Map Locations of contig_64584 (9162 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_64584

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73858 1 4942 bp MLOC_73858.1 Available Available LOC_Os01g66500.1, FRAME:+2, EVALUE:0.0, 13101.m07198 protein phosphoribosylformylglycinamidine synthase, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_73858






Contig Sequence (9162 bp)

>contig_64584 9162 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
CCACCAGCACCTCATCCAACAGCAGTGGCGGCGCGAGCTGAGCGGCGATCCAGACCAAAA
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GTGGACTTGTAAGCCCTCGCTACTCCTCCTCTTCTTCCTCCCCCTCGTCCTCTAATTTCT
AGGGTTCTTAATTCGTTTCTTGCATAATGACTTCTGATTGTTGGGATTAACCGAATAGAC
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GTGTCTGTGTGCGTTCTCGTTATGTTCTTGTGTCCGTGCTTGCTGGCTGCTGCGGGACAT
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AGTCCCTTGAAGGCTAACCCTAATAACTCTATTATTGGGTTCAAGGATAACTCGAGTGCA
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GGTGCTTGTGCCATTGGAGAACAACCAATAAAGGGTTTACTTAATCCTGAGGCAATGGCA
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ATGTATGATGCTGCTGTCGCAATGGCTGACTGCATGATTCAACTTGGTATTGCAATTGAT
GGAGGAAAGGATAGCCTTTCTATGGCAGCGCAATGTGATGGCGAGCTAGTCAAAGCTCCA
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GATCTAAAGCTTGTGAAGGACGGGGTTCTGTTGCATGTTGACCTGGCTAAAGGAAAGCGA
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ATAGAAGACGTCCCTTACTTGAAAAAGGTCTTTGAGGGTGTTCAAGAATTGCTCAGCGAA
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GCTGCTGGTTTTGAACCGTGGGACATCACAATGTCGGATCTCTTGAACCAAAAGGCTTCT
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TCAGCAAAAGGTTGGGCTGCATCTATCAGGTTCAACCAGCCCCTCATACAGCAGTTCCAG
GAGTTCTACAATAGGCCAGACACATTCAGCCTTGGGGTGTGCAATGGGTGTCAGCTAATG
GCTCTTCTTGGTTGGGTACCAGGACCAGATGTTGGAGGCTCGCTTGGTGCAGGTGGAGAC
ATGTCCCAGCCAAGGTTCACTCACAATGAATCTGGCCGTTTTGAATGCCGGTTTATCAGT
GTGGCCATAGGAGATTCTCCTTCTATAATGTTCAGAGGTATGGAAGGCTCTACTTTAGGC
ATTTGGAGTGCTCATGGTGAAGGGAGAGCCTTCTTCCCAGATGAAAATGTCTTATCTCAT
GTTGTGAATTCAAATCTGGCCCCTCTGAGGTACTGCGATGATGCTAATAACGTCACAGAG
GTCTATCCTTTCAACCCTAATGGCTCTCCGCTTGGTATTGCGGCCCTTTGCTCCCCTAAT
GGAAGGCACCTTGCTCTGATGCCACACCCGGAGCGTTCATTTATGATGTGGCAATACCCA
TGGTATCCCAAGGAGTGGCAGGTTGAGAAGGGTGGTCCCAGTCCTTGGTTGCGCATGTTC
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CTTTTTTTTGGCTCCCTGTATTTATTTATTTTTGCTTATGGTTCCCTATAGTTAGATCTC
TGGCTAGCCCGTTAACTAGGCACAGTTTGTTGCTCTCGTCTGCATCTGAACCACTCATTC
TGTAAATGGCATTCTTGTTGTTGTATGTTTCTGGTAACTCTCCTCGTAGCTTCATCTCTA
TTATACTAGTACCGTGCTAGCTTGAACACCACTTTGTGCTTGAATTTTGTTATTTGACGC
AGTGATAATTATTAGGCATCCAGGATCTCTCATGTTCTAGCTCAGTGCTTCACTGTAATA
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ATAAATTCCAAGCGGCCACTGCCATGAAATAAATATTAGCTTACCCTTTCTATCCTGGAA
CTTACAGGGGCCAAATTGGTGTCTGCTTGGGCATTCTGCTGTAGAACTGAACTGGCGTGG
CCATGGATCGACTGAATATTATGTCTGAAATTATCGCGTGGGAAGAACTCGAGTAACAGG
CAGCAGTTCTCAGTTCTTGAGTTGAGATGGAATGTTTCTGCTACTTATTCTCAATGGACA
GTTCCTGTATTGGCGCTGCCTGTGTGCGAGCATGGTCATGTTTCACTAGTTAGCTGAGTT
GAGCTGAGCTATATGATTCTTCTGCAATTATTCACCTGTATCCAATAATAATGATATGAT
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ATCCATTTTGTAGTATTACAGAGAAATGCACCATGTTGCCCGTTACATATTCGGGATTAT
GTTTTCAGTTTGGCGTAACCTCAAGCGGGTGATAACACTTGACAGGGTGGACAATAGCTA
GAACTCTTGGATTCATGGAATTGAGGAAGAAGATCTTAACAGCATCTATAACGGGCGCCT
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GGAAAAAAAAATGACCCAACCAGATCATTGTATTATTCTTATATGTTTGTGTTGTTCGCG
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GCCTAGCCTAAAATGGCTATCAATGGTTGTTCCCCATGTCCGGTCAGCCATGAGCCCCAC
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GTGTTGACAGCCTCCCATGTGTTGCTCTTCCTCGCTGTCGGTAGTGGTCGCGAAAATGTC
GGCTTCGTGGTCGTGCCGGCGTGGCGCGAACAATCTCGCATCGTTGCCGTGCAAGCAGGC
AGACGGGGGCACGGACATGCTGGCATTGTCGTCGTGTCGGCGAGGTGCCGAGGAGCTAGT
GACGTCGTCCTCGTCCTTGCCATAGACTCCATCTCCCGCCTCGTCGAACTCCTTGAAGGC
GGCTTCTAACTCTGCCCGATGGACGCGATACTGTGAGCGGTTGTGGTGGATTTCTTGGGC
AGCCTCCTACTTGCCCACATCCACATCTGGCATGATGGTCGTTCCGACGGTGAGTTGCTC
CTTCGCACCCGGGTGCTCGTCGAGGAGGCGAAGGTTGTACACGTGGTCCGCGTGCGCCCG
CCGCTCTTCCAACACCATCTCGGTTTAGTGAGCGCGGGCCTCACCGATGGTGATGTCGGC
ATTGGTCGGCGAGGACGGGGGTGTCAGTTTGTCATCGATAGCCTCTTCCATTGGCGTGTC
TGCCTCCGTCTAACAACCGGAAGCAATGGCGGTGATCTTCGCCTTTTGCTCGGGCGAGAG
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