Map Locations of contig_64537 (4964 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012
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Predicted Genes from contig_64537

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73838 1 950 bp None Available Available LOC_Os04g42000.1, FRAME:+3, EVALUE:5e-27, 13104.m04132 protein 6,7-dimethyl-8-ribityllumazine synthase, chloroplast precursor, putative, expressed
MLOC_73839 2 1012 bp MLOC_73839.2 Available Available LOC_Os12g32210.2, FRAME:+3, EVALUE:2e-29, 13112.m03285 protein autophagy-related protein 10, putative, expressed





CDS Structure of MLOC_73838






CDS Structure of MLOC_73839






Contig Sequence (4964 bp)

>contig_64537 4964 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAGTCTTCTTTGTATCTTTGTCAGATATTAGATCTCAAAAGTTGAAGACACCAGCATACT
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TTAGGCCAGGGCCACCATGGTGTGCGCACCGTGGCGAGTAGCTAGGAGCTGCACGACCGA
GACTCATGGATCGTGGACGTGGGATGGCACGTCGGAATCAGTCGTGGGAGATCGCGTGAT
CAGCGTTTGCTTTCGCATGAAATAAAACGGCAAGAAGGCCGGATAGAAAAGCTACAAGTT
CACGCAGCACAAAACCTCGCTCTCTCTCGGTCGCGTTCGATCTCAACAAGTGGCATCAGA
GCCCGATCACTCGATCCAGCGACCATGTCTGCCGATGAGCGCGGCAGCGCCCGCTCGCCG
GCCAGGTCCCTGACTCCTCCATTGCTGCGACGGGGAAGGAGTAGGACCAGGCGCAGCGGC
CGCGCCGTGGGGCGGGATAACTTCGTATAGTATAAATTATACGA