Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_65274 (4706 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map location No map location




Predicted Genes from contig_65274

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_74165 4 2387 bp None Available Available None
MLOC_74166 4 2291 bp None Available Available None





CDS Structure of MLOC_74165






CDS Structure of MLOC_74166






Contig Sequence (4706 bp)

>contig_65274 4706 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TTTTCATTTGCGACTTTTTTACGACAAAAAAGAGACGGTCAAAAGCTAAGGGTCTCTAAT
GAACTATAANNNNCTTTTTTCTGGAATGGTCGAAGACATTTATGACCAAAAGAAAACATT
AAAATTATTTTGGTTGTTGGTTATCTGCCCAAGCCACATCGGATCCAACGTGACAAGCTG
ACATGTCAAAGTTACGACCAATTCGATTAGTCGTTGATAAGAATGAGCCCGGTCCAGTTT
GGTGCTTTAGATGGGCCAAGCCCATTAATTCGGCCTTTTTACATTTTTTTCCTACAGCCC
AACATTTTTACCTTTTAATTTTGGGTTGTGGCCTTTTACTTTCTATTGATTTCATTTTTT
GACCATTTTATTTTTGTACTCGTCCTACTAGTCAAAATAGTCATGTTCATCTCTCAAATT
GACCCCACATGTCAAAAATTTACAAATTTGATAGATTATTTTCATAAAGTGGGCCCACTG
GTCATGTTTCAATTTCACAAGTTTTCAAATCACATACATGATTAATATTTCAAATGGAAC
AAATAACACATAAGATACATTAAATATACCACTAAATAAATCTATTACAATCTTTACAAT
ACAGATATGCTACAATATGCTCAGTAGGACTTCATGAGGCTTCACACTTCACGGCTTCAC
ACTTGCTCCACACATAACGACTTCAAGACTTCATGAGGCTTCACACTTCGCGGCTTCACA
CTTGCTCCACACATAACGACTTCACACGAGATTCTGTATAAAAGAGGAACCACCACAATT
TTAAGTCTGCAATACAACAATTGATACTAGTCAAGAATAAAAACAAAAACAAGTAATATA
CTCAAATGTGGAGGCAGCATGGAACTACTAATACGACAACATGCAGAAGCTTCATGAAAA
TAACTGATTTTTAACAAAAGTTACAGAAAATGAACCAAGCTACTGCAATCAGTACTCTAT
TACTCCACGAGAAGTTGCTTTTCAACAAATTTAGTTCCTACAAACTTGTGCACAAGCTAA
GCTTTAACAAATTTTAACTGAAAATAAACATGTGTTTGCTTTACTCTACTGCACTTGTAT
CTTTAACACAAAATTAAGAAAAAAATCATGAACATGTACAGCAGGAGAGAGGAGTAGCTT
TCTCTACTGTACTTTTAGCTTTAACATATTTACACAGAGAGAGGAGAGGACCAATTTTCA
CAATGAGTTTCAAAAAATTAACAAGACAAGTTAACTTGTTTGGCCCTTTTTTCTTTTCAG
TTAACAAGACTGGTAGCAGCAACAAGTGAACAAATTTCAATTAACAAGACTGGAGTAGTC
CTACTGAGAATGCGGAACAAGACTGGAGCACTGAGGAAGTAATCACCTAACTTTGCATGT
TCACAACACTTTTCTCTGCTTGTTTAGTGTACTGCTACCGAGCATGCAGAACAAAACTGG
AGTATATGCAGAGACACAAGTACTGCTACTGAGCATACAAAATATCTAAACATGTTCGAC
AAACAACAAACAATTTGTTCATAGATTTACTGTCTTGATGCGGCAGCATGAGACAAATTC
AGGTGATAATGTTAAACGTTACAGTTACACTTGGTGCTAAATAGCTACCGCAGCTCCAAA
ATGCAAATAGTTGGTTGTCATGGTAATAAATAGCTACATTTTTTTGATATACCCATGTTT
TTCCACATACGTGGACTTATTGCTAATGTAGTCAAGGTAATTGTTAATGTAGTCAAGGTA
ACCAGACTGGTAGTATGGTAAGTCATGGTTTTGGTTCACAGCTCTCCTGCCTCTCTGTGT
GTGTACTAGATTAAATTAAATGAGCACACACTTGAACTTTTTATGGCTGGTTGGTGTTTT
AACCTTGGTGGAATTGTTGGCGACGTCGACGCCCTGGGTGATGAGGGCGACGAGGCGCTT
GACCGCGTCAACATTGTCTATGTCGAAGCGGGAGTCAAGCACACCGGGATGGCGGCGTCC
TCCGCGTCGTAGTAGAGGTGCACGTCAGTGCCGACCCGGCAGCCTTCGTCCGCACACACA
AAAACACACAGATGGTTAAACAAATAGTCCAGCGCACCAGCAAATGCCCATAGGCAACTA
AGTTACGAAGGAGATAAGTTCTCGGAGCCAGTGAATATGGCCAATAGTCAGCTGGTTCAT
ATCTTACACGGGGTAACTCTGGGAGGTCCAAGAGGACATCCTATACCTCCAGGTAGTAAG
CATCCTACTGAATTTTGTAAAATAAATACAGTTTACTTAGACGGACATACATATGACAAA
TCCCACCAACTGAAGTTCACACAGAGTTTGCATGATACTCCCTAGCTATGGGTTTGTGTA
GACTTGATACTTTACCCACAACAAATAGTGAAATATTGTTCCAAACAGGCTTTAAAAAAT
CTAAGAAGTAAAGATTAAGTGCTTAACAAATCACAAGGATGTCAGTTTTTCTCGAAACAT
GGAAATAGAGTAACAGACTCACAGTAGAATACATCTTCAATTTTGTTAATAAGTAGGCAA
AGAAGCAATAAGTCAACACGCATGTTCTTTGTTAAATAACCGAAGCAATTTTAATTAGTG
CCAAACCTCAGCTTGCAATTCAATGGCTACTTATTGATTTGTTATTAGGATTATTAAGGG
GTGCTAGTATGTTGTTAAGTACCAGTATGTTGTCTATTAGGATTAAGCAAAACAATATTA
GGAAATTGGTACTAGCACAATCTTTTCCATCAGTAAAAAGAAACTTATCTAACTGTGATA
TCATGTGACTTCAAGTCACATGCATACACTCAAGCCCTCAAGCAAAAATGGAACTGGCTT
TCTATCCTAAAACGGTGTAACTTTGGTCTTACTGTAGATGAAACTTTTAACTTTGACTAC
GTCCTTCCTTTGTTTAAGTAATATTCCTCCGTCCCAAAATAAGTGTCTNNNNNNNNTACT
AGCTCTAGTACAAATTTGTACTAAGCTTAAGACAGTTATTTTGGGACTGAGGGAGTATTA
GTTAAGAACCTATGATGCCCTTTTCTCCTGAATTAAGTTTAAACAGCCCACCACGACAGT
TTTGCACGAATCCGTTTTCACCAAGACAGTTTTGCATGGATCCTGATACATCATGGCCAC
TCAGAACACAGTTGCGCATATATCAGGCAGGTGAGCAAGTGTGCTAGCACAGTCTTACCC
TTCAGACTTGGATGCCGCCTCGCTTGCTGGCGCATCAGCCTTGGTCTGCACACATGAAAA
CACATGCAAGATTAAGCGAACAATTAGGTTCACCAATAGATGCCCACAAGCAACAAAATT
ACGAAGGAGAAGTTCTTAGAACAGAACAGAGCACGCATCTGCAACGGCAGCGGACGCCAC
CAGCCTCCCTTCGGGACGCGCGCCCACGCCCGATCTGGCCACACGCACGCTCCTCACCGC
TGCAGCAGAGAAATACGCATGCAAAACAGCGAAGATCCGGCGGCCACGGGCGACGAACCA
GGGTGAAGGTACTACCTGACGCGGATTTGGGGCCGGCGGATCCCACCCGCGGGGTGGCGG
CCGGGACGGCGACGTCGCTGACAAATGCCTCCGGATCGAGGTCTTGTCCTCCAGATCCAC
CACGAATCTGGGCCCGCCATGGCCTCCCGTTCGAACTGGGCCTCGAGGAGAGGACGGAGG
GGATGGGGCGACGGTCGCCTGCACAACCCCTCCCGGCAGTTGTCCTCACCGAGCCCTTCC
AGCTCCACGCGCACCGCCGGCTCCATTGCATCCCCGGGCGCCTCCCCGCCGCCGACACCG
AGCTTCGCCAGGAGATCCCCTTGTCCTCCTCGTCATCGCACCCGTAGGCGAGGTGAGGAG
ACGTTGGATCAGTAGAGTGTGGACGGCTCAGATTGCCTACAGGAGGGTGATTCGGGGTAC
ACGTGGTGATTGGTCGAGACATGTGTCATCTAAAATAGTCTCTAAATGCTAAAAATAATG
AAGATTTATGAAGAAACTACCAATAATATTTTGCAAAATGCCACCACTAAAATTTTCACT
CAAGTTATACCACATTTTATGGATAATAATCAACTTCTATGCATTTTCTTTGTACAAAAA
ATTCATTTTTCATTTTTTGAGTGTCCAAAATGAGTTGTTTTGTGAAGAACCTATCATATA
CTTGTTGCAAAATTGGACCCAATAATTTTTTTAAAATACTAGGTCATATTTAATATACAA
TTGACTAAATTGTTGGGTGTCAAAAGTGTTTATTCACCTCTCGTGAAAAAGATAAATTTC
CACCGATTTAATTGGAAGCGGGTCAAATTTGAACTGCAGCTGCCTTATAGTTCCTCTTTA
TTTTTTCCAAAAATCATTTCTAGGCACACAAGTATCTATTTCATCATAAAAACACTAAAA
GTTTTCCAAGATTCAACAACTAGCTAGGAACGGTCATACCGTCGTTTTCACCGCATTTTG
AAATAAGCACTAAAACTCAAAAAACAAATGAAATCTTCGCATTGTGACATTATATGTTAC
AAAGTTACCATGTAAAATAATAAACTTGTAATATGGCAATTAGTTTTAAGAATTGTTCTT
AGAAATGTGCTATCATGTGTGAAGATTCATNNNTTTCAAGCCAAATGATCAATCTTTTGG
CCACATTCATTGCATAGTTTGTTCANNNNNNNNNATATTGTGCACAAGGGTGCGTATTGA
AATGGCAAACAATATTGCCTAAGAAA