Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_65368 (4207 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_65368

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74211 1 2959 bp MLOC_74211.1 Available Available LOC_Os07g07240.2, FRAME:+2, EVALUE:1e-24, 13107.m09980 protein ubiquitin-conjugating enzyme, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_74211






Contig Sequence (4207 bp)

>contig_65368 4207 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCCCCCCCCGCCCCCCCCCACACCCCCCCCAACCCCCCCCCCCACCACCCCCCCCATCCT
CTGCCCCCCCCCCCCCTCCACAATCCTCCCCAACCCCTTCCTCCCAAACAAGGCCTTAAG
CGGGTATTTTGCATGTTTAGTTGTTTGGATGCAGACTGTTGTTATGGTCATATGATGTTC
TTTCTATTACATCTACAGATGTGTTGTTTGCTTGTGGTTGATTGATTTTGTGAGCCACAA
AGAAGCTCACGTAACCACCAGAGACCATCAAGACTACCATAAAAAATTTAAACTTGTTCA
TGAATAACCATAATAACCAGCTAGAGGAACAATACAATAATCATAAATTAAAACTTGTTC
ATGAATATGAAAAAAAAATATGGATTTGATATTTTATGAGTTTTAAAAATATTCACTAAC
TTTTAAAATGTCCATGGATTTAGAAAGTTTGGCAATTTAAAAATTATTCACGAGTAATTT
AAAGTTCGCCACAATTTTCAATGTATGAATAGTTTTAAGTTTACCAACCTATGAAATTTG
TTAACATTTTATGGAATATATGAATATACAAAAATCGTGATTTTTTATTCCCAGAATTTT
AAAATTCGGGATTTTTTAAACCTATCTACATCTTTTGATCTAATAATCATTTTTCAGATA
ATTAGTATCGCCGACTTTGTATGAGCCAGCAGTGGAGCGAGTAGAAAATGAAACATCTTT
GGTAACCTGCATTACATTTTTGGGACGAGTGGTTGCTTGAGTTGTGCAAAAAATCTTAAC
CGTTATGAACTTTAAAGCACCTCTGGACTTGTCTTCACAAAGACGCCTGAATTGCCGTTT
TTCCACACCAGCCGTACCACTCAAGTAACACTGTAACAGTGAATGTTGAGTGTCAGAAAA
AAAACTTTTAGGGCTAGAATGGGGAGCAGATTTTATTCGCAAAAAGGAGCATATATTTTT
TTTAAAGGTAAAGTATGAAACTCTTTCTTCCTGCAGGGCCTGGAGCATTTTTTTTTCTGA
GACAAAAGTCAGGATCTGATAGGAACGAAAAGAGACCTCGGCTCGGCTGGCGGCCACTCT
CTCTGGGCCCCGCAGGCCCACCTTTCCCACCGCCTACGCCGACCGACCGTGTCCTATCCG
CGGAATCTGAGCCAGCAGCCACCGACAGCTGGGCCCATCCGTTCCACTGTGCCCAGATTC
AGCCGTCCTCATCCCCATCCCCCCATCATGCCACCCGATACCCCTCACCGACAGGTGGGG
CCGGGCCAGCGCGTGGCGGCTACGCGAGCCCACGGCTCACGAGGGACGGAGGGAGGGGAG
GGACGTCACGCTCCTCGCGCCCCCACCCTCCTATACCATCCCCTCCCCCTTTCCTCCCCC
ACGCGCACGCCCACCTCCGCACCGACGAAGCTTCCCCCCCGCACCACCAGCCCGGGGAAC
CCATCGAGAGGCGGCGGCCGCTCCGGGAGCGAGGGATCGGGAGGAACGGGGCCAGGCGGG
GGCTCGGAGATGTCGACGCCGGCGAGGAAGCGCCTGATGCGCGACTTCAAGCGCCTGCAG
CAGGACCCGCCCGCCGGCATCAGCGGCGCGCCGCACGACAACAACATAACGCTCTGGAAC
GCCGTCATATTCGGGTATGAAGCACCGAATCCCCGCCCCCTTTTCCTGCCGTCGTTTCCA
TCCCTAGGTTTTGGAGCTCGGGGGATCTCGCGCACCCGCGGTTTCCTTCCTCTATATCTT
GCTAGGTTATTGGTGTATGGTTCCCTGATGTTGTTGTTTTTGTTTTGCGTGATTCCGCAG
GCCCGATGACACGCCGTGGGATGGAGGTGAGAGCCTGTTCCCGATTTACGCTTCAGTTTG
TGTTTCATTCATGATTCATCCGCGTATAGCTGCTCGATTACTACTTACTAGTGTTTGCCT
GCCGTGTGATACTATACTGATTGGTTAATTGGCACTGCGGCTGGACCTATTTAACCTATT
TATGATCTGTAATCGCGCGCGAAAAATTGTCTTTCTAGTTTCATTTCTCATATGCAAGGT
GTGGATGTAGAACTAATGGGAAGTAGAGGAACCTTTTGCCCCCAAGGTAGCAACCTGCCT
AACTAAGCCTGTCGTCTACCCGCCGTTTTACGTCACTGGTATGGCAGGAAACCGAAAGCT
GTAGCATCCGTGATGTCCGAAACGGAAACGGAAACGGAAACGGCTGCCTGTTGTGATATA
GTGATTTATAAATTGGTACTGAAGTTGGACCTATTTATAATCTGTAGCCGCGTGAGAAAT
TGTCGTCTTCCTCGTTTGATTTATCGTATACAAGGCGTATATCTAAAGCTAATGGGAAGT
GCAATAACTTTTTGCCACAAAATACCTACCTGCCTAACTAAGCCTCTCGTTTACCTGTCG
GACTATGTCACTGGTACGGCAGGAAACCGAAAGCTGTAGCTTCTGTGATGTCCGTTGTTT
AACAGAAACGTAACGGGTTGCCTGTTGCGATATAGTGATTGGTTAATTGGTATCATGTTG
GACCTATTTGTAACTTGTCATGGTTCGACAAATTGTCGCCTTCCTCGTTTGATTTCTCAT
ATACACAGTGTATATGTAAAGCTAATGGGAAGTACATTAACTTTTTGCCCCCAGAATAGC
AACCTGCCTAACTAAGCCTGTCGTTTACCGGTCGGTTTATGAACCGAAAGCTGTAGCACC
TGTGATATCCGTTGTTTAACGGATATGTAATGGGCTGCCTGTTGTGATATAGCGATCAGT
TAATTGGTACTGAAGTTGGACCTATTTATATTCTGTAACGTGTGAGAAATTGTCGTCTTC
CTTGTTTGATATGTAATAACTTTTGGCCCCAAAAAAGGCCATCTGCCTAACTAAGCCTGT
CGTTTACCGGTCGGTTTATGAACCGAAAGCTGTAGCACCTGTGATATCCGTTGTTTAACG
GATATGTAATGGGCTGCCTGTTGTGATATAGCTATCAGTTCATTGGTACTGAAGTTGGGC
CTATTTATATTCTGTAACGTTTGAGAAATTGTCGTCTTCCTCGTTTGATATGTAATAACT
TTTGGCCCCAAAAAAGGCCATCTGCCTAACCAAGCCTGTCGTTTACCGGTCGATTTATGT
CACTGATACGGCAGGAAACCGAAAGCTGTACCATCTGTGATGCCGGTTGTTTAACGGAAA
CAGAAAAGGCTTCCATCTCGTGTTTGATTGCTGCTTTGATGCTAAAGGGTGTCAGCCTCT
CACAGGCTAGCAAGAAACATGCTTTTACAGATGTTAAATTTGGTCTAGTAATGTGCACAG
TGCAGCTATTTTTAAGCAAGGTTAGTTCCTAATCTTGCCTCTATGTAGTGCCTATCTGGC
CTAGGCGCACGCCTAGCAGCGCTTAAGGCTAGGCATTTCGTTGTCGCCTAGTGCCTAGGG
CACACCTAAGTGCACGCTTAGAAGCGTTGTTCTCTATCATTGCTTTGAAGTGTATGTTAC
AGTTTGGCATACTATCTGGCACACCTGAAATCAGTAATAAGCATATGGCCCGTAAAAGAA
CATGCTCTTGGCTCTTGAAATAATAGTGACGGAGTGTGTGTGCAGGTTAGTCTTCTTGAC
TATCATTACTTATATCTGCTGGAGTTTTTTTTTTGTGTGTGGTGTATGCCAGCTAACAAT
TATTATGTACTCCCGCTGTATCAAAATATAAGACACTATTTGACACTGACAGTGTCAAAA
AATGTTTATTTTGATAGAGGGAGTAGTATGTACTACCTTAGTCTTAGCCTTAAGTCATGT
GTTCGTCATGTACGTGTGTAGCCATCATGTAAATGGTGATTGGGGAGCCCTTGTTTGAGA
TGGGGTCTCTATTCCTGCATGTGCACGTTGGAGTATGATTTATTTAATCATTGGTAATTT
GGTGTCGTAGTACAACTGGCATAGTTTATCGGGCACATTGTGTTTTTGTTGGGGGAGGTC
ACTTCATGTCTAGAGCCCAGAGGACAAATCAATTTTGTCTTCTGCAGGTACTGAGACGGG
GCTCCAGTAAATAAATATCAGCTTTATTTTGTGGGGTTTTGTTTGTTTGGAACAAAATAT
TCTAGAAGCCTAGAATGCATGATCATCTGATTCAGGAATGTCTACTTTCTACCCAATGTC
GGTTGCCTGCAAGACTTAAACACACCCTGGAATTGTGATAACTGATAATATTTTCTTTTG
GATCCAG