Map Locations of contig_6553 (8918 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_6553

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74291 4 1377 bp MLOC_74291.2 Available Available LOC_Os03g46390.1, FRAME:+2, EVALUE:2e-109, 13103.m04991 protein ras-related protein, putative, expressed
MLOC_74292 4 1808 bp AK356716 Available Available None





CDS Structure of MLOC_74291






CDS Structure of MLOC_74292






Contig Sequence (8918 bp)

>contig_6553 8918 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCTGGATTTAGCCGGCCCGGCCCTGACTCCGTGTCGATGTGAGCCAGCCCATCGCGTTCG
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GTATGAAATTTAGGAGAGGGATTTCGGCAAGCATTTGTCGTGCGGCTTCGTGCCGCTCTT
GATCTTGTGGCTGCCTTCCTGGCTGATCTGATATACTCTAGCACCACCGCGCCTGCCTGA
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GATATCGCAATTCGCAAGTGAGAGTTACCTGCAAAGTGGTTGATTTTGTCTTGCTTTGCT
CCCCAAGTTTGATGTTCAGGGAGTATGTCCCCCAGCAATTGTTAGTTTGCTCCCTTCGTT
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TTAGAAAAACCTAGTACTTCAATTATTTTGAAACAAAGGAAGCATTTAACAAAGAATTTA
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GGTAGTGTGCAGGGGTATGCAACAACCATGGACACAAATCTGCCCATCTTTGCATATCCC
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GAGCACCGACGGCACGGTTAGTGTCAGGTAATAGCCAAATGCATGCATCTTCATTATCTG
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TTAGTGCATTTATAATGCAGATCTATAGTACCTGGCTGTAGTGCAGATAGATGTGGTAAA
ACACATACAGGAACAAAAATATCCTTGCCACCTGAAAGAAGTAGACCAATGCTATGATCA
GAAAAGCTCCGACCACCAAATACTACTGGAAGAACCCTACTAGTATAACAACTAGGCGGT
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CATGTTTTTTCTTTGTTTACAGAACATTCAAGACAGTTCAAAGAAATACTCACCAGCCAT
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GTTTCTGAAATAAGAATCATGTATGTGTAAAACTGCCCCTCCCCTGACAACATTGTGTAA
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GGGACTGACCTGTTGTTCCATTCAACACGTTGTATTTTTGTCAAAGAAGAATAGCCCTTG
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GTTATTATAACAGGCCAAATACCTAGTCCTGTTTGTGGTAACTAGCCTGCCATAAATAAA
TACTGGACGATCTACTAGTGTTACTCCCTGGGGGTGTGGTGTAGAAAGCACATGGTGTAG
CCAAAGCTCTTCAGCATAACCAACCGCTGCTCTCATGAATGGATCAACAAGGCAGAAACA
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GATGAAATTACCATCTTGCAGAGGAAAACGCCGATGAGCACGGAGGTGTAGGGGACGAGC
GGGTCGGCTAGCAGGTAGTCCCTCATCATGGCCTGCGCTTGGTAGCTGTAGGCCGTCATC
GCCATCGTCCTCGCGGATCAAAACGCCTGCATCATCACAAAACATATGCTGAGAAGATGA
ACCAGCATTCGTTCGTTCGTTCGTTCAGAGAGCATCCCACGGAGCAGGAGCGGATCTTGC
GCGGCGACTCAAACATGTATCTACCACATGACCAGCTATGATCGCCGCACGGAGCTATCC
GTCCCCATTAGCGTTTCCCCTGGCCGCCGCACAAGGCAGAGGCATCGATCCGATTGATCA
GAGTCGTAACAAATCGACGATGATCGAAGAATATGGTCCTAGGAACCAGCAGCGCACGGT
GCCTGCGAGCGAGCAGAGCACGTTGAGGAGGTCGAACACGGAAGCAAATCAGCGGGGGCG
GCGCCGCAGAAGCGGATCTCCATTCGCGGGAGCACCTGCGCCGCACAGCGAGAGAGACGC
GGAGAATGCGGCCACACGCCGCCGCCAGACGGCCAAAAGGGCCGGACGCGCACCGTGGCA
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CCGAAAGCAGCGAGCCGCAGAAGATGGGAGACCGCGGAGCGACGAGATCCGGGCTAGGGG
AGCCAGTCAACCGGCCGGCCGGCCCCGGACCCAAGAAGAGGGAAGCAAGAACCAAGAAAC
GATCCGCACCTCTTGCAGTGGAGGAGGAGGAGCCGCGCGGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGG
GGGTCGCCGACGGTAGCCGGCGGGGAAGGGGGGCGGGGGGGGGAGGGGGGACGGTCTCGG
GGGTGCGCGGGGTCGGGTAGTCGGCACCGCACGCGCGT