Map Locations of contig_66248 (11681 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_66248

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74642 2 1719 bp MLOC_74642.1 Available Available LOC_Os02g48560.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13102.m05493 protein fatty acid desaturase, putative, expressed
MLOC_74643 1 662 bp MLOC_74643.1 Available Available None
MLOC_74644 1 136 bp None Not available Available None





CDS Structure of MLOC_74642






CDS Structure of MLOC_74643






CDS Structure of MLOC_74644






Contig Sequence (11681 bp)

>contig_66248 11681 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAAGTTGCTCCACCCCAACTTAAAACTTATAAGTCACCCACTTTTACATGAAAAGATGAC
TTATAAGTCAGATGACAACCAAACAGACGTGACTTATAAGTCACCTGACTTATTGAAACC
AAACAGGGCCTTATATGTATAAACCGAAATAATGTGCTACCCATGATGGTAGCTAGGCAC
GATCCCAGTTTTTATCTCTAATTATTTTGTTGAATTATTTTAGACTATGAAAAATAAGTC
TATAACAAAAATATCATAACGATTTCCTATGCATGATGATAGCCACGCACACTCATTTCA
GAAAATGCCCCAGTCTGAATTTTCCAGTCAATTTAGCATCTATCTTATGCAACATCATGG
ATTATGCATCTCTTTTGTATTAGACTGTACGGCTTTTTTTCATTGTTGGCATGTATGACC
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TTTAAGTTCTTTCTTACTTAGCTTGTCAATCACGTAACTATCCAAGTACAACCTAATGAA
TGCCATCTGCTTGTCATGATTTTTTTTGGCAAGGCAGATTTAGCGCAACCTCATTTGACT
GATATTAATAACATACAACTGCCAGTTTCTATTGGATCTACGACTTGACTGAAGCTGGAT
TGAATTTCAGTTGAGTGTCAAACACACACTCCTTAGAGCATGTACAACCGGACTCCTTCC
TAAATCTTCCTCAAAGTTCACGAACACGATTGATTAGTGAGTGGACAAAAATAAGAAGAA
AAAAAAACTGACATAATCGGCTCCCTCACATCATCCCTATGCGTCCAAACTATCCGCGAA
CCCTCATATTCATCACAAATATAGGAAGGATACAAGGACTCGCGGACGCGTCCGATAAGT
CCGTCACGTAGGACGCAACCCACCCGCACCGGCTTTTTTCTTTCTTCACTCATTTTTTTC
TTTCGCTTTCTTCATGTTCATGAATCACATACAAGTGACCGGACATATGAGGAAGAACAT
AAGAGTTATGGCTGCATGGATGAATAAATAAAGAGTCAAAACAAACGCGCTCGTTCACTG
ATCGGACGTGTCCGTAGAGTTGAATTAGAGGTACTCCCTCTACAAACTAATATAAGAGTA
TTTAGACTATTAAAATAATGATCTAAATGTTCTTATATTAGTTTACGGAGAAATACATGC
TCTTATTGTGTTGGCAAGGAAGACTTAGCGCAGCTTCATTTAACGAACATACATACACAC
AGGATAAACAAGTGACGTCTCTAAAAAAATGATGAATTGGAGGGGCGCCGCATATTAGTC
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TAAATATTCTTTTGATTTTGCGTTTAAAAAATATTTATTTTCCAAACCGCTATCTTAATT
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GATGACAACCATGATGACATAAATGTGTCAACTAGGAACGACGAAAAAATATCAACGAAA
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CATGGGTGTCGGAGGCAGGATGACGGAGCAAGAGCGGGAGAAGCAGGAACTGCTCGGCCG
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GGCAATCCCGCCTCACTGCTTCCAGCGCTCCCTGATCAAGTCCTCCTCCTACTTGGTCCA
TGACCTCGTCATCATCGCGGCGCTCCTGTACGCCGCGCTGGTCTGGATCCCAGCCCTCCC
AAGCATGCTTCAGCTGGGCGCCTGGCCGCTCTACTGGGTCGCGCAGGGCTGCGTCATGTT
CGGCGTCTGGGTGATCGCGCATGAGTGCGGCCACCACGCCTTCTCCGACTACTCGTTGCT
CAACGACATCGTCGGCCTGGTGCTCCACTCATGGCTGCTCGTCCCCTACTTCTCCTGGAA
GCACAGCCACCGCCGCCACCACTCCAACACCGGCTCGCTGGAGCGCGACGAGGTGTTTGT
CCCAAGGCCGAAGGAGGCCCTCCCGTGGTACACCCCCTATATCCAGAATAGCTCCGTCGT
TCGTGTGGTGCTCATCATCGTGCAGCTCACCCTTGGGTGGTATATGTACCTGTCGCTCAA
TACCTGGGGCCGCCCGTACTCGCGCTTCGCCTGCCACTTCGACCCCTACAGCCCGATCTT
CAATGACCGGGAGCGCGCCCAGATTTTCCTCTCGGACGTCGGCGTGCTGGCCGTGTCGTT
CGCCATGTTGAAGCTCGTTTCGACGTTCGGGTTCTGGTGGGTGATGCGGGTCTACGGCGT
GCCGTTGATGATCGTGAACGCGTGGCTGGTCCTGGTCACCTACCTGCACCACACCCACCA
GGCCCTGCCGCACTACGACTCGACGGAGTGGGACTGGCTGCGCGGGGCGCTCGCCACCAT
GGACCGCGACTACGGCATCATCCTCAACCGCGTGTTCCACAACATCACGGACACTCACAT
CTTGCACCACCTCTACTCCAACATACCGCACTACCACGCCATGGAGGCCACCAAGGCGAT
CAAGCCCATCCTTGGCGAATACTATCAGATCGACCGCACCCCTCTAGCCAAGGCCACATG
GCGCGAGGCCAAGGAGTGCTTGTACATCGAGCGCGAGGACAACAAGGGAATCTTCTGGTA
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GCTATTACCGTGCCGATGCTAAGTTGGGCTTTGGTCAGCTCCGTCTTTGTTTCTCTGTGC
TTTCGTCACCGGGCTTAGGTTTGGCCGGCGGTCGTCTTTGGTGTCCGTGGCCATTGACCT
TGGCGTGTGTTGTGTGTGCGTTTGTCTTTGCATTGGCGTCATCTCCCAGCCCATGTCCTG
TTGTTGACGTTGTAAACCATTTCGTGTTTATGTCGGCTTCCTCTTTTGCCGCAACGCGCC
ATGTGGCACAATAATAGTTAGCCAGTATACGTCTTATTACCAAAATAAAGTTTTATGTTG
TTGCATTTTATGTTCTTCAATGTGAGAGTAAGTATGATGTCATGAAATGTTGTTTGTAAA
ATTGTGCCTGATTCTCTAAATAAAGGAATTTAGTTTTAAAAAGTATGCGATATGTATTAT
CATGGTCATTATTACATGATCTTTGTTAATGTATTCATCTATTTGGCAGTTAAAATCCAA
CCATTTTTTTTATTTCGCGAACCCTCATGTGATTTTGATATCATTTTTTTAGGATACTTC
CATTTTTTGGATGATTAATATTAATGGCATTCTTGTTGTAAATGCAGAGTTAATGTTTGC
TCGGTGATAATGTCATTTGTATTTTCAATGTCAATTCAAATGCCATTTTCATTTTGAATA
TCATTAAAAATTTAATGGGAATTATGCTCAATGTCACTTTCACTGTCAATTAAGTGCCAA
AATGTTAATCCCTAGAGGTTTATAACATGTCATGAATCATTGTGTGTGATGACATATTGG
ATTACATTATGTTGTTGCTTTTTGTATATGTTGGCTATTAAATTAGCCAATGTTCTTGCT
GGTCATTGTGTGATTTTGTAAGTCTCTCTGATCAAAATTGAACTCACGAGCAGTTTTGAT
TAATGATTTTATGAGCAAGAGTTCCAATGGCATATGATTCTATTCTGACATCCGTTGAGT
ATATTGCATGTGTGTTTAATGAATAAATAAGCTCATTTTTTGTTTTTATCAACGACGATA
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TTGATGTATTCCTTTTATTATATTTCTAGCAATGAACGTTAATAGTGATACTAACTATTG
GTTTGGCACCACACGTATGACCTGGGGGGCAGGCGATCCGGCACCACGGCTTTGCCGAAG
GAAGGTCGTGTGGAGGGCCCCGTCCATTCCAAGGCAGAGGCAGCTGCTAGGTTGAAGCTG
GAGGAGGTGATGTTCAGTCGTGGAGAGGAGGGGATAAGATCGAAGATGGCCTGAGTGGGT
GCGTAGTTTTGATGTTTTGTCGTCTGTTTTGGGGTTTGGTTTGGTGGTTTTTTGCAATTT
GGAATTAATAGTAGAGTAACTTTTTAATTGTAGAATAAGGTATTAATGTGCACATTTTAC
TAAAATAGGAAATGGGATCTTTTGACTTTTTCTTCATATAACTCACTTTGGAGTACCTTA
GATATATATGTATCCTTTATAATACTCCTAAGAATTTATACATATGCATAAAGGGATGAG
TTTCGTCCATCTTCTATATCAAAATAGCTAATAACCCCACTAATCTATTTATTTTGACAT
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CATAAAAAAAGTGCCTCAGCATGCAAACATGCATGATTTTTTAAATTATATTATGATATT
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GCAATGAAGTGGCAACTTGCAAATTAGTAAATATACTCTAACTAATTGCTACGGGTGCAT
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ATACTAATGCGTTTTAGTGTGATGAACATTAAAAAAAAATTACTTGCAACAAGGAGTATA
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TCATGCAACTTGGCCCACAAAAAGCAAATTGTGGTATATTTATAGCATTCCGTTGTTTCT
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TTTCGTTTGTGTAACGGTATATACCAATTTTTCTTGAGTTAGTAGTACCATATTTTTTGC
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ATTTATTGTGATAGCATATACTACTACTCCCTTCGTTTCTAAATATACATCCTTCTAGAA
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ATTTTACTTTATATGTAGACTCGTGAAATCTTTTATAAGACTTATATTTAGAAACATAGG
GAGTACAAAAAACGATTACTACCATGTTGGTTAGTCAGAGGGAGTGAATAAAAAATTAAT
ACCACGTGCGTCTGCACTCTGCACTGATGTTTTACTTGTACCTTTACGTGAGCAGAAGAC
TATGCATGGCTTAGAACGAGGATCACGTCTCGTCCTTAAATCGCTGGTCAGGGTGAAAAG
AACACTGACGTCGTCGTCGTCGTCGACGGCTGCTAGCAGCTGACAGGGAGCGGGCTTATT
TGAAAGTCCCTTCTCCACGGGAAGCGGAGTTGAGACGTTGTTGACCACGTGACGGCGCGA
TTCCTTTATGGAGTAGTTTATAACAGAAACACTAGCGTCGTTGTCGCTGGCGGCTAAGCG
GCTGACCGGTGACCGAGCTACATGAAAGATCCCACGCCACCGGAGGGATGTTCAACTGTG
TAGACGTTGTTGTCGTCGGTCGATCCCGGCGGCGCATTGGGGAGCAGGGGACTGAGGTCT
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ACAACTGCGCTACATGACAGGGTCCTCTCCACGGATGTTCAGATGTTGTGGGCGTGGTGG
TTGCGCATAGGGGAGGAAGGGACTGAAGAGAAATGCGCGTGTGAACACAGCGACAGCTCC
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CTGGAGGCGCTTTGTTGCATCATTGATGCTGTTAGACTTTTAAAATAAATTACTCACTCT
GTTTTAAAATATGAAATATATTATTTAAAAATCAAAGCATCTAAATTTGATTAAATTTTT
GTAAAGAAAATACCAAATCGGTATGATTAGACTCATCATGAAATGAGTTACCACTTTTTT
GTTTAGTACTGTCGATGTTAATTTTTTTGCTTAGAATTTTTTTATGAGAAAAACTTTCAA
TCTGTTCATCTTCAATCATGATAGTACCACGGAAACTAAAAATAACTAGTGGAATGCCCG
TGCGTTGCCACGGGCCTTTTCAATTTTATGTAGTTGCATCTATGAACATAATGTATGTCA
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TCCCCGAAATTAGCACTCCATACCTATCTATCTTGGTCAATCAAGACCTTCTATGATCTA
GACCAGTTTGGTGGGCTGACAAGTAAATAATCATTAGGGATCATAACTTCTCTCGCTAAC
TAAATTATCACACACCTTCACCCACTTGAAGAGCACATACCTATAGAGCATGAATATACA
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TGCACGGGCGTGCAATAGGGAGAGTGGGGAAGAAGATGTAGGTGACACGTGAGCATCCCG
TTAGTGATTGACCTGTTTCCCGGTGTGACAAACTGGTCTAAAGACAGGATTGACCAGGAT
TGACAAGTACGGTGCCAATTGCAGGGATTGAGAACTTCGATTCGGACCGACTCTATGAAG
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TGGCGTGTGTCGGGCCTGAGTTGTTTTTCTAACGAGTAATTAAATGCATGTGCCTAGGTA
TTAATTCATGGTTCAATGTTCATATAACTTTATCTGCAAGTAAGTATGTAACTTTAATTT
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TGATTAACAATTGACTGACAAATATAGATTGTACACATGCAAACTTCAGTAATAGAACAT
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CTTTCGCTTAGCTGCAAGGTATGCATTTCGTTGAGCCCGCAATGCCTTCATCTCATCTGG
TGGTATGCTCTGCGTGCATGCTCTTCGACGGGCGTTCATCTCTTGCCTCTGCTCAACTGA
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ATACCATTTGATGTTCCCACATGCTCCCCTGGCTCCAATGCTATCATGGTATTGGTTGTC
GGATGCATTTTAGCTCATTGGGTGGACGGTTCACCTATGAACATTCCATAAGACTGTTCC
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CTACAAAAATTGTGAGAGAATACACATCTCCTTTTCCCTTATCCTCCGAGATCTTATAAG
CAAATGTTGCATGGATAATGATTAAGGACGTTTGAACCTTCAACACCGTGGTTCATAAAC
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CATCACTTGTGTAATTAGAACCTATCTCACCTATGAAACCGCAAAACTATGACACTCACT
TTTAGTAGTAGTTCGACATGCATCGTCTTTTGTTAACTAAATAAGTTAATAATGCACATA
TCATGACTATGAAGATCCATAAGAAATACGACACCATGTCGGAGAAACAGATGGCTTTGT
CAAAAGGTGAACTCACCTCCGGGTAATGAAGGTGAGGCTCACAGGTTGATGATAAACTCA
TGTGACCTCCGTGGTGAATTGGTCTGATCTCTAGTGTGATCTCCCAGCGAGCATGGTCCG
TGCTTGACGATGAGTACTCGAGGTAGTGGTGTTTGTGAATGACCAACCATGTAACAGAAA
CGTATTATTTAAATACGTACTCCTACCAAATATGGTGGAGATGTTTAATGGCGTTATCAA
TCTTGTCGGGCTTTCCTTATCTTGTGCATGAAGTTTAGTATGTAATAGTTAGGCAAATTG
TTGTTAGTATTCTATGGTTTGTTTCCCATGTATAGTACTTTTGCATACCAGGATGGGAGG
AAGGCTAATTATTTTTAGTACGTACTCAGGCTGCAAGGGTGGGAGGAAGTTTACGATGGT
GCTTATTTTTCGGGTTTGTTTCCATATTAATATTAGTATTCTTTGGATCTGTTTCTTTGT
ATGACTTTGACGCTGTGAGGGTGGTAGGAAGGTTACAATGGTGTAGATTTGCTGGGTTTT
ATTTCCATATTAATATTAGGATTCTTCGGGTTTATTTCCATGTATGACTTTGATGCTGTG
AAGATGGGACGGAGGGGTGGCAACGAAATACCGACATACCAATGCGTTATCACAACCACA
AACTCCCCTTTAGGAGCAGATTCATTGGTTAGAGATGTTAAATGCGATGCTAAATGCGAG
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TTCCTGAAACTAATGGTTGTAGAAAAAGACAGCAAAGATTGAAGGTGCTTGGCGTGTCCC
TTGACTGTGCTAGATGACAAGGAGATGTGAATGTGTAGCACTCGTGGCGCGAGTGTGGGG
TGCATGTGGGGAAGGAGTAACCATTGGTGTCGCCGCTGCTCTTCGCCCGAGGGCCACCCC
TGCAGCCACGGTCGCTAGAAGGGGTAGTAGTGGAGGGCGCTGCCTCCCCGGGAGCATCCG
ATATGGGGAGCAACCGCCGGTGGCTGCGAGGACATGTGCACCGCCTCAACTTCAAAACTG
AATTGGTATCTGACGTCTACATTAATATGAACTATATGATGTATTATGCAGGAAGAAATC
TGGATAGACTCAAACCAGCTCATGCATGCTAATTGCTTAACAGTAATCAACGAAAGCTCG
TAAATATTTAAAAAATAACCACTAAGTAGGGATCAAGGTCCAAACTAATAAAGAAACCGA
CATAACAGCCACATATATAGAAAACTTGCAAGCATGCCCCACCAGTTCACTTATTCAAAC
AAAAATAAATACACAACTCACGTGGAGTCTCTCCACCTAAACTAAACAATGGTTTCATAA
CTGAATACCTTCTACTGAATTCATCAAACACGGGGTATCCAAATTATTTGCATGGTTTTA
CAATAGAGATAAGATTCTTAATATCTGAGTGATACAATAGAGATAAGATTCTTAATATCT
GAGTGATACAATCCGAGCAAAAAACATGGGTCTGCAAGTTTGAACTAACAATAAGAACAC
CGCAAAGATAATACTAATTCTTCCAACACATCAGGCAATCTGCTACTACGTGCATGCATG
TGGAAAGAGGAGGGGCTTACAGAGTGGAGGAACGCCCGAAGTGAGGTCTCGTGGTTGCCC
CGAGCTCGCACATACACAATCCATCTCTGGGTCGCCTCCGAGCTCCAGCCATCGCCGCTA
CAGTTGCAGTTCACACCCGGTCGCGTCCGAGGCTTCGATCTCGTGTCTACAGTCGTAGGA
AGCAACATGTCGTCGCCATCTCGTCGAGCTGTAACCCTGCCGCCACCACCACGGCTGAAA
AAACAGTGAGTATGGGGTGGGTGCGTTGGGAGAGAAGGGGTCCAGTTCATACAAGAAGGA
GTGCTTGAGAAAGTTTGAGAAGGACGGAGGGGACGCGAGAGTGAACATAGGCGAGCTGCA
CGACAACCTGGTCTTGGCCCTCCGAAATCCACAGCATACCAATGTCCACGCCCTCAGGCC
TCCTCCCCCTATGGTCATGTGCTTCAGAGAGAGGATGCGGGGGGGGGGGGGGGCGGCTTT
CGGGGGGGGGGGGGGGGGGGCGCTTCTTTTTTTTTTTGTTG