Contig Data
morexGenes
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Map Locations of contig_65301 (6262 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location




Predicted Genes from contig_65301

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74176 1 1240 bp AK374600 Available Available None
MLOC_74175 4 1868 bp MLOC_74175.2 Available Available LOC_Os01g73550.1, FRAME:+3, EVALUE:0.0, 13101.m08024 protein mitochondrial-processing peptidase subunit alpha, mitochondrial precursor, putative, expressed
MLOC_74174 2 445 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_74176






CDS Structure of MLOC_74175






CDS Structure of MLOC_74174






Contig Sequence (6262 bp)

>contig_65301 6262 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CGCCGCCGCCGCCGTCGCCGCCGCCAGGGATTGGAGGTGGCCGTGGGGTCCTTTGCCCGG
CTCGCTCCCGACGGCGCTACCTTCCGGCTGCCGTGTCTCGGGGTTCTGCTCGTTCGGAAA
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GGAGACGGTACGCTCCTTGATTTCCCTCTAGGTTTCAAATATAGTTGGTAATACAAAATT
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TTGTCTCTGCCCTAATTTTGTTGCGGAACATACCACAGGGTTTGCTAACTACTCCCTCCA
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TGTCCTGCTCCACGACTACCTTCTCCTTTTTCTTTTTCTTACTATCCGACAGTGCAGATT
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TCTCCACTTGTTGCTTTGACCGTTTCCTTTTCTCCTTCTTTTTCATACTAGAGTCAACGG
GATCACGATCAGGCAAGCCTTCATCCTTGTTCAGCTTACTCCCTTTCCTGGAGTTCTCAT
TCTGGGAGATAGAGATAGCTTCTATGGGCTTTGCATTGAATATGCGCAAGTTCGGCACAA
TTTTCATGACCTGAGAGAGCATTTATAAGTTACTCAAGAACTACAATACACCCTGGAAAG
AAGAGAAGTAAGAGAGAGAGAGGTGACCTTTTTAGCTAGAGTGTCTTTCTCAGCAATAGG
ATTTCCCTGCAAATTTAGGTTCCTCAAGTAGCGCAGTTCAGAAAGAACCTAGCAACCAAA
CAAATGATTAGAGCAGTGTAAGCAAACCATGTGTGTTGGTGAAAGCTGATCAGATCCAAA
CCTTCAAATCCGACTCCCTCTCAATTAAGTTATTTCCCAAGTCAAGGTTCAAAATTTTGG
TATTTTTGGCCAAGTCTGATGGAATTGTCTGCAAGTCAGAGGTAAATAAGACCATGTTAA
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ACTTACAGTGATCTTATTGTGAGCAAGCCTAAGTTCCTTCAATTCCACACATGCAGCAAG
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ATAAGATAATAGTCAAATACAATTAGAAATGCTACATAACAGAACCATCAGAACATATAT
CATATACTCCCTCTGTCCCAAA