Map Locations of contig_65423 (8796 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_65423

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74233 4 1927 bp None Available Available None
MLOC_74235 2 967 bp None Available Available None
MLOC_74236 1 1598 bp None Available Available None
MLOC_74234 1 778 bp MLOC_74234.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_74233






CDS Structure of MLOC_74235






CDS Structure of MLOC_74236






CDS Structure of MLOC_74234






Contig Sequence (8796 bp)

>contig_65423 8796 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CAAGCGTACTCCAAGTACGAAAAACGGCCGCGAGTCCAAGTTCTTAAGACCACTGCCAAT
CGTAAACGATTGACAATAGTCTCGGGGACTACACCTAGTGGGTGCACTCAGCGTGCCCCC
ACTGGATACAACACTACTCGACCAAGTCCGACCTGTCTGAGTAACAAGAGAGAGAGAGAG
AGAGAAAAATGCAAAATTTTCTCTATCAGACCACCACCGATGCAAGAACTTGACGGCGGT
CTCGGGGACTACACTCAATGGGTGCACTCAGCCTTCCCCCACTGGACCTACTATCACTCG
ACCAGGTCCGACCTGTCGAGTGCCAGGCGACTATCAAAAACAAATCTAAGACCCCTGTCG
ACGTCATCGCCATTCGACAATGATCTCGGGGTCTACACCAAGTGGGTGCACTCAGCGTGA
CCCCACTAGACTCAAAACCACTCGACTGAGACATGATATTACTCGAGGGGAAAACAAAGT
ATACACCAAAATAAAACACCCAATGGGTGTAGAGTCAAGATGGACAGGGATTCAATCAGA
AATGAACTTACAATCGCACTTACTCAGACATTGGCACAAAGCGTTGAGCTGGCATCATAA
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ATGGCTTCTTTACCAACTCAAGTCTTGTCCTCTGGGACGCGATGCAGACAGAACGCGTGC
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GCTGAGACCACAAGACTTGAGGGTGATGGCGGGGCAATCGATAGCGGAACCTCAAGTCCA
GCTTTAGCGCTGGAAGAGTCGTCAAGCTCATGAGAAGTCGCCAAGCTCCTCATCCTCATC
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TTTCCACAAAACAGAGCAGGGTGAAGATTTGTTTACCTTGTTGAGAAGTTGCCACGTCAG
AAATTTCCACTTCCACGTGCTCCTCTTCGTCTCGCGGCCGTGACGTCAAGGAGGTAGCAG
CTCTCGCAAGAAAATTTCACTCCTTCAGTAAAAACAGCAGAAGAAGGAAAATGAACACTC
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GGGTAGGTTTAGGCTACTTCGCAGACTTTTCACTCGACTCACAGGTTGCGGGATTTCGTT
GAGCAGGTGGTGTGCGTGCACTGGGCGTGGCGAGAGCACACGTTTTGCACGCGCTCGCCC
AAGCTACCACGTCCCTGCCTTTGCCCCTGGACAGCCACAGAGCCGCGTCAAGCCCCTTGA
CAAATTTTCCATGCCTTGCTGCACTCTGCTTCACCCCTGCTGCGCCCAAAGCACTATTGC
CAATGGCAAAGCCGAAGTGACCGGCACCCACATCGGCCCTACCATTGCCAGAGCCGCCAG
AGCCCCTCTAGAGAGCCACCTACCCCTTGGACCACCCCTGCATCGCCCTCGTGCTGCCAA
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ATCCACAGAACCGGCGAACCGACTCGGCCACGGCTATTTAAGCCCCAGAAACACACCCCA
AGTAGATCATGGCCTCCCGCCTGCAGCTCTTAGCGCACCCCCAGAAGCCCCAAATCGGCC
GAGCCTCCGGAATTTCTCCCCTCCGGCGAGAGTGCCGGCCACCCAAGCCGGTCAGCTTCC
CCGCTCTCAGTGACCCCCTCCCCTTGCTCTCCTCTGCAAAAGCCTCTAGGAAGCCCCTTT
AGCCCATTCCCCGCCCAATTTAGCCTACGAAACCCTCTGGCTGGATCCCATTCTGCACCA
AAGCCCTCCGTCCAGCATGGTTGGAGGTGTGCTCGCCAGCGACCTCCCAGCAATCTGTGC
GCCCTCCAGAGGATGGGGTCCTCACCTTTGACCACACTGGTGTGCTCAGCTCCGGGAGCG
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GAGAGGAGGAAGGGAAACCTGACAGGCAGGCGCCACATATCAGCAAAGCAAGCCCCTTAG
GTATGCCTTCGCCTAAAGAAAGCGTACTCTGCACCGAGACGTTTTCTGTTTTCTATTTTA
TTTAAAAATCCAATTTGACTCAAGTTTGACCGGCCACAACTTCTTAAATAAAACTCCAAA
TAAATTGACTCTTTTTCCTACCTCTCTAAAAAAATTTATAGTTTATTTACAATTTTATTT
AAAAAATATTCAAACAAATTTTATGTGTTGTTTTGTGATTGCGTGTTAAATGGCGTTATT
TTCAAACTAGGAAATTGGAGAAAGGAAACCCCCTTCAAGATGTTGGGGTGCACACCACCC
TCCTCAACTCCTAAGGCAAGCATCTTGAACCCTGGTTTGTTTGGTTTGTATAATGTTTGC
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TTGCATGAATGCATGTGATGAATATTTGGTTTGTTGCTAAATACTTGTGATGCAAAGGTG
AGTGGGTACTCCTCATGCCTCATATGCCATGCTGGTCTGGACAACCTCAGAGGGAGGTTT
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TCACCTTACCCTTTTGTGCTACCATGCGTCTTCCCAAGAGGGAATATAGTTGAGTAATAC
GTAAACCTATTATTAGGCACACACCAAGTAGAGGGGCCAGGATGAAGGTATCCATTGCCC
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GTCGGTCTGAGTGTCGGTCTTCGGAGGAAATTAAACTGAAAATGGATGGACCCTATAAAC
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TTGATATTTTGTAAGCCCTTTCTGCGGTGTCGCTTAGACGCCTGACTAGGGAAACTGTTA
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TTTCTTTCATATAAGCCCTTTCCGTGGTATCGCTTAGATGTCCGACTATGGCAATTGTTA
TTGCTTTTATGTGAGACCTTTAGGTCGTGTCGCTCCGACGCCCCATTGTGGCACACATGC
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AGTAATATTCCATTGACAAGTCACTTTTTTGTGGTGTCGTTAAGACGCCGACTATGGCTT
GTGTTACTTGTCTTTCCGAGGCGTCGCCTCATACGCCCAATCGACAAGCTTATAATTGAT
TATTACCCTTCCTTGCTTGTTTAGACAACATTGGTGGAATTGATTTATCTGCATGAATGC
TTCCGTGAATTAATCCCGATGGCATGATAAGTTTATTAAGTGAATTATGCATGTCTCTCA
CCTGCTTTAACTTATTCTTTTTATTGATGTTTGTGAGTACATTCAAAGTACTCACTGGCT
TGTCCCTAGCTCTTGTCTTAGCCAGATTCCATCGGAGAGGAGCACAATGTCATCAACACG
GAGATCTAGGAATCGAGGATAGCAGCTTTGTGAGATAGGAATTTATCCAGGTGAGATGTT
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CACACTATGTTCAACCTGGTGGAGCTTTATGGTCTTGTAACCCAAACCTTGTATTTTTTC
TTGGGATTTCTATATCAAGTGAGTGTTCACTAGCTAACAGTAGTCCTGGGGCTGGTGAAC
ATAAGGGTCTGTTTTCAGGAATTGTTTTTCCGAAAAACTGACCACCACAACCTTGCTATG
AGAGACAGGCTAACCATTGGCTAAACCTATCTTAGCCAGGTCGGTATCCCTAGCCCAGAT
ATTTATATATCCGTAACCCAGCCTAGCCTACCCAACAGCGAACCACATTAACCATCCGAC
ACCTTTTGGCAGTCGGTGCCCAAACTGTCAGCCCAGCCTTTAAGTTGTATGTCAATGACC
GACACCGGAGTTGTCTCATCTCCTAGTGTGCGATGGAAGACTCCCTACCCTATATAGTAA
GGCCTTGCCTTAACCTAACAACCCGCAACCTTGAGACCACTACCCATGTAACCCCATACT
TGCAAGATGCATGGTTGCATTCTTTGCAACGAGACCACCATGTCCGAGCCTGGAGACTTC
GAAACCATCCTCGCCGACCTCAACCGCTAAGTTTTTGGCATAGAAGAGCCCCAAGTGTAT
GTTGTGCATGGGGAGCCTACGAGTGATGTTAACCGTCACTTCTGGGCCTTGATACACATC
TATGGGGAGAGTTCCCTGCTAGAGTGACTTTACCATTTCACTTGTATAGAAGACACGAGC
GAAGCCCAAGCCCGTCAACTTGCAGCCCAAGGGGCTATAGTCTAGCTGCGACATTTGTCG
CCATGGATGAATAGCCGACCATTCNNNNNNNNNCCTAGTCGTGAAGGCTATGGTAGTCAG
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TTGAGAGCGCATGAGGCTCTCATTGATCAGATCACCTCTGACCTGGTAATCAACCGCACG
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ATATTTGTTGGAAGACCTATCAGATCCCTGAGGTCTACCCGAGCATTTATGTTAGCCAGG
CCAAGCATGACCCCGTTAGAGCTTCACTGGAACTTGGATGCCTTGTGGAATTAAGTTGTG
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GTTATCCTGTAATGTTGTATTCACATGTTTTTATAAGACGGTGTTAAATAAAATTGCAGG
ATGCCTGCCTGCCTTTTCTTTTAAGGTATAATTGTTTAACCAGTATTGGCGAGACCACAG
GTCCTTAGAATTAAATTTTTTAGGGTGACCACCTAACCACCAAACCAGCTACCCGAGTGA
TGTGTCACTTGGGAGTTGATACCCGAGTTTCCACCCCGATGACCTAGGTCACACCAGTGT
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TCTCAACAAGTGCACTACCCAGAGCCAGTCCTCCCCATGACTACCCCTCGGGATTCATCC
GGGATTTCTTGATGCAATCCCACAATAGACACTGTGTTGCCTCACAGCCCAGTATAGAGC
AATCCGTGTGTGACCACCTTTGTCCTATACATCGTCGCCAAGACCGTTGACCCATCAGCT
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GTTTTCCCCGACCGAGAATATTTCTCGAAACCTTCTTGCCCGTACCTCGTGGACCGCCCT
CGGAGTGTACGTTAGTCCAGTCATATGCTTCCTTTGGTGCTATATGAGCAAGGGTGTAAA
TTATGATTATTCTTTTTGCACCTGCATATGAGTGACTATGTGCTTGCTTTCTTTGCGCCT
GCATTGGAATTATTATGCACTCAGTTTTAATGAGTGGGTTAATTTCTCTCCCTAAGCAAA
TCTCAGGGGTGAGATTTATTTTCAAGGGGGTAGTGTCTCTCACACCCCAAAAATTGAATA
ATATTTTTATGAATTAAAATATTGCCTAGGGTAATTTTTTTGTCAAATAAATTGCTTTAT
GCTAGTTTCAAAAGCATCTTTCCAAAAACTTTTCCTTGCAAGGGACATTTTAAATACCAT
TGAAGTGCTTGAGTCCTTGCTTGAGGCCATTTTTCTCCTTATCTTATTAAAGAATGACAT
TCTTCTAAATCTGACCATGATTGTTTAAATCTTAATTTCTGGTTTTTCTTATTTATTTTA
GAACCAATCCTTTTCTTTAATTATAAAGTTTTCCTCCAAGTAAAAGTTTTTAAAAATTTA
TGTTGAGACTTAAGTGATTGCATCGAAACATTTCTTTTCTTTTGACAAATTCATTGAACA
TTTTTTGATAAATATTTTTGCCAAAGTTTCTCTTATTCAGAAATGACTTTTAATTCCTTT
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GTAGGTGACATGTGATGTTCCTAGAACAATTTTTTGTAAAAACTTAACCAAGTTTTTTGA
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CCCTAGCTATAACCTTTCAAAAATTCGACAAAAATTTGGGGATGTCAAGTGATGCATTAG
ATTCACTTTTATGCAAAAACCCAAATATGTGCATTAGAAAGTTTTCACAAAATAACCACT
TTTCTGTTTTGGTCCAGTTTGGTACTTTCTTCTACAAGCATGCTTTGCCTTTCTCAAATT
GCCTTGAGATTTTTCTTACTTGTAAAATACCCTACCAAAACCTTAAGTCCATGAGTTGAG
ACCCATTGGAGGATTTTGAATGCATATAATGATAGTCCTAACATGCTGCCCAAAATTGGT
TTTCTCTAAACTTTGCATTAACAAGTTTAACGTTTTGCCAAACTAACTTTACCATCATGA
CTAACAACTAAGGACACTTTGATCTAGAAATTTTGCATGGAATCAAAATCCCTTAGAGGT
GCATGGCAAACTGTCAAACACCTTGAGTTCATGTACTATTTTGGCATGGATTTTAGTCTG
CATTGCAGAGTTGCTATATTGGCCAAGCCAGCATGTCCTCTAGCCCCTCCTTTGCCTCTA
GCCTAACCCTGTTGACTTTGGTTAGTATTGGAGTCCATTGGCGATGCATGGCATTTCGTC
GAAAAGGTGTCATGCATTCTCCACGCGTGGCCAGAGCGCACATTTTGCACGCGCTCGTCC
GAGCTGCCACATCCCTGCCTTTGCCCCTGGACAGCCGCAGAGCCGCGCCAAGCCCCTGAC
ATATGTTCGTCGCCCTACTGTGCTCTGCTGCACCCCTGCCGTACCCGAAGCACTTCTTCC
GCCAGAAAAGCCGTTGTGGCCGGCGCCTCGCTTCGTCCCTGCCATGGCAAGAGCCACCCG
AGTCCCTCCAGAGCGCCACGTGCCCCTTGGACCACCCCTGCGTCGCCCTCGTGCTGCCAG
CGCCGCTAGTTTGCTCCTGCTGCCCGTGTGTCGTCGCAAAAACATGTCGCCAGCGTGCTT
ATGCACAACCCCGGCGAACCGACTCGGCCGTGACTATTGAAGGCCGAGCCCCCCCCCCCA
AGTGGATCATGGCCTCCCCTGCAGCTCTTAGTGCACCCTTAGAAGCCCCGAATCGGCCGA
GCCTCCAGAATTTTTCCCCTACGGCGAGAGTGCCCGCCACCGGAGCCAGCCAAATTCCCC
GATCTCAAAGACCCCCTCCCCTTCCTCTCCTCTGCAGAAGCCTCTTGGAAGCCCCTTTAG
CCCATTCCCCGCCCCAATTTTTCCTACGAAAGCCCTGTGGCCGGAGCCCCTTCTGCACTG
AAGCCCTCCGTCCGCCATGATCGGAGGCGTGCTCGCCCCCAAGCTCCCCAACAACCTGTG
TGGCCTTTAGAAGATGTGGTCCTCACCCCTGAGCACACTAATGTGCTCAGCTCTAGGAGC
AGAGCTTCCTAGCGCCGCCGAGCGTCACCGGAGCGCGCCTCTCACCCTATCCCCTATGCG
CGACAGGTGATGAGGACATGACTACCTTGGATATTATCATAATCATTGCATATGCGTATT
TATTTGAGGTGATTTCTGATAAAAGTCATACAATAATTTATTTATGTTATCGGAACAAAA
ATACTTCACCTGTTTTAATTTTAAGCCTAAATGCAGAATGACGGAACACTTGTATGAACC
ACTTGTGATGACAAGGGAAGAGGAAATGGTTGGATG