Morex x Barke POPSEQ 2013 | Oregon Wolfe POPSEQ 2013 | Morex Genome Release 2012 |
|
|
No map location |
Predicted Genes from contig_64057
Gene ID | # CDS Predicted | Max CDS Length | Probes in Cluster | FPKM by Treatment | FPKM by Replicate | Top Rice Hit |
---|
MLOC_73622 |
3 |
1457 bp |
None |
Available |
Available |
None |
CDS Structure of MLOC_73622
Contig Sequence (6827 bp)
>contig_64057 6827 assembly3_WGSMorex_rbca.fasta
AAAAACCACAGTTTTTCCAATACTGCAGTTTTAAAATCACAATTCTTAGAGGCAACCAAA
CACCTCACTGTAAATAAAACTATGATAATCTCNNAAACTGCAGTATTCTAAAAATACTAC
GAAAATTCTTCGTTATCAAACAGGGCCTACATCGGCATACATATCATGACGATCAAAACA
TACGATCTTGATGATATAAATCTTCTCCGGGCGGACGGACAAGATGCAAAAGCTGGAAAT
CGTCCAAATTCGTTTGCTGCCAAGTGTTCTCAAGTGTTAGTATAAAATTCAGCGTTTCAC
ATGCGACCATGTGTTGGTGTTAAGATAATTGGTTCTCTTCACGTTACTACTTGGAATATG
CCCACCTCTTCCCACATGCCGAATATCCGGTGTTTTGTGTAAGACGACACCCGCCGGCAC
CAATGCATTATTAGAAAAATCCTTGTTATTAGCTCAGGTAATATATGTACAATTAATATT
TAGCAGTAGCGCGGCTCTGGCTCACGCTACAGCTAAATAGCAGCAGCGTCGGTCTCTGCC
TACTAATCATACGTATTTTTTATATATTTATATATAATTATATATATTAATATAAAAACA
ATAAAAATATAGAAGAAACAATATTTAGATTTAACCATAGCGTTTTTTTACAAGGCGTGC
TACTAATAAATCTCTATCTATAAGATTTTTTCTATTAATGATGTCGTCTCGGGTACATAC
CAATATGTCGAGTATAATTAGTTTTTTTATACAAAAAAGTATAATTAGTTGGAATTTATA
TACTCTGTATCTATATATGTATATACTAATATAATAAAGAGTGAATTACAGAGATTCAAC
AAATCATATCCGTTCAACCACATCTATCCAATGGTTTAAGTTGCTTGGTGTTTAGCATTA
AACATGTTCAGCACCCTCCAATAATTAATATCATGTCTATTAGATGTCAGTATTAACCAA
ATAATATATCCTATCAACTGTTAACATGTAATTTATATCTTGTCTAATATTGATGTACAA
TAAAATTAATATCTTTTATAATATCAATATCAGCATTAACCAAGTAATTATATCCAACAT
AATATTAATATATAACTTATATCTTGCCTCTACTATTATGCAACAATATTAATATCTTGC
CTAACACTAACGTGCATTTCATGTACATAGTTACCGGTCTTTACAAAAATGAACAAGAAT
GTGAGATGGAACGAACCATTCTTAGCTATATACAACATTCATATTGTACAAATATTGTCA
ATATTTTGGATATGTGATTATAGTACTCCGTATTAATTGTCAGTTTTCTCGCTTTTTCTT
TATTTGTTGAAAAATTCGCCTTCAAGGTTATATCTCGTGATTCTCTTATATTATTTGTTC
CAACAGCCTGGCCGCACTTTGTTGTTGTTGTCTCCTGGATGCCTGCTTCTGAGAGTAGCG
ACCACAGTTCCATCCTCGTGCCCGGGGAAATCGGACTGATCAATTGTGCCTTGTTACCAA
AATGCTACTAGCCTCCATGTTTTGGGCCCTATCACATTTTTCTACTACTTGGTTTGTAAA
CCTCCACATTGGGATTAATTATTTGGTTGGTTTGGATGTGATGACTACCTTTCTAATTGT
TACTGATCTATCTTTATTTTCTCCTTGCTTGAGAAATAAAAAAAGATACGATTAAATTGC
ACCGCTGATATGAGATTAGACGTGTATGTATAATCTTGGCTTAGAGCATGGCTATAAGTC
AATTGTTGGTTATAAGATGTTGCCATGTTATTTATAGCCAATCTAATATCAAATATAATT
ATAAGTTCACTATAATAAGTACTTCCTCAGTCATGATTCACTGGTCCCCTCGTATTTTGA
TCATGATTTTAACTAATGAAATATAAGTTATATGTATAAAAATAATATTATTGAAAACTA
TACTCAAATACGAATTCAAGAAAGATATTTTTTGATGACATGCATTAATAAATTCTTAAT
CAAATATGTGGTCAAATTTTGACCCAACATATGATGAGAACTAATAAACGCCCAGAGAGA
TAGTACTACTTTGTTAAGCCATAGCTCACCTCACACTCTTGTAAAGTTTCTTGAAATCTC
TGTTACAACTGACTCTTAATATACAATCTACTTCTTTTCACTTTTGTATTATCTTTCTTT
CAAATCAATAAAAATATAATATTTAAATCTTTATAGCTCGTTTACGTCAGCTTATTATAC
TCACTCTTAAACTCAACTGACTCACTAAGGCACTAAAAGCTACAATATCTCCACAATTTT
AGCGATCAATGTATCTAGGTTCAACTAACATCACGTGTATACTCATTAAATACACTAACC
ACTTAATGATTTGTACTTAATCATCAAAAAACAATAGGAAGGTCCCCCGCAAAAAAAAGG
AAGGACTAGATGCACTTTCAGGGGGGGAAATCTAAATCGTATTTTCACGCACTTTTATTT
CCAGCTTATTTATATTGAAAATACAGGATACCTCAAACCATATTATCTACTTCCTCTGTC
CTGATTTAACTGACGTTTGTATACGAATTTGTACTAACTCACATCTGCCTCTGTGTCGAA
GGGTAGAGTACTAAGGCCATGTTTATTTAAAAACTCTTAGGACTTTTTTTAGTCTCAACT
AAAAAGTTCCTAGTCACTATATCTGTTTGTTTCCAGGGACTAAACAGGGACTAGAGGTCA
TTAAATGACATGAAAAAGACCATGTTACCCCTGACCATATTATTAAATAACACTTGTTCA
TAAGCAAATATTACAGAAGCAAAGAACACTTGTTCATAACAACCGAAATAATATATCATT
GTTGTTTCAACGACCACAACCCATCAGCGACCCAATCTCTAAATTGATTCATAGCAGCAC
TNNNNGTCTCATTGGTTGAATCATTTCTTGGAGTAGTCGTTAGCACAGACAATGGTACAT
AATTTTCATCTTGATCACACAAGTCAAAATCTATATCGGCTAGTTGACTTTGTCTAATAA
AATTGTGCAATGCAATGCAAACCACAATGATTTTTCTTTGTTTCTGTTGTGGATAACTAG
GTAAGTGAAACAAAATCCTCCACTTGTTCTTCAAGACTCCAAAACACCTCTCAATGACAT
TTCTAAGTGAAGAATGGCTGAAATTGAAGTGTTCCTTTTTTCCTCTAGGCATTGTGCCAT
CACGGTACTCTTGGAAATGATAGATTAAACCCTTGTATGGTGCAAGATAACCAGGTTTGT
TTGGGTATCCCGAGTCGACAAGATAGAACTTTCGAGGTGGTGGTTTTGGAAACTTTTCAC
CAAATCTGGATCGGGCATCATTGAAGACCCTCATGTCATGCACTGATCCTGGCCAACCGG
CTAGGAGAAATGTGAATCTGATATCAAAGTCACACACACACATCACATTCTGACTCTTCT
CCTTATGTATATTCCTATGATGGATAGAAGTGGCAACTGGTACCACAACTTGTATGTGTG
TCCCATCTATTGCTCCAATGCAATTGTCCATAAATGGTGAATATTTAGTACATCTTAGTT
TGGAATGCACAGTTTTGAATTGAGGATATGTTGGTTTGATGATCTCTTTTGATAGCTTGA
TTATAGATGCCAAAACCTTATCAAACTTCCTTACAATTGTGTCGAGTGACCTAACAAATC
TATTTTCTGCTTGTCTTAAAGATTGAGGGGAACCTACTATCCACAGAAACAGGCCTAGAG
ACTCAACTGATGACATTCTTTTGCTGGACTTCAACCATACGAATCAACAAGCACACTATG
CAATTTCTCAAACACTGGTGTGTGCATTCTAAACATGTTGTAACTGGAGGTTTTGTTGGC
TAGTGTTGTCATAACCCAATCATGCCTAGACTGTATTGCTACTCTTTTAGGTCCTTTGTT
ACAGTAATAGTCCAAGTAGTACATACCAACCATGCAAGCCATCTACAACATTCTTCTCTT
CCTTTTTTGGTGCATCAACAACATCGGTGCTTCATCATCACTACTGCTCTCATCAGCGAT
GCTGCCATCATCTGCACTGCTGCCATCATCCTGAAACATGCAAACATTAGTACAACTTTC
TTTATCATGCACCACCTCTTCACCCAACAAACATTATGAAACACACAAAATGCAATGATC
ATTTAACAAGGTCACACGCTACAGGTCCATTACATAGTTATATTAGAAAAAGAACACTAG
TACACTAGTACAACTTCTTCATCATGCACCACCTCTTCAACCAAGTCAGTCTAGCCTCAC
TACTTGAAATGTTCTGAAATATGACTCTGTTTTCCTCATCTGCAAACAGTTGAGTTGCCA
TGAAATACTCAACACTTGTTTCATCTGCACCACATTGAACTACCAACAATTCACAATGAG
CAATAAATTATTTAATGTTGTTTGATTTCTTCTCTTTTGCCTTGTCCTTTGCTTCCTGCC
TTTTGTTTGCATATTCAGTGATCATGTCATAAGTGTTCTCACTCTTCATATTATTGATCA
GCCCTGTCATTAGTTTCACTATTGGGCTCTTGTGTTTCTTGCCTGGGCTTGATGCTAACT
GTTCAGCGCCGCTGCTTCCCCTCTTCCTGCTGGTGGTGCTCATTGGACTCTCCTCATGTG
CATCATCGGTAGCAACATACTCTTCTTCCTCCTCTTCATCTATGGGCACATAAGTTGATG
ATCCATCAACTGCCACACCTTGGAATAGCTCTATAAGCATATCCAAATAATCAGGATTGC
CACCCTTGAATTTTCTGACATATGGTCTCTCTTGTAGCATTAGTTAGGTAATTAGGACAA
GGATAAATGTAGGAGTGTGAGCAATGCAACTGTAATTTGCAGAATAATATACCTTAATTT
TTTGTTCCACCACTCAGTTGAGGTTGTTATAACTCTGTCTCTAGTTCGACCACAACCTGT
TTGCTGCCCCAACCACACCCAAGCACTATATTAGTTTTTCAGTTTAGTTAAACAATTTTT
GAATTGCTTGGTACTATGGAGGAGTCCAGTGTGATGATAAAATTTTGTCTTCATATTCTT
TTAGGCTTTAGTTGTCCAAGTACCATTCACACAGTGCCCATCCCTAGCTTCCTCACAGGC
AATGTTACAAAAAAACAATAACATTCTTGTCTATCCAATCAGCCTTGGCAATGATTTTCT
AAACAAAAAGAAGATGAATTTGCACAACTCTTTTCCTTGTAGACAGAAAGCTGAATATGC
ATACGAACGAGAAATTTATACCTCTCCCATAGCCGTTGTCGTCTCCATCTTCAAAGCCTT
CGCTGTCGTCCGCATCTTCTGAAGGCGTAGGAGATGACGATGCTCGTTGCCGGCTTGCAA
CCTGAGAGATGGAAAAGCCCCGACGTGCGACGAGTCGAATGCCGGTCGATGAGGCACCAC
GGGCTCGGCCTACACCGCATCCAGTGCCCTGGGACACGGACCTCCCACGCCCTCTGACGC
CTCCGCCAATGGCAGTTGCGCCCGGGGGCGACGAATGGACGCATGTGAGCGGCTCACAGA
CCAGGTCAGGCCTCCTCTTCCCTGGGAAACAGACCTCCCACGACCAGGCCCAATCGGAGG
AGAATCATGAACGTCCGGCTCGTCAAGGAGGAGCTGCTGGTACGAGCCCAGCTCGGGGAA
GTCGTCGATGTTGATGTTGAGATCCAAAAAACCAATTCCCCTCCCCAGATTTCCGCCGGT
GGATGAGCTCTGGGATGCCCGTTGATGCGAGGGAAACTGAGAGAAGAACTGCGTCTCGTT
GTCTTCATCTGTGGCCATGACGGCAGCGGCTTCTCAGGACACTGGCGGTGGGGGAGGGGA
GGAGCGAGCGACTGGGAGGGAGGAGCGAACGGATGGGAGGGAGGAGCGAGCGAGCCAATG
GGCATGGACGAGCGAGCGGACGGATAAGGTGCGGTGCGGGGCACGGTGGGAAAAAGTCCC
AAAAAGACCCTCCCACGTGGACTTCTTCCTTTAGTCCCAAATACCCCCTTTTAGTCCCTA
AAAGTCCCTCATGTTTGTTTCGCATGGGACTAAAAGAGACTTTTTTTAGTCCCTACACCA
AAAAGTCCATGTAAACAAACACCCCCTAATTGCAGTACTGCTTGCTTGAGACTTGAGGTC
TTATCTCTATGGACTGATACACTGTGTCTCGCCTTGGGAGAAAGTTATCACTTCATGCAA
ATTATCATGCTTTAATGCCCAATGACTGACTACCAATCAAACACTAATGATAAGTTAGTC
AAAAGTAGATCCATGTTAATAGGTTTCAACTATCTTTTTCCCATGAAAACCTGAAAAAAC
AAAACCCCATATAGCAGACTCCGGAAGTACGGTTGCGATTTTTGACTTTTTTAAAAGGAC
ATGTTGTGTTTTCTTTACTTCTTTAAGTAAGCACACGTTATGCTTCTCGCGAAAGCATGG
TTTTGCTTCTCGTAGAATCACAGTAGTTATTTTCCCTTTTCGAGTACAATAATGTCACCC
TCAATGCCGACCTTTGGGAGGGATGATTCGTCCACATTAAATCCCCCCCCCAATTTCATC
GTGTGGGCCTGCCCATTAAGTTTAATTCCGACCCTCCAACCATGCTCATCCCGTAATGAT
TACATAAAGTATATGTAGGTGTAGCAAAGCTCTTTCAAGTAAAAGCAGAGTTATACTTCT
CATGAAAGCAAATCTATGTTTTCACAAGAAACACAATCGTCCTTCTTGTAGAAACATTTT
TCCAAAAACCTAGAGGAAATCACACAAAAACTGGAGACGTAAAAAATCCTTCTAAAACCT
GAAAACATGTACAACAAATATACATTAAACCCCCCCCCCCCCCCCCC