| Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|---|
 |
No map location | No map location |
Predicted Genes from contig_64484
| Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
|---|
| MLOC_73815 |
3 |
2293 bp |
MLOC_73815.3 |
Available |
Available |
LOC_Os07g35310.1, FRAME:+1, EVALUE:0.0, 13107.m03609 protein TKL_IRAK_DUF26-lc.12 - DUF26 kinases have homology to DUF26 containing loci, expressed |
CDS Structure of MLOC_73815
Contig Sequence (8309 bp)
>contig_64484 8309 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAAAGTTGCATACACGTTCGTCATAGTTGCAACCCGAGTTCACTAGATTGTTTTGTTAC
AACCTTTTTTTTGTTTTGCTATCACGCATCATCAGCTTCGTTTCTTTGCTACGATCACGT
AGATATTTTTATTGCTACAACTATATTTTTATTATAATCGTTGACAAAAATTGCTGTATC
GTAGATAAAATTTATTACATAAAAAATGCTGTATGAAGATCTAATGACACGGTCCGCATA
CAGCTAACGGATCGGGCGGCCGCGGCCGGTCGTAACGATTCGGCGGGCGTCACAGCATTG
CCGTTCGCTTAAATACTTTTCTTGAGTCAAAGCCAAGGGGCAAAGTGGGGGCTAAAGTGT
CCGACGGTCAAATTTAATTCGGCCTACAAAAGCCACCACCAAGTCGCCCGTTCCAGTTCC
ACCACCATCCGTGGCAGAGTAGGCTAGTAGCATGGCTCACCACCAGGTCCTGTCTGTGGT
CATCGTCGCCGCCGCGCTGCTCGCTTCCCCCGCCGCGGGAGTATACCCGTGGACAATATG
CGGCCTGAGCACCTACGCTGCCAAGAGCCAGTACCTGGCCAACATCAACCGCATCGGCGC
GACGCTTCCCAGGAACGCCTCCCAGTCACCGGACCTGTTCGCCACGGCCCTGGTCGGCGC
CGTCCCTCAGCAAGTCTGGGCCCTGGCGCTCTGCCGCGGCGACGCCAACGCCTCCTACTG
CTTCACCTGCCTCGACCAGGCCTTCCAGGACCTGCCCAACGCCTGTCCCTACAGCCGGGA
CAGCACCATCTACTACGACTCCTGCGTGCTCCACTACTCCAACATCCAGTCCCGCCCCGA
CGACGACACCACCTACAACCCCACGCGCCCGCTCCGCAACAACTTCAACGCCACGGCCGA
GCCGGCCCGGTTCCAGAGCGTCGTCGCCGCGCTCCTCAACGCCACCGTCAACTACGCCGT
CACCAACTCCACGCGGCTCTATGCGTCCGGGGAGGCCGACTTCGACCGGGAGCTCCCTAA
GGTGTACGCTTGGGCGCAGTGCACGCCTGACCTTTCGCCGGAGAGGTGCCGGGATTGCCT
CGCCATGAACATCAAGACGTCGGCGCCTCTGTTCACGGACGCCATCGGGGCCAGGATTCT
TGGGATGAGGTGCAGCTACCGCTACGAAACGACGCCCTTCTTCAATGGCCCGGTGATGGT
GCGGCTGGCAGGAACGTCGCCCAGCTCTGGCGCACCGGCGTCGGCGCCGGCCATGGTTCC
CAACGTTTTGACACCACCGGCGGCGGCAGGAGAAGGTGAGTCAAAGTCAAAGTTTGTTTA
ATTCTTTGGGCCACTGTGAGAACTGACAGTGACAACACATCACCCATCTATCGCAACTTG
CATTTGGTGCGAGACGCCAGCAGCCCAGCATAGTTCTAGACCACTTGCATAACGAAATCA
AAATACCCGAGCCGCACATTGTTTTGATACTGTTCTGTTCGCCTTCCAGAATTCGAAATA
AAAGTATTTTTTTTGGGATTGCCTGCAACTCTCAGCCGGCTGAGACACAGGTATGGTGTC
AGTCGGCTGACGTCACCTGTCGTATTTTTTAATTTGAATAGGAATTTTTAGGTGGTCAGC
AACCTGCTCGTTTCTTTCCATTTTTATCCGTTGTGTCTTGTCTCGTGGGCGTTGTCTAAT
TATGGGCCTGGTCGTAGGTTTTTTTACTAGGTCAAGCTTCCTTCCGTTGGTTGACACTCT
GATGCAAATGTTTCCTGTGAGAAAACATTAGAGTTGGGTCGTGTGGATGTGTATGCAGAG
TATTTATAGTGTGTCAAGTAATTTATGTTGAAATTGAAATCATGAAATTCAAAGTTCAAA
ATTTCAAAATGATATGTTCAAATTGTGCCCTTTTTAAATCATAATTTTAGAAATAAATAT
CCTTGAATTTGTTCATAAAATATCATGATTAAAAGGATGGATTTTTAAAGGATTTTTTAA
AAAAAATCCTCATGAGATTAACAATTGCAAAAAGGTGAAAAAAGTTGCGAGTATAAAACA
ATATTCACAAATTTAAGAAATGTTCATCGTAGTTGTAATCGGCTAAAATATGATTTACAA
CTACGATTCCGGCTTAGAAAAATGCAATTACAACCCACCTTAAAAACATGCAACTGCGAC
CTCCTTTGAAAACATGCAGTGCGACCCCGCCTTACAAACATGTAGTTGAGACCCACCTTC
GAAACATGCAACCCCTCTTGGAAACATGCAGTCGCGACCCCGCCTTAGAAACATGCAGTT
ACGACCCTACCTTAAAAACATGCAGTTACGACCTTGCCTTAAAACATGCAGTTGCGACCC
TGTCTTAAAAACATGCAATTGCGACCCCGTCTTTGAAACATGCAGTTGCGACCCTGCCTT
AAAAACATGCAGTTATGACCTTGCCTTAAAACATGCATTTGCGAGCCTGCCTTAAAAACA
TGCAACCGCGACCCCGTATTTGAAACATGCAGTTGCGACCCTGTCTTAAAAACATGCAGT
TACGACCCCGTCCTAGTAACATGCAGTTGCGATCTTGCCTTAAAAACATGTAGTTGCGAC
CCCGTCTTAAAAACATGCAGTTGCGACCTTGCTTTAAAAACATACAGTTGCGACCCCGTC
TTAGAAACATGCAGTTGCGACCTTGCCTTAAAAACACAGTTGCAACCCCGCCTTAGAAAC
ATGCAGTTGCGACCTTGCCTTAAAAACGTGCAGTTACAACCCCACCTTAAAAACATGCAC
TTGTGACCCCTCTTGAAAACATACAGTTACGACCCCGCGTTAAAAATATGCAGTTGCGAC
CCACCTTAGAAACGTATAATTGTGACACCTTTTGAAAACATACAGTTGCGACTCCGTCTA
AAAACATGCAGTTACGGCCCCGCTTTAAAAAATATGTAATTACGTCCTACCTTAGAAACA
TACAGTTGCGCCCCCTCTTGAAAAACCTAAGAAATCAATTTAAAATCACAAGTAACAAAT
GAATATTAATCTAAAACAAAATAAATATACTGAAGTTGATAAAAAGGGAAAATAGTGAAA
CAATGTTCTACTATATATATAGTGAAATAAGAAAAAAATATAGATCTTCAACAAATGGCC
CCGCTTTCAATGCGGGTCGAAGCCAGCAAAAACAAAAAACAGTAATTAATCATGAAAAAA
TTGTTTTAAAAATTTATTACAATGATCTTACCCTTTCACCTGCAAAAAAAAAAAGAGCTT
GTCCCTAGAAGCTATATAGTGAACAGATGACAACACATGCAAAAAGCAAGCAACGTTCCT
TGGACCCTCATCTCCCCTTTTCGGCCGGGTAAAAAAAAGAATAAGAAAGCCCACATATTT
TAGCTCAGGCAAAAGAGCAAAGGCTCGGCTTAAACTCATACATGGACAGTTGCTCGTACG
AGACGAACCAGGCACCCAACAGCTCCCGAGATAATAATAAAAAAAATGAATCTAGCAAAT
ATGGGAGGTGAAAAGTGATTGAGACCATAGTTGAAACTCAGCTCAGCAAAACCGATTCTT
TTAAGAGAATAGAACCTTTTCATTAGCTTTTGCCTCTCCATCAATGTGGAAAACTCATTT
ATTGCAATCACAAAACGAAGACCAACATTTCTTCTTGCAAGTCCAGCTCGACACTTCAGT
AACCTTATATGTTTCTCCCGTTCAGATTTGCAAATCTCGGCTGACCTGATATTTGTCATC
TTGAATTGGTTAATTCACAGGGAGAAAGTACAGTGTTCCTGGCATGGTTCTTATAGTTCT
TCTACCTACCGCAGCAGCCATAAACATTGTGGTTTGCTTCCTTCTCTGGAGGAGGCGGCG
GCCACTGGCAGAAGCAAAGCAGCCATGTATGCCCTGCAAAATTCTCAAACTGATGACGCG
TAACAATTCATGGGGCCTAGAATGACATAACTGTAAACTGACCCCATTGTGGTGACAAAC
GTCACTGATGTTTAAACAGATACAGGTTATTCTGGCGAGGCCGAGGACATTGAAAGTGTG
GACTCGATGCTGATCGACATTTCAACTTTACGAGCTGCAACCGGGGATTTTGCGGAAGCC
AACAAGCTTGGCGAAGGTGGATTCGGTGCGGTGTACAAGGTGCCAAGCGCCGGACATATC
TTGAATAAAACTTGTAAAATACATCAAAAAATTTGTGAGCTTAGTCGTCTTGGTTTGATT
TGCGCAGGGTACTCTCCCAGACGGCGAAGAAATAGCAGTGAAGAGACTGTCGAAAAGCTC
AACACAAGGAGTGAAGGAGCTGAAGAATGAACTCGCCTTGGTTGCCAAGCTTAAGCACAA
GAACCTCGTCAGGCTTGTCGGCGTCTGCCTGGAGCACGAGGAGAGGCTGCTCGTCTACGA
GTTCGTCCCAAACCGGAGCCTCGATAAGATCCTATTCGGTACTGACATAATTCTTTCATC
ACATTTGTTTCAGTTCCTATCTCCATGTTCTCTGCAACTTGTGGTGCCACTGCGTATTTG
CATACACTGACCATTGCTAATCTCTGAACATTGTCGTAGACACAGAGAAACGCGAGCAAC
TTGATTGGGGAAAGAGGTACAAGATCATAAACGGGATCGCTCGAGGCCTGCAGTACCTCC
ACGAAGATTCCCAGCTCAAAGTCGTCCACCGTGACCTCAAAGCCAGCAATATCTTGCTAG
ACACCAACATGAACCCCAAGATCTCGGACTTCGGCCTCGCCAGGCTCTTCGGGCGAGACC
AGACGCAGGCCGTCACCAGCCGAGTCGTTGGAACATAGTCAGTACCATGCCATACATATC
AAAAATTTGGTGAGCTTAGTCGTCCGATCGCGCAGAGAAACTAATTGAATTACCACCATG
TTGTTCCAGTGGGTACATGGCGCCGGAGTACGTGATGCGCGGGAACTACTCTGTGAAGTC
GGACGCGTTCAGCTTCGGGGTCATGGTGCTGGAGATCGTGACGGGGAGGAAGAACAACGA
CTGCTACAACTCCCAGCAGTCTGAAGATCTATTAACCACGGTACGTGATGTTCCTCTGTA
TCTGAATGAATGTATGTATGTACGAAGAATGTTGAGCTCATGGCTGCTGCGAATGGCGCA
GATATGGGAGCACTGGACGGCCGGAACAGTGCTGGCTACGATGGACCCGAGCATCGGCAG
CAGCTTCTCGGAGAGCGACGTCCGAAGGTGCGTCCACGTAGGGCTTCTGTGCGTTCAGGG
GAACCCGGCGGAAAGGCCGGTGATGTCGTCGGTGGTCATGATGCTCGGAGGCGAAACAGT
CTCTCTCAGCGCCCCGTCCAAGCCGGCGTTCTATGCAAGGAACGCCGGTGCCGATCACTC
GGTCGTCATCGCGTCCACCGTGTCCACCGTGTCCTTGCAGGATGGTCCTGCTTAGCAAGT
TCAGTTTGCAGATTAATGGATGCCTCGCGCTTAAGGGCATGTAAAGAAACCTTATTTTCT
TTAAAAAAAGAAGAAAAGGAGGACCACTCTGCGTAGGTGATACACACATTCTGTGAAGAT
GTACTTCATTGAAAAAAAAAGATTGAGAGATGTCTTTCAATGCAATGTTGCTCTGGTGCA
GCATACCACGACCTTTTGCAAGAATCATTTTGTTCATGTGCCAACGTAAATTAGCATTGC
CATAAAGTCAATGAAAACATTGGACGCTATTTTAAAACGAAGAAGGTATTAAGTCAAGGA
GACTCTATATCCCACTATTATTCAATCTAGTGATGGATACGTTGGCCATTACGATTGACC
GGGCTAAGCAAGATGGACAGATTAAAGGGGTAGTCCCACATCTGGTTGATGGTGGACTAT
CAATCCTTCAATATACACACGCTACGAGTCTTTTTATGGAACACGACCTGGAGAAAGCAA
CCAATCTGAAATTAATATTATCAGCTTTCGAATAGTTATCGGGATTAAAAATTAATTTCC
ATCAAAGTGAATTGTTCTGCTTTGGCGAGGCTCAGGACGCAGCTGTTCAATATGCTGAGC
TATTTGGATGTGAGCAAGGACGATTTCCTATCAAGTATTTGGGTATACCAATACATTATA
GGACATTAACACATGCCGAATGGAAACACGTCGAAGAGCGTCTGCAAAAAAGACTTGCGA
GTTGGAAAGGAAAATTGCCATCCCGGAAGGAAGACACGTTCTCATAAATTTAGTACTCAC
TAATACGGTACTTTATATGATATCTTTCTTCTAACTACCCAAAGGAGTTCTGCAAAGATT
AGAGTATTTTCGATCGAGATTCTTTTGGCAAGGGGATAGTGAGAAAAAGAAGTATCGACT
GGCTAAATGGAACGTCGTATGCCGACCAAAAGACCAGGGAGGACTGAGGATACATGACCT
GCAGGTTAAGAACTCAACCCTCTTGGGTAAGTGGTTGTTTAAGCTACTTACGAAGGATGA
TGTCTGACAAACACTCCTTAAACGAAAATACATAGGCACAAAACCGCTATCACAAGTCCA
GTGGAGACCTGGTGACTCACATTTTTGAGGTGGCCTAATGGCGACTAAGAATCATTTCTT
TCGCTTTGGGGTATTTAAGATTAAGGATGATTCGGAAATTAGATTCTGGGAGGCCAAGGG
GTTATGGAATACCACCCTCCGAGAACAATATCTGGCTCTATATAATATTGTGCGACAAAA
AGGTGCTACACTTGCTTCCGTTATACAAGTTTCGCCACCGGTCCTGACTTTCAAAAGAGA
CTTAATTATTACGAGACTACAGTCTTGGAATGACTTGTTGGGACGCCTGGCCTCGGTTCA
GCTGTCACAAGGTTCCGATGAGTTCCATTGGAATCTATGTGAGAATGAGAAATTCTCAGT
GGACTCCATGTATAGGGCGCTGGCACAGGCTGAAGTGCCAGTCGATAATAACAAAAAAAT
ATGGCGCATGAAGGATTCATAAAACTAAAGATATTTATGTAGTACCTTCGGAAAGGGGTC
ATTTTAACTAAAGATAACCTTGTCAAGCGGAACTGTCATGGCAAAACGAAGTGTGTATTC
TATCCTCAAGAAGAGACAATAAAACACTTATTCTTTGATTGCCAGTTTGCACGATCTATT
TGGTCAGCTATCCATATGGCTTCCAACTTGTATCCACCTACTTCAGTTGCCAATGTTTTT
GGTAACTGGTTATTCGGGATTGATACTAAGTTTAGAACCATTTTAAGGGTAGGAGCGCTT
GTCGTTATATGGTCGTTATGGCTCAGTAGAAATGATAAGGTTTTTAACGGTAAAAACTAC
TCTCGTCTACAGGTTACCTTCTGATGCACATGTATTCTCCGTTCGTGGTTCACATTACAA
CGGACGGAGTTTCGAGACCTTTTTACACAACTTCTGTGCGATTGGAGAAAGTGGTGAGGG
ATATTTTTATCCCACATGGATGGCAGCGTGATCTCCGAATAAGTCCTTCATACGCGACTA
CGATTTACTCTTACATGATTGTATTACGTCGGTTGTTGTTTCACTATCTTTTGTTGTTGT
TTTAACTGTCGATGTGTGCATCCTAGTTATGCATAGGCCAGGTCTAATGCTTAAACTTTT
AAGTAATAAAATCCCTTTATAAAAAAGAGAGCATCTAGGACATTACAAACATCACCCGCT
AAACATTCGCGGATGCGTCCGGTCAGTGACCGAAAGTGACTTCTATTTATTCGTTCGTGC
AGATGTATTTTTTATTTTTGTCCTCATATGGTGGGTCATTTGCACGTATTGATGAACAGA
AAGAGAGAGAGAGAAAATAATAATAATAATAAAAAGTGATCCGTGATGGGATCATGTCCT
ATGTGATGGAGTGACAGAACGCGTCCGCGAGCCCTCGTATCCTCTCCATATTTGAGATAG
ATATGAGGGTTTTGCGGTGACCCAGGCGTATAAGGTTCATACGAGGGATTTGGTTGGGTC
ATCTTTTTTCTTTATGTCTGGTCACTGATCGAGCCCGTCCGCAAGTGTATGAGGTGTTAT
TTGAGGGGTCTGCCTGTAAATGCTTTTAGTAAGATATTTTTTAATGCTAGAATTCCGTGA
AGAACCCTCCAACAGAAAATCTGAATTTTCTTATAAATCTTCAGCTCCCACATCTTCAGC
TCCCATAAAAAAAATACAATATCATTTATTGGCTTCTCAAACCAATCTCTAGTTGGATGA
AAGTTTCGCACGCTGGTTGTAATGGGTAGTATCATATACTAGTATCATGCATATTATACT
AGTCTATGATACCACATTCGTAATGCATAGTATNATATGTTAGTATCATAGAGTAGTTCA
TTTATTGCCATACAAGACACATAGTAGCA
