Contig Data
morexGenes
Links



Map Locations of contig_64909 (5374 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
No map locationNo map location




Predicted Genes from contig_64909

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73998 1 889 bp MLOC_73998.1 Available Available LOC_Os02g30320.1, FRAME:+1, EVALUE:1e-30, 13102.m03311 protein drought-induced protein 1, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_73998






Contig Sequence (5374 bp)

>contig_64909 5374 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TATTAAAATTTTTAAAAAGATTTATATTTAGGAACGGAGGGAGTATAATTGATGTTCACG
GATGCTTCATGTGGTTTTTGCTGTTAGATGCACTGCTCATCTTTTTAGGATTTACACTAT
GCAAGATTGCTGCATTGGGTTCCCCTCATTGGATTTACACTGTAATCCTTAGTGGATTTA
CATTGTATTTAGGAGATTCTACACTATAGATTCTTAGTAGTTTCACTGTAATTTTTTTTG
GATATTGAAGTGTAATTCTTAGTGGATTTTTAGTTGTAATTCTCAGGAGATTTTTCACTG
TAATTCTCAGTGGGGTTCCACTGCAACTTTCCTCTTTTTAGCTGAAATTCCAGTATGATT
TACAGTGCAAATCCAGTTCCACTGACCACTGATATCCTAAGTGTGTTTTATACTGTAGCT
GATGACCTGTAGTTCTCAGTTAGTTTCCACTCTAATTTTATGATATTGTAATGCATTTCA
ACAGTTATAGCATGACCATCCATTATACTACTTGATCCACTAGCACTGCCATGCTTCTAC
TAATAATCACAACCACCACCTTGAGAACTTAAGTGTTTATTACACTGTAATTTCAGTGTA
GTTTTTATCATAATGTCATTAGTGTGCAACTTACAACGGTTTTCTCCCAATTTTCTAGTG
TTTTTAGTGTAACTTTATAGTGATTTTTGGGACCGTAATTCTTAGTGCATTTCTGCAATG
TGTCTTAGTGGTTTTTTACGGTGTAATTCTTCATGTATTCACATTGTAATTCTGAATGTT
GAGATTCCTCTCTTATGGTTTTTGACCAATTCTTTTGCAAATAAAAAAAAAGTGCAGGAG
TGCATGCTGAATAACAAAACCCAAACACAAGGAATCCAGCCATTGTCCGTAATGCTTTTG
AGGGTGCTTGGAACGCTTATCTGTTGTGGAGATTGAGCTTTGTAAGTCCAAGTTCTCTCT
TTCTATCTTTTGTTTGTGTTCATGCTTTTTCTATTATATTTTTACAGTGTAATTCTTAGT
GGATTCACATCGTAATTTTGATAGTGATTTTACTGTGTAATTCTAATTGGGTTTACAGTG
TAATTCTTAGTGGATTCACACTGTAATTTTTATAGTAGTTTTACTGTGTAATTCTAGTTG
GGTTTACACCGTAACTCTTCGTGGATTTACTGTGTAATTTTATTTGGATTTACATTGTAA
TTCTCAGTGTATTAACATAGTATTTTTCTTACTGGTTTTACTGTGTAATTCTAGTTGGGT
TTACACTGTAGGTCTTGGTGAAGTCACATAGTAGTTTTGTTAGTGGTTTTACTATGCAAT
TTTACTTGGAATTACATTGTAAGTCTTAGTAGATTCACACTGTAATTTTGTTATTGGTAT
TACTGTGTAATTCTAGTTGTGTTTACACTGTAAGTCTTGGTGGATTCACACTGTAATTCT
TTAGTTGTTTTCCCATGTAAAACCTAGACCGTTGTACTAGTTGATAGCTCTTTAGTTATT
TTTGTTTTCTTCAGTAAATTGGTTTTGGTATGTTTTGCCAAAAAATTTAGTTCCAACACA
GATTAATAATTTCAGCAGCTTTTGGCATGCGTATGTGACTCCTATGATGCATAGAAAAGG
ATTGATTTCGAAGAGCTTGATGTGCTATACCCAACAGTTCCTAAGCAAGATAATCGGTAT
TATTTTTTTGCTTTTATTGTTTTATTTATTTTTATATAGGCTATATGAAAGCTTCGTTTC
TTATTTGTGTTTTTTGTAACTTAATATCTGTGCTCAAGCAGCTGACTTTAGGTGTTTTTT
TTCGTCTAGACATGCAGTACCTGTTGTTATTTTGATTTCCTACTTTAGGTGTTTTTCTAT
CCGGGTTGAAAAAGTTGTGGACCCGTTTAAAAAGATAACACAGGAAACAGGAAAGGGGAC
AAGTGTCATGCTTTTATTGAATTCAAAATTTGGATGAAAGCTAATTGCATTTCATCCGGA
TGTAAAACAGACACTCCCACCTTCTCTCTTCGTGTAAATAAAATGGCCGTGCTCATGCCG
GTTCCTATAAAAAAATAGTGACCGCCATTGTTTAGCTTGCAAGCAAAGTAATTAACGCGG
GGAAGAACCCAGTCGGCAATGACTCTACTATAGCTCAATATATATATATATTTGACAGCG
GAAAAGATAGCACTTGGGGATTTTAGGATGCGGTGGCGACTTGGCGTTCGCGCTATAGTT
TGGCTTCTAGTGAGCTTCTGGTCGACGGTTGAGGTGAGGCATGCATGCGCACATCACACG
CGCTTCCATCCTGTCCGCGACGTATGTATGTATCAACTACTCTTTTGCAGGTAATCGTTA
CCGGAATTCATAAGAATGCAGAGGACAACTGCTGTGCCCAGCCGCAGGTTCGTCCCGTAG
CGTGGAAAAGGCAAAGGGAGACGAGAATCCACGTGCAGCTGCCCAAGCGGCTTGCAGTAT
GCACACGAAACCGCAACAGAATCGCCGAAGCATCGTAGCAGGGCAGGCGACGGACAGGCG
CAGGCCAAGCAGGCATGGGCATGGCAAAGCCAAGGTAGCGAGGCGGGCACGCCTTCCCTT
CCGCGCCTCCGCTACCCTCCAAACCGCCGAACCAAACGAGCCCAGCACCCACCGCCCGAA
ATAATCCTATATATCAATCGACGCATCGAAATCTTTTCCTCCACTCCTACCAGCACCGGG
CAAGTGTACAACTCCTCTTCCCCCTCGTCTGCTGTTCCTTTCTCCGGTAGCTAGCCGGCA
GTCTGCGCAGCAAGAGAAGAAGAGAGAGTTCTGCTGCGAAGATGGTGGCGCCCGTGGTGA
TCGCGTCGGCGGGGCTCGGGATGCTGGCGGGCGTGGTGATGGCGAACCGGACGACCGGGG
ACGGGCTGCCGGCGGCGTCCAGGTGGGACGCCCGGCCCCGTTGCTCCACGTGCAGCGGCA
CCGGCCGGGAGGAGTGCCTCTGCAGCCGCTGGTCCGACGGCGACGTCGGCTGCGGGACGT
GCTCCGGCTCCGGCCGCAAGCGGTGCCGCAGCTGCGGAGGCTCTGGCACCGGCCGGCCGA
TCCCGGCACGGCTCATCGTCCAGCAGCAGAAGCTGCCGACCGCGCCCGGGCGACGCGGAG
GCTACAACTGATGTTCGTCGTCGGTTTCGCGGAGGAAATTAAACCAGAAGTGCAATTAGG
CAGAACATAATAGTTATGCATAAAACATTTTTAGAGCTCCTTTGATTCAAGGGAATTTAT
AGAAATTTTAGAGGATTTATGTCCTTGGGGATCTTTCCTGCGTTGGCAGGTTGATTCACA
TGATTACAATTCTTTGGAATTTTCCTTTGGATTCATTTCCATTCTATTTTGGAGAAAAAA
AAATCATTCGCTCAATCCTTCATTAAGAAATGTCAGCGGTTTCCTATGTGGATGTGCTAA
AGCACATCTACATGTGACTTAATTACCGGTCGTTGATTTTACTCGAAGATTCATATACAT
ATTTGACGATTTTTAAGTTTGATTTTTTTAGAGAACGTCGACATTTATTGATCAAGCAAC
AAAGTTATAAATAGTCTCCCGGATACAATCCGGAAGAGAATGAAAGAAATAAAGACTAAA
CGTGGTCAAACCTGATTTGCTAAAACATGAGCTGATATATTAAGGTGCCGACGGATATGC
ATGAACAACAAAGAGGAGAGGCCGCTCGCCGCTTCTTTGATCTCAGCCATAAATGGCTCC
TACCACAGAACGATCCTTCGATGAAGACGTCACACGTTGCACAACCGAAAGGCAGTCAGT
CTTAAAAAACATTTGTGAAACCTTTATCAAGCGCCAACCTTGTTGTCCGTTGAAGCGCCA
TGGCCTCAGCAATCTCACGAGATAGCACCCCCGTGAGGGTTCAAAGCAGGCCGCCACACA
TCGACCGAGGGAGTGCAGGGACACCACCCTCGTGGCTACACCGACTCGTGTACCGCCACT
GTGTCGCCCCTTCGAGCCGTGACAATGAGGTCTTTTTGAAGTCGCCCTGACCCGTGTGTT
GCCGCGTCGTCACCCCTTCGGGCCGTAGCACCGGGATGCATGGTCCACGCCACCGTCCCC
GCGCATCGACTTCTATGTGGCATGCATCGCGTTGCCTCCCTAGTCGCGGGAAAGCCACCG
TCCACGCTGGTCTTTGTCACGGTCTTGGGTTCTTCCTCGTCTACTTCGAGCATCGTCGCC
GCGCTCCTAACCAACCGCCTCCATCGCCGTCAGGCCACGGCCGCATCTCTTCTACGGTGT
CGATGTAGCTTGCTCGCCCATGTCGCGCCGCCAGTCCACCCCCTTCATCTTCGTCTCCTA
CCCCGTCTCTAAGAGAGGCTTCTTGCCCTCTAAGTATGTACTCCTACATAGACTCGACCA
TGAGGTTCAATACAACATCCATCATATTTCCTACCAGTCCATGTCTCTCTCTTGTAACAT
TGAGCATCAGACAGAGCCTTAAATATTTTGATCGACCACTCTAAACTTCTGAGGTACACA
TCTAGTTTCTTAAGCGGCAGCGACAGCTAGGAACTCGTCGGATTCGACTCCTTTGTGTGT
TGCTTTGGCAACCATTGACAGTGGAACCTCAATGCCTCGGCTTCAGTTAGTAGTTTGGAT
TAGAGGGTTTTAGTCCTTCCAAGAGTGACACTCGGGCAGATGGCAGCCTTGATCTTGGGA
TTGGTATCTGAGGATCTCATGTTTCTCATCCTCCTCGAGTTCACCCGTCAGACAAAGTTC
TGACATACATTTTTGACATATCGTGAGTGCGGTGAGGTTAGGATTTCTCGACATCCACGT
ACGCCGGCAAGATATGATGTTAGACGTGGTAGATTAATAGTATTCTGGGTTGCACTTCAT
TTCGTTCAATTTATCGTTTCTTCATTTCATTCAATATATATTAACCTGCCTTGTTTACAT
ATTCCTTCTACAATTAACATGACATCTAGTGGTTCAATAGTGACAACTACCCCTATTAGA
AAAAGGCTTATAGGTGGCTTCAAATCAGTAGCAGGCAAGTATTTGAAACGGACATTACTA
TTGTGAAAATGTAGCACTGGCGGTAGAAAAAAGCCCCTGCCACTTCAGTTAGTAGTAGCT
GGCACAAGTATCCATCCGCTACATATATCCATCCGACCATCCGCTACATATAAGGACATC
TCCTACGTGGCTGCTCAATTGCCCCGGACCAGTCCGTTTTGAGCAGGCTGGGCCAAAACC
AGGCCCCTATGGGGCTGCTCATACGGACAACAGTCCGTGGATGCTCAAACCCAGACCAAA
TTTGGTCCAGATTTGAGCAGCCCGCGGACAACAAAGTGTCATGTTTTCTCCCTCCCCTGG
CCCGCCACAGAGCGACCCCTCCTTCCACCTCGCG