCAGGCCCCGGGCAAC
GGAGGCGCGGTGGCGCGGCGCGTGGACGAAGCGGGCATCGTCGTCACACAGCGCCTCGAG
GCTGCGGATCTGGCGGGGCGAGGTGAGCTTGATGAGGATATTAGGGTCAAGGTGCAGGTG
TCAGGTGCAGCAATGTTGTATGGTGGCCAGCAGGTGCCGCAGGGCCATCTACCGCATGTG
TGGAACTACAGTTGATGATCGGTCATTCAGCTGAAACATGGCAAGCAAGTAACTGAATGA
CAGAAACATGGTTATTTAAGAAAATCCCTAAGAGCCTGAAGGGGGAGGCTGGAATGGCTG
GGTTAATCCCTCTGTAGCAAATGCTGAAACGAATGATGTGAGTATTGTTTTCTATTGGAG
TTTGTCTGATATAAAGCTTGTGTACACTGCCCATTGGCCAAATGAATAACACAACTCATA
GTGTTGTCCTTTTTCTCTGCCTGTACACCGTTTTTGGATTGACAAGCTGTTTCCTGCAGC
TATCTATAGTTGGGGATTCTGTAGAGTGTCTCTTGTTTAAAGATTTCAGAGTGAAATGAC
TGTCTGGGTGGCATTTGTTGCAGGTTTGGCACCGAGGCCATGGATGTCCTTGTAGGCTGG
ACGAAAAACTTATGTTCCAGCAAGGATTTGCCCGGCTGCAGCGTACTTGACATAGGAACC
GGGAGCGGACGACTCTTACAGCAGCTTGCAAAACAAGGGTATGCCATGGAAACAGGACAC
TGACTAACTTGTTGGTTTCCATTTCTCAAACCTAATCTTGACATGAATATTACTGTTGTC
AACTTCAATACTCTGGCGACTTTTCATAATGTTTACTAGATTGATTATCTTTTTGGTTCT
GGATTTGTGTGCCCAACATAAATAAAGCATACAATTTTAGGAAGGTTACACAAAATGGCT
CTGCATGTCTTGCTGATTGGTGGCCCCAGGATCCACATGTTTGTGAGACATTTTATGGAT
TAGATGGTTGCGGTTAAATTTTATTTCTTCCCATGTTTTTACGAGAATACTGAGATTTGG
ATGCCTATGTGATTCTCACAATTAGTGGCAAGTTGGTGGTAGGTAGTCCCTATTTATTTA
TTTTGTCTATGTATGGCATGCTAAAAGATATGGAGTATCATATGATTCTCAATTATCATA
ATGGAGACGTCTTTTAAGAGCAACTCTTGGAAACAGCATATAATATACTTTGAAATTGTC
ATATGATACTCTTTTATGCTTTGGGAAACATTATGCTGGCAGTCTCCTGTTCCATTCAAA
AGGTGTCTCTATGATGTTAGCAGGTTTTCGTACATAAATGAAATTTCTTTATGCATTTAG
CCTGTTTCATTATTAACACCTCTTGGCAGTACTGATGTGTAATGTAAATATGCAGGTTTT
CTGATCTAACTGGCATTGACTATAGTGAAGCCGCAATTGAGCTTGTTCGAAACCTCGCAA
TTCGTGATGGATTTGAGCACATTAATTTCCTGGTGAGTTGTTCCTCCTTTTCAAAAAAGA
AAAACATTAATTTCCTGGTGAGTTGCTCGGTGGACCATTAGACGTACAATTTACATGATC
GTATTTCATTTCCACATTTACATGCCTTCTTGTGCTTCAGTATATGATGTTGAACATAGC
GTTCCCATACTTGAAAGATGAACAAAGAACCCTTTGAGAGTTATAAAGCATTTTATGTTT
GCAGGTCGATGATGTTCTAGAGTCGAAGTTGGAGAGGAGATCTGAACTTGTGATGGATGA
AGGAACTCTGGACAAACGAATTGATCCAAAAGACCCTGATGCTGAGGACACGCCTGCAGA
AGATGATGTTGAATCTTTACTGAAAAAGCTCGGCATGGATGTAGAGACTGAGTACAGTAG
CGAAGTTAAGGATGCAAAAACATGGAATAGATGGTCCACAATGGAGCTGTCGAGGGAGAA
TAAACAATGGATGCCTCTTCGTGAAAATTCTGGTACTTAACTTCCCCCTTTATTAGTAGA
TTGAGAAGTGACTTTGTAGATTTGGTTAGTTAACTCAATTCTAACACTGGGATGCTATTT
CCAGGAGCAGGAACAGTCAATGATCAGCTTTCTATGGTGGCAGAGTTTCTAGATGGTAAA
TTCTCGTACTTCTGTCCTGTTAAGCTTTGGTCATCCTCATGTGAACAGAACTAAATAGTA
TATTTTTATTGCCTTGTAACTTTCAAATTTTATTTCTCAGTGTGCAGCTCCTTATAACTA
CAGTGCCTGACAAAAAACTGGATAGTACTATGAGGCTAAAAGAATCATTCTTTTGGGTTG
TTTGGCGATACATTGTTGAGATGTAGTCTTGCTAACGTTGTTTCGTACTATCATTATTTG
GGAGCAAAGTTGTATCCTCTATTCAGGTGCGGCCTGTTGATCTAATGATCGGTTTTGGGT
TTTAGATTACAGGAAGTCTCTAATCGAGCCATATGAACATGAGTGTTTTTCTTGAGTTTC
TAATGCTTTTCTTTCAATTATGCAACACAACTGGCATGTGTCCCAAAAGTTACTGTAGCA
GCAGAAACATTTTTGTCTTCAAAAGATCGTCATTTTCTCAGATTATGTGCATGTGTTGGT
ATGTGTTTTGCGCATTTGACATGAATGACAGCAAACTCATAAATTATATAGAACAATAAG
TTTGAATGAAAGCAAATTATTTTGTTTTATTATTAGAGTTTTGTTCTTCGGTGTAGTGTG
GGTTAATTTCCTAAAACAATAGGAGGTATTTGCAAAACTGTAGTGAAGACCGGCTCAGCC
AGCATGACGCCACTTGTCACGTTATGACTGACTTTGGACCAAATTATCACATAGGCTGCA
AGTTGTAGGATGATGGGATGAGATTTTACAAGTTTTGGATCAAAACATCACATCCCAACA
AGTTGTAGGACTTACGTGTTATTAGCTCATACTCCTTCCGTCCCATAATTCTTGTCTTAG
ATTTGTCTACATATGAATGTATCTAGTCACGTTTTAGTATTTTGATACATTCATTTCTAG
ACAAATCCAAGACAAGAATTTTGAAAGGGAGGGAGTAGATAAATTATGAGTAGTTCGCAG
CAGCGTGCTGCATCATCCGTCCGGACCAACTACACGTCTCCGGTCGATCCTTGACCAGTG
AAGGAGGACGTACACGTACGTTGGCAGCACGGCGTCGTGCCGGGATCTCGTGGTAAGCGG
GTAGGTGAAAAGACGCCGGCGACGTTGTTTCGTGCTGGGTGCGGTGGTGGAATCGGCAAG
GCGTCGACCGGACCGACGTCGTGCCCATGTGATATTTGACTAGGCGACGCCGTCAGGGAA
GCGCAGTTTTGAGTGATTGCGAGGATAAGGAGGTGTGTGATTGCGAGTGCGAGGATAAGG
AGGTGTGTGATTGCGAGTTTGCGGCTGCTGCTCGTGTGCGGGTGCTGGGTGCTGGGTGCT
GGGACCTGGGGCTGGGATAAGGTTGGTGGGAATGGATCATCCGTCAAGTTGCTGCCCGGG
AACGTGTCTTTTCGGGAAAGTTCGGTGAAGATAATGGGGTACCTGCGAGAAGCAGTAGAT
GCATGTCGGCTCGTACTAGTGAAAGACGGTCCCAAAATAATTGTCTCAAACTTTGTAGTA
CTAATTTTAACACAAAATTGTATTAAGTTTAAGACACTTAATTTGAGATGAAGGAAGTAT
GTTTGTATCCATTTTGTCCCTTTTTATTAATTAATTAAGCAATTCTCTCCTGCTTAATTA
ATCGATGAGTTCGTTTAAAAAAATTAGTATATACATGCCGGTTCTTTGCTGGGAGCAGCC
GTATGAGTTCGTTTAAAAAAATTAGTATATACATGCCGGTTCTTTGCTGGGAGCAGCCGT
GGCTAACAGTTGCGCTTTGTTTTTTTAGTAGAAGTGTCGAGATTATATTAGAAACATCAC
CAAATTACAACAAAAAATGTAGCATCTCTCGAAAGACATTCAGAAAGATCCTAACAACGG
GAATTTGCTGAAAAATACCAGCAACACATTAACCAATAACTTTCGACCACCGCCATCGTT
GAAGAGTCCACGAGAGAGAGAGAAAAAATGATGTCAACTAAGATAAGATCCATGAGAAAG
TCATAGCAGCAAAACTGTCTTGTGAGCCTCCGAACAGGTGTCATCTCGAACTACGCCGCA
CTCGTCATTGTGGGTTGTGAGCGAGGCAAATCTTCACTCCTTCGCCATCACAAACCTCAA
GGCCTCGAATTGCAATGCCCAAGGAGGTTCCGGAATCGTCAACAACCTTTCGTATCGAAA
AAATCTTGGTGTTGTTAGAGACACGTGCACATCATTTTGCACGCATATGAATCAAAATCA
CGAAGAGTATGGAAATCTTATGAAGTTTATTTACTAAATAAAATGTGTCCATCAAAGTGC
TTAAACTAAAATACAAAAGATTTGAAAGTAGAAACCAAGTTACTCCCTTCGTCCAGTGAA
GAGTGTATATTTGGTTTAAAAATTTGTTCATAAAAAATGTATTTTTTCCAATACAATTTA
AAGTGTGGAAAATGCTTCTCTCTCATCAAACGGTAATCAAGACCAATGATATTTTATACA
TGATCTCTTTAATTTCTACATTCAATTAGCTCATTGGGTGTTGGATAATTAAAGAGAAGA
GAGATGATGGCTTGCATCTTTCCGATGCATTTTTTACTTCATTCCATAATTTGTCCTAGA
TTTTCTATATGCACATTTTTCACCGGACGAAGGGAGTAGTAGAGTGTTTGTAATAATACA
TTAAAATGCTTGGTAGGGTTTTACAAGTGGCTATTGGGCTTCCAAATAAAAAACCTGATC
GCCATGGATGCTTAGTAGGGATTTGTAATAATACATTTTTGGGCGCATATTATTTGGCAT
GAATATAGGAACTATGGATGTGTTGGCTAGTTCGGATGATCAGTATCATATAAAACTCCA
TATCTGCAACAAGGCACACAACTTCACATGGACCCTTGTTGCTGTGTATGGTGCAGCACA
CGATGATTTCAAGGTTGACTTTCTTCGTGAGGTGGTTAATCTGGCGAATGATAATCCCTA
TCCTATTGTGATAGGTGGTGATTTTAATTTGCTAAGATTCCCAAACGAGAAAAGTCATGG
TAGGTTTGATAATCATTGGCCTTTCCTATTCAACGCTGTTATTGACATGCTTGATTCGCG
AGAGGTTTTCATGATTGGGAGAAAATTCACTTGGGCGACCAGTTTACCCGAACCGACATA
TGAGAAATTAGGCCACATGTTAATGGATACCGATTGGGAATCTAAATTCCCCATGGTTAC
CGTGCGTGGATTTCCTCGTATCAAGGCTCTATTAGACCATGTCCCTATCCTTCTAATCAC
TGGTTTTTCATGACCACAAAGTAGACGCAAGTTCAAGTTCGAACATGGTTGGCTACTTCA
TGATGGATTTCATGATATGGTCATGGAAGTGTGGGTGAAACCCGTAGCTGGGCTTACTCC
AATTCATAAATGGAATAATAAAATATGTGCAACACGTAAATTCCTTGGTGAATGGGCTAG
GCATACTGTGGGTATCCTAAAAAGAGAAGCTTCGTCTCACGTCTCTTATTAACGAGTTAG
AAGCTCTTGCAAAGGTTCGACCGCTATCTAAACATGAAATTGAAATCAAGAGCCAATCTG
ATGCACAAATAGCTAGACTTCTGAGAGAAGAGGAACTCAAATGGTACCAACATTCAAACT
CTCAATTCATTCTTAAAGGGGATTCGAATAATAGATACTTCCATGGTGTTGCCAATGGCA
GACACCGAAACAAACTTATTCATTCCCCTACACAAGAGGAGGGTACGATTGAAGGCCGTG
AGCAACTTAAATCGTACATAACTAAGTATTACAAAAATTTGTTTGGGGCTCCACAAGTAA
GCAACTTCTCAATGGATGAGTCCCGAAGACGACATTCCCCAGGTTTTTGTTGAGGAAAAT
AACCTTCTAACAACTCCTTACTCCGAGGAGGAGATAAAGTAGGCGGTTTTCCTAATGAAA
CACAACAAGGCCCCTGGTCCAGATGGTTTTCCAGCCGAGTTCTATCATAACTTCTAGGAG
AGTATCAAACCAGATCTTCTAGATTTATTTGGTCACCTACATGATGGGCAACTAGAATTG
TTTCGTCTAAACTTTGGTGAGATAATTTTATTACCTAAGGTTAATGAGGCAGTAAAGATA
GAACAATATAGACCTATCCGCCTCCTTAATGTTCGTTTTAAAATCTTCACAAAGGTGGCG
ATGTTTAGGCTAAACTCGATGGCTGGCCGTGTGGTTCGCCCTTCCCACACTGCTTTCATG
CAAGGTAAAAACATCCTAGATGGAGTGGTAATCCTTCATGAAACGGTTCACGAACTACAT
CAGAAGAAGTTGAATGGGGTAGTCCTAAAAATTGATTTTGAGAAAGCTTATGATAAAGTC
AAATGGTCTTTTCTCCAACACACTCTCAGAATGAAAGGCTTCTATGCAGAGTGGCGCGCT
CTAATCCATAAATTCGTTTCCGGAGGTAGTGTGCCCGTTAAAGTCAATGATGACGTTGGC
CGCTACCTTCAAACGAAGAAGGGATTTAAACAGGGCGACTCATTATCGCCCATGCTATTT
AATATAGTGGCTGATATGTTAGCTGTCATGATTGAGCGAGCAAAGGTTGATGGTCAAATT
GACGGGATAGTTAATCATCTTATGGATGGTGGACTTTCTATCCTTCAATATGTCGACGAT
ACGATTCTCTTTATGGATCATGACCTAGAGAAAGCGAGAAATCTGAAATTAATTTTGTCA
GTATTTGAGCATCTTTCTGGTCTTAAGATAATTTTCCATAAAAGTAAATTATTTTGTTTT
GGCGAGGCCCAAGACGAGGCACAACTATACGCTGAATTGTATGGCTGCGGGTTTGGCCAG
TTTCCAATCAGCTATTTGGGGGTGCCGATACATTATCGAATACTCACAAACGTTGAATGG
AAACACGTCGTGGAGAGATTACAAAAAAGGCTAAGCAGTTGGAAAGGAAAACTGCTATCT
CTGGGTGGAAGATTGGTCCTCACAAATTTAGTGCTAAGTAATATGATATTGTATATGATT
TCGTTCTTCTAATTACCTAAAGGAGTCTTGCATAAATTGGATTATTTCCGATCAAGATTC
TTTTGGCAAGAAGATAGTGAGAAAAAGAAGTATCGACTGGCTAAATGGAGTGTGGTTTGT
CGTCCCAAAGACTAAGGGGGATTAGGTATTCATGACCTTGACGTCAAAAATATTGCCGTC
CTTGGCAAATGGTTGTTTAGGTTATTGAGAGAAAACAATGTATGGCAAACCCTTCTAAGG
AGAAAATAAGTGGGCTCAAAAGCAGTGTCCCAAGTATATTGAAAGCGTGAGGACTCACAC
TTTTGGGATGGCCTAATGGCTACGAAGAAATACTTCTTCCGCTATGGATCCTTCGTTATT
AAAGATGGATCGGAAATTAGATTCTCGGAGGATAAGTGGCTAGGTAATGCTACACTTCAA
GAACAATATTCGGCTCTATACAACATTGTACGTCATAAAGGTGATACTATTGCCATGGTT
TTGGATTCATTTCCACCGAATGTGACATTCATAATATATCTAATGGACCTCTCTATTATT
GAGATTATCCTCGGCACAACTATCACAAGGAATCGATGAATTTCGTTGGAGTTTACAAGT
GAATGGTAAATTCACGATAGACTCTATGTATAGTGCTCTCATCGAGTCAGAAGTGACAAT
TGATAACAACAAGAAGATTTGGAAGATGAAGATACTACTTAAGAATAAAATATTTGCGTG
ATATCTTCGTCGAGGAATCATTCTTACCAAAGATAATCTTACTAAAAGGAATTGGCATGG
AAGTACGCAACGTGTGTTTTGTCATCACGACGAGACGATAAAACACTTGTTTTTTCAATG
CAAATTGGCTCGTTTTATATGATCAGTCATCCAAATAGCTTTTGGCTTGTATGCTTCATG
TAGTGTTGCTAATATATTCCGCAAATCG
