Map Locations of contig_64116 (4840 bp)

Morex x Barke POPSEQ 2013Oregon Wolfe POPSEQ 2013Morex Genome Release 2012




Predicted Genes from contig_64116

Gene ID# CDS PredictedMax CDS LengthProbes in ClusterFPKM by TreatmentFPKM by ReplicateTop Rice Hit
MLOC_73669 1 203 bp MLOC_73669.1 Available Available None





CDS Structure of MLOC_73669






Contig Sequence (4840 bp)

>contig_64116 4840 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
TAGTATTTTAGAAAAATGATTTGATACAATTTTGAAACAAATATATGNNAGGTCCTTCAC
AAAAAAAATCATTTCCGACACTTGAAAAATGGAAAATGAATTTTTCATACAAGGAAAATG
AAAACTCCCTTAATCAACATTGTTTGTCATTCCAACATGCACACTTGTGCAAAATATTAG
ATCGTTTCAACAAACTATGGCATGAATCTGGCCATGAGATTGATCATTTGGTTCAAAAGC
CATGAATGTGGCATGCCCATTCCTAGCTAGTTGTTCGATCTTGGAAATTTTTTGATGTTT
CTATGATTAAATAGATACTTTTGTACCGAGAAAAGATTTTTGCAAAAAATGAAAAGCAAT
CTATGAGGCAGGTGCAGTTCAAATTCGACCCGGTTCCTGCTGAATCGGGAGAAATTTGTC
TTTTACACGAGAGGTGTCTCACAACTTTTTACATCCAACCATTTAGTCGATTGTATATTA
AATATTACCTAATATTTTAGAAAAATGATTTGGTCCAATTTTGCAACAATTATTTGATAG
GTTATTCACAAAACCCCTTACTTTTTAGCACTTAGAAGTTTTTAAGTGACACATTTCTCT
AACCAATGAGGATGCAGTATCACTCTCCCACGGATCACCCTACCGAAGGCATCTGAGCCG
TCCACGTCCTACAGATCCAACGTCTCCTCCCTCTCCTACCTAAACCTAGCGCACGAAACA
CCCGCCTCCTTACGTACCGCCGCCCTCTCTCTCCCTCTCCCAGATCCAGATCGAGGCCAC
CGACACCTCCGGTGCCCACACCCCTTGTGTCTATCCTCTCCCTCCGCCTCCGATGCGGCC
GTCTCCTGCCTAGTCCTCGTCCTTCTATGTCTCCTCATCCGCCCAGTCCTCGTCCTTCGC
TGCGGCCTGCATGCTGGAGGAAGCTGGCGGCTAGGACGGCCACAGAGCAGAGGGAGGTTG
CGGCACACACGCAGGGTGAGGACCATGCGCGATCGATCAACACCACCAGCGGGAGGTTTC
ATCCTCCCCCCGACTCGACGCAGCAGCCAATGCAGGAGGCCGGCAGCATGGAAGGGAGCA
CGATTGGAGGCAGATCCGGTGGGGACTTCACTGGATCCGGCCAGGGCGGACCGGATCCCG
ACGTCGCGGCTCCATTTCTGGCGCGAGAGAATAGTTCCCGGCGACGAACTCACGGATGGA
CAGTCGTAGCTGGCGGCTCGCATTCATGGCGTTAGGACGACTGCTCGGGATAGAAGCGCA
CGGGCGCGACGAGGAGAGGGGCACGGGCAAGGGGCGACCAGCCTGGCTGGCTCTCGTCAC
GGATCTGCAGGAGGCCATCCAAGCCAAGAGTACGTCTAGTCACCTATCTCCTCCTTCTCG
CCAATGCCTTCTGCCTCTAGATTTGAGTTTGAATCTGGAAAACACTAGTGCCCGCGACCG
CAATTCAGTCACTGTGTTGACCGGATGAGTTCACCCGGATGCTGACTTGGTAAACGCGTC
AGTGAACAAGTAGATATGCTGAATGTTAGCACCGTGTTTGGTTCATAATAGCACAGTTTG
ACAGCCACATCACTGCAAGGGCTGCTGTTTCAGTAGGTGTTTTGCTCTCCTTGATTGCTT
GCTTGACCTCATCTGGTAGGGCTCCTTTTGGCTGGTGCAAGTTGTTAGGATCCTGTCTAG
GTAGGAGGGAGTTAGCCGTCCACATCTATATATGCACTCATAATCTCCATGATTCTTTTT
CTTTCTTTAAATATAAAAAACACTTTTATGCGAGTATTTCAGTTAATTACAGTCCTTCCG
GAGAAGAAGTTACAGAAGGATAACTGAATCAGAGCACAGAACGTGGGTAGGTGTTGTTTG
GAGATCAATTTGGCTAATATTTTTCACAGTTTCAACTGTGCGTTTCAAAGAACAGTCATG
AACTACAGTGAAAAACATGTCGTGGCTCCCTTGGAAAAGAATTAAGTTGCTGTTGCAACC
TAATTATGTTTATTCATAATCTATTGGAAGCTACTTGATCTCAAATTGCAACACGGATAC
CTTTAATACGAGAAGTACATAAAATGTAGCAGCAAGTCTCTCACAAACTCTCAAAAAGTT
CTATATCGACATATCACTCACATTTAACTTTGCGTGAGCGGGAATACATTTTGTGATTGT
GATTGTGATGGATATGGTGTCTGTGGTTGCTAGGAAGTTGTGGACCCTGAAGTCCAAGAA
GGCGGTGACGGTGCAGCGGAAGGCCAACCCCTCTTGCAGGATCTGGTTTGTCTGCAAAGG
AAACCTCATCTGCACTAGGTACGCATATGTGGCCGCAGGGATGGATGCCTTCCCCTATAC
TCTTGATCCATATAAAGAACATCCACAAGGGCAAGGATGGGAGCAGGCTGAACTTTGTAG
TGCCAAAACTGGTCTGAATGCTCTCAATTCAACTTTAATTTCCAAGGCTTGATTTAACTG
TGCCTTGGTTCGGCCTAAGTATAGTTGGCTGAATCTGTGTGTTTCCTAATTGTAACAATA
TGTGTAGTTTAGGATTGTTGGCATTCAGAAGCTCCTGCTTGTTTCCATTATGACTAGTTC
TTCACATGAAATTTCTACTAATTCATAGTTCATGAAATATAACTGATGCTAATATCAAGT
TGTTGCCGAGAAGAAGGCAATGTCTCTTACATATGTATTTGTGCTAACTTACTACAAACT
GCTAAATGTTGAATAGTGAGTTATCATTCTCTTAAAAAAGAGAGTGCATTTTGGATGTGA
GTCTTTTATCAGCTAGTGCCACTTTCAACAACTTTTTGTTGATTTTGCTGAATCGATTAC
TTATTTTTCCGGAATATACTAAAGTCAGGGAGTTTTGCATGGCTGATACTAGTAATGTAG
TTCGATTTTGAGTTGTGTGGAATCTGAAACTGTTGTTTTTTGCTTTGGTTCTGATTCGCT
TTGTTGTCGATGTTTCTGTGCGAGCGCAGGCTCGTGGTGAAGAACTGCAAGGCCGAGCAG
GACCTTTCGGGGGTTTCTTAGCAGGCAAGCTACTTGTAATGAACTATTTGTAATGCTAAT
AGTTTGTGTCTTAAACCCGTTCGTGGGCCTTTCGGGGGTTTCTTAGCAGGCAAGCTACTT
GTAATGAACTATTTGTAATGCTAATAGTTTGTGTCTTAAACCCGTTCGTGGGCCTTTCGG
GGGTTTCTTAGCAGGCAAGCACTGCACACTGCAGATGAGCTTCTTCGTGCTTGCATTCTG
CAGCAACTTATTTTCATTCAACATTTTAGATAAACTGGTTCAACATTTTACATGAATTTT
TTTTGAATCATTTTTTGATTGTAGTAGTTGGTCCAATTGGACTTGTACTCTTAATTAGTA
CTATTATTAAACTACCAAGGGTTTTATGTTGTAGCTAATCAACTTGTACTTCCCAACTTG
TGTAATGCACGGTGCGGCTGTATTCTCTAGTTTAGCTTGTAGGTTGTGCTTTGGGAGTTT
GGTAGGCCCATCGCTAGTTTAATGTGCTGCTGTTGTAGCCTGAATTTGCTCTGTTTGGCA
TTTTGGTTAGTCTTAGTTGTCAAGTTTGAACACTCATGTTTAGCTTGATGACTTTTAATA
TTGTGAATATGAAAATTCAGAGGTTGTACTGAAGTTCCATGCATTTTATTCTGTGTCCTG
AGCTTACCTTTGTATCTCCGGATTTTTTATTCATCTGTTACCCTTCCTTTCACTGTAGTT
TATCTTCGTACAGAAATCAATCATGGCATTCTTCCTATTTGCATTTTATTATGTTTTTAA
AATTCCCTAGCACAACTACATATAAGAATGTGGGTATGTGTTTTCTTATTTCAGTGTCTA
TAGGCATCTATGCATTTGCATGATGTTGAATTATGTGCTATGGAATATACATTAGATGAT
TTATACTGTTCTTCTTCTCGACTAATCAAATGTGCTTTGTTTTTTCAGTATGGATACCTA
GGTCAAGCTTGCGGTGGTGAAGGTGATGATATGGGTTTCCTATCTTCAGAAGTAAAATGT
TTGCTTGCTACCTTCTTTAGGGTACTGTTTTCTAATCAAATTGTTGAACACATGAGTTAT
TTATACAAATCATGTGCTATTTATGGTTACTCCACCTTCTTGATTACTTAGCTGAATTAT
GTTTTGTGTACTAAACAACATGTGTAGTATTTGGCTTCCATGTACAAACATGATAAGTAT
GTATACTTCTTTGAGGTTCAAATTCTACAGATGTTGCATAATATTGGTGTCAAAGTGCCT
CTCCTTAGGGATTGATTTAAACCGCGTATGAGCTACTAAAACAATTGTTTTGCTGTTCAA
ACATGAAATTCTAGTTCTTTGTTTCAAACATCGAAATGTTGTTTACCTTGTCCTTCTATG
CTTAAATGGTAAAAATTTCGCATTTATAGGATTGTACACCTGATGTGATCGGAGTAGGAT
TTACTTGCTGCTCACAATTACTACTTGTATTCACTGATTTCTATGCCTCATTTTGCTTGT
TTTACTCTCATTTACACAGACAAACTGCCTACAAGTTAGTGTGCTGTTAGATTTTCTTTT
ATTTTGTTCTTAACCATTTTGTCTGATAACTTGCAAATGTTTACCTTCATTCGCGTTTCA
TCGCAAGGTCTAGGACAAAGAAGTCAGGAGAAGCACAAAGTTCTTGATCATTGGAGCTAG
TTATTGTTTTGGTTTTTTAGTTGTGTTACCTGATGTGAACTAGTTTTGATTGTAAACCTG
ATGCGAACCATGTTTGATTGAAATGTGCCAAGTTTGGATATGTTTGATTGTATTCATGAT
GTGACAGAGGTTCAAGTTATAATGGTTGTTTGACATATTT