Map Locations of contig_65448 (9435 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_65448

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74253 5 5936 bp MLOC_74253.1 Available Available LOC_Os07g05820.2, FRAME:+2, EVALUE:2e-121, 13107.m00544 protein hydroxyacid oxidase 1, putative, expressed
MLOC_74254 1 560 bp MLOC_74254.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_74253






CDS Structure of MLOC_74254






Contig Sequence (9435 bp)

>contig_65448 9435 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CTTGTGTACGAACTTGGAGCTTGCGACGATGAATTCTTGCGGGGTTGCTCGAGCTATCTT
GACGTGGATTAAGGAAGGTGGAACTGGCGTCAGTTTTGTTGATTTGCTAGGAATTGGCGT
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TAGCGGCGGGGGGCTCTATGGGAATAGCATGTACTCCAGCTATGGAGGAGGTGGCGGCCT
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TTTTACTCTGAAGCCCAGGCTGTTGTGAGTTTCTATGTTGTACCTGTTTTGATATGTCTA
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GTCCTTGCTCCATGTCAGTACGTTGTAAGTTTGACTGCTCCTCCTTAATGGGTGTGACAT
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TGTGCATGGTCGTTCATCAGCTTGCAACGTCTAACTAGCTAGCAACGTGAGCGTTTGCAA
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TTACGGTGAGCTTGCGAGATTTGTCTTGCGCCTGATAGGAGTGCGAACAAAGTCAAAGAA
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TGTTGTTTGTATGTATGTGGAGGGTAAATAATAGTACCTGTTATCTTGAAAAGAACGGAG
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TTTTGTCTGCATGCACCCAAACCTCCTGCGCCTCATCTCTTATATTGCATCAATCCCCTT
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TTAGGTGGAGAGGGAGTAATTTTCTTTTCTTTAGGTTTAATAACTAACTAGGCCTCTTGT
TGTTTGTATGGAGTGGTGCAGGTGGTGATTTGCGCAGAAAAATGGAGATCACCAATGTCA
CAGAGTACCAGGCCATCGCCAAGCAGAAGCTTCCCAAGATGATCTACGACTACTACGCCT
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GTAGCATTACTACCGATTTACCCATCCATTGTCTGCATGTGTTTTGGGTAGGTTCCGCCC
GCGCATTCTGATCGATGTATCCAAAATCGACATGACAACAACTATCCTGGGATTCAAGCT
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TGCAGCCCCTTGCATCAGAATATCTATACTGACCGGTATATTGAACAATCCTATGTGAGG
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TGTCTGAATTCTCATGAGATCTCTGTGTTCCAAGCAGGCTAACGATTCAGGACTAGCTTC
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TGAAATAATTATTTCAAACTGTCAAAGAACTGATTTCGATCCTTCAAAAAGAAGATTTCA
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TCCCCTTCTGGCTGGCTTCCTTTTCTATTTCGCGGGCCGAAGCGGTATGTTTTGCGAGAG
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GAACGATTTCACAAAGTTCAGAACAAATTGTTTCATATCCATTTCACGAAGCAGGGAATG
CCAACCATCTAGAAAAAAAACAAGGCAAGTTTAAATCATGCACAACAAAACCAATTTCAT
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GCTGGTACGGTGTGCTGACGATTCCATTAGGAGGTTTCAATAAGCTTAAGGCTCTGTTTG
ATAACAAAGTAGTAAAAAAACTAAAGTATTAAAAACTGCAGTAATTTTATGTGTAGATAG
AAAATACCATGGTTT